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PCR引物设计知识与技巧分析

PCR引物设计知识与技巧分析自从1985年Mullis等发明了具有划时代意义的聚合酶链式反应(PCP) 以来,PCR已经成为了分子生物学领域zui基本也是zui重要的技术手段之一。然而能否找到一对合适的核苷酸片段作为引物,使其有效地扩增模板DNA序列,无疑决定着PCR的成败。现在动物遗传育种早已进入了分子时代,在基因水平寻求影响动物遗传表型的新基因突显重要,因此引物设计无疑又成为了寻找新基因的重中之重。1 引物的设计以及初步筛选引物的设计与初步筛选基本上通过一些分子生物学软件和相关来完成的, 目前运用软件Primer Premier 5 或美国 whitehead 生物医学研究所基因组研究中心在因特网上提供的一款免费在线PCR引物设计程序 Primer 3来设计引物,再用软件Oligo 6进行引物评估,就可以初步获得一组比较满意的引物。但是对于初学者来说,运用软件和程序来设计引物好象无从着手,其实只要我们掌握了引物设计的基本原则......阅读全文

RT-PCR实验方法大全

RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求:1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不会出太大问题。 3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单

PCR引物设计及软件使用技巧

PCR引物设计及软件使用技巧张新宇,朱有康,高燕宁(中国协和医科大学中国医学科学院肿瘤研究所,北京100021)摘要:本文旨在介绍使用软件设计PCR引物的技巧。在PCR引物设计原则的基础上,详细介绍了两种常用引物设计软件的基本使用方法,并对其各自的优缺点进行了比较。一般性引物自动搜索可采用“Prem

RT-PCR实验方法总结大全

生物谷: RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求:1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不会出太大问题。 3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存

质粒提取的小技巧

  实验室里经常听到这样的抱怨:实验没做好,实验没结果,心情郁闷。但其实静下心来查找原因,往往是由于操作上面的不认真,或是一些小小的细节没有注意到,以下是10个实验室日常小技巧。   主题:   关于质粒提取的小技巧   内容:   现在用质粒提取试剂盒非常方便,而且菌体培

RT-PCR实验方法总结大全

生物谷: RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。要求:1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不会出太大问题。3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单改变

常用生物软件(windows)全面介绍

常用生物软件(windows)全面介绍一、基因芯片1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件,不仅可以进行图像分析,还可以进行数据处理,方便protocol的管理功能强大,商业版正式版:6900美元。 Arraypro 4.0

分子标记

内容:一、遗传标记 二、DNA分子标记 三、染色体原位杂交 四、DNA分子标记的应用 长期以来,植物育种中选择都是基于植株的表型性状进行的,当性状的遗传基础较为简单或即使较为复杂但表现加性基因遗传效应时,表型选择是有效的。但水稻的许多重要农艺性状为数量性状,如

Real-time qPCR手册---手把手教你从菜鸟到高手

3.3 SYBR@Green 法SYBR@Green I是一种结合于小沟中的双链DNA结合染料,与双链DNA结合后,其荧光大大增强。这一性质使其用于扩增产物的检测非常理想。SYBR@Green I 的最大吸收波长约为497nm,发射波长最大约为520nm。在PCR反应体系中,加入过量SYBR@Gre

RT-PCR实验方法总结(1)

RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求: 1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不会出太大问题。 3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA

整理的PCR资料.供大家分享.

PCR实验技巧增加PCR的特异性:1. prime理想的,只同目的序列两侧的单一序列而非其他序列退火的引物要符合下面的 一些条件a. 足够长,18-24bp,以保证特异性.当然不是说越长越好,太长的引物同样会降低特异性,并且降低产量b. GC% 40%~~~~60%c. 5'端和中间序列要多

PCR引物设计技巧

自从1985年美国PE—Cetus公司的人类遗传研究室 Mullis等发明了具有划时代意义的聚合酶链反应(PCP0 以来,PCR已经成为了分子生物学领域zui基本也是zui重要的技术手段之-[ I。然而能否找到一对合适的核苷酸片段作为引物,使其有效地扩增模板DNA序列,无疑决定着PCR的成败。现在动

PCR引物设计技巧

自从1985年美国PE—Cetus公司的人类遗传研究室 Mullis等发明了具有划时代意义的聚合酶链反应(PCP0 以来,PCR已经成为了分子生物学领域最基本也是最重要的技术手段之-[ I。然而能否找到一对合适的核苷酸片段作为引物,使其有效地扩增模板DNA序列,无疑决定着PCR的成败。现在动物遗传育

PCR技术(十五):个体配子DNA序列的PCR分析

高等生物遗传图谱的构建依赖于选择性杂交后代的分析或者通过家系分析法来计 算连锁关系。对人类而言仅后者是可行的。使用长度多态性限制片段(RFLPS)在构 建人连锁图谱方面已取得长足的进步。为了对带有与已知表现型相关的RFLP标记的基 因进行定位,首先得建立间隔约10CM的遗传标记束(平均1CM等于1%

攻克多重PCR之难(上篇)

