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生物学,崛起的下一代计算平台

Synhego公司距离Facebook总部仅五分钟车程,从外观来看,它和硅谷的其他创业公司并无差异,但是在它米色的办公园区里,一模一样的黑色服务器机架整齐地排列着,灯光闪烁,发出呼呼的排气声,然而这些金属架子里并没有零件在驱动网络的运行。这些机器正在利用分子改写生代码。 Crispr是一种功能强大的基因编辑器,它革新了科学家修改生物基因包括人类基因的速度和广度。因此,不论是学术研究人员、科技公司,还是生物制药公司都想使用这项技术,而这些新兴公司的出现就是为了满足这些需求。Synthego公司使用的是软件工程和硬件自动化相结合的技术,它意图成为基因工程领域的亚马逊,而Insacripta和Bioscience公司则分别希望成为这一领域的Apple和因特尔。 这些公司与计算机行业的类比不仅仅是在玩文字游戏,Crispr使得生物学变得可程序化了。生物技术公司的高管们声称他们在Crispr后端系统中阅读了这一系统在硅谷的......阅读全文

生物学,崛起的下一代计算平台

  Synhego公司距离Facebook总部仅五分钟车程,从外观来看,它和硅谷的其他创业公司并无差异,但是在它米色的办公园区里,一模一样的黑色服务器机架整齐地排列着,灯光闪烁,发出呼呼的排气声,然而这些金属架子里并没有零件在驱动网络的运行。这些机器正在利用分子改写生代码。   Crispr是一种

生物学将是下一代计算平台:DNA是代码,CRISPR是编程语言

  每一个行业都在向CRISPR投入大量的资金——制药、农业、能源、材料制造。甚至连那些大麻贩子都想砸钱进去。日前,《连线》杂志发表了一篇文章,详细地报道了在这样的趋势下诞生的创业公司。生物技术公司的高管们宣称,生物学将是下一个伟大的计算平台,DNA是代码,CRISPR是编程语言。图片来源于网络  

计算生物学所量化生物学平台正式投入运行

  近日,中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所量化生物学平台(Omics Core)正式投入运行。平台配备有Illumina HiSeq 2000测序系统和相关仪器设备,该测序系统将文库DNA/cDNA片段附着到特殊处理的光学透明玻璃表面(即Flow cell),并采用可逆终止法边

电商平台崛起,煤炭物流迎转机

   “截至7月末,全国已经累计退出煤炭产能9500多万吨,只占目标任务的38%,所以后几个月任务还很重。”8月18日,在第六届中国能源物流产业大会煤炭物流贸易与电商平台创新转型发展分论坛上,中国煤炭工业协会经济运行部副主任梁敦仕表示。  自2012年初至今,煤炭经济下行已近五年,随着煤炭市场逆转和

计算生物学家为分析解释遗传测序数据开发平台

  我们可以在现场获得可操作信息,从而让我们很快地就如何向前推进做出决策。  对于设法治疗无明显致病原因患者的医生来说,基因测序技术可能会为他们指点迷津。但大量的信息也会使其很难快速找到答案。  两三年前,位于秘鲁利马的美国海军医学研究六所(NAMRU-6)的医生必须将其测序数据送往美国分析,这一过

基因测序的云计算平台

   自二代测序的技术问世以来,就一直是研究和临床领域关注的重点。随着整个行业的技术发展,二代测序也带动了整个基因研究的产业链。在二代测序的产业链中,上游做检测,中游做分析,下游做应用。在测序价格持续下降的情况下,中游测序数据的生物信息学分析成为了提高效率最大的瓶颈。  传统的测序数据分析依赖于本地

法国启动全国量子计算平台

  法国高等教育、研究与创新部4日发布新闻公报说,在法国量子技术国家投资规划框架下,政府当日宣布启动全国量子计算平台,旨在更好推动量子技术的应用和发展。   根据公报,该平台拥有初始投资7000万欧元,目标投资总额1.7亿欧元。平台将以法国替代能源与原子能委员会运行的超大计算中心(TGCC)为载体

下一代测序技术将改变生物学现状

  新一代非基于“桑格技术”的基因测序法以空前的快速测序速度问世了,它为人类带来了重大的科学成果和先进的生物学应用软件。然而,要研发出新一代基因测序法,必须克服30年来以桑格技术为基础的惯性思维。    1977年,Fred Sanger 和Alan R. Coulson发表了两篇关于快速测序技

下一代测序技术将改变生物学现状(一)

新一代非基于“桑格技术”的基因测序法以空前的快速测序速度问世了,它为人类带来了重大的科学成果和先进的生物学应用软件。然而,要研发出新一代基因测序法,必须克服30年来以桑格技术为基础的惯性思维。1977年,Fred Sanger 和Alan R. Coulson发表了两篇关于快速测序技术的论文[1

下一代测序技术将改变生物学现状(二)

最新的新一代测序仪操作只需一个人,24小时内可产生与几百台桑格毛细管测序仪同样多的序列数据。此外,样品中DNA损伤与常温贮藏的状态以及新一代测序误差等因素往往超过了序列变异,因此很难确定样品来源于现代人类还是古穴人。相比较而言,断言长毛象的某一特定顺序是来源于古代标本,而不是现代污染物更容易,因为现