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凝胶迁移实验(gelshift)基本知识问题与回答1

(1)什么是凝胶迁移或电泳迁移率实验?凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。通常将纯化的蛋白和细胞粗提液和32P同位素标记的DNA或RNA探针一同保温,在非变性的聚丙烯凝胶电泳上,分离复合物和非结合的探针。DNA复合物或RNA复合物比非结合的探针移动得慢。同位素标记的探针依研究的结合蛋白的不同,可是双链或者是单链。当检测如转录调控因子一类的DNA结合蛋白,可用纯化蛋白,部分纯化蛋白,或核细胞抽提液。在检测RNA结合蛋白时,依据目的RNA结合蛋白的位置,可用纯化或部分纯化的蛋白,也可用核或胞质细胞抽提液。竞争实验中采用含蛋白结合序列的DNA或RNA片段和寡核苷酸片段(特异),和其它非相关的片段(非特异),来确定DNA 或RNA结合蛋白的特异性。在竞争的......阅读全文

研究蛋白质与DNA相互作用的主要方法

一、引言在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。重组DNA技术的发展,人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要:a、鉴定分析参与基因表达调控的DNA元件

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验             实验步骤

凝胶阻滞实验分析RNA-蛋白质作用常数实验

凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛的应用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 结合蛋白的纯化,确定一种已知或可能的 RNA 结合蛋白所识别的序列,建立反应常数(如亲

研究蛋白质与DNA相互作用的主要方法

  一、引言   在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。   重组DNA技术的发展,人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要:   a、鉴定分析

常规聚丙烯酰胺凝胶电泳实验——检测

实验方法原理常规聚丙烯酰胺凝胶电泳后的检测,对于不同的目的,应采用不同的检测方法。由于这种电泳方法不破坏蛋白质的生物活性,所以可选用的检测方法很多。试剂、试剂盒丙烯酰胺单体贮液Tris-甘氨酸缓冲液贮液电极缓冲液样品缓冲液过硫醆铵浓缩胶缓冲液贮液分离胶缓冲液贮液实验步骤一、早期染色方法用染料和生物大

2-DE 蛋白质组学的 PROTICdb 数据库实验

仪器、耗材DBMS实验步骤3.1 PROTICdb 概述在输入或浏览数据时,每个最终用户需要一个 PROTICdb 账户(由您的管理员创建 ) 。作为一个新用户,首先要创建一个新的项目。一旦建立,该项目就属于这个用户,这个用户有权授予其他用户访问权限。为确保数据一致性的精确度,尽量不要用手动输入操作

凝胶阻滞实验分析RNA-蛋白质作用常数实验

实验方法原理 凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛的应用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 结合蛋白的纯化,确定一种已知或可能的 RNA 结合蛋白所识别

凝胶阻滞实验分析RNA-蛋白质作用常数实验

            实验方法原理 凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛

2-DE 蛋白质组学的 PROTICdb 数据库实验

实验步骤:3.1 PROTICdb 概述在输入或浏览数据时,每个最终用户需要一个 PROTICdb 账户(由您的管理员创建 ) 。作为一个新用户,首先要创建一个新的项目。一旦建立,该项目就属于这个用户,这个用户有权授予其他用户访问权限。为确保数据一致性的精确度,尽量不要用手动输入操作。因此,

PCR技术在突变基因检测中的应用

基因突变(gene mutation)是遗传病和肿瘤发生的根本原因,检测与遗传病及恶 性肿瘤发生有关的突变基因(mutant gene)是分子生物学,医学遗传学及肿瘤学研究 的热点,它对阐明遗传病和肿瘤发生的分子生物学基础及其诊断和早期诊断具有重要 \意义,分子生物学技术的发展,尤其是PCR技术的出

