表观基因组学研究指南（一）
今年九月，对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份，因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature，Genome Biology，Genome Research等杂志上公布了三十多份论文，还有在Science，Cell，以及the Journal of Biological Chemist上的一些功能性介绍论文。这一项目的研究人员对147细胞系进行了将近1,650次实验，分子转录，转录因子结合，染色体拓扑结构，组蛋白修饰，DNA甲基化等多方面内容。 包含这些种种功能元件的就是表观遗传学，近年来科学家们越来越意识到这些元件特征在发育和疾病中的重要性，因此早在2008年，也就是NHGRI启动ENCODE计划的五年后，NIH又开始了第二项大规模图谱绘制工程：表观基因组学路线图项目(Roadmap Epigenomics Program)，这一项目整理了61个“完整”的表观基因组，......阅读全文
胚胎干细胞转录因子NANOG的新发现
在胚胎干细胞的自我更新中，转录因子Nanog 具有关键性的作用，这一因子也一直是近年来研究的热点。最近，西班牙国家癌症研究中心（CNIO）的科学家们发现，NANOG也调控成体生物分层上皮细胞的细胞分裂，分层上皮细胞是皮肤表皮的组成部分，或者覆盖在食管和阴道表面。相关研究结果发表在最近的《自然通讯
CCAAT转录因子
中文名称CCAAT转录因子英文名称CCAAT transcription factor定 义可与启动子中的CCAAT元件发生特异性相互作用的转录因子。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
辅助转录因子
中文名称辅助转录因子英文名称ancillary transcription factor定 义协助RNA聚合酶同启动子结合，并促进已结合的RNA聚合酶启动转录速率的转录因子。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
转录因子组成
真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分：亚基RNA聚合酶的亚基，它们是转录必须的，但并不对某一启动子有特异性。复合物某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复
Nat－Commun：揭秘转录因子“勘察”细胞基因组的分子机制
转录因子（TFs）是一种能调节基因表达的特殊蛋白，其能在完整的基因组中搜索并结合特殊区域来调节基因的表达；我们都知道，转录因子不仅能结合特殊的DNA序列，还能非特异性结合任何DNA链。这些非特异性的关联就能够明显增加转录因子寻找特殊靶点的能力，然而目前研究人员并不清楚在扫描大量基因组、定位以及结
转录因子活性ELISA
转录因子活性ELISA是建立在ELISA基础上的高灵敏度的检测方法，比EMSA的灵敏度高l0倍，在5h内就能完成。不涉及放射性和凝胶电泳，安全简便，而且这种微孔板的形式能同时检测1—96个样品。ArrayStarTM转录因子活性ELISA试剂盒可以快速、灵敏地检测细胞核提取物中转录因子的DNA结合活
转录因子和转录因子之间可以有相互作用吗
可以转录因子真核生物转录起始十分复杂，往往需要多种蛋白因子的协助，转录因子与RNA聚合酶Ⅱ形成转录起始复合体，共同参与转录起始的过程。根据转录因子的作用特点可分为二类；第一类为普遍转录因子,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体时，转录才能在正确的位置开始。除TFⅡD以外，还发现TFⅡA，TFⅡ
多名学者推荐全基因组分析转录因子功能新技术
来自北卡罗来纳大学教堂山分校，NIH等处的研究人员利用一种新型方法，分析了酵母转录因子Rap1在整个基因组中的结合动态，从而可以更好研究这一转录因子的功能，这一方法将有助于科学家们实时分析转录情况，相关成果公布在Nature杂志上。 对于这一成果，来自法国国家科学研究中心的François
利用人工组合转录因子对人类基因组扫描
Scanning the human genome with combinatorial transcription factor librariesPublished online: 18 February 2003, doi:10.1038/nbt794March 2003 Volume 21
转录因子的转录调控区的介绍
同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。 转录调控区包括转录激活区（transcription activation domain）和转录抑制区（transcription repression domain）二种。近年来，转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-10
利用人工组合转录因子对人类基因组扫描2
Figure 5: Regulation of CDH5 by TFZFs in several human cancer cell lines.Blue, cells infected with a pMX construct containing the DNA binding domain o
关于转录因子的转录抑制区的介绍
也是转录因子调控表达的重要位点，但是对其作用机理研究尚不深入。可能的作用方式有三种：1）与启动子的调控位点结合，阻止其它转录因子的结合；2）作用于其它转录因子，抑制其它因子的作用；3）通过改变DNA的高级结构阻止转录的发生。 转录因子必须在核内作用，才能起到调控表达的目的。因此，转录因子上的核
概述转录因子的组成
真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分： 1、亚基 RNA聚合酶的亚基，它们是转录必须的，但并不对某一启动子有特异性。 2、复合物 某些转录因子能
