《NatureGenetics》解读肿瘤利器，预测癌症进化
伦敦玛丽王后大学的研究人员开发了一款计算分析模型，可用于预测肿瘤进展。这项研究发表在《Nature Genetics》，目的是让临床医生具备预测肿瘤生长轨迹的能力，从而先发制人地控制病程和选择相应治疗方案。 研究人员采用亚克隆选择计算模型和适用于高通量测序数据的理论种群遗传学来监测人类癌症克隆动态，这种方法可以察觉肿瘤样本的亚克隆结构，同时测量每个亚克隆的选择性优势和出现时间。 “知道肿瘤是否会以某种方式改变，据此设计有效治疗，”伦敦玛丽王后大学Barts癌症研究所教授Trevor Graham说。“这项工作还处于起步阶段，待其成熟后将变得非常强大。” 解读肿瘤的“秘密日记” 随着肿瘤生长，它们的遗传密码（突变）也在不断改变。其中一些变化可能赋予癌细胞优势，使其更适合在某环境下生存。遵循达尔文进化论原则，这样的细胞受到青睐能够保持复制，产生更多相同突变细胞。许多携带不同突变的细胞群都在如此生长和聚集，创造出具有高度遗......阅读全文
肿瘤大数据须着力打通“孤岛”
我国海量肿瘤临床诊治信息处于无序利用状态，也限制了肿瘤诊治经验的积累、传承与深度挖掘，直接影响了恶性肿瘤诊治规范的制定和质量控制管理。 或许，在很多人的心目中癌症就等同于死亡。 国家癌症中心发布的最新数据显示：我国平均每天超过1万人、每分钟就有7人被确诊为癌症。癌症的发病与死亡人数逐年
赫捷院士：我国肿瘤大数据刚刚起步
“恶性肿瘤已成为严重危害我国人们健康的重大疾病。但我国却尚未建立以医院为基础的癌症监查网络，缺乏全国肿瘤诊疗状况的权威数据，这就会导致肿瘤防治、临床研究、指南制定、政府决策等带有一定盲目性。” 7月29日，在中国卫生信息学会健康医疗大数据肿瘤专业委员会暨慢病防治联盟指导委员会成立大会上，中国科
肿瘤基因专家致力挖掘单细胞大数据潜能
近年来，随着测序技术的迅猛发展，单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年，单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测，都是在大量细胞宏观水平上，对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上，对其遗传物质进行检测，从
“肿瘤精准医学大数据中心”在津成立
1月15日，全国首家“肿瘤精准医学大数据中心”在天津落成。天津市肿瘤医院院长、肿瘤精准医学大数据中心主任王平教授介绍，该中心将以推进我国“精准医学”建设为核心，打造肿瘤生物医疗大数据科研平台，通过对海量肿瘤样本数据的分析研究，发现与中国人密切相关的肿瘤早期诊断的标志物，为肿瘤的早期筛查、诊断和药
－访ASCO主席：肿瘤大数据如何引导癌症疗法创新？
在2015年美国临床肿瘤学会（ASCO）年度会议来临之际，ASCO主席Peter Yu教授在采访中简要介绍了今年会议计划的主要主题之一——大数据，并概述了ASCO牵头的大数据项目CancerLinQ™的未来。此外，他还为 ASCO与会者推荐了一些重要的会议主题，并对为什么恰好是肿瘤科医生引领医药
癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据
研究人员希望，数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。 这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望：“让我们测序你的肿瘤，或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过，现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些
人工智能与数据挖掘驱动的肿瘤新药研发
人工智能作为一种旨在模拟、延伸和扩展人的智能的科学，人工智能正在以前所未有的广度和越来越快的速度改变着世界的面貌。而在普瑞基准创始人季序我和梁晗看来，人工智能可以帮助我们更好地回答那些医学中最为本质的问题，对于新药研发、临床诊疗和医学基础研究，都有着不可估量的价值。 道路 在癌症诊治的过程中，
新一代肿瘤基因测序，数据质量是基石
