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SNP的检测方法(直接测序法与PCRSSCP)

人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)。SNP通常是一种二等位基因的(biallelic),即二态的遗传变异,SNP的数量大、分布广,在组成人类基因组的30亿个碱基中,平均每1000个就有一个SNP。SNP作为第三代遗传标记,在复杂疾病的基因定位、关联分析、个体疾病易感性分析与药物基因组学的研究中发挥着愈来愈重要的作用。1.直接测序法进行SNP分析在所有SNP的检测方法中,对欲检测片段进行直接扩增、测序是最为准确的方法。通常情况下,纯合型SNP位点的测序峰为单一峰型,而杂合型SNP位点的测序峰为套峰,因而很容易将其区分开来。通过直接测序方法进行SNP检测的检出率接近100%。2. PCR-SSCP方法单链构象多态性分析(single-strand conformation polym......阅读全文

SNP的检测方法(直接测序法与PCR-SSCP)

人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)。SNP通常是一种二等位基因的(biallelic),即二态的遗传变异,SNP的数量大、分布广,在组成人类基因组的

PCR-SSCP

一.  样品的制备1. 设计引物。用Oliga6.0对目的基因进行分析,设定引物,引物长度18-21个碱基,扩增片段以200-300bp最为合适。2. PCR扩增并检测。根据不同的引物挑选适合的退火温度进行PCR扩增。扩增产物用2-2.5%的琼脂糖胶跑水平电泳检测,上样量3-5ul。PCR

HLA基因分型方法:PCR-SSCP法

PCR-SSCP法1)提取DNA同前RFLP法 2)PCR扩增同前PCR-RFLP,也可加入1μCi32P-dCTP标记产物。 3)非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳1.取PCR的扩增产物,加凝胶加样液3μl,95℃加热变性2min,冰浴骤冷。同位素掺入的DNA取1μl稀释10倍,加样3μ

PCR-SSCP技术检测细菌

16SrRNA基因以快速鉴定细菌陶洪群1 李向阳1 杨雷2 杨锦江11.温州医学院附属第二医院检验科? 3250272.温州医学院分子生物实验中心? 325027  长期以来,临床上主要用细菌培养和血清学方法检测病原菌,但均不能达到快速诊断细菌感染的目的。常规PCR技术采用针对特定病原菌的特异性引物

PCR-SSCP技术检测细菌

长期以来,临床上主要用细菌培养和血清学方法检测病原菌,但均不能达到快速诊断细菌感染的目的。常规PCR技术采用针对特定病原菌的特异性引物,由于临床病原菌往往不明,需用多种不同引物和扩增程序进行PCR扩增,亦难实现快速诊断。PCR-SSCP技术主要用于基因突变的检测,利用该技术鉴定细菌虽有报道[1,2,

PCR-SSCP技术检测细菌

长期以来,临床上主要用细菌培养和血清学方法检测病原菌,但均不能达到快速诊断细菌感染的目的。常规PCR技术采用针对特定病原菌的特异性引物,由于临床病原菌往往不明,需用多种不同引物和扩增程序进行PCR扩增,亦难实现快速诊断。PCR-SSCP技术主要用于基因突变的检测,利用该技术鉴定细菌虽有报道[1,2,

PCR-SSCP、 RTPCR-SSCP 区别

仅仅是扩增的方法不同而已,一个是普通的PCR,一个是RTPCR.如果需要鉴定染色体的DNA序列有无差别或基因突变,可以用PCR-SSCP,我曾做过这方面的实验,检测病人有无基因的点突变,同时扩增病人和正常人的基因片段,然后做sscp,只要有一个核苷酸的区别,变性SDS-PAGE后,条带就会有很大的区

PCR-SSCP、 RTPCR-SSCP 区别

仅仅是扩增的方法不同而已,一个是普通的PCR,一个是RTPCR.如果需要鉴定染色体的DNA序列有无差别或基因突变,可以用PCR-SSCP,我曾做过这方面的实验,检测病人有无基因的点突变,同时扩增病人和正常人的基因片段,然后做sscp,只要有一个核苷酸的区别,变性SDS-PAGE后,条带就会有很大的区

PCR-SSCP 技术实验

聚合酶链式反应-单链构象多态(Polymerase Chain Reaction-Single Strand Conformation Polymorphism,PCR-SSCP)技术可用于:(1)癌基因和抑癌基因突变的筛查检测;(2)遗传病的致病基因分析;(3)基因诊断,基因制图等领域。实验方法原

PCR-SSCP 技术实验

            实验方法原理 PCR-SSCP技术的基本原理是PCR扩增后的DNA片段经变性成单链DNA,单链DNA在中性聚丙烯酰胺凝胶中电泳时形成不同的立体构象,其构象直接影响泳动速率,相同长度的