微生物组测序分析的一大问题
BMC Biology杂志上的一项研究指出，许多已发表的微生物组研究其实受到了污染，错误的报告了来自于环境的杂菌。研究人员认为，在临床样本中检测到出人意料的细菌时，不应过早将其于疾病联系在一起。 我们机体内生活着不计其数的微生物，它们组成的生态系统就是微生物组。微生物组参与了许多重要的机体功能，比如消化食物、合成营养物质和抵御疾病。就算在微生物数量较少的机体区域，菌群改变也被认为与疾病的发展有关，比如肺部的慢性阻塞性肺病和哮喘。 日新月异的DNA测序技术推动了微生物组研究的快速发展。然而，Wellcome Trust Sanger研究所的科学家们发现，DNA提取试剂盒、化学试剂和实验室环境中的杂菌很容易造成污染，影响微生物组分析的结果。 研究人员发现，没有污染的话对照样本应该只有一种菌，但有时却出现了270种不同的细菌。与高生物量的样本相比（粪便样本），来自血液或肺部的低生物量样本尤其容易受到污染。 “现在的DNA测......阅读全文
空间转录组测序样本准备指南
一、外泌体研究热度持续攀升 外泌体（exosome）是活细胞分泌的30-200nm的囊泡，在电镜下具有非常明显单层膜结构，通常为茶托型或一侧凹陷的半球形。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体，经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体，
空间转录组测序样本准备指南
现有空间转录组研究平台是基于冰冻样本进行研究，所以在样本冻存前至少10分钟，将异戊烷和液氮浴准备好（之所以用异戊烷而不直接用液氮进行速冻，是因为液氮沸点比较低，直接液氮处理可能在沸腾过程中使组织周围形成空穴，导致不同区域降温不同步而改变内部形态，甚至组织碎裂）。然后用镊子或者刮刀将新鲜组织转移到异戊
空间转录组测序样本准备指南
现有空间转录组研究平台是基于冰冻样本进行研究，所以在样本冻存前至少10分钟，将异戊烷和液氮浴准备好（之所以用异戊烷而不直接用液氮进行速冻，是因为液氮沸点比较低，直接液氮处理可能在沸腾过程中使组织周围形成空穴，导致不同区域降温不同步而改变内部形态，甚至组织碎裂）。然后用镊子或者刮刀将新鲜组织转移到
代谢组学样本收集-答疑解惑
样本收集是代谢组学研究的第一步，是保障代谢组学研究结果可靠性的最重要的环节之一。根据不同的研究目的该选取何种生物样本？不同种类的生物样本的规范收集流程是什么？有哪些注意事项（抗凝剂、冻融、抑菌剂等使用细节）？如何保存生物样本？可保存多久等等？这些都是代谢组学实验中小伙伴经常咨询的问题，本文将针对
病原微生物样本的采集
传染病实验室诊断、传染源调查、自然疫源地监测、流行病学调查研究，都以检出特定的病原微生物或其相关物质为目的。这类样本来源主要是人和宿主动物、媒介昆虫，也包括水、土壤、食品等样本供调查传染源。1、病原微生物样本采集的一般注意事项1）针对性：不要求样品代表性，强调针对性，尽可能采集病原微生物含量最多的部
如何避免核酸检测的样本污染？
进行 PCR 反应时，遵照下列规则有助于防止 PCR 的污染。（1）PCR 的前处理和后处理在不同的房间或不同的隔离工作台上进行。即整个 PCR 操作要在不同的隔离区（标本处理区，PCR 扩增区，产物分析区）进行，特别是阳性对照需在另一个隔离环境中贮存、加入。（2）试剂要分装，每次取完试剂后盖紧
实验样本被污染如何处理？
(1)空气收集器未经质量验收,空气收集器的本底值较高,影响检测结果。如用于采集钠等金属元素的微孔滤膜中可能会含有微量的钠等金属,采样后,可能会出现样品空白的吸光度高于样品吸光度的现象,使得检测结果为负值。(2)空气收集器未清洗干净,使得样品空白值高于实验室空白。(3)采样过程不规范,导致样品空白值异
微生物污染的污染途径
微生物污染常见的是空气的微生物污染和水的微生物污染。空气虽然不是微生物产生和生长的自然环境,没有细菌和其他形式的微生物生长所需要的足够的水分和可利用的养料, 但由于人们的生产和生活活动使空气中可能存在某些微生物, 包括一些病原微生物如结核杆菌、白喉杆菌、金葡菌、流感病毒、麻疹病毒等,可成为空气传播疾
卫生指标微生物样本的采集
1、卫生指标微生物样本采集的一般注意事项1）代表性：采样量、采样部位应依据检样归属类别的标准要求执行，注意采用随机抽样法，并按批号抽样。2）均匀性：固体粉末样品应边取边混合；液体样品应振荡混匀；涂抹取样的棉拭子应将棉拭子尾部剪断，投入稀释液内充分振荡后，作为原液检样。3）及时性：为避免样品变质和样品
美公布禽流感样本被污染原因
美公布禽流感样本被污染原因 由于一位联邦科学家劳累过度并急着召开实验室会议，一个低致病性禽流感病毒样本不慎被高致病性H5N1禽流感病毒感染。这是近日美国疾病控制与预防中心（CDC）发布的内部报告得出的结论。 在3月发生的事故中，一个隶属于CDC的流感实验室将低致病性H9N2禽流感病毒