  多重PCR能够在提高通量的同时节省样品降低成本,它需要耗费更多的时间和精力,同时也会给用户回报更丰富的数据。本文介绍了一些实验技巧和商业化工具,希望能帮您轻松获得好结果。   PCR 的重要性毋庸赘述,这一诺贝尔获奖技术的普及带动了现代基因组学、鉴定技术、医疗诊断等领域的发展。如今,PCR

labonchip对PCR的一些个人体会

PCR应该是分子生物学的基本,记得刚进实验室时,大家的口头禅就是:今天你P了吗?那怎样才能做好PCR,结合个人体会,我谈谈自己的看法。论坛里高人很多,说得不对的还请多多指教和包含。当然,若能给新人朋友们带去一些帮助,那我本贴的目的就算是达到了。PCR设计的一般套路1) 目的基因或目的基因片段对象是什

2017年暑假生物医学大型仪器理论与实验技术培训班

(二轮通知 2017年7月10~19日,北京)  中国医学科学院基础医学研究所∕北京协和医学院基础学院在医学领域具有国内一流的影响力和知名度,以尖端的医学研究及出色的理论和实验教学成为著名的医学科学研究与教育基地。为了培养生物医学领域创新人才,现推出一年一度的,以尖端仪器和实战训练为特色的“大型仪器

染色质免疫沉淀技术的应用

随着人类基因组测序工作的基本完成,功能基因组学逐渐成为研究的热点。而基因表达的调控又是功能基因组学的一个重要研究领域,要想提供蛋白因子直接调控的证据,需要直接检测蛋白质-DNA的相互作用,而染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)就是一种研

端粒酶活性检测操作必知

近几年来端粒酶由于与长寿、癌症等的研究相关联而备受关注,而端粒酶活性检测具体方法又有那些呢?小编整理了端粒酶活性检测的原理、基本操作技巧 、结果判断、扩增片段检测等方面内容,以飨读者。端粒酶 (Telomerase)是由RNA和蛋白质组成的一种核糖核蛋白酶。人端粒酶RNA组分(hTR)于1995年被

利用现有技术,如何鉴定一个全新的病毒

80年代的技术很经典,但那时分子生物学不够发达,现在方法有无进步呢?如何利用现在的技术来鉴定全新的病毒呢?有此想法很久了,可一直未搞清楚。这也跟如何发现一个新基因的道理是相通的。这是真正创新的基础。网友alishang:我先来最简单的:      1

别人家的实验室:植物园里的逆境生物学研究中心

  ——走进上海中科院植物逆境生物学研究中心   分析测试百科网讯 中国科学院上海植物逆境生物学研究中心坐落于风景优美的上海辰山植物园内,由中央“千人计划”顶尖人才、美国科学院院士朱健康教授领衔,是在中国科学院、上海市和国家有关部委联合支持下,依托中国科学院上海生命科学研究院研究平台,与上

RT-PCR原理与实验技术

一、知识背景:1. 基因表达:DNA——RNA——Protein单拷贝基因表达存在逐步放大机制,如一个蚕丝心蛋白基因——104个丝心蛋白mRNA(每个mRNA存活4d,可以合成105个丝心蛋白)——共合成109个丝心蛋白 。因此单拷贝基因的mRNA表达水平对于其功能水平的调控是非常重要的。2.&nb

TRAP法端粒酶活性检测实验操作方法及疑难解答

Kim应当不会预测到,他在1994年发明的TRAP会那么受欢迎,被一代又一代的研究者奉为端粒酶 活性检测首选方法。不过,TRAP法虽然灵敏度高,却同样存在瑕疵。下面为大家介绍的是根据TRAP法适当改良的研究专用试剂盒具体情况和使用方法以及常见问题解答。本品与通常的端粒 酶活性测定法相比较,具有以下特

如何做好荧光定量PCR实验

荧光定量PCR实验指南一、基本步骤:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;4、反应体系的配制;5、反应条件的设定;6、反应体系和条件的优化;7、荧光曲线和数据分析;8、标准品的制备;二、技术关键:1、 目的基因(DNA和mRNA)的查找和比

PCR技术 PCR技术的应用

一滴残留在裙子上的精液使得美国总统Bill Clinton不得不坦承他与白宫实习生有不正当的关系。因为他知道现在的生物科技就连一个精子也能被用来做为证据。这种将极微量的生物标本化为可供鉴定的现代技术正是PCR(Polymerase chain reaction)--聚合

实时荧光Taqman 探针设计的几个要点

实验室很多同学都要做Real time PCR实验,实验室的师兄师姐都会有很多宝贵意见,不过也有实验室前没有做过的,查找了下资料和大家分享下关于实时荧光 Taqman 探针设计、实时荧光PCR探针的选择、引物的设计及评价。荧光探针法是用序列特异的荧光标记探针来检测产物,探针法的出现使得定量

PCR引物设计及评价实验

实验方法原理聚合梅链式反应(polymerase chain reaction)即PCR技术,是一种在体外快速扩增特定基因或DNA 序列的方法,故又称基因的体外扩增法。PCR技术已成为分子生物学研究中使用最多,最广泛的手段之一,而引物设计是PCR技术中至关重要的一环,使用不合适的PCR引物容易导致实

PCR引物设计及评价实验

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PCR引物设计及评价

【实验目的】1、掌握引物设计的基本要求,并熟悉使用Primer premier5.0软件进行引物搜索。2、掌握使用软件oligo6.0对设计的引物进行评价分析。【实验原理】一、引物设计原则聚合梅链式反应(polymerase chain reaction)即PCR技术,是一种在体外快速扩增特定基因或

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特异性位点的DNA甲基化的检测方法

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