PCR技术应用三:突变基因检测

   基因突变(gene mutation)是遗传病和肿瘤发生的根本原因,检测与遗传病及恶 性肿瘤发生有关的突变基因(mutant gene)是分子生物学,医学遗传学及肿瘤学研究 的热点,它对阐明遗传病和肿瘤发生的分子生物学基础及其诊断和早期诊断具有重要 \意义,分子生物学技术的发展,尤其

非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳

Native-PAGE原理:非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 (Native-PAGE)是在不加入SDS 疏基乙醇等变性剂的条件下, 对保持活性的蛋白质进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,常用于同工酶的鉴定和提纯.未加SDS的天然聚丙烯酰胺凝胶电泳可以使生物大分子在电泳过程中保持其天然的形状和电荷,它们的分离

CEInfinite: 全柱成像新技术 拓展蛋白质分析无限想象空间

  【导语】用液相色谱法分离分析多肽或一些小蛋白的方法已经很成熟,但若要分析较大的蛋白质分子,科学和工业界都会选择电泳技术,比如在生物制药行业中做提纯后蛋白质的分析表征。不过,不管是凝胶电泳还是传统的毛细管等电聚焦,电泳实验可真不是好做的,方法开发困

凋亡细胞核DNA片段检测方法进展(一)

摘  要:当今生物学领域的研究一个热点之一是细胞凋亡。开展对细胞凋亡的研究,首先要解决是方法学问题。作者从凋亡细胞的特征性核DNA片段检测着手,阐述了多种凋亡细胞核DNA片段检测方法以及近年来的一些新进展。细胞凋亡(apoptosis)又称细胞凋谢或称程序性细胞死亡(Programmed

毛细管电泳的应用前景(一)

一, 毛细管电泳的兴起与发展毛细管电泳(capillary electrophoresis, CE),又称高效毛细管电泳(HPCE)是近年来发展最快的分析化学研究领域之一.1981年Jorgenson等[1]在75μm内径的毛细管内用高电压进行分离,创立了现代毛细管电泳.1984年Terabe等

凋亡细胞核DNA片段检测方法进展

细胞凋亡(apoptosis)又称细胞凋谢或称程序性细胞死亡(Programmed cell death,PCD),是有别于细胞坏死而受基因控制的一种主动性细胞自杀过程。对细胞凋亡的研究已成为当今生物学领域的热点之一。开展对细胞凋亡的研究,首先要解决的是方法学问题。根据凋亡细胞的生化特征检测组织或培

蛋白质组技术的研究进展

大规模基因组测序计划的实施已改变生命科学的重心,在相当短的时期内,一些原核生物和某些低等真核生物的基因组序列已被测定. 1995年,流感嗜血杆菌基因组序列首次被破译,在此后不到两年的时间,近50个细菌的基因组序列已被完成. 然而,这仅仅是理解有机物功能的一个起点. 在基因组时代,许多DNA序列信息仅

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验

蛋白质翻译后修饰 (PTM) 在细胞生物调节中发挥着基本作用。PTM 是 mRNA 翻译后蛋白质的酶促共价化学修饰。蛋白质化学修饰非常重要,因为它们会潜在地改变蛋白质的物理或化学性质、组成、活性、细胞定位或稳定性。实际上,在氨基酸或蛋白质的 N 端或 C 端加入或移除化学基团会导致大部分蛋白质发生变

毛细管电泳分析方法的工作原理介绍(二)

CE现有六种分离模式,分述如下:    1. 毛细管区带电泳(capillary zone electrophoresis, CZE), 又称毛细管自由电泳, 是CE中最基本、应用最普遍的一种模式。前述基本原理即是CZE的基本原理。    2. 胶束电动毛细管色谱 (mice

毛细管电泳工作原理(capillary electrophoresis, CE)(二)

CE现有六种分离模式,分述如下:   1. 毛细管区带电泳(capillary zone electrophoresis, CZE), 又称毛细管自由电泳, 是CE中最基本、应用最普遍的一种模式。前述基本原理即是CZE的基本原理。   2. 胶束电动毛细管色谱 (micellar electroki

