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DGGE技术在微生物生态学中的应用

在自然界中存在大量丰富的微生物资源,但目前被人们所培养利用的仅仅占1%~10%,还有大量的微生物没有被人们所了解和利用。随着基因组学在生物技术领域的不断发展,微生物基因组学的研究凭借基因组研究(TIGR)所利用鸟枪法成功地对流感嗜血菌(Haem ophilus influenzae)的全基因组序列的测定而日趋发展起来。特别通过将分子生物学的研究方法与微生物学的研究相结合,使得人们在微生物的进化、结构以及基因组等方面取得了一系列重要的研究成果,从而使大量未培养的微生物的利用变为可能,其中变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术在对微生物多样性的研究中应用广泛,目前DGGE已被应用于分析自然环境中细菌、古菌、真核生物、微型真核生物和病毒群落的生物多样性。这一技术能够提供群落中优势种类信息且同时分析多个样品,具有可重复和容易操作等特点。适合于调查种群的时空变化,并且可通过对切下的带进行序列分析或与特异性探针杂交分析来鉴定群......阅读全文

DGGE技术在微生物生态学中的应用

  在自然界中存在大量丰富的微生物资源,但目前被人们所培养利用的仅仅占1%~10%,还有大量的微生物没有被人们所了解和利用。随着基因组学在生物技术领域的不断发展,微生物基因组学的研究凭借基因组研究(TIGR)所利用鸟枪法成功地对流感嗜血菌(Haem ophilus influenzae)的全基因组序

变性梯度凝胶电泳(DGGE)

简  介  这个方法是应用最早也是最常用的突变筛查方法之一,在过去的十年中经历了很大的改进,并被诊断室所广泛使用,最近有篇关于该问题的综述(Fodde>和 Losekoot 1994 年)。原  理  如果 DNA 双链分子全长不断增加温度或用化学变性剂处理,两条链就会开始

食品检测中的生物技术分析

  摘要:近年来,食品安全问题得到了全社会的关注,食品检测技术得到了更多的重视,生物技术等新兴的食品检测技术也因此而得到了广泛的应用。文章在简要介绍生物技术的基础上,详细阐述了生物技术在食品检测中的应用,以期为生物技术的发展与应用提供新的思路。   食品安全问题是由于食品中含有毒、有害物质

食品检测方面生物技术的应用

摘要:随着食品工业持续、快速地发展,传统的方法已经不能够 满足当前对食品检测的更高要求了,人们要求更为简便快捷、灵活 性强、特异性高的先进的检测方法,而现代的生物技术的快速发展 使食品的检测方法更加多样、准确、迅速及安全,也就是说生物技 术的应用满足了现代食品检测的更高要求。 关键词:食品检测;生物

浅析不同水质微生物的水质检测技术

1、传统水质微生物检测技术对于人们来说,饮用水的质量至关重要,如果饮用水的水质不达标,将很可能会对人们的生命健康安全造成重大影响。因此,对于水质中微生物的检测就显得更加重要,近年来,随着科学技术的发展,微生物水质检测技术也越来越多样,而且正在朝着多样化、精确化、快速化的方向发展。现在,我们将详细探讨

我国土壤环境监测技术的应用现状及发展趋势

  土壤环境监测是环境监测和环境保护的重要组成部分,本文首先介绍了环境监测的内涵,其次分析了我国土壤环境监测技术的应用现状,指出我国土壤环境监测工作中的不足,最后对土壤环境监测技术的发展趋势进行预测。土壤作为陆地生态系统的重要组成部分,是人类赖以生存的物质基础。土壤环境不仅关系到生存环境也决定着农产

C.B.S变性梯度凝胶电泳DGGE 应用原理及注意事项

原理:变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophresis,DGGE)是一种实用价值较高研究DNA突变的分析方法。本质是一类电泳(电泳定义:带电颗粒在电场作用下,向着与其电性相反的电极移动,称为电泳(electrophoresis, EP)。利用

C.B.S变性梯度凝胶电泳DGGE 应用原理及注意事项

  原理:变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophresis,DGGE)是一种实用价值较高研究DNA突变的分析方法。本质是一类电泳(电泳定义:带电颗粒在电场作用下,向着与其电性相反的电极移动,称为电泳(electrophoresis, EP)。利用带电粒子

C.B.S变性梯度凝胶电泳DGGE 应用原理及注意事项

  原理:变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophresis,DGGE)是一种实用价值较高研究DNA突变的分析方法。本质是一类电泳(电泳定义:带电颗粒在电场作用下,向着与其电性相反的电极移动,称为电泳(electrophoresis, EP)。利用带电粒子

