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Thescientist:近期最受关注的基因组测序TOP5

The scientist杂志集中盘点了近期最受关注的一些基因组测序成果,包括山地大猩猩、绿脓杆菌、金丝雀等。 种属:山地大猩猩(Mountain gorilla) 获得东部大猩猩的一个亚种群——山地大猩猩的第一个全基因组序列,揭示出在10万年的时间里这一种群一直在衰退,因此导致了有限的遗传多样性和已知最高的灵长类动物近亲繁殖率,这项重要的研究发布在4月9日的Science杂志上。 一个国际科学家小组对7只山地大猩猩和6只东部低地金刚猩猩(eastern lowland gorillas)进行了基因组测序,将它们与2万年前与东部大猩猩分离的另一大猩猩物种——西部大猩猩的基因组进行了比较。研究人员发现13.8%的西部低地大猩猩的基因组在两套染色体上包含有相同的等位基因,34.5%的山地大猩猩基因组和38.4%的东部低地大猩猩基因组也是如此,表明了存在近亲繁殖。相比之下,父母是嫡亲堂(表)兄妹的人类只有11%的基因组中具有......阅读全文

1月27日《自然》杂志精选

封面故事:东南亚猩猩基因组完成测序  东南亚类人猿或猩猩的基因组已完成测序——具体来说,所获得的是一个苏门答腊雌性个体的基因组初稿以及来自另外5个苏门答腊猩猩和5个婆罗洲猩猩(分别是Pongo abelii和Pongo pygmaeus)的短序列数据。测序分析表明,婆罗洲—苏门答腊全

1月27日《自然》杂志内容精选

 杂志封面  封面故事:东南亚猩猩基因组完成测序  东南亚类人猿或猩猩的基因组已完成测序——具体来说,所获得的是一个苏门答腊雌性个体的基因组初稿以及来自另外5个苏门答腊猩猩和5个婆罗洲猩猩(分别是Pongo abelii和Pongo pygmaeus)的短序列数据。测序分析表明,婆罗

基因测序仪的应用领域有哪些

     导读:您是不是真有尼古丁依赖?您是不是适合饮酒的人群?您需要吃什么样的东西才能有效减肥?基因测序后便可明了。随着基因测序价格的持续走低,基因测序的应用也变得越来越广泛:防治疾病、亲子鉴定、个体化减肥、追溯物种进化史、农作物选育……让我们一一来看!DN

Science:抵抗病原体的通用遗传学策略

  平衡选择(balancing selection)能够在种群中维持遗传学多样性,而不是仅选择一个最有利的基因型。芝加哥大学和牛津大学的科学家对人类和猩猩进行了全基因组分析,找到了进化过程中平衡选择的新实例。他们发现,在至少六个基因组区域中,人类和猩猩共享着同样的基因突变组合。文章发表在二月十

科学家绘制高精度类人猿基因组图谱

一个国际科研团队宣布,他们新近绘制出红毛猩猩和黑猩猩这两种类人猿的高精度基因组图谱。与过去类似研究不同的是,这次没有参照人类基因组图谱,因此更准确地揭示了人类与类人猿的基因差异。 利用第三代基因测序技术和先进的拼接方法,美国华盛顿大学等机构研究人员绘制出的这个高精度基因组图谱,对人与类人猿基因组

基因测序仪的应用领域有哪些

         导读:您是不是真有尼古丁依赖?您是不是适合饮酒的人群?您需要吃什么样的东西才能有效减肥?基因测序后便可明了。随着基因测序价格的持续走低,基因测序的应用也变得越来越广泛:防治疾病、亲子鉴定、个体化减肥、追溯物种进化史、农作物

基因测序仪的应用领域有哪些

基因测序仪的应用领域有哪些导读:您是不是真有尼古丁依赖?您是不是适合饮酒的人群?您需要吃什么样的东西才能有效减肥?基因测序后便可明了。随着基因测序价格的持续走低,基因测序的应用也变得越来越广泛:防治疾病、亲子鉴定、个体化减肥、追溯物种进化史、农作物选育……让我们一一来看!DNA测序技术在分子生物学研

Science年度突破发布,看看都是哪些技术上了热榜~

  1、原子水平的生命(Life at the atomic level)  冷冻电镜技术获得2017年诺贝尔化学奖,其影响自不必多说。  同时,生物探索特推出专题《冷冻电镜新晋诺奖,想进一步了解就来看这个专题》,详细介绍冷冻电镜是如何被开发出来的,其发展历程上的里程碑事件以及冷冻电镜在中国的发展,

