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只需100个细胞的表观基因组分析

近年来,表观遗传学已经成为了干细胞分化、炎症、癌症等多个领域的研究热点,但它在临床上的潜力还未得到充分挖掘。表观基因组分析可以帮助医生根据患者的自身状态调整治疗方案,最终实现个性化医疗。问题在于,表观基因组分析需要的细胞量很大。举例来说,检测全基因组的蛋白-DNA互作和染色质修饰大约需要一千万细胞,对患者样本进行这样的分析基本是不可能的。 弗吉尼亚理工学院的Chang Lu教授十多年来一直致力于开发活细胞分析工具,以便更好的理解人类疾病。他擅长用微流体装置检测细胞内发生的分子事件。 最近Lu教授与爱荷华大学的Kai Tan合作,在Nature Methods杂志上发表了突破性的研究成果。他们基于微流体装置开发了MOWChIP-Seq(microfluidic oscillatory washing based chromatin immunoprecipitation)技术,只需要100个细胞就能进行表观基因组分析。......阅读全文

2018年9月28日Science期刊精华

  本周又有一期新的Science期刊(2018年9月28日)发布,它有哪些精彩研究呢?让小编一一道来。  1.Science:重大进展!鉴定出有害藻花产生强效神经毒素软骨藻酸的基因簇  doi:10.1126/science.aau0382; doi:10.1126/science.aau9067

Autoimmunity:能研究细胞表观基因组学特性的新型工具

  如今研究人员都知道,表观基因组在控制DNA表达上扮演着关键角色,而且表观基因组的一系列改变与多种健康问题直接相关,比如癌症、自身免疫性障碍等多种疾病,但目前科学家们关于表观基因组并不是知道地很多,甚至也并没有工具去研究表观基因组。图片来源:CC0 Public Domain  刊登在国际杂志Au

甲基化领域重要研究成果解读!

  本文中,小编整理了近年来科学家们在甲基化研究领域取得的重要研究成果,与大家一起学习!  【1】Science:重大进展!揭示DNA甲基化增强基因转录机制  doi:10.1126/science.aar7854  DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能够在不

sci-CAR方法同时分析上千细胞中转录组和染色质可接近性

  不同细胞类型的基因组可能是相同的,但是它们的表观基因组和转录组不是相同的。表观基因组由一组影响每个细胞的基因组发挥何种功能的标记组成,而转录组指的是在某一特定条件下,细胞内所有转录产物的集合。转录产物经翻译后会产生蛋白。  在RNA转录过程中,细胞仅能够接近它们的染色质包装的双链基因组的某些部分

白血病细胞或会通过表观遗传学改变转分化为非癌变细胞

  日前,一项刊登在国际杂志Leukemia上的研究报告中,来自Josep Carreras白血病研究所等机构的科学家们通过研究发现,白血病细胞或能通过表观遗传学改变转化称为非癌变细胞。  我们机体的所有组织都携带相同的DNA,但其却会发挥不同的功能,比如,淋巴细胞和神经元就拥有相同的遗传物质,但其

Nature 表观遗传学进展将遗传学、环境与疾病联系了起来!

  21世纪,表观遗传学的研究得到了快速发展,同时其产生了让研究人员感兴趣和憧憬的东西,当然了,这其中也存在一些大肆宣传的成分,本文中,我们回顾了表观遗传学在过去几十年里是如何演变的,同时分析了近年来改变科学家们对生物学理解的一些研究进展;我们讨论了表观遗传学和DNA序列改变之间的相互作用,以及表观

一文了解甲基化研究领域新进展!

