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科学家合作构建再生生物学多组学数据库

随着细胞重编程、基因编辑、合成生物学、高通量测序等技术的快速发展,再生生物学进入前所未有的蓬勃发展时期,助力解决组织替代、功能修复、衰老干预、疾病治疗等一系列生命医学领域的重要科学难题。面对科学数据的爆炸式增长,亟需建立以再生生物学为核心的开放数据库,以存储世界范围内的组学研究数据为基础,推动再生相关的基础研究和临床转化应用的不断发展。 9月30日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)鲍一明研究组、张维绮研究组和中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组合作,在Nucleic Acids Research 杂志发表论文,建立了再生生物学领域首个多组学数据库Regeneration Roadmap。该数据库从转录组、单细胞转录组、表观基因组及药物基因组等不同层面整合了再生相关数据集,涉及11个物种、36种组织类型,实现了不同条件下基因表达随再生变化的汇聚融合,以及对不同层次组学数据的交互查询和联合比较分析。此外,......阅读全文

科学家合作构建再生生物学多组学数据库

  随着细胞重编程、基因编辑、合成生物学、高通量测序等技术的快速发展,再生生物学进入前所未有的蓬勃发展时期,助力解决组织替代、功能修复、衰老干预、疾病治疗等一系列生命医学领域的重要科学难题。面对科学数据的爆炸式增长,亟需建立以再生生物学为核心的开放数据库,以存储世界范围内的组学研究数据为基础,推动再

中科院再生生物学重点实验室开放课题申请

  中国科学院再生生物学重点实验室2016年开放课题申请通知  中国科学院再生生物学重点实验室是致力于干细胞与再生生物学及其相关学科领域基础研究的开放型科研机构(实验室代码:2008DP173344);实验室实行“开放、流动、竞争、联合”的运行原则。现有一支以中青年为骨干的干细胞与再生生物学研究队伍

天津大学:新冠病毒基因组注释数据库向全球开放

  疫情就是命令!30日从天津大学获悉,该校生物信息中心新型冠状病毒基因组注释数据库上线,并纳入中国国家基因组科学数据中心向全球开放服务。新型冠状病毒基因组注释数据库 ZCURVE_CoV Database 网站截图  面对疫情加快蔓延的严重形势,科技界正在争分夺秒与病毒抗争,开展病毒防治相关药物的

植物生物学研究数据库

实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant

中国科学院再生生物学重点实验室2018开放课题申请通知

  中国科学院再生生物学重点实验室是致力于干细胞与再生生物学及其相关学科领域基础研究的开放型科研机构(实验室代码:2008DP173344),实行“开放、流动、竞争、联合”的运行原则。现有一支以中青年为骨干的干细胞与再生生物学研究队伍,有广泛的国内外合作基础。实验室拥有良好的科学研究基础,并配备了

动物所等建立衰老生物学多组学数据库

  随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多以及高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。  中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研

研究团队部合作建立衰老生物学多组学数据库

  随全球人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题.近年来,随衰老相关研究成果不断增多及高通量测序技术日益发展,衰老相关多组学数据逐渐增多.然而目前,尚缺乏一个综合性的、整合衰老生物学多组学数据的数据资源库.  中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)研究员鲍一明研

欧洲建成开放式细胞分裂研究数据库

  近日,欧盟一项历时6年的科研项目“MitoCheck”顺利完成。由奥地利分子病理学研究所领军的欧洲11个研究机构和公司,研究了细胞分裂的遗传基础,并建立了开放的细胞分裂研究数据库。相关研究成果分不同部分发表在近日出版的《科学》和《自然》杂志上。   细胞如何从一个分裂为两个,两个分裂为4个,最

基因组所完成开发RiceWiki数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台,是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。   水稻是人类重

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank 3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese