MRMProteomics同Biodesix合作开发蛋白质组肺癌精准诊断法
蛋白质组学领头公司MRM Proteomics和分子诊断公司Biodesix于近期签署了一项合作协议。根据协议条款，MRM Proteomics将授予Biodesix使用其专有iMALDI技术的权利，以进一步推进其基于血液的肺癌诊断。在此之前，Biodesix的测试菜单包括GeneStrat®基因组测试，旨在测量非小细胞肺癌（NSCLC）的可操作突变； 还有VeriStrat®，一种用于肺癌的蛋白质组学测试，旨在提供独立于治疗选择（包括免疫疗法）的客观预后信息。这两项测试都是Biodesix Lung Reflex测试套件的一部分，测试过程为72小时，用于支持治疗决策。去年一项研究显示VeriStrat对NSCLC患者的预后价值还包括BDX-XL2技术，这是去年Biodesix收购BDX-XL2后获得的新技术。BDX-XL2这是一种基于血液的检测方法，旨在通过将血浆蛋白与肺癌相关的临床危险因素相结合，识别可能有良性肺结节的中低风......阅读全文
MRM－Proteomics同Biodesix合作开发蛋白质组肺癌精准诊断法
蛋白质组学领头公司MRM Proteomics和分子诊断公司Biodesix于近期签署了一项合作协议。根据协议条款，MRM Proteomics将授予Biodesix使用其专有iMALDI技术的权利，以进一步推进其基于血液的肺癌诊断。在此之前，Biodesix的测试菜单包括GeneStrat®基因组
MRM－Proteomics与仪器巨头合作，目标直指这个领域
MRM Proteomics和安捷伦科技公司周四表示，他们已经就定量蛋白质组学工具达成了联合营销协议。 该合作伙伴关系将涵盖总部位于加利福尼亚州圣克拉拉的安捷伦质谱产品和总部位于蒙特利尔的 MRM 蛋白质和代谢物定量试剂盒。 MRM 将专门为与 Evosep One HPLC 系统联用的安捷
PNNL发表开源蛋白质组学软件InformedProteomics
分析测试百科网讯 一则消息可能对蛋白组学研究者们最头痛的事有一定的缓解。美国一机构介绍了一款用于分析鉴定完整蛋白质的新型开源软件。 ProMex中的LS-MS特征查找，该功能是Informed-Proteomics软件套件的第一个组件的特征检测算法。 它被开发用于检测完整蛋白质离子的同位素包膜
毅新博创与Biodesix达成合作，精准医学更进一步
分析测试百科网讯 近日，美国 Biodesix公司宣布和北京毅新博创生物科技有限公司（Bioyong Technology Company Ltd.）达成全面战略合作协议，Bioyong将开发和商业化Biodesix的VeriStrat多肽组质谱检测，用于非小细胞肺癌（NSCLC）患者的精确医学
蛋白质组学几种定量方法的案例解读（三）
经典案例题目：Proteome-wide Mapping of Cholesterol-Interacting Proteins in Mammalian Cells（采用甾醇探针结合SILAC定量技术在哺乳动物细胞中分析胆固醇-蛋白质相互作用）期刊：Nat Methods主要技术：SILAC定量文
AB－SCIEX欢迎蛋白质组学者们参加第10届HUPO会议的技术交流会
第10届HUPO会议将在2011年9月4-7日于瑞士日内瓦举行，届时，AB SCIEX公司将举办技术讲座交流会。欢迎来自中国和全球各地的科学工作者们注册：Register for our workshopsSeptember 4, 2011 -
蛋白质组学前沿－|－基于QTRAP－MRM³的微量唾液中外泌体磷酸化蛋白质定量分析
概述近日，东南大学生物科学与医学工程学院顾忠泽教授及陶纬国教授课题组在微量唾液细胞外囊泡（EVs）磷酸化蛋白的定量分析研究方面取得新进展，利用多级质谱（MRM3）技术对口腔癌患者唾液中的外泌体磷酸化蛋白进行定量分析，相关成果以“Targeted phosphoproteomics of Human
Protocol－for－Protein－Extraction－for－proteomics
Protocol for Protein Extraction10 % w/v TCA/ acetone/ 0.07 % v/v -MercaptoethanolPlant cells are rich in compounds that interfere with the 2DE separat
定量蛋白质组学的诞生
在现代研究技术，如荧光显微镜，流式细胞仪和蛋白质芯片技术中，抗体仍然扮演着非常重要的角色。但依赖于抗体的蛋白质检测存在一些缺点，其中最大的限制就是，抗体的可用性和质量差别很大。一些大规模项目，比如人类蛋白质图谱（Human Protein Atlas），Antibodypedia，以及美国NIH
Ruedi小组用QTRAP开发出全球首个定量蛋白质组数据库
苏黎世理工学院借助AB SCIEX的QTRAP技术研发成功全球首个蛋白质组学MRM Atlas 基于质谱的在线数据库加速蛋白质分析 福斯特市，加利福尼亚—2010年10月4日，生命科学分析技术的全球领导者AB SCIEX公司，今天宣布瑞士联邦理工学院(苏黎世理工学院，ETH)与西雅
非小细胞肺癌NCCN指南更新：新增血清学蛋白质测试
美国NCCN（National Comprehensive Cancer Network）在近期更新的非小细胞肺癌指南中，推荐EGFR野生型和EGFR状态未知的非小细胞肺癌患者在接受二线治疗之前使用Biodesix公司的VeriStrat测试从而判断是否应该使用厄洛替尼。 VeriStrat是
PROTEOMICS：OGalNAc糖基化修饰蛋白质的系统发现
