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LncRNA芯片应用于胃癌研究

研究背景 在全世界分范围内,每年因肝癌死亡的病例超过50万人,是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中,随着影像学的进步以及健康体检的普及,越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺,外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确预测体系或标志物。本研究建立了一种预测早期肝癌病人术后复发的模型。 研究结果 1. CpG位点选择 研究者首先对66例病人的样本采用450K芯片(该研究中Illumina Methylation 450k Beadchip服务由伯豪生物提供)检测,过滤得到2550个差异CpG位点。随后,研究者为了区分高风险和低风险的病人,采用LASSO和SVM-RFE算法分别得到了30个差异最显著的CpG位点。 2. 探究可预测的标签 通过比较两种算法得到的CpG位点......阅读全文

LncRNA芯片应用于胃癌研究

     研究背景      在全世界分范围内,每年因肝癌死亡的病例超过50万人,是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中,随着影像学的进步以及健康体检的普及,越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺,外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后

LncRNA芯片应用于胃癌研究

上海交通大学附属仁济医院房静远教授主要从事消化系统肿瘤发生的分子机制、早期诊断和分子治疗等相关研究。近期,该课题组应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌组织的lncRNAs表达情况,筛选到可预测胃癌发生的分子标志物GClnc1,并且阐明了GClnc1在胃癌的发生和发展中是如何发挥

Arraystar lncRNA芯片应用于乳腺癌研究

德克萨斯大学安德森癌症中心的华人学者杨柳青博士主要从事肿瘤转移及信号传导方面的基础研究。近期,杨柳青博士应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了乳腺癌组织的长链非编码RNA(lncRNA)表达情况,并且发现部分lncRNA可以直接和脂质(磷脂酰肌醇三磷酸PIP3、卵磷脂PC等)发生相互

Nature子刊:Arraystar lncRNA芯片应用于乳腺癌研究

   德克萨斯大学安德森癌症中心的华人学者杨柳青博士主要从事肿瘤转移及信号传导方面的基础研究。近期,杨柳青博士应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了乳腺癌组织的长链非编码RNA(lncRNA)表达情况,并且发现部分lncRNA可以直接和脂质(磷脂酰肌醇三磷酸PIP3、卵磷脂PC等)发

lncRNA芯片应用于通过脂肪肝模型中分子特异性表达研究...

lncRNA芯片应用于通过脂肪肝模型中分子特异性表达研究非酒精性脂肪肝发生机制利用lncRNA芯片研究非酒精性脂肪肝对于很多小伙伴们,特别是医院的工作人员,除了每天繁忙的门诊工作之外,还需要挤出时间来做科研,发文章。这真是一件又苦又累又烧脑筋的工作。有没有办法即简单,又快速地发表还可以的影响因子(3

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析

  Nature子刊|联合南京医科大发表重要研究成果:揭示lncRNA促进胃癌进展的新机制   近日,南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果,以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinoge

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析

  近日,南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果,以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinogenesis by epigenetically silencing EphB3 through

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析(二)

2. GC细胞中FOXD2-AS1富集高的患者预后较差在芯片数据GSE51575基础上,以正常组织作为对照,来评估FOXD2-AS1的诊断效果。ROC曲线下面积为0.919(95%置信区间[CI] 0.809-0.976; P < 0.0001);特异性和敏感性分别为0.885和0.885。

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析(一)

近日,南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果,以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinogenesis by epigenetically silencing EphB3 throu

Arraystar CircRNA芯片应用于肝癌研究

第二军医大学免疫所所长、中国医学科学院院长曹雪涛院士课题组主要从事天然免疫与免疫调节基础研究、免疫治疗应用研究。近期其实验室用Arraystar CircRNA芯片研究发现circMTO1可以作为microRNA的吸附海绵结合癌基因miR-9从而上调p21的表达从而抑制肝细胞癌(hepatocell