基因测序:数据深度挖掘和解读难题待解

作为一种新型基因检测技术,基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。正因如此,今年华大基因的上市,就引发了资本市场的热烈追捧。 在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上,与会的众多专家就基因技术发展方向及面临的机遇与挑战进行了深入的交流和研讨。 基因测序用途广泛 当前,基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用。有学者甚至认为,基因测序技术可能是下一个改变世界的技术,因为在自然界乃至人类世界,基因测序都有着有着无可替代的作用。 今年5月,由中科院昆明植物所牵头的联合科研团队通过基因组建库与测序等一系列关键技术,攻克了茶树基因组测序的难题,在国际上率先获得了高质量的茶树基因组序列。 中科院昆明植物所研究员高立志坦言,这对揭示决定茶叶适制性、风味和品质,以及茶树全球生态适应性的遗传基础都有重要促进作......阅读全文

基因测序技术大升级

  DNA就像是漆黑的夜里萤火虫发的光,第二代测序技术无法辨别每一只萤火虫,所以就把上千只萤火虫放在同一个袋子里,才能收集到它们的光。但第三代技术却可以辨别每一只萤火虫,而且可以同时测量很多个DNA片断。 日前,南方科技大学生物系副教授贺建奎与另外几名中美科学家联合在生物医学杂志BioRxiv上

5大玩家竞逐下一代基因测序数据游戏

  【导语】美国化学学会(ACS)出版的新闻周刊C&EN以基因测序为主题发表了封面文章“下一代基因测序是一场数据游戏”,文中指出:2013年基因测序市场规模为13亿美元,其中Illumina市场占有率为71%;被赛默飞世尔收购的Life Tech居第二;罗氏排名第三;另外文中还公布了影响用户购买测线

美洲大蠊基因组测序完成

   中科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所詹帅及同事对美洲大蠊进行了基因组测序和分析,表明在已测基因组的昆虫中,其基因组规模仅次于蝗虫。这项研究3月21日在线发表于《自然—通讯》,文章揭示了该物种成功适应城市环境的遗传学基础的相关洞察。  美洲大蠊(Periplaneta americana

基因测序:数据深度挖掘和解读难题待解

   作为一种新型基因检测技术,基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。正因如此,今年华大基因的上市,就引发了资本市场的热烈追捧。  在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上,与会的众多

基因测序:数据深度挖掘和解读难题待解

  作为一种新型基因检测技术,基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。正因如此,今年华大基因的上市,就引发了资本市场的热烈追捧。  在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上,与会的众多专

-英公开埃博拉病毒基因测序数据

  一个英国科研团队成功完成了对埃博拉病毒的基因测序,并已将数据在网上公开发布,免费提供给全球科研人员使用。这有助于各国研发更高效的治疗药物和疫苗。  剑桥大学3日发布公告称,2014年埃博拉疫情在西非暴发后,来自该校及英国多个科研机构的研究人员开始在塞拉利昂采集病毒样本,并利用美国一家公司开发的新

基因测序全球大热,谁会抢到市场先机

  日前,美国总统奥巴马在2015年国情咨文演讲中提出“精确医学计划”,提议在2016财年向该计划投入2.15亿美元,推动个性化医疗发展。   在这笔2.15亿美元预算中,1.3亿美金将分配给NIH(美国国立卫生研究院),用于首批志愿者的招募和测序;7000万美金给NIH的癌症研究所,用于解

基因测序:数据处理与标准问题仍待解

  【导读】目前我国在数据行业标准方面概念还很模糊,这就导致科研机构、医疗机构、企业在利用基因数据的时候,没有统一的规则,也造成基因测序行业良莠不齐。这种情况,亟须得到改变。  目前我国在数据行业标准方面概念还很模糊,这就导致科研机构、医疗机构、企业在利用基因数据的时候,没有统一的规则,也造成基因测

基因测序:数据处理与标准问题仍待解

图片来源:百度图片 目前我国在数据行业标准方面概念还很模糊,这就导致科研机构、医疗机构、企业在利用基因数据的时候,没有统一的规则,也造成基因测序行业良莠不齐。这种情况,亟须得到改变。 基因测序,一直被视为生命科学和生物技术发展的重大革命。在经历过前些年的积累之后,今年的基因测序行

