中药多组学研究取得重大突破

中药材基因资源是国家战略资源,其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期,中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景,相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上,引起了国际学术界对我国中药应用基础性研究的高度关注。 该研究针对传统草药遗传信息缺失制约中药学科基础研究的关键问题,首次破译一批草药基原植物基因密码,成功搭建了首个全球药典草药基因组数据库,包含近千种药用植物核基因组和质体基因组序列,推动中药研究全面走进“组学时代”,为进一步应用现代生命科学思维开展传统草药育种、鉴定、品质提升、生物合成等研究提供了分子遗传学基础。通过结合中药传统选育及组学技术,项目组成功选育一批中药材新品种,获得人参、黄花蒿、紫苏等多个中药材新品种证书,并正进行产业化推广,攻克长期困扰我国中药材选种育种模式落后的问题。 论文链接: https://......阅读全文

中药与组学将碰撞出什么火花?

  2020年,全世界人民最关心的问题就是健康,在中国几千年的历史长河中,中药的发展与国人的健康息息相关。中药作为中华民族的瑰宝,有非常多的研究人员用新的思路、新的方法将其研究得更加透彻,从而更好的发挥中药的作用,为人类健康做出更多的贡献。图片来源网络  在组学研发迅速发展的今天,中药如何更好的与其

中药基因组工程研究项目启动

    7月上旬,中药基因组工程科技大厦选址于长沙岳麓山大学城湘江风光带北端,与此配套的中药材基因库已在岳麓区观砂岭茶子山村动工建设,规划占地200亩,拟建成一个符合国际标准的中药材种植试验基地和湖南省珍稀植物药种资源保护与繁殖基地。这标志着中药基因组工程研究项目正式启动。      我省中医药

中药材“甘草”基因组测序完成

  日本理化学研究所、千叶大学、高知大学和大阪大学等组成的一个研究小组宣布,他们对中药材“甘草”进行了全基因组测序,成功取得了推测的全部基因94.5%的基因信息。  甘草是一种豆科植物,广泛应用于各种中药中,是重要的中药原料。它具有改善肝功能、治疗消化性溃疡、抗炎症及止疼止咳等多种功效。甘草根部富含

中药材“甘草”基因组测序完成

   科技日报东京10月27日电 (记者陈超)日本理化学研究所、千叶大学、高知大学和大阪大学等组成的一个研究小组宣布,他们对中药材“甘草”进行了全基因组测序,成功取得了推测的全部基因94.5%的基因信息。  甘草是一种豆科植物,广泛应用于各种中药中,是重要的中药原料。它具有改善肝功能、治疗消化性溃疡

中药基础物质、代谢及代谢组学研究方案

  中药组成成分复杂、作用环节多样,中药药效物质基础以及临床疗效机理的阐明,已成为中医药现代化研究的重要内容。如何快速地从海量的质谱数据中获取有价值的信息,减轻繁重的数据处理工作量,成为广大中医药研究工作者的心声。  赛默飞的Compound Discoverer软件针对中药成分鉴定、体内代谢转化和

利用植物表型组学挖掘基因组学的成果

到2050年,全球人口将达到97亿,预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标,作物产量需每年增长2.4%,但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素,但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。为了确保粮食安全、生态系统的可

传统背后的科学—代谢组学对理解中药的作用

肺炎是导致全球幼儿和老年人死亡的主要原因。它是一种感染性疾病,感染引起一个或两个肺中的气囊发炎并导致气囊积液,引发咳嗽、发烧、寒颤和呼吸困难。 中药(TCMs)在全球范围内广泛应用于病毒性肺炎的防治,因为它具有增强机体对肺炎病毒的抵抗力和调节免疫反应的潜力。许多病毒都已经建立了与宿主的免疫系统相互作

整合基因组和组织学信息-基因组学公司联手开拓新前沿

  10x Genomics公司宣布收购位于瑞典斯德哥尔摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空间基因组学(spatial genomics)领域的领先公司。空间基因组学是一个新兴领域,它不但让研究人员可以获得单细胞内的基因组数据

美印药物基因组学与癌症基因组学检测商业化

美国Companiondx实验室拟与健康信息技术服务商Enable Healthcare合作,向医生推广药物基因组学检测;印度癌症医学公司HCG宣布建立一个新的肿瘤基因中心,旨在下代测序技术能够帮助定位肿瘤,从而提高化疗和放疗的效率和响应率  美国药物基因组学检测商业化  Companiondx实验

Science专题:癌症基因组学

  在2001年完成人类基因组测序后,许多的研究人员立即将目光放到了利用这些信息来更好地了解遗传学上。最近,越来越多的研究确定了表观遗传学在癌症的发生、形成及发展过程中起效应。从鉴别与遗传性癌症相关的单基因变异的前基因组时代转向,测序技术的进步使得研究人员能够利用全基因组方法来检测基因组间的差异,以

药物基因组学的定义

药物基因组学(pharmacogenomics),又称基因组药物学或基因组药理学,是药理学的一个分支,定义为在基因组学的基础上,通过将基因表达或单核苷酸的多态性与药物的疗效或毒性联系起来,研究药物如何由于遗传变异而产生不同的作用。