双向电泳(two-dimensional electrophoresis,2-DE)-1

一、蛋白质组学概论随着人类基因组计划的实施,生命科学步入了后基因组时代,出现了不同于以往经典生物实验科学的全新的研究方式─“生物大科学”。这种生物大科学的核心思想是整体性研究,即以生物体内某类物质为对象进行完整的研究。过去对生命活动的研究仅限于研究细胞内个别的基因或蛋白质,而基因组学和蛋白质组学的目

蛋白质免疫印迹技术

实验概要免疫印迹是利用聚丙烯酰胺凝胶电泳来检测样品或提取物中某种特定蛋白的方法。聚丙烯酰胺凝胶紧贴着膜放置,在电流的作用下蛋白质从凝胶迁移到膜上并且被固定,常用的膜是硝酸纤维素或 PVDF(聚偏乙烯氟化物)。膜是凝胶蛋白质的复制品,然后可以与抗体结合后进行染色。实验步骤1.  

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验(一)

一、引言蛋 白 质 翻 译 后 修 饰 (P T M ) 在 细 胞 生 物 调 节 中 发 挥 着 基 本 作 用 。 P T M 是 m R N A 翻译 后 蛋 白 质 的 酶 促 共 价 化 学 修 饰 。蛋 白 质 化 学 修 饰 非 常 重 要 ,因 为 它 们 会 潜 在 地

如何挑选凝胶成像分析系统?

简介 曾经在过去的很多年,科研人员需要通过不断重复的工作对凝胶进行保存,以记录辛辛苦苦得来的凝胶结果,浪费了很多时间与精力。自从凝胶成像仪的诞生以来,科研人员已经不再需要如此辛苦,他们可以利用现代化的手段快速而准确的记录下试验结果,并且可以方便地获得分析和组织实验的数据。如今,凝胶成像分析

Western Blot 相关技术操作与原理-2

一、SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳     30%丙烯酰胺-双丙烯酰胺溶液 4 × 浓缩胶缓冲液 (Stacking gel Buffer, pH 6.8) 4 × 分离胶缓冲液 (Resolving g

C.B.S变性梯度凝胶电泳DGGE 应用原理及注意事项

原理:变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophresis,DGGE)是一种实用价值较高研究DNA突变的分析方法。本质是一类电泳(电泳定义:带电颗粒在电场作用下,向着与其电性相反的电极移动,称为电泳(electrophoresis, EP)。利用

C.B.S变性梯度凝胶电泳DGGE 应用原理及注意事项

  原理:变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophresis,DGGE)是一种实用价值较高研究DNA突变的分析方法。本质是一类电泳(电泳定义:带电颗粒在电场作用下,向着与其电性相反的电极移动,称为电泳(electrophoresis, EP)。利用带电粒子

C.B.S变性梯度凝胶电泳DGGE 应用原理及注意事项

  原理:变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophresis,DGGE)是一种实用价值较高研究DNA突变的分析方法。本质是一类电泳(电泳定义:带电颗粒在电场作用下,向着与其电性相反的电极移动,称为电泳(electrophoresis, EP)。利用带电粒子

使用胶做western blot的方法

在经典的Western Blot的世界里,蛋白电泳—转膜—封闭—抗体—显色这个五步骤环环相扣,构成WB完整过程,就象砌积木一样,少了前面一步的基础后面的就砌不上去。但是亲爱的朋友,告诉我,你们在一次又一次重复这个貌似简单又颇为费时的实验时,有没有设想过能省略掉其中的某个费时的非必需步骤,更直接更快得

凝胶电泳在做实验时应注意的事项

 影响电泳分离的主要因素:1. 待分离生物大分子的性质:待分离生物大分子所带的电荷、分子大小和性质都会对电泳有明显影响。一般来说,子带的电荷量越大、直径越小、形状越接近球形,则其电泳迁移速度越快。 2. 缓冲液的性质:缓冲液的pH值会影响待分离生物大分子的解离程度,从而对其带电性