新一代肿瘤基因测序,数据质量是基石

  肿瘤细胞的一个明确特点是其复杂的异质性,存在个体不同细胞间,不同个体间,另根据现有的研究基础,已经发现肿瘤基因层面变异频率普遍较低,各种因素告诉我们,在复杂的背景中确定肿瘤突变,首先测序碱基的准确率必须过关。原始数据的碱基识别准确性越高,使用的信息分析方法越合理标准,对测序深度的要求就会越低。在

科学家提出基因测序数据分类新标准

有助于开发出更有效的疫苗;更迅速应对潜在公共卫生突发事件   最近,美国洛斯阿拉莫斯国家实验室(LANL)的一个遗传学小组和一国际财团联合提出了一套旨在阐明可公开获取的基因测序数据信息的质量标准。新标准最终可使遗传研究人员开发出更有效的疫苗,或有助于公共健康部门或安全人员更迅速地应对潜在的公共卫生

盘点:全球十大顶尖基因测序公司

  新一代测序(NGS)的市场规模到底有多大?据BCC Research统计,到2022年NGS市场将达到105亿美元。MarketsandMarkets则更加乐观一些,估计届时将达到124.5亿美元。不过BIS Research的预测较为保守,认为市场增长速度将相对缓慢一些,预计2024年达到11

ctdna测序数据测序深度多少可用

ctdna测序数据测序深度多少可用2-氨基嘌呤等其他碱基结构类似物同样具有诱变作用。②药物或射线引起的化学变化 亚硝酸能够作用于腺嘌呤(A)的氨基而使它变为次黄嘌呤(HX);可以作用于胞嘧啶(c)而使它变为尿嘧啶(U)。这两种氨基到酮基的变化带来碱基配对关系的改变,从而通过 DNA复制而造成A∶T→

基因测序

基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,可以说基因测序技术,是下一个改变世界的技术

基因测序

第1代测序技术——荧光标记的Sanger法 在第一台全自动测序仪出现之前,使用最为广泛的测序方法就是 Sanger 在 20 世纪 70 年代中期发明的末端终止法测序技术。 Sanger 也因此获得 1980年的诺贝尔化学奖。 他的发明第一次为科研人员开启了深入研究生命遗传密码的大门。G1.1   

测序“垃圾”数据变身宝藏

  基因组测序中曾经被视为是垃圾的数据,现在能够用来为人们提供重要的疾病线索。St. Jude儿童研究医院——华盛顿大学儿童癌症基因组项目的研究人员独辟蹊径,在染色体末端DNA重复片段的测序数据中,挖掘到了宝贵的癌症信息。   染色体末端的DNA重复片段被称为端粒,此前这种重复片段往往在二代测

首个中国地区古人全基因组数据被测序

  近日,《当代生物学》发表了首次针对中国地区古人类的全基因组研究成果。该项目由中国科学院古脊椎动物与古人类研究所和德国马普进化人类研究所等团队合作完成,研究分析了距今4万年前出土于北京房山田园洞的一具男性个体基因组,发现东亚早期人群组成十分复杂。  虽然欧洲和西伯利亚地区都有古人类样本基因组被测序

最新Nature公布两大基因组测序结果

  6月11日的Nature杂志公布了两项重要的基因组测序结果:巨桉树基因组,以及栉水母“太平洋侧腕水母”的基因组,这些遗传信息的解析将有助于我们更深入的了解生物功能基因变异,以及相关经济产物的作用机理。  来自佛罗里达大学的研究人员发表了栉水母“太平洋侧腕水母”(Pleurobrachia bac

Nature:测序研究引发的思考,谁该拥有个人基因数据?

