昆明植物所利用第二代测序仪测定铁竹线粒体基因组
同动物的线粒体基因组相比，植物的线粒体基因组有着十分独特的进化方式，如具有较大的基因组、极低的分子进化速率和相对较频繁的基因组结构上的变异等特性。目前，植物线粒体基因组大都通过传统的Sanger法进行测序，需要耗费大量的人力和物力，严重限制了植物线粒体基因组的测序，进而导致对其独特进化方式的研究进展缓慢。第二代测序技术的出现为大规模测序基因组序列提供了可能，这些技术现已成功应用于植物叶绿体基因组的测序，但是其在植物线粒体基因组测序上的应用尚缺乏深入的研究。 最近，中国科学院昆明植物研究所博士生马朋飞在李德铢研究员和郭振华研究员的指导下，利用第二代测序技术Illumina测定了6种竹子的叶绿体基因组全序列，并且发现Illumina测序序列中还包含了大量来自线粒体基因组的序列，这些序列是否可以通过拼接而获得较完整的线粒体基因组序列，从而为测序植物线粒体基因组提供新的途径?该研究选取了其中的裂箨铁竹(Ferrocalamus......阅读全文
昆明植物所利用第二代测序仪测定铁竹线粒体基因组
同动物的线粒体基因组相比，植物的线粒体基因组有着十分独特的进化方式，如具有较大的基因组、极低的分子进化速率和相对较频繁的基因组结构上的变异等特性。目前，植物线粒体基因组大都通过传统的Sanger法进行测序，需要耗费大量的人力和物力，严重限制了植物线粒体基因组的测序，进而导致对其独特进化方式的研究
叶绿体和线粒体基因组变异检测获突破
近日，《公共科学图书馆―综合》发表了中国农业科学院油料作物研究所博士后曾长立与合作导师伍晓明研究建立的能高通量检测叶绿体和线粒体基因组遗传变异的新方法。 据曾长立介绍，叶绿体和线粒体基因组作为植物细胞质基因组，对光合作用、呼吸作用等重要生命过程具有重要意义。 研究叶绿体和线粒体基因组
叶绿体基因组
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能的重要细胞器，叶绿体中进行的光合作用是严格地受到遗传控制的。早在20世纪初，人们就已知叶绿体的某些性状是呈非孟德尔式遗传的，但直到60年代才发现了叶绿体DNA(chloroplast DNA，ctDNA)。叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子，其大小在1
美首次对老鼠基因组的调控序列测序
美国科学家在7月1日出版的英国《自然》杂志上撰文表示，他们首次详细标示出了老鼠基因组功能序列中一个重要部分――调控序列的详细情况。老鼠是生物医学研究中最广泛使用的哺乳动物模型，因此，最新研究也将有助于我们进一步解读人类基因组。 加州大学圣地亚哥分校路德维格癌症研究所基因调控实验室主任任兵教
《自然》：美首次对老鼠基因组调控序列测序
美国科学家在7月1日出版的英国《自然》杂志上撰文表示，他们首次详细标示出了老鼠基因组功能序列中一个重要部分——调控序列的详细情况。老鼠是生物医学研究中最广泛使用的哺乳动物模型，因此，最新研究也将有助于我们进一步解读人类基因组。 加州大学圣地亚哥分校路德维格癌症研究所基因调控实验
PacBio构建目前最高质量的植物基因组参考序列
来自中科院遗传与发育生物学研究所，四川农业大学的研究人员发表了题为“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章，对一个籼稻基因组蜀恢498（R498）进行PacBio单分子测序，结合遗传图谱和
科学家构建出目前最高质量的植物基因组参考序列
随着PacBio单分子实时（SMRT）测序技术的发展，利用它已能够独立完成高质量基因组草图的组装。然而，这些草图序列中仍然存在多种错误，比如序列中会包含有很多嵌合体（即不同位置的序列连接到了一起）或是组装质量比较差的区域等，特别是重复序列区域有的没有组装出来，有的组装出来多个序列，而且这些错误通
二代测序技术助龙胆族叶绿体基因组进化和系统学获进展
随着二代测序技术的发展，植物叶绿体基因组序列已普遍应用于重建植物“生命之树”研究中。大多数植物叶绿体基因组呈环状四分体结构，包含约80个蛋白编码基因。叶绿体基因组由于缺乏重组，而常被认为是连锁的单一基因座；然而，越来越多的研究表明，叶绿体基因组中不同区域以及不同编码基因具有不同的核酸替代速率，经
测序技术及DNA序列测定结果分析
实验概要 在分子生物学研究中，DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger等（1977）发明的双脱氧链末端终止法和Maxam和 Gilbert（1977）发明的化学降解法。这二种方法在原理上差异很大，但都是根据核苷酸在某一固定的点开始，随机在某一个特定的
鸟枪法如何测序
全基因组鸟枪法测序（Whole Genome Shotgun Sequencing）无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱，采用最经济有效基因组鸟枪法测序/鸟枪法Shotgun测序（Whole Genome Shotgun Sequencing）无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱，采用最经济有效的实