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PacBio三代单分子测序获表观遗传研究新发现

来自福建农林大学海峡联合研究院林学中心等处的研究人员发表了题为“Comprehensive profiling of rhizome-associated alternative splicing and alternative polyadenylation in moso bamboo (Phyllostachys edulis)”的文章,采用PacBio第三代单分子测序,并结合RNA-seq和PAS-seq (polyadenylation site sequencing),全面解析了选择性拼接和选择性多聚腺苷酸化在毛竹地下茎组织生长发育中的调控。 这一研究成果公布在植物学权威期刊The Plant Journal杂志上,通讯作者为福建农林大学马留银副教授与顾连峰教授,第一作者为王涛涛、王汇源及蔡大伟。 毛竹是生长最快的植物之一,福建是毛竹的主要产区,研究其快速生长机制具有重要的理论意义和实际应用价值。毛竹地下茎系......阅读全文

PacBio三代单分子测序获表观遗传研究新发现

  来自福建农林大学海峡联合研究院林学中心等处的研究人员发表了题为“Comprehensive profiling of rhizome-associated alternative splicing and alternative polyadenylation in moso bamboo (P

毛竹:探秘地球的前世今生

  地球是人类居住的唯一场所,为人类提供了生活必需的粮食、水、能源和矿产资源,同时也给人类带来了诸如火山、地震、海啸等灾难。人类如同向往太空一样,对地球的深部充满着好奇。 地球科学是一门古老而又年轻的科学,自人类在地球上诞生、繁衍和发展以来,就对自己赖以生存的地球进行了不倦的探索。从地球的起源到

PacBio单分子测序最新科研动态

  DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域,并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计,2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿,按最近几年增长

PacBio推出小而强大的测序系统

  之前,人们一直在猜测Pacific Biosciences可能会推出小型的单分子测序仪,但PacBio从未给出肯定的答复。而在2015年9月的最后一天,PacBio给了人们一个惊喜,突然宣布推出Sequel测序系统。Sequel系统保留了SMRT技术的优点,与现有的PacBio RS II系统相

罗氏联手PacBio打造NGS诊断产品

  美国Pacific Biosciences公司周三宣布与罗氏诊断签订一项协议,以PacBio的SMRT技术为基础开发诊断产品。包括前期、里程碑和供应付款在内,罗氏将向PacBio支付7500万美元。   罗氏选择了PacBio公司的SMRT技术   去年,罗氏曾向 Illumina发起收

PacBio单分子测序最新科研动态

DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域,并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计,2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿,按最近几年增长速度

地空学院毛竹教授当选美国矿物学会会士

  近日,美国矿物学会(Mineralogical Society of America, MSA)主席Mickey E. Gunter教授致信地空学院毛竹教授,祝贺她当选为美国矿物学会会士(MSA Fellow)。  美国矿物学会是全球最具影响力的地学学术组织之一,创立于1919年,今年正值美国矿

PacBio完成大型基因组测序项目

  什么叫PacBio技术应用到大型基因组测序项目中会大打折扣,在哪个环节大打折扣?提出这个问题的读者几乎都是抱有同样的心态,尽管大多数读者都基本认同了,如果为了得到Finishing Genome,那么PacBio无论技术和成本,理论上都是最低的,但即使这样,客观成本还是高的吓人,而假如将就D

PacBio助力感染菌株基因组重测序

  Andrew Kasarskis博士是Icahn基因中心遗传与基因组中心的副主任。他目前领导着一些专攻治疗和诊断的合作项目,而他自己的研究也主要在病原体检测,药物基因组学,睡眠与遗传的关系几个方面展开。在加入西奈山之前,他曾经就职于PacBio,Sage Bionetworks和Merck。他有

PacBio如何获得又长又准确的reads

  Pacific Biosciences公司近日以单分子环形一致性测序(CCS)为基础开发出一种方案,能够在Sequel测序平台上生成高度准确的长reads。这种方法有望克服短读长测序的读长不足以及长读长测序的准确性有限的问题。  这篇题为“Highly-accurate long-read se