灵长类动物结构变异的机制

  2013年度基因组生物学大会(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美国纽约冷泉港实验室召开。这是基因组学领域最大的会议之一,吸引了多个著名研究所的大牛参加。会议主题包括高通量基因组学和遗传学、复杂性状的遗传学、功能和癌症基因组学、计算基因组学、进化基因组学以

盘点:2012年顶尖基因组研究

  基因组研究是一门新兴的、发展迅速的生命科学,其普遍应用及向其他学科、领域的不断渗透日趋明显,这些学科涵盖了现代农业、生物能源、生态环境和人类健康等各个方面。随着测序成本的下降,基因组研究成果也呈现井喷之势。近日The Scientist对2012年最突出的基因组研究进行了盘点……   1.

顶级实验室"垃圾"DNA是宝

   一类(Non-coding)的DNA分子(不表达质),曾经被认为是“垃圾”的DNA目前正成为遗传研究的新热点,“垃圾”DNA的真实含义早已变更,它仅仅是一个历史遗留的名称,实际上,“垃圾”DNA具有无与伦比的表达调控功能,2所顶级学府的2个独立团队在Science上发表关于

2顶级实验室《Science》“垃圾”DNA是宝

  一类非编码(Non-coding)的DNA分子(不表达蛋白质),曾经被认为是“垃圾”的DNA目前正成为遗传研究的新热点,“垃圾”DNA的真实含义早已变更,它仅仅是一个历史遗留的名称,实际上,“垃圾”DNA具有无与伦比的表达调控功能,2所顶级学府的2个独立团队在Science上发表关于垃圾DNA的

Nature子刊:四十年前旧假说获得新证

  大约四到六百万年前,人类与黑猩猩从进化树上分支开来。科学家们认为,基因调控序列的突变,在这一进化过程中起主要作用。现在,康奈尔大学的一项新研究,为这一理论提供了进一步的证据,文章发表在Nature Genetics杂志上。   人类和黑猩猩的蛋白差异很小,相似度超过99%。大约四十年前,科

科学家开发比较基因组学进化分析新方法

  比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据,解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一,如PAML等方法,都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展,众多物种的基因组

科学家开发比较基因组学进化分析新方法

  比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据,解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一,如PAML等方法,都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展,众多物种的基因组

2018最受关注的8篇文章 | Cell Press旗下生命科学类期刊

  历经40多年的发展,Cell Press 一直是生命科学领域的出版先锋,辞旧迎新之际,出版社的编辑们选出了Cell Press旗下生命科学科学类期刊2018年“最受关注(most talked about)”的8篇文章,这些文章涉及到同性生殖、婆罗洲猩猩生存调查、饮食与健康、神经传导、大象基因组

调控玉米性状 可变剪接“火”起来

  可变剪接,这个早在上世纪就被提出的概念,在近几年的研究中,又“火”了起来。科学家们发现,可变剪接不仅丰富蛋白质组多样性,还在生物体内起着重要的调控作用。  可变剪接是什么?这项研究有了什么新发现?是怎样得出来的?实验中的难点是什么?对之后的研究有怎样的借鉴意义?科技日报就此采访了该研究团队。  

调控玉米性状 可变剪接“火”起来

  最近,中国农业大学国家玉米改良中心田丰教授团队与杨小红教授团队合作研究,以368份玉米自交系未成熟籽粒为实验材料,定位玉米种全基因组水平QTL(数量性状位点),全面解析了其可变剪接的调控机制,并为研究表型变异提供了重要线索。相关论文近日发表在《植物细胞》杂志上。   可变剪接,这个早在上世纪就

基因检测背后的哲学审视

   切过乳腺的安吉丽娜·朱莉。  1. 在分子层面上为生命提供“说明书”  人类历史的进步,并不总是直线上升的,而是呈现一种“间断平衡”的状态。意思是,人类社会在很长时间内可能会一直进步缓慢,但突然会在某一个时期跳上一个台阶。从生命科学的领域来看,最近的两次飞跃,一个是人类解剖学的发展,而这一次靠

基因检测背后的哲学审视

  1. 在分子层面上为生命提供“说明书”   人类历史的进步,并不总是直线上升的,而是呈现一种“间断平衡”的状态。意思是,人类社会在很长时间内可能会一直进步缓慢,但突然会在某一个时期跳上一个台阶。从生命科学的领域来看,最近的两次飞跃,一个是人类解剖学的发展,而这一次靠的便是基因组。   基因组