微生物分子生物学检测新技术问世

  日前,中国地质科学院水环所经过积极探索,反复试验,建立了适合土样和地下水样的微生物分子生物学检测高新技术。   微生物分子生物学检测技术通过对不同样品微生物DNA的提取,将提取的DNA进行扩增并识别,来确定样品中微生物的多样性和种属,具有先进性和准确性,免去了烦琐、需时长的培养过程,可检出传统

基因芯片与SNP分析

基因芯片技术作为一种新兴的生物技术,近年来得到迅速发展,其应用具有巨大的潜力。单核苷酸多态性(SNP)作为新的遗传标记对基因定位及相关疾病研究的意义亦非常重大。本文主要介绍了DNA 芯片技术的原理和分类、单核苷酸多态性检测方法及DNA 芯片技术在单核苷酸多态性检测方面的应用。生物芯片技术是90

SNP 的检测方法

SNP 的分型技术可分为两个时代,一为凝胶时代,二为高通量时代。凝胶时代的主要技术和方法包括限制性酶切片段长度多态性分析(RFLP)、寡核苷酸连接分析(OLA)、等位基因特异聚合酶链反应分析(AS2PCR)、单链构象多态性分析(SSCP)、变性梯度凝胶电泳分析(DGGE),虽然这些技术与高通量时代的

试管婴儿植入前遗传学诊断单细胞PCR的方法(2)

7.等位基因特异性扩增 在设计引物时,根据已知突变位点的特征,在引物3’端或中间设计一错配碱基,使之仅能与突变型或野生型基因互补,而只扩增相对应的突变型或野生型基因。主要用于点突变导致的遗传病的检测。其优点是只需一步PCR,而无需电泳和标记,摆脱了分子生物学方法中必经电泳的现象。在相互竞争的突变

盘点:分子诊断常用技术50年的沿革与进步

  一、基于分子杂交的分子诊断技术  上世纪60年代至80年代是分子杂交技术发展最为迅猛的20年,由于当时尚无法对样本中靶基因进行人为扩增,人们只能通过已知基因序列的探针对靶序列进行捕获检测。其中液相和固相杂交基础理论、探针固定包被技术与cDNA探针人工合成的出现,为基于分子杂交的体外诊断方法进行了

一文读懂分子诊断技术、PCR技术、基因测序技术

  分子诊断技术是指以DNA和RNA为诊断材料,用分子生物学技术通过检测基因的存在、缺陷或表达异常,从而对人体状态和疾病作出诊断的技术。其基本原理是检测DNA或RNA的结构是否变化、量的多少及表达功能是否异常,以确定受检者有无基因水平的异常变化,对疾病的预防、预测、诊断、治疗和预后具有重要意义。通俗

DGGE、CGGE和TGGE比较

  DGGE、CGGE和TGGE三种方法是基于相同的原理而设计的突变检测方法,它仍均是根据DNA的解链特性而设计。对于同一定序列组成或的DNA片段来说,它具有恒定的解链温度(Tm),但若其序列发生改变时,Tm值亦发生改变,在含有变性因素(变性剂,高温)的凝胶半进行电泳,当其比链解开形成分叉时,电泳迁

基因多态性的检测方法概述

多态性(polymorphism)是指处于随机婚配的群体中,同一基因位点可存在2种以上的基因型。在人群中,个体间基因的核苷酸序列存在着差异性称为基因(DNA)的多态性(gene polymorphism)。这种多态性可以分为两类,即DNA位点多态性(site polymorphism)和长度多态性

多个序列突变的筛查-HRMA(一)

摘要:双链DNA分子转化为两个单链分子,DNA分子变性或熔解用于研究DNA结构和组成已经有多年。最近,新技术的进步提高了这种技术的潜力,尤其是用于DNA序列突变的检测。通过饱和DNA染料的发展和设备的改善,熔解的灵敏度和特异性有了很大的提高(改良的温度精确地结合每个时间单位温度的精确测量)。熔解分析

PCR技术在突变基因检测中的应用

基因突变(gene mutation)是遗传病和肿瘤发生的根本原因,检测与遗传病及恶 性肿瘤发生有关的突变基因(mutant gene)是分子生物学,医学遗传学及肿瘤学研究 的热点,它对阐明遗传病和肿瘤发生的分子生物学基础及其诊断和早期诊断具有重要 \意义,分子生物学技术的发展,尤其是PCR技术的出

