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Nature汇总两个大规模项目提出重要标准

来自加拿大蒙特利尔大学IRCM,美国哈佛大学医学院等处的研究人员根据两个大型研究项目:癌症基因组计划CGP,和癌细胞系百科全书CCLE的研究数据,指出药物筛选研究中标准化的重要性,这对于提高筛选研究的可重复性,寻找更多新型治疗性药物具有重要的意义。 这篇文章发表在Nature杂志上,文章的通讯作者是一位来自IRCM的生物信息学家Benjamin Haibe-Kains。他在这篇文章中强调了标准化药物筛选的重要性,这项研究表明需要进一步发展和标准化药物筛选研究的重现性,因为这对于寻找新的治疗药物及潜在的药物组合非常重要。 癌症基因组计划(CGP)是一项针对主要癌症遗传变异的全面整合分析的计划。最早出现在2005年,目的是绘制一个有关各种癌症基因异常特征的“一览表”,以便通过系统分析找到新方法对抗这一顽疾。 而癌细胞系百科全书(CCLE)整合了来自大约1000个人类癌细胞系的基因表达,染色体拷贝数和大规模平......阅读全文

基因芯片——生物信息精灵

基因芯片,也叫DNA芯片,是在90年代中期发展出来的高科技产物。基因芯片大小如指甲盖一般,其基质一般是经过处理后的玻璃片。每个芯片的基面上都可划分出数万至数百万个小区。在指定的小区内,可固定大量具有特定功能、长约20个碱基序列的核酸分子(也叫分子探针)。由于被固定的分子探针在基质上形成不同的探针阵列

2018基因检测与生物信息分析论坛圆满闭幕

  2018年9月16-17日由江苏人民政府主办,易贸医疗协办的2018基因检测与生物信息分析论坛在江苏泰州举办。这是一场生信人的大聚会,13场嘉宾发言,2场晚间沙龙,1场嘉宾访谈和1场闭门圆桌论坛,大家意犹未尽,期待下次的相聚!16日下午  大会首先由泰州医药高新技术产业园区管委会副主任梁洪基先生

Cystatin基因家族的生物信息学分析

实验概要半胱氨酸蛋白酶抑制剂(cystatin)基因广泛存在于植物物种中。该类基因能够起到抑制某些病原微生物和昆虫体内半耽氨酸蛋白酶的作用,在植物的防卫体系中起到重要作用。我们利用已经分离出植物cystatin基因的cystatin结构域为检索序列在基因组水平上对拟南芥和水稻中的cystatin基因

华大基因成功开发移植瘤生物信息分析新算法――PDXomics™

  2012年7月17日,华大基因宣布其成功开发出一套适用于异种移植瘤模型生物信息学分析的新算法——PDXomics™,该算法能够将移植瘤与宿主基因组序列进行区分,有效地排除后续分析中异源物种数据的污染,保证分析结果的准确性和可靠性,从而可使移植瘤模型更为有效的应用于肿瘤新药开发和疾病机理研究。

生物信息学技术:基因芯片实验原理与方法

本实验的目的是学会cDNA芯片的使用方法。了解各种基因芯片的基本原理和优缺点。基因芯片这一技术方法在1991年的Science杂志上被提出,其高通量、并行检测的特点适应了分析人类基因组计划所提供的海量的基因序列信息的需要,可以说,人类基因组计划是基因芯片技术发展的原因,而对深人研究基因突变和基因表达

生物信息分析数据挖掘

DNA芯片技术能够在基因组水平分析基因表达,检测许多基因的转录水平及在不同条件下的基因转录变化,显示反映特征组织类型、发育阶段、环境条件应答、遗传改变的基因谱。基因芯片产生了海量的数据,仅仅进行差异表达分析还远远不够,如何管理分析这些数据、从中挖掘信息已经成为利用这一技术的新的难点。芯片数据大量出现

天津工业生物所通过信息整合获得更可靠的基因组注释

  不同来源的数据信息的比较整合是提高数据质量,获得对特定生物更准确认识进而进行设计改造的常用方法。目前已有多种基于web的基因组注释服务(如RAST, JCVI, IMG, IGS等),通过这些服务提交序列信息即可得到基因注释结果,但不同服务得到的结果往往有较大不同,因此对不同来源的基因注

生物信息学教程

Sequence - Evolution - Function Computational Approaches in Comparative Genomics by Eugene V. Koonin National Center for Biotech

信息素生物测定的概念

中文名称信息素生物测定英文名称bioassay of pheromone定  义测定信息素引起同种动物靶标的行为或生理反应的大小与强度。应用学科生态学(一级学科),化学生态学(二级学科)

信息素生物测定的定义

中文名称信息素生物测定英文名称bioassay of pheromone定  义测定信息素引起同种动物靶标的行为或生理反应的大小与强度。应用学科生态学(一级学科),化学生态学(二级学科)