近日，上海交通大学系统生物医学研究院张延课题组在国际知名蛋白质组学研究期刊PROTEOMICS上发表题为《Systematic identification of the protein substrates of UDP-GalNAc: polypeptide N-acetylgalactos
什么是MRM模式
正离子模式：[m+h]+、[m+nh4]+、[m+na]+、[m+k]+、[2m+h]+等，负离子模式：[m-h]-、[2m-h]-、[m+b]-（b是酸根离子）等。负离子模式下也可以用甲酸或乙酸，流动相不用换。
蛋白质组学几种定量方法的案例解读
上期分享的蛋白组学内容，是不是有些小伙伴还绕在云里雾里呀？这次，小编用实例说话，帮您梳理清楚。 一、Label-free定量 Label-free定量，顾名思义就是不需要对比较样本做特定标记处理，只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化
蛋白质组和蛋白质组学分析
随着人类基因 组计划研究成果的公布，人们对基因的认识逐渐清晰，但基因数量的有限性和基因结构的相对稳定性，与生命现象的复杂性和多样性之间存在巨大反差。如何了解众多的基因与危害人类身心健康的疾病之间的关系，对生命科学研究者来说仍是一项长期而艰巨的任务。因此，作为生命活动的直接承担者――蛋白质，成为后基
2010年“蛋白质组学与疾病”专题研讨会日程
2010年“蛋白质组学与疾病”专题研讨会 Symposium on Proteomics and Disease 2010 时间：2010年9月15-17日 地点：上海新国际博览中心W2馆W2-M9会议室 主办单位：中国生物化学与分子生物学
MIDASTM确证Biomarker（二）
鉴定过程共进行两次实验，约30多种蛋白质被鉴定出来，已鉴定的蛋白质如表1所示，其中红色标注的蛋白又通过MIDASTM确认。两次实验结果相比较，重叠率低于75%。许多在第一次实验中被鉴定但可信度较低的蛋白质，第二次实验中并未产生更多的MS/MS图谱，没被再次鉴定出来，增加了鉴定与验证确认的难度。
蛋白质组与蛋白质组学简介2
3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合，然后将DNA从被修饰的碱基处切割，电泳分离，结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰，不能切断，可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白
蛋白质组与蛋白质组学简介1
一、蛋白质组概念：一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表
肺癌蛋白质致命弱点发现
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519431.shtm 图为突变型表皮生长因子受体（EGFR）中的界面对于EGFR驱动的肿瘤生长至关重要。图片来源：扬尼斯·加尔加达斯，日内瓦大学肺癌是全球死亡率最高的恶性肿瘤。其中非小细胞肺癌（N
蛋白质组，蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然，不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
蛋白质组，蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然，不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
生物标志物之于肿瘤转化医学的意义
生物标志物之于肿瘤转化医学的意义：从筛选、确证走向临床应用医学是否能够有效的治疗及治愈癌症直接取决于是否能够在癌症早期阶段对其进行及时的检测。生物标志物作为最直接快速有效的诊断手段，其筛选与获得可在肿瘤诊断、发展、治疗、以及疗效监测等多个方面发挥重要的作用。因此，自该概念的提出，就受到了极大的关注，
强强联合（脂质组+DIA），IF>10（一）
脂质组学技术 相比其他组学技术，脂质组学技术发展较晚，新颖性高，仅仅只是纯数据分析也可以发表在不错的期刊上。如果希望研究得更高深入，可以往下游脂质功能或者往上游的蛋白或基因出发研究脂代谢调控机制。DIA技术 新一代、革命性的蛋白质组技术DIA,相比传统的蛋白质组技术（shotgun，Label fr
QTRAP代表文献回顾
生物分子发表的代表性文献 QTRAP：同时具有三重四极杆和线性离子阱性能的独一无二的LC/MS/MS系统 QTRAP系统最早在ASMS 2002上，作为第一台商用的线性离子阱发布，是世界上唯一的线性离子阱和三重四极杆的复合串联液质联用系统。QTRAP具有独一无二的能力，可以运行蛋白
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时
蛋白质组是什么
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一个基因组(genOME)，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变. 在转录时，一个基因可以多种mRNA形式剪接，一个蛋白质组不是一个
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时、耗
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时、耗力，不
蛋白质组是什么
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一个基因组(genOME)，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变. 在转录时，一个基因可以多种mRNA形式剪接，一个蛋白质组不是一个