《科学》:基因调节驱动进化

耶鲁大学的研究人员发表在8月10日的《科学》杂志上的文章显示,他们通过采用新方法分析基因启动子序列变异,而且对基因调节推动进化分歧有了新的了解。 之前完成的基因组测序工作显示,人类和黑猩猩的蛋白质编码基因有99%是相同的。目前生物学家面临的挑战是解释导致人和猩猩之间明显差异的原因。通常认为,如果

Nature重要论文:阐析生物学“暗物质”

  在我们的基因组中有一些基因并不编码蛋白质,而是生成长链非编码RNA。近日来自瑞士洛桑大学、洛桑联邦理工学院(EPFL)和瑞士生物信息学研究所(SIB -SIB)的生物学家们,研究了这些知之甚少的基因类型的功能。发现其中一些基因历经进化过程保存下来,存在于从人类到青蛙等11个物种之中。研究结果

Science:基因组测序或将颠覆近亲繁殖

  山地大猩猩是一种广泛近亲繁殖而且濒临灭绝的动物。日前,科学家们首次完成了山地大猩猩的全基因组测序,并将结果发表在四月九日的Science杂志上。这项研究不仅有助于理解种群衰退对动物产生的影响,还颠覆了人们对近亲繁殖的认识。  “山地大猩猩是野外研究得最多的灵长动物之一,而我们首次进行了深度的全基

重要病毒测序完成:基因交换病毒很棘手

生物通报道:研究人员已经对来自大猩猩和黑猩猩的埃博拉病毒进行了首次测序,并且发现这种病毒比之前想象的更加易变。令人意外的是,他们还发现这种病毒的不同病毒株能够交换基因——这意味着开发一种成功疫苗将变得更难。 埃博拉病毒(Ebola virus)能导致发烧和出血,并且90%的感染者会死亡。自1976

《科学》焦点文章:文化智能假说

来自德国马普进化人类学研究院(Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology),西班牙马德里孔普卢顿大学(Universidad Complutense de Madrid),美国杜克大学的研究人员进行了第一次人类儿童、 黑猩猩、和黄猩猩在社会和

10种灵长类动物基因组研究成果公布

在最新一期的《基因组研究》杂志的网络版上,来自美国科罗拉多卫生科学中心大学和斯坦福大学的研究人员公布了一项大规模基因组研究的结果。 该研究的目的是分析调查10种包括人类在内的灵长类动物之间基因复制数量的差异,剩余九种灵长类动物分别为黑猩猩、大猩猩、倭黑猩猩、猩猩、长臂猿、短尾猿、狒狒、狨和狐猴。

身负重任的猪:让异体移植离临床更近

  在中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学课题组用于研究的养猪场里,生活着一群特别的猪。这里不仅有十几头带有基因剪刀的工具猪,而且拥有六七百头其他在生物医药领域具有重要应用价值的基因修饰猪。而这些猪的用途听起来更加“骇人”,有些基因修饰猪可以模拟人类疾病,如老年痴呆症、渐冻人症和亨廷顿舞蹈症等,

身负重任的猪:让异体移植离临床更近

  在中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学课题组用于研究的养猪场里,生活着一群特别的猪。这里不仅有十几头带有基因剪刀的工具猪,而且拥有六七百头其他在生物医药领域具有重要应用价值的基因修饰猪。而这些猪的用途听起来更加骇人,有些基因修饰猪可以模拟人类疾病,如老年痴呆症、渐冻人症和亨廷顿舞蹈

新型冠状病毒的第一个传播者:消失的零号病人

消失的零号病人  零号病人并不一定是第一个发病者。  而是第一个感染,并且把病毒传播给其它人的人。  因此,第一个出现症状并发病的人叫做一号病人。  那么,零号病人的医学意义是什么呢?专家给出了提示:  1. 能够锁定传染源,比如是否接触了什么动物?  2. 锁定传播方式,比如跟动物是如何接触的? 

古代染色体数字化重建揭示哺乳动物进化

  人类有46条染色体,狗有78条,而一种位于南美洲的被称为红兔鼠的小型啮齿类动物,拥有惊人的104条染色体。数十年来,遗传学家们一直对染色体在哺乳类动物之间展现出的多样性感到惊讶,现在他们有可能弄清楚这些差异是如何发生的。  目前,一项针对所有胎盘类哺乳动物祖先的染色体数字重组研究,揭示了这些紧凑