肿瘤细胞的一个明确特点是其复杂的异质性，存在个体不同细胞间，不同个体间，另根据现有的研究基础，已经发现肿瘤基因层面变异频率普遍较低，各种因素告诉我们，在复杂的背景中确定肿瘤突变，首先测序碱基的准确率必须过关。原始数据的碱基识别准确性越高，使用的信息分析方法越合理标准，对测序深度的要求就会越低。在
壳五糖骨肉瘤细胞抗肿瘤研究数据
研究人员发现壳五糖可有效抑制骨肉瘤细胞的增殖、迁移、侵袭能力，其作用机制可能是通过调控PI3K/AKT信号转导通路产生的，该研究有望改善骨肉瘤的临床疗效及预后，文章发表于国际骨科学杂志上。该研究使用不同质量浓度的壳寡糖单糖（聚合度为2-6）处理3种骨肉瘤细胞系（MNNG、MG63、U2OS），发现壳
统计数据显示：肿瘤成为国人最为关注的疾病
240亿！这是2017年今日头条健康类资讯总阅读量。其中，“肿瘤”以36亿次的超高关注度位列2017国人关注的疾病之首。 11月29日，在今日头条与《健康报》社联合主办、中国健康知识传播激励计划战略合作支持的“2017算数健康大会”上，今日头条副总编辑徐一龙表示，健康类资讯已成为移动互联网3
日本科学家因数据问题撤销《肿瘤学》论文
据Retraction Watch网站消息，由于论文数据存在问题，日本大分大学（Oita University）Noriyuki Takai博士撤销了他发表在《肿瘤学》（Oncology）上的一篇论文。 该论文主要研究卵巢癌中组蛋白的信号通路。《肿瘤学》发布通告称，论文作者发现一些数据和原始
日本科学家因数据问题撤销《肿瘤学》论文
据Retraction Watch网站消息，由于论文数据存在问题，日本大分大学（Oita University）Noriyuki Takai博士撤销了他发表在《肿瘤学》（Oncology）上的一篇论文。 该论文主要研究卵巢癌中组蛋白的信号通路。《肿瘤学》发布通告称，论文作者发现一些数据和原始
临床测序重磅成果！300多种肿瘤，突变数据集问世
肿瘤分子分析是精准肿瘤医学的基本组成部分，它能够识别基因以及通路中所发生的变化，这是个性化医疗的关键。不同组织复发性突变的存在，加上分子靶向治疗组合的扩大，这就需要灵活且综合性的方法来分析全癌谱中与临床相关的基因。 5月8日，Nature Medicine杂志在线发表了一篇“大作”，科学家们采
中国完成首个人类肿瘤放疗增敏数据库
近日中科院合肥物质科学研究院技术生物与农业工程研究所研究员赵国平课题组、吴李君课题组与安徽大学夏俊峰教授合作，在前期工作基础上开发建立了人类肿瘤放疗增敏数据库dbCRSR。该成果是国际上首个关于人类肿瘤放疗相关基因的多组学整合数据库。研究成果发表在《数据库：生物数据库与管理》。图片来源于网络
首个国产PD1免疫治疗儿童肿瘤临床数据出炉
中山大学肿瘤防治中心张翼鷟教授团队在 Signal Transduction and Targeted Therapy 期刊发表了题为：Safety and clinical efficacy of sintilimab (anti-PD-1) in pediatric patients wit
二代测序在肿瘤治疗研究项目中的应用及数据
GenomeWeb芝加哥讯 – 本周美国临床肿瘤学会年度会议中展示的研究项目包括了来自于部分研究项目的大量数据，这些研究项目均使用了二代测序技术来指导对肿瘤患者的治疗方法。 研究结果表明，正如之前科学界已报道的那样，NGS panel及更广泛的测序方法可以在很多情况下的少部分（有时是多数）患者中鉴别
超十万肿瘤患者数据证明：TMB预测免疫治疗疗效靠谱
随着免疫检查点抑制剂在我国的获批上市，免疫治疗大大改变了传统的肿瘤治疗策略。但是目前差不多只有20%-40%的肿瘤患者可以从免疫治疗中获益。要想筛选出最佳获益人群，就要做到知己知彼，通过标志物了解肿瘤和自身免疫系统的状态。近日，一项评估了45项临床研究、103078例肿瘤患者数据的研究为TMB与
300多种肿瘤－晚期癌症患者测序突变数据库发表的启示
5月8日，Nature Medicine杂志发表一篇重量级文章，纪念斯隆-凯特琳癌症研究中心(MSKCC) 的科学家采用MSK-IMPACT方法，开展了一个大规模、前瞻性的临床测序研究。他们对上万名晚期癌症患者，接近300多种肿瘤进行了基因测序，同时收集了这些肿瘤病人的临床注释、病理等方面的信息
大型高质量mIF数据集——AstroPath，有助于识别肿瘤免疫疗法
针对免疫系统的癌症免疫疗法目前已经在多种癌症的治疗中取得了令人兴奋的成绩，美国食品和药物管理局（FDA）在超过17种实体瘤中批准了抗PD-1/PD-L1的药物的使用，然而仅有30%的癌症患者对免疫疗法起反应，因此发现有效的生物标志物从而指导患者的临床用药是非常迫切的需求。免疫组化（IHC）评估的
