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英国推进十万人基因组计划Illumina等企业踊跃参加

英国计划在2017年完成10万人的基因测序工作,但筛选疾病基因需要创新的软件。 一对加利福利亚双胞胎出生后,他们的父母日益忧心:宝宝们发育缓慢,而且肌张力低。脑部扫描发现,男宝宝可能有大脑麻痹,但女宝宝却有癫痫和震颤。医生们百思不解。多种测试结果都无法确诊两个宝宝究竟出了什么问题。等到孩子们5岁的时候,使用左旋多巴胺——一种帕金森病药物,疗效也非常短暂。 2010年,这对双胞胎14岁了,全基因组筛查终于揭开了谜题。双胞胎编码墨蝶呤还原酶(sepiapter in reductase,一种在神经递质多巴胺和5-羟色胺合成中起作用的酶)的基因存在缺陷。医生因此改变了治疗方案,增加了5-羟色胺的服用。男孩子的行动能力有所加强,女孩也不再出现突发性抽搐了。 这样的故事激起了学界人士使用基因筛查作为诊断工具的兴趣。确实,如果检查能筛出疾病相关的基因突变,这样治疗就更加有的放矢。 但这样的基因测试通常不能为诊断提供多少依据,因为......阅读全文

线粒体基因组的疾病关系简介

  人线粒体DNA(mtDNA),共包含37个基因,这37个基因中有22个编码转移核糖核酸(tRNA)、2个编码核糖体核糖核酸(12S和16S rRNA),13个编码多肽。  对于可疑线粒体病的患者来说,理想的遗传学诊断方法是发现导致线粒体结构和功能缺陷的相关基因突变。这些基因突变可能在mtDNA上

雪貂基因组测序加深人类疾病研究

   近日,一个国际研究团队进行了雪貂基因组测序,他们认为这将巩固雪貂作为研究人类呼吸道疾病如流感和囊性纤维化的生物模型。   研究人员检查了雪貂感染大范围流感病毒后基因随着时间推移的不同表达,通过研究囊性纤维化雪貂模型反映了人类疾病的发展。   基因分析中心的合著人Federica Di Palm

全基因组测序助力食源性疾病检测

CDC研究人员检查用于全基因组测序的电脑芯片。  李斯特菌暴发致3人死亡并且迫使美国得克萨斯州蓝铃冰淇淋公司在上个月底召回其全部产品,这是遗传流行病学如何正在改变食源性疾病检测的最新例子。两年前,位于亚特兰大的美国疾病控制和预防中心(CDC)启动一项试点计划,测序与某种疾病相关联的每个李斯特菌样品的

基因组测序新公司工作全靠机器人

CG公司的基因组测序工作完全由机器人完成工作人员正在蓝色幽暗的“车间”内操作检测设备   美国加州的山景城是“硅谷”的重要组成部分。现在,一个与硅芯片相关的潜力大产业正在这里兴起,那就是基因组测序技术产业。这个产业的发展是随着多家大公司的激烈竞争开始的。不过,一家名为“整

阿里联合生物技术公司打造基因组数据云

   本报讯 近日,北京贝瑞和康生物技术有限公司与阿里云共同向外界宣布,双方将共同打造以海量的中国人群基因组数据为核心的数据云,实现对个人基因组数据的精准解读。此次,双方共同合作的“神州基因组数据云项目”将首先聚焦于基因组大数据在云平台上的批量计算、分析、存储,进而在基因大数据领域共同进行前沿探索。

整合基因组和组织学信息 基因组学公司联手开拓新前沿

  10x Genomics公司宣布收购位于瑞典斯德哥尔摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空间基因组学(spatial genomics)领域的领先公司。空间基因组学是一个新兴领域,它不但让研究人员可以获得单细胞内的基因组数据

Science:绘制一张复杂疾病基因组图谱

  尽管研究人员已经利用全基因组关联研究(GWAS)确定了与人类疾病相关的遗传因素,但是要解释这些数据,还需要清楚的了解这些新的风险基因是如何被调控的。   近期Science杂志发布了最新研究成果,解析了人类天然免疫系统中的遗传调控网络,并且也指出了这些信息如何能直接用于理解自身免疫疾病的遗传学

全基因组分析发现多个疾病相关基因

来自伦敦帝国理工学院的研究人员通过多次全组关联,发现了多个与疾病相关的基因,其中包括了糖尿病,冠心病等现代社会热点关注的疾病,这些成果陆续发表在《Nature Genetics》,《JAMA》等杂志上。 第一篇文章中,研究人员找到了控制电信号,也就是控制心律的基因,这种被称为SCN10A的基因受

北京基因组所发布脑疾病知识库BrainBase

  近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的脑疾病知识库BrainBase正式上线。相关研究成果以BrainBase: a curated knowledgebase for brain diseases为题,在线发表在Nucleic Acids Resear

NIH出资$3.13亿用于疾病基因组测序研究

  美国国立卫生研究院(NIH)将资助一些基因组测序分析中心,致力于破解人类常见病和罕见病的基因信息。NIH下属的国家人类基因组研究所(NHGRI)14日宣布成立“常见疾病基因组学中心(CCDG)”,该中心将利用基因组测序技术,从基因水平研究心脏病、糖尿病、中风以及自闭症等常见疾病产生的原因。NHG