毒理基因组学的定义

毒理基因组学(toxicogenomics)是从多基因、全基因组水平研究毒物作用与基因表达的相互影响。其研究内容主要包括3个方面:促进环境应激原与疾病易感性关系的理解、阐明毒性分子机制、筛选和确认与疾病和毒物暴露相关的生物标志物(biomarkers)。

蛋白质组学不能被基因组和转录组取代

基因和蛋白并不存在严格的线性关系ORF并不预示一定存在相应的功能性基因mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应翻译后修饰及同工蛋白质(isforms)等现象在基因水平无从表现

宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组

  来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。   由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。   宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术,并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增

全面解读药物基因组学基因检测技术

全面解读药物基因组学基因检测技术FDA和CFDA分别于2010和2012年将CYP2C19基因检测的重要性说明纳入氯吡格雷的药物说明书。在国内,阜外医院已完成氯吡格雷用药基因检测超过20000例,居全国单中心检测量之首。以下列出了药物基因组学涉及的主要基因及对应的个体化用药:(4)  以下为上述三大

北京基因组所开发出比较群体基因组学新算法

  随着基因组测序技术的发展,物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为在基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了机遇。然而,目前的分析方法面临着技术瓶颈和挑战。其中,关键问题是如何高效准确地检测作用于非编码区的自然选择效应。同时,能够高效、高性能地分析多物种大样本数据,成为方法学方面的迫切要求。

基因组学与蛋白质组学两大巨头建立合作

  AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmics™ 计划,其目的是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学(NGP)和新一代测序(NGS)的工具。作为此计划的一部分,Illumina的应用商店BaseSpace将托管AB Sciex的SWATH™ 蛋白质组学云工具,这使得BaseSp

九院士两药学专家联合建议开展中药代谢组学研究

为中药安全性评价提供科学依据 复方中药是中国医药学的精髓和宝贵财富,对其进行系统的科学研究对于继承和发展中医药,并赢得全世界的认同,具有十分重要的意义。复方中药的药味多、成分复杂,加上辨证施治的用药原则,使组方差异较大,而且一些中药在使用时还具有毒副作用,为中药配伍研究带来巨大困难。因此,亟待开

表观基因组学研究指南(一)

  今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal of Bi

表观基因组学研究指南(三)

  今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在 Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal

基因组学:-跨越癌症研究国界

  1982年11月,在尼日利亚海军医院外足球场上踢球的一名军官,突然摔倒死亡。这名男子被带到急诊室时,当时还是一个新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade医生正在值班。“我们搞不明白为什么他死亡,这让我感到震惊,从那时开始我意识到,我需要做更多的工作来理解和帮助人们。”Ol

-Science:宏基因组学测序技术

  宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。   长期以来,对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua

作物基因组学研究进展

  摘要:农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2017年度主要农作物基因组

表型组学技术:精准挖掘玉米抗旱基因

  随着测序技术普及和待测材料的规模化,传统的干旱表型性状获取手段已经不能满足植物抗逆基因组学研究的需求,严重阻碍玉米抗旱资源的挖掘。  近年来,以智能化、高通量、动态无损测量为主要特征的表型组学技术迅猛发展,使得多时空多尺度表型检测成为可能,可实现作物全生育期表型动态精准鉴定。  近日,《基因组生

蛋白质组学之逆袭,深度注释基因组

  申请课题缺创新点?撰写论文没思路?急着毕业时间紧?别怕,对于吉凯,一切都是套路!更有甚者,对于宇宙终极难题:“屌丝如何逆袭白富美?”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。   从前,在生物学研究领域,有一个白富美叫基因组学(Genomics),她有一项强大的技能:DNA测序,凭借这项技能,她完

北京基因组所生命组学数据资源建设获进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。该研究成

全基因组测序的竹亚科及生物学性状的比较基因组学研究

  禾本科(禾草)是被子植物最大科之一,约有12000种,是水稻、小麦、玉米等人类粮食和牲畜饲料的主要来源,也为人类提供了加工淀粉、制糖、酿酒、造纸、编织和建筑等方面的重要原料。同时,禾本科又是植物遗传学和基因组学研究的模式类群。竹亚科(竹子)是禾本科的12个亚科之一,与早熟禾亚科、稻亚科组成BOP

华大基因携手爱丁堡大学,共促基因组学研究

  2012年7月24日,深圳华大基因研究院与英国爱丁堡大学签署合作协议,宣布双方将在基因组领域展开广泛的科研合作,通过汇聚中英两国研究专长,加速基因组学在人类健康和农业及其他相关领域的创新和发展。   在签署的合作备忘录中,双方将着眼于对人类和其他生物的科学认识,通过共同努力,对遗传信息进行深入

基因组学做不了的事-蛋白质组学更精准打击癌症

近日,国际人类蛋白质组组织公布了2020年度权威奖励获奖名单,中国科学院院士、军事科学院军事医学研究院研究员贺福初荣获蛋白质组学杰出成就奖。 贺福初院士率先提出人类蛋白质组计划的科学目标与技术路线,倡导并领衔了人类第一个关于组织、器官的蛋白质组计划,揭示了人体首个器官(肝脏)蛋白质组。2014年