一文读懂分子诊断常用技术

  基于分子构象的分子诊断技术  (一)变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)与单链构象多态性(single strand conformation polymorphism,SSCP)  1970~1980年间,Fischer等

毛细管电泳法检测肺癌p53基因第七外显子的突变

作者:刘勇1,2 王荣*1,2 高 岚2 贾正平1 辛晓婷1,2 谢 华1 马 骏1   作者单位:1(兰州军区兰州总医院临床药理基地,兰州 730050) 2(兰州大学生命科学学院,兰州 730000) 【摘要】  p53基因点突变在肺癌的发生过程

DGGE,CGGE及TGGE 比较

DGGE,CGGE及TGGE三种方法是基于相同的原理而设计的突变检测方法,它仍均是根据DNA的解链特性而设计.对于同一定序列组成或的DNA片段来说,它具有恒定的解链温度(Tm),但若其序列发生改变时,Tm值亦发生改变,在含有变性因素(变性剂, 高温)的凝胶半进行电泳,当其比链解开形成分叉时,电泳迁移

DGGE、CGGE及TGGE比较

DGGE、CGGE及TGGE三种方法是基于相同的原理而设计的突变检测方法,它仍均是根据DNA的解链特性而设计。对于同一定序列组成或的DNA片段来说,它具有恒定的解链温度(Tm),但若其序列发生改变时,Tm值亦发生改变,在含有变性因素(变性剂,高温)的凝胶半进行电泳,当其比链解开形成分叉时,电泳迁移的

PCR技术应用三:突变基因检测

   基因突变(gene mutation)是遗传病和肿瘤发生的根本原因,检测与遗传病及恶 性肿瘤发生有关的突变基因(mutant gene)是分子生物学,医学遗传学及肿瘤学研究 的热点,它对阐明遗传病和肿瘤发生的分子生物学基础及其诊断和早期诊断具有重要 \意义,分子生物学技术的发展,尤其

DGGE,CGGE及TGGE 比较

DGGE,CGGE及TGGE三种方法是基于相同的原理而设计的突变检测方法,它仍均是根据DNA的解链特性而设计.对于同一定序列组成或的DNA片段来说,它具有恒定的解链温度(Tm),但若其序列发生改变时,Tm值亦发生改变,在含有变性因素(变性剂, 高温)的凝胶半进行电泳,当其比链解开形成分叉时,电泳迁移

BIO-RAD(伯乐)电泳仪、电泳槽

相关专题Mini Protean 3 Cell 小型垂直电泳简介:凝胶数:1 或2玻板尺寸(W x L)短板10.1 x 7.3 cm间隔板10.1 x 8.2 cm凝胶大小(W x L) 手灌胶:8.3 x 7.3 cm; 预制胶: 8.6 x 6.8 cm典型上层缓冲液体积1

我国学者在土壤有机碳矿化研究取得新进展

  近日,中国科学院亚热带农业生态研究所环江喀斯特生态系统观测研究站王克林研究员团队在土壤有机碳矿化及微生物群落丰度及遗传多样性研究方面取得新进展。图1 添加14C-CaCO3和14C-稻草后土壤有机碳矿化的激发效应  土壤碳库对于温室效应与全球气候变化有着重要的控制作用,而有机碳矿化是土壤碳循环的

常用的分子生物学基本技术(三)

DNA序列分析(DNA sequencing) 应用各种突变检测技术检测到的基因突变,最后都需用序列分析才能确定突变类型及突变位置,其效率可以达到100%。现在的测序方法已与经典的方法有了很大的不同,其基本原理虽仍是双脱氧终止法,但自动化程度大为提高,操作更简便,测序时间也大大缩短。随着PCR技术与

变性高效液相色谱技术

变性高效液相色谱 (denaturing high performance liquid chromatography, DHPLC)是一项在单链构象多态性 (SSCP)和变性梯度凝胶电泳 (DGGE)基础上发展起来的新的杂合双链突变检测技术,可自动检测单碱基替代及小片段核苷酸的插入或缺失。DHPL

高通量测序数据分析

  1. 是不是一定要用大型计算机?  除了序列拼接组装以外,其它分析不是一定要大型计算机,在普通的PC上也可以进行一些处理,当然,买一台或几台高性能的工作站电脑,能显著加快数据处理的速度。  2. 是不是一定要用Linux系统?  也不一定非用Linux不可,在Window下可以完成部分数据处理。