  大样本数据库是影响基因数据分析解读的重要因素,也是影响测序产业链发展的瓶颈之一。如今,越来越多的志愿者将自己的基因数据贡献给科研,但是对于后续的数据反馈,却是一个值得深思的问题。近日,一位遗传学研究者在Nature网站上披露了如今遗传学研究中存在的问题:是否有必要将原始数据反馈给参与者?以下为她

精准医疗时代已至-基因测序数据分析成为关键

  随着医学技术提升、就医环境改善,困扰人们的复杂疾病是否能够得到更加有效的治疗?相关统计显示,针对城市居民死亡率较高的癌症(恶性肿瘤)、心脏病、冠心病等复杂疾病,传统医疗方案的治疗效果并不佳。据WINSymposium公布的数据显示,传统医疗在肿瘤治疗上用药无效率高达75%。人们仍然谈“癌”色变。

平价基因测序公司如何赚钱?高价卖数据才是生财之道

  可能一天前你还在为已经降到“冰点”的基因测序市场价格而窃喜,却不知后一天,基因测序公司已经将你的“基因秘密”高价转手卖给了那些需要基因大数据的研究机构或者制药公司,而后者据此研发的靶向治疗生物药物,一个疗程就可能售价十几万美元。  平价基因测序时代来临,基因测序业务门槛低、不赚钱已是行业内公开的

乳腺癌的8年数据,基因测序受患者青睐

  随着基因测序技术的发展,成本不断降低,活跃在市场上的乳腺癌基因测序产品也越来越多。然而,患者对乳腺癌BRCA测序持何态度?BRCA基因测序是否对患者的治疗决策有影响?2016年2月11日,《JAMA Oncology》杂志报道了年轻乳腺癌患者BRCA基因检测的调查报告,经调查发现,近年来乳腺癌年

基因测序定义

  基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。  基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,可以说基因测序技术是下一个改变世界的技术

蚕豆基因测序!

蚕豆的基因组终于被测序了,它拥有130亿个碱基,超过了人类基因组的4倍。这项研究最近发表在《自然》杂志上。这一非凡的技术壮举对于培育具有最佳营养成分和可持续生产的豆子的目标具有重要意义。由英国雷丁大学、丹麦奥胡斯大学和芬兰赫尔辛基大学领导的一个来自欧洲和澳大利亚的研究小组合作进行了这项广泛的测序工作

基因测序仪

原理编辑abi prism 310型基因分析仪采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddntp(标记终止物法),因此通过单引物pcr测序反应,DNA测序仪生成的pcr产物则是相差1个碱基的3''''末端为4种不同荧光染料

基因测序简介

  测序技术迄今为止已发展了三代,测序技术有4个指标:读长、成本、准确度、通量。  成本、准确度这两项指标都很好理解,成本下降使得单个人类基因组的花费已经从2001年的1亿美元下降到了1000美元以下。准确度则是测序结果的准确程度,例如二代测序的solid可以达到99.9%,而唯一投入实用的三代测序

基因测序原理

基因是位于DNA上的,其测序的原理是一样的DNA测序的方法有很多种.目前最常见的是双脱氧终止法了.在测序用的缓冲液中含有四种dNTP及聚合酶.测序时分成四个反应,每个反应除上述成分外分别加入2,3-双脱氧的A,C,G,T核苷三磷酸(称为ddATP,ddCTP,ddGTP,ddTTP),然后进行聚合反

Science:华大参与三种鳄鱼基因组测序

  最近,德克萨斯理工大学的生物学家带领一个50多名科学家的研究小组,测定了三种鳄鱼——美洲鳄、咸水鳄和印度鳄的基因组序列。  生物学副教授David Ray指出,通过测定这些基因组序列,科学家们可以更好地了解鸟类的进化,它们是这类食肉动物的最近亲缘种。该研究小组完成了这三种鳄鱼的基因组,可以说真正

单分子测序在肿瘤基因检测中的6大应用

  肿瘤是当今导致人类主要死亡的主要疾病之。由于其发病隐匿、治疗方法局限、多数预后不良,且分子生物学特征复杂多变,因而肿瘤的预防、早期筛查与诊断、临床治疗、预后评估一直是临床医生致力于解决的关键问题。随着现代医学技术的发展,肿瘤已经进人了个体化治疗阶段。肿瘤的基因组转录组和表观遗传特征在探究肿瘤的发

Science:华大参与三种鳄鱼基因组测序

  最近,德克萨斯理工大学的生物学家带领一个50多名科学家的研究小组,测定了三种鳄鱼——美洲鳄、咸水鳄和印度鳄的基因组序列。  生物学副教授David Ray指出,通过测定这些基因组序列,科学家们可以更好地了解鸟类的进化,它们是这类食肉动物的最近亲缘种。该研究小组完成了这三种鳄鱼的基因组,可以说真正