肿瘤免疫火得飞起，更新后的TIMER－2.0数据库真心好用！
肿瘤微环境中免疫细胞的组成和丰度是影响肿瘤进展和免疫治疗效果的重要因素。由于直接测量方法的局限性，计算算法通常用于从肿瘤转录组图谱推断免疫细胞组成。这些估计的肿瘤免疫浸润人群与肿瘤的基因组和转录组学变化相关，提供了对肿瘤免疫相互作用的见解。今天我们就一起来看这个肿瘤免疫分析的又一神器——TIME
中科院物质院完成首个人类肿瘤放疗增敏数据库
记者从中科院合肥物质科学研究院了解到，技术生物与农业工程研究所研究员赵国平课题组、吴李君课题组与安徽大学夏俊峰教授合作，在前期工作基础上开发建立了人类肿瘤放疗增敏数据库dbCRSR。该成果是国际上首个关于人类肿瘤放疗相关基因的多组学整合数据库。研究成果发表在《数据库：生物数据库与管理》。 放射治
贝瑞和康建成全球最大妇科肿瘤基因组数据库
基因组大数据的重大意义开始凸显，贝瑞和康与阿里云合作开展的“神州基因组数据云”项目取得的阶段性成果，便已经收效显著。 9月23日，在第十九届全国临床肿瘤学大会暨CSCO学术年会上，北京贝瑞和康生物技术股份有限公司（以下简称“贝瑞和康”）公布了在生物信息分析领域和大数据建设方面做出的重要成果。
乳腺癌是保还是切肿瘤专家用真实世界数据将告诉你答案
乳腺癌作为中国女性健康的第一杀手，他不仅发病率高，而且依然以每年3%的速度在递增，对于乳腺癌的治疗，也是各有各的说法，有的人认为乳腺癌应该选择切除手术进行根治，这也是目前来说治愈率比较高的一种方式，而有的人认为早期乳腺癌可以选择保留乳腺，做到精准治疗，对于这样的争议专家也在不断地在寻找新的治疗方
首届科学数据大会探讨“科研大数据与数据科学”
2月24日，首届科学数据大会在中国科学院大学国际会议中心举行。包括中科院院士郭华东、陈润生，中国工程院院士汪懋华在内的400多名专家、青年科研人员参会。 中科院副院长、国际科技数据委员会(CODATA)中国全国委员会主席丁仲礼向会议发来贺信。他在贺信中表示，科研大数据和数据科学的作用越来越
定性数据和定量数据的区别
1、定义不同定量分析是依据统计数据，建立数学模型，并用数学模型计算出分析对象的各项指标及其数值的一种方法。定性分析则是主要凭分析者的直觉、经验，凭分析对象过去和现在的延续状况及最新的信息资料，对分析对象的性质、特点、发展变化规律作出判断的一种方法。2、所依赖的哲学体系不同作为定性数据，其对象是客观的
定性数据和定量数据的区别
1、定义不同定量分析是依据统计数据，建立数学模型，并用数学模型计算出分析对象的各项指标及其数值的一种方法。定性分析则是主要凭分析者的直觉、经验，凭分析对象过去和现在的延续状况及最新的信息资料，对分析对象的性质、特点、发展变化规律作出判断的一种方法。2、所依赖的哲学体系不同作为定性数据，其对象是客观的
定性数据和定量数据的区别
1、定义不同定量分析是依据统计数据，建立数学模型，并用数学模型计算出分析对象的各项指标及其数值的一种方法。定性分析则是主要凭分析者的直觉、经验，凭分析对象过去和现在的延续状况及最新的信息资料，对分析对象的性质、特点、发展变化规律作出判断的一种方法。2、所依赖的哲学体系不同作为定性数据，其对象是客观的
肿瘤研究，从认识肿瘤细胞开始
最近一段时间我们一直围绕着肿瘤动物模型的构建，为大家介绍了肿瘤研究中各种实用动物模型的建立方法，相信大家应该收获颇多。动物水平的研究为我们提供了更接近临床的数据分析，与此同时，肿瘤细胞的实验研究也同样重要，它是肿瘤研究的初级阶段，可以更加快捷地提供在体外水平的研究结果。本期我们就开启肿瘤细胞学新
大数据能否破解数据造假难题？
林宣雄，1962年9月生，江苏宜兴人，西安交通大学环保大数据研究中心主任。1998年获陕西省优秀青年科技工作者称号，1999年主持研发的“国家环境监理信息系统”被确定为国家级火炬计划项目，同年获省优秀软件人才称号；2003年获首届省优秀青年科技创新奖；2008年承担环境保护部节能减排核心重大软件
分析数据的处理——可疑数据的取舍
1. Q-检验法 （3~10次测定适用，且只有一个可疑数据） （1） 将各数据从小到大排列：x1, x2, x3……xn ; （2）计算 （x大-x小）, 即 （xn -x1）; （3）计算 ( x可-x邻), （4）计算舍弃商 Q 计 =ô x可-x邻ô/ xn -x1