通用转录因子的定义
通用转录因子(general transcription factors, GTFs) 。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子。
依赖ρ因子的转录终止
ρ因子是一种分子量为46kDa的蛋白质，以六聚体为活性形式。
通用转录因子的定义
通用转录因子（general transcription factors, GTFs） 。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子，这些起始因子称为通用转录因子
简述转录因子的作用
是通过和顺式因子的互作来实现的。这段序列可以和转录因子的DNA结合域实现共价结合，从而对基因的表达起抑制或增强的作用。 目前，人工转录因子（Artificial Transcription Factor，ATF）的构建已用于转录因子的生物学功能研究中起到重要作用。ATF是指将不同的DNA结合结
转录终止因子的定义
中文名称转录终止因子英文名称transcription termination factor定 义辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等)，其作用导致转录终止。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
胚胎干细胞发育研究取得新进展
清华大学陈烨光研究组和中科院遗传与发育研究所韩敬东研究组合作在胚胎干细胞发育研究方面取得新的进展，相关成果文章“Genome-wide mapping of SMAD target genes reveals the role of BMP signaling in embryonic stem
北京基因组所转录因子TALE和DNA相互作用研究获进展
近日，中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室雷红星研究组，在其开展的转录因子TALE(transcription activator-like effector)和DNA相互作用研究方面取得阶段性进展，该研究对TALE蛋白的构象可塑性以及特异性识别DNA的机制进行了深入的计
转录起始因子的定义
中文名称转录起始因子英文名称transcription initiation factor定 义参与转录起始作用的因子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
PNAS：“打了就跑”的转录因子
细胞核中的调控蛋白，在活化基因时采取了一种“打了就跑”（hit-and-run）的策略。美国国家科学院院刊PNAS杂志上发表的一项最新研究，深入解析了这种高效的转录模式。 “就像马克吐温笔下闯了祸就跑的汤姆·索亚一样，转录因子结合启动子并激活转录之后就会立即离开，让小伙伴们去继续自己未完成的工
转录终止因子的概念介绍
中文名称转录终止因子英文名称transcription termination factor定 义辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等)，其作用导致转录终止。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
转录激活因子的定义
定义1:一个转录因子家族,通过识别和结合环腺苷酸应答元件而激活基因表达。环腺苷酸应答元件存在于很多病毒和细胞的基因启动子中。 所属学科:生物化学与分子生物学(一级学科);基因表达与调控(二级学科)定义2:与特定DNA序列结合以促进基因转录的因子。 所属学科:遗传学(一级学科);分子遗传学(二级学科)
通用转录因子的相关介绍
在真核生物中有效的和启动子特异性的起始需要几个起始因子，这些起始因子称为通用转录因子。通用转录因子共同执行
基因转录因子的相关介绍
转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态，RNA聚合酶自身无法启动基因转录，只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后，基因才开始表达。转录因子的结合位点
转录激活因子的定义
定义1：一个转录因子家族，通过识别和结合环腺苷酸应答元件而激活基因表达。环腺苷酸应答元件存在于很多病毒和细胞的基因启动子中。 所属学科：生物化学与分子生物学（一级学科）；基因表达与调控（二级学科）定义2：与特定DNA序列结合以促进基因转录的因子。 所属学科：遗传学（一级学科）；分子遗传学（二级学科）
玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2－调控醇溶蛋白
玉米（Zea mays）原产于墨西哥和中美洲地区，是一种由古印第安人（Indians）在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍（Euchlaenamexicana）（现存在于墨西哥和尼加拉瓜）杂交而来的品种。但是，作为一类重要的粮食作物，天然玉米籽粒在其营养价值上却有着重要的缺陷。根据已有
玉米转录因子和籽粒重要转录因子互作协同调控醇溶蛋白
玉米（Zea mays）原产于墨西哥和中美洲地区，是一种由古印第安人（Indians）在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍（Euchlaenamexicana）（现存在于墨西哥和尼加拉瓜）杂交而来的品种。但是，作为一类重要的粮食作物，天然玉米籽粒在其营养价值上却有着重要的缺陷。根据已有的文献报道，玉米籽粒
张锋最新Cell论文：细胞命运调控可预测
全面了解基因调控网络（GRN）控制细胞状态是分子生物学的基本目标。转录因子（Transcription factors，TF）结合到基因组中的特定序列，以改变基因表达和特定细胞的状态。单个转录因子的过表达就足以导致细胞命运的深刻变化，例如，改变转录因子的表达可以诱导多能干细胞向特定类型细胞的再分