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氨基酸序列的测定方法

有两种方法,一是直接测序列法,常用Edman降解法,在弱碱性条件下多肽连N端氨基酸(阿尔发)与PITC反应,标记为苯氨基硫代甲酰蛋白质。肽链中的第一个肽键变弱,在无水酸的存在下发发生降解,第一个氨基酸(AA1)经过分子重排成为PTH-AA1结合层析技术即可确定氨基酸的性质。C端氨基酸残基分析,可用;羧基肽酶,肼解法;二是串联质谱测定多肽链氨基酸测序。氨基酸(amino acid):含有氨基和羧基的一类有机化合物的通称。生物功能大分子蛋白质的基本组成单位,是构成动物营养所需蛋白质的基本物质。是含有碱性氨基和酸性羧基的有机化合物。氨基连在α-碳上的为α-氨基酸。组成蛋白质的氨基酸均为α-氨基酸。......阅读全文

单抗药物的分子质量、氨基酸序列以及糖基化位点鉴定 三

经过 Protein Deconvolution 2.0 软件去卷积处理之后的单抗分子质量分布图(图 3),根据单抗的氨基酸序列理论分子质量进行计算,将观察到的质谱峰进行归属,可以初步推断该单抗药物存在多种形式的糖链结构,主要包括 G0、G0F、G1F 和 G2F,该结论与常见的单抗组成基本

ADC 单抗药物的分子量、氨基酸序列、糖基化位点以...(三)

经过 Protein Deconvolution 2.0 软件去卷积处理之后的单抗分子量分布图如下所示(图 4),根据单抗的氨基酸理论序列分子量进行计算,将观察到的质谱峰进行归属,从图中我们观察到,该 ADC 单抗分子之间存在 956 Da 左右的质量增加,由此推断该单抗分子结合了不同数目的

蛋白质预测分析资料大全

蛋白质预测分析:物理性质预测:Compute PI/MW http://expaxy.hcuge.ch/ch2d/pi-tool.html Peptidemass http://expaxy.hcuge.ch/sprot/peptide-mass.html T

蛋白质二级结构预测-人工神经网络方法

人工神经网络是一种复杂的信息处理模型。随着神经网络研究的兴起,科学家们也将神经网络用于生物信息学,其中包括二级结构的预测、蛋白质结构的分类、折叠方式的预测以及基因序列的分析等等。将神经网络用于二级结构预测的最早是由Qian和Sejnowskit提出的,他们受到神经网络在文字语言处理方面应用的启发,将

简并引物设计方法及原则

相关专题简并引物设计简并引物常用于从已知蛋白到相关核酸分子的研究及用于一组引物扩增一类分子。简并引物设计方法(1)利用NCBI搜索不同物种中同一目的基因的蛋白质或cDNA编码的氨基酸序列 因为密码子的关系,不同的核苷酸序列可能表达的氨基酸序列是相同的,所以氨基酸序列才是真正保守的。首先利用NCBI的

蛋白质结构预测(protein structure prediction)

一种生物体的基因组规定了所有构成该生物体的蛋白质,基因规定了组成蛋白质的氨基酸序列。虽然蛋白质由氨基酸的线性序列组成,但是,它们只有折叠成特定的空间构象才能具有相应的活性和相应的生物学功能。了解蛋白质的空间结构不仅有利于认识蛋白质的功能,也有利于认识蛋白质是如何执行其功能的。确定蛋白质的结构对于生物

长肽合成及难溶多肽合成技术

1. 长肽合成技术:在现代生物学研究中,经常会用到序列比较长的多肽,对于序列中含有60个以上氨基酸的多肽,通常会采用基因表达及SDS-PAGE法来获得,但是这种方法周期长,最终产物分离效果差等,使固相法长肽合成技术成为一种需要。肽谷生物经过长期的摸索与积累,对合成工艺及方法不断优化,解决了长肽合成难

有效增加难溶肽溶解度的3种方法

  多肽广泛应用于医药,材料,染料等多种领域,多肽的溶解性也是关系实验室实验成功与否的重要因素。   一般来说,多肽的溶解性通常与整条肽链的氨基酸序列密切相关,通常整体显酸性的多肽溶解困难时可以加入适量的碱性溶液,而显碱性的多肽溶解困难时可以加入适量的酸性溶液,序列中含有大量疏水性氨基酸或中性氨基

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多肽广泛应用于医药,材料,染料等多种领域,多肽的溶解性也是关系实验室实验成功与否的重要因素。一般来说,多肽的溶解性通常与整条肽链的氨基酸序列密切相关,通常整体显酸性的多肽溶解困难时可以加入适量的碱性溶液,而显碱性的多肽溶解困难时可以加入适量的酸性溶液,序列中含有大量疏水性氨基酸或中性氨基酸时,难于直

采用计算方法的组合式蛋白质设计策略实验

采用计算方法的组合式蛋白质设计策略             实验步骤 蛋白

采用计算方法的组合式蛋白质设计策略实验

实验步骤 蛋白质设计中的概率性方法是提供在一个特定的蛋白质结构中对某氨基酸(出现)在一指定位点的概率估计。这里,我们讨论几种估计这些概率的方法并将重点放在直接解出这些概率的基于熵的自洽公式。2.1 关联序列的比对蛋白质结构的序列可变性可用序列和结构数据库来探讨。已知折叠为非常相似结构的序列可以从蛋白

正粘病毒化学组成及其功能(二)