  本文中,小编整理了多篇重要研究成果,共同解读科学家们在甲基化研究领域取得的新进展,分享给大家!图片来源:Vossman/ Wikipedia  【1】Nature:母体维生素C调节DNA甲基化重编程和生殖细胞产生  doi:10.1038/s41586-019-1536-1  发育通常被认为是在

自然选择才是最挑剔的科学评论家

  2003年,人类基因组计划向世界宣布“人类DNA中有30亿个化学单位”。从那时起,科学家们便开始设计许多方法来组织和评估这些极为庞大的储存信息。如今,冷泉港实验室(CSHL)的科学家认为,自然选择进化才是解析基因组的看家法宝。  我们已经知道,人类基因组中仅有1%由基因构成,这些基因生产组成我们

Cell公布表观遗传学重大突破:40多篇论文的成果

  ——国际人类表观基因组协会(International Human Epigenome Consortium, IHEC)公布了一系列研究成果,包括表观遗传对免疫力、细胞系确定和细胞分化的影响。  生物通报道:2011年,欧盟委员会启动了有史以来规模最大的投资项目,投资3000万欧元(约合410

科学时报年终专稿之生命科学篇 裴钢:风景这边更好

编者的话 对于科学和技术的重大进展来说,一年并不是一个很长的时间。然而科学与技术的任何进步,都是科学家在日常工作中留下的一个个脚印。刚刚过去的2007年,科学与技术的各个领域可谓异彩纷呈。为了让读者对此有全景式的了解,本报特别约请各领域专家梳理并点评了科学与技术发展的亮点,并展望令人期待的

Cell Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

Cell Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

科学家发现正常乳腺组织中癌细胞发育的重要线索

  1月29日,Nature Communications 发表了中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所Andrew Teschendorff 研究组和英国伦敦大学学院妇科癌症研究中心Martin Widschwendter研究组的合作论文DNA methylation outliers in n

表观基因组对糖尿病发展作用揭示

  英国《自然·通讯》期刊近日发表的一篇表观遗传学论文,揭示了表观基因组对疾病发展的作用,探索了环境对Ⅰ型糖尿病发展产生影响的线索。科学家在Ⅰ型糖尿病病人中发现了免疫基因的表观遗传变化,而这些机制对人类来说仍是未解的谜题。   过去十年来,Ⅰ型糖尿病的发病率出现了显著上升,这被认为是环境因素(比如感

2015国家自然科学基金:表观遗传学什么是重点

  来自国家自然科学基金委员会的消息,8月18日国家自然科学基金委员会公布了2015年国家自然科学基金申请项目评审结果,其中面上项目16709项、重点项目624项、创新研究群体项目38项、优秀青年科学基金项目400项、青年科学基金项目16155项、地区科学基金项目2829项、海外及港澳学者合作研究基

Scientific Reports:创建首个全面基因组图谱

  近日,澳大利亚加文医学研究所的研究人揭示身体不同部位脂肪积聚所造成的伤害的驱动因素。他们的一项新研究比较了皮肤下的脂肪细胞和腹部内的有害脂肪,创建了第一个全面的基因组图谱。该图谱揭示了在细胞发育早期独特的特征,不同类型的脂肪似乎“硬捆绑”(hard-wire)在一起。该研究发表于Scientif

Nature:不容忽视的表观基因组

  肥胖有可能不仅写在基因之中,也写在基因之上。迄今为止最大型的一项探讨人类表观基因组(epigenome)的研究发现,某些表观遗传标记与身体质量指数(body mass index,BMI)相关。   在上个月的《柳叶刀》(The Lancet)杂志上,科学家们报告称在2500多人的血液

新的基因编辑领域突破口—表观遗传调控

  几十年来,DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质,但是近些年不断的研究表明,生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的,比如科学家们发现,可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰,这种改变不仅影响个体的发育,而且还可遗传给后代。如肿瘤等多种疾病并非仅由基因突变而引起,且与DNA和组蛋白

新的基因编辑领域突破口—表观遗传调控

  几十年来,DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质,但是近些年不断的研究表明,生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的,比如科学家们发现,可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰,这种改变不仅影响个体的发育,而且还可遗传给后代。如肿瘤等多种疾病并非仅由基因突变而引起,且与DNA和组蛋白

Nature子刊:CRISPR发现表观遗传对染色体的影响

  *本研究所使用的靶向表观基因组编辑技术由赛业生物提供   染色质的3D结构会随着细胞的生活周期而变化,对我们人体的健康和疾病发生产生重要的影响。近年来随着新技术的发展,科学家们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作,他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。大脑中TAD结构与神经精神

Nature子刊:用CRISPR操控表观基因组

  杜克大学的研究人员开发出了一种新方法,可以精确地控制基因开启及激活的时间。借助这一新技术研究人员可通过化学操控包装DNA的蛋白,来开启特异的基因启动子和增强子——控制基因活性的基因组片段。  研究人员说,拥有操控表观基因组的能力将有助于他们探究特殊启动子和增强子在细胞命运或遗传病风险中所起的作用

Science:揭示大脑回路的表观基因组成

  表观基因组学的变化,包括DNA的化学修饰,可以作为基因组的一层额外信息。表观基因组学在学习和记忆及年龄相关的认知度方面扮演着重要的角色。新的研究发现DNA甲基化,一种特殊的表观基因组学修饰的形式。从出生到成年,DNA甲基化形式在大脑细胞中是动态变化的。从而帮助理解大脑细胞中基因组学的信息是如何控

Nature子刊:CRISPR发现表观遗传对染色体的影响

  *本研究所使用的靶向表观基因组编辑技术由赛业生物提供   染色质的3D结构会随着细胞的生活周期而变化,对我们人体的健康和疾病发生产生重要的影响。近年来随着新技术的发展,科学家们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作,他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。大脑中TAD结构与神经精神

Nature子刊:CRISPR发现表观遗传对染色体的影响

染色质的3D结构会随着细胞的生活周期而变化,对我们人体的健康和疾病发生产生重要的影响。近年来随着新技术的发展,科学家们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作,他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。大脑中TAD结构与神经精神疾病的患病风险息息相关,但这一研究领域仍存在许多未解之谜。来自西

Nature重大成果:最全面的人类器官表观基因组图谱

  多年来,科学家们成功获得了人类基因组的工作图——编码人类生命的完整DNA序列图像。而现在他们仍然在往这一图集添加新页面——散布在DNA链上,影响了基因抑制的化学标记物——甲基的图谱。  来自Salk研究所的科学家们报告称,他们构建出了来自个体捐赠者(包括女人、男人和孩子)十多种不同人类器官最全面

新的基因编辑领域突破口——表观遗传调控(一)

几十年来,DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质,但是近些年不断的研究表明,生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的,比如科学家们发现,可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰,这种改变不仅影响个体的发育,而且还可遗传给后代。如肿瘤等多种疾病并非仅由基因突变而引起,且与DNA和组蛋白修饰

PLOS Genet:单分子测序技术助力原核生物DNA甲基化研究

  近日,刊登在国际杂志PLoS Genetics上的一项研究论文中,来自美国能源部联合基因组研究院的研究人员对230种古细菌和细菌基因组进行了测序,旨在研究DNA甲基化在原核生物中所扮演的关键角色。  细胞的表观基因组是基因组DNA特殊剪辑发生改变的一个特殊集合,这些表观基因组的改变会影响基因组的

全局DNA甲基化重塑技术帮助检验体外实验模型是否有效

  一些神经疾病的发病率正在攀升,特别是那些与衰老有关的疾病,如阿尔兹海默症和帕金森。为了更好地了解这些疾病,评估潜在新疗法,生物学家需要能在实验室进行研究的精确模型。  来自Salk和Stanford的研究人员,与Baylor医学院的合作者证明,用之前发表的方法诱导神经细胞,与大脑中自然发育的神经

精准定位为耐药性癌症治疗提供了新认识

  美国国家癌症研究所的 "癌症登月计划" 研究人员正在推进新的生物技术,研究免疫治疗和表观基因组分析。  加州大学默塞德分校 Fabian V. Filipp 教授正在进一步研究精确癌症靶点和个性化医疗。  Filipp 教授绘制了黑色素瘤的的基因全景并发现了一种可以有效应对致

多篇文章聚焦免疫应答背后的表观遗传相互作用

   国际人类表观基因组联盟(IHEC)近日在《Cell》等杂志上发表了40多篇论文,为人们呈现了原代组织的表观遗传数据集,以及复杂人类疾病的细胞机制分析。其中,几个团队开始解析免疫细胞发育、谱系确定和分化,以及免疫应答背后的复杂表观遗传相互作用。  在一项发表于《Immunity》的研究中,德国的