(6) 正粘病毒脂质层 由内、外两层构成,紧靠于内膜蛋白之外。脂质占病毒粒子总重量的20%~25%,使病毒对乙醚和其它脂溶剂敏感。HA和NA亚单位的疏水性末端即植入于这个脂质层内。流感病毒的脂质与副粘病毒相似,主要来自宿主细胞,由磷脂、胆固醇和三甘油脂组成,其中磷脂和胆固醇占95%以上。

采用计算方法的组合式蛋白质设计策略实验

计算方法一直在蛋白质设计中发挥重要作用。本工作主要集中在搜索蛋白质序列空间,以找到一条或数条与已知结构和功能相容的蛋白质序列。在期望的功能和结构限制下,概率性计算方法为所容许的氨基酸变化范围提供信息。本实验来源「现代蛋白质工程实验指南」〔德〕K.M.阿恩特、K.M.米勒编著。实验步骤蛋白质设计中的概

肽库合成技术及文库介绍

肽库是用于从大批量多肽中筛选极少量具关键生物活性的多肽的一种方法,在生物学和化学研究中,肽库是一种强大的筛选工具,在蛋白质组学及其相关领域应用范围非常广泛,如药物研发、蛋白-蛋白相互作用、抗原表位筛选、GPCR配体筛选、蛋白功能分析、酶底物或抑制剂筛选、信使分子研发及多肽/蛋白信号对答等。1. 截头

从礼来到基因泰克,60年蹉跎让你知道胰岛素有多难!

  如今,使用胰岛素治疗糖尿病已经十分普遍了,胰岛素携带方便,使用方便。但是,上世纪初,当胰岛素刚刚问世时,作为大分子药物,使得其从实验室到生产经历了一段比研发本身还要艰难的过程。60年的蹉跎终于换来了人源胰岛素!  在1922年初,胰岛素发现者们尽力地提高溶液中的胰岛素含量、减少杂质,但是归根结底

功能基因cDNA序列的分析

(一) cDNA序列的测定一.原理DNA 序列测定技术,目前主要是根据Sanger 等提出的酶法和Maxam和Gilber 提出的化学降解法,这两种方法的原理大致相同。这里主要介绍Sanger 的酶法——双脱氧链终止法。双脱氧链终止法是Sanger 等人于1977 年建立起来的。它是利用了2'

使用Skyline创建单克隆抗体的MRM方法

  在抗体药物的血药浓度定量分析中,使用配体结合的传统方法进行测定时,必须针对目标药物制备具有高度特异性和亲和性的检测抗体,并且确立分析方法也需要耗费大量的时间和费用。而使用LC/MS/MS进行分析,由于不需要制备抗体,不仅大幅度缩短了分析方法的创建时间,还可以降低成本。本文向您介绍使用S

蛋白质三级机构预测-同源模型化法-2

5、构建目标蛋白质的环区:在第2步的序列比对中,可能加入空位,这些区域常常对应于二级结构元素之间的环区,对于环区需要另外建立模型。一般也是采用经验性方法,从已知结构的蛋白质中寻找一个最优的环区,拷贝其结构数据。如果找不到相应的环区,则需要用其它方法。6、优化模型:通过上述过程为目标蛋白质U建立了一个

蛋白质组技术的研究进展

  大规模基因组测序计划的实施已改变生命科学的重心,在相当短的时期内,一些原核生物和某些低等真核生物的基因组序列已被测定. 1995年,流感嗜血杆菌基因组序列首次被破译,在此后不到两年的时间,近50个细菌的基因组序列已被完成. 然而,这仅仅是理解有机物功能的一个起点. 在基因组时代,许多DNA序列信

几种常用的蛋白鉴定方法

   传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达通常耗时、耗力,不适合高流通量的筛选。 目前,所选用的技术包括对于蛋白鉴定的图象分析、微量测序、进一步对肽片段进行鉴定的氨基酸组分分析和与质谱相关的技术。

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蛋白质组鉴定技术简述

如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE,那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定。在这里,我们不考虑传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达。并不是因为这些方法无效,而是因为它们通常耗时、耗力,不

几种常用的蛋白鉴定方法

几种常用的蛋白鉴定方法 传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的 comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达通常耗时、耗力,不适合高流通量的筛选。 目前,所选用的技术包括对于蛋白鉴定的图象分析、微量测序、进一步对肽片段进行鉴定的氨基

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传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达通常耗时、耗力,不适合高流通量的筛选。 目前,所选用的技术包括对于蛋白鉴定的图象分析、微量测序、进一步对肽片段进行鉴定的氨基酸组分分析和与质谱相关的技术。1 &nb

蛋白质组鉴定技术

如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE,那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里,我们不考虑传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效,而是因为它们通常耗时

蛋白质组鉴定技术

 如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE,那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里,我们不考虑传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效,而是因为它们通常耗时

几种常用的蛋白鉴定方法

 传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达通常耗时、耗力,不适合高流通量的筛选。 目前,所选用的技术包括对于蛋白鉴定的图象分析、微量测序、进一步对肽片段进行鉴定的氨基酸组分分析和与质谱相关的技术

四种蛋白鉴定分析方法

传统的蛋白鉴定方法,色谱柱如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达通常耗时、耗力,不适合高流通量的筛选。 目前,所选用的技术包括对于蛋白鉴定的图象分析、微量测序、进一步对肽片段进行鉴定的氨基酸组分分析和与质谱相关的技术。1&nb

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