CNCP2014在京开幕面向蛋白质组学大数据

2014年11月12日, “第三届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP-2014)”在中国科学院计算技术研究所举行。CNCP-2014由中国人类蛋白质组组织、中国科学院计算技术研究所、北京蛋白质组研究中心、北京生命科学研究所主办,中国科学院计算技术研究所pFind团队承办,会议得到了赛默飞科技(中国)、布鲁克(北京)公司的赞助。相比前两届CNCP,CNCP-2014设置特别研究专题,同一个研究专题又从干湿两个方面组织报告,并在关注各领域最新进展的同时适度回顾领域的总体进展,更好地推动了中国的计算蛋白质组......阅读全文

第四届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP2016)

  一、CNCP会议简介  随着蛋白质组学的兴起,特别是质谱技术的快速发展,蛋白质组学研究中产生的数据规模越来越大,必须通过先进的计算机算法、高效的软件与硬件来自动处理大批量的蛋白质组数据,这已经成为蛋白质组学研究的一个重要分 支,即"计算蛋白质组学"(Co

CNCP2018在京开幕-计算蛋白质组学——小人物的学术盛会

  分析测试百科网讯 2018年08月22日,“第五届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP-2018)”在中国科学院计算技术研究所举行。CNCP-2018由中国科学院计算技术研究所、中国人类蛋白质组学会(CNHUPO)、北京蛋白质组研究中心徐平实验室、北京生命科学研究所董梦秋实验室、中国科学院大连化学

2014第三届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP)学术报告(一)

  2014年11月12日, “2014第三届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP)”在中国科学院计算技术研究所

2014第三届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP)学术报告(二)

  2014年11月12日, “2014第三届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP)”在中国科学院计算技术研究所举行。CN

CNCP蛋白质组学生物质谱技术评测揭榜-这家中心获第一!

  由贺思敏老师,刘超老师率领中国科学院计算技术研究所 pFind 团队联合CNCP组织单位,进行的CNCP-2020蛋白质组学生物质谱技术评测近日终于揭榜。共有来自15家单位的20个实验室采集到的26套数据参与此次测评,参与者针对Thermo公司提供的HeLa细胞标准品,利用各自实验室认为最合适的

蛋白质组和蛋白质组学分析

 随着人类基因 组计划研究成果的公布,人们对基因的认识逐渐清晰,但基因数量的有限性和基因结构的相对稳定性,与生命现象的复杂性和多样性之间存在巨大反差。如何了解众多的基因与危害人类身心健康的疾病之间的关系,对生命科学研究者来说仍是一项长期而艰巨的任务。因此,作为生命活动的直接承担者――蛋白质,成为后基

蛋白质组与蛋白质组学简介2

3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合,然后将DNA从被修饰的碱基处切割,电泳分离,结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰,不能切断,可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白

蛋白质组与蛋白质组学简介1

一、蛋白质组概念:一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

杨芃原教授宣布第三届中国计算蛋白质组学研讨会圆满闭幕

  2014年11月13日,“第三届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP-2014)”在中国科学院计算技术研究所落下帷幕,

首届中国计算蛋白质组学研讨会在计算所召开

会议现场  11月10日,中科院计算技术研究所前瞻研究实验室生物信息学研究组主办的“首届中国计算蛋白质组学研讨会”在计算所开幕。   “计算蛋白质组学”是生物信息学中一个新的研究方向,其最基本的内容是蛋白质序列、结构和功能的规模化研究,一个简明的定义是“系统生物学的高通量分析”。美国

蛋白质(二)相关计算

相关计算原子数由m个氨基酸,n条肽链组成的蛋白质分子,至少含有n个—COOH,至少含有n个—NH2,肽键m-n个,O原子m+n个。分子质量设氨基酸的平均相对分子质量为a,蛋白质的相对分子质量=ma-18(m-n)基因控制基因中的核苷酸6信使RNA中的核苷酸 3蛋白质中氨基酸 1

蛋白质浓度计算

1ml蛋白质,你稀释到了100ml, 说明现在里面有1%的蛋白质。然后取0.6毫升,对考马斯和蒸馏水,里面现在有(0.6/6.0)×0.01毫升的蛋白质。测完光,对完标准曲线后,得到的12.777ug/ml 是0.001毫升的蛋白质的浓度哦。所以, 总的蛋白质浓度,也就是一开始的那1毫升里的蛋白质浓

蛋白质浓度计算

1ml蛋白质,你稀释到了100ml, 说明现在里面有1%的蛋白质。然后取0.6毫升,对考马斯和蒸馏水,里面现在有(0.6/6.0)×0.01毫升的蛋白质。测完光,对完标准曲线后,得到的12.777ug/ml 是0.001毫升的蛋白质的浓度哦。所以, 总的蛋白质浓度,也就是一开始的那1毫升里的蛋白质浓

蛋白质组鉴定技术

如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE,那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里,我们不考虑传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效,而是因为它们通常耗时

蛋白质组是什么

蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组(genOME),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变. 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个

蛋白质组鉴定技术

如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE,那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里,我们不考虑传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效,而是因为它们通常耗时、耗

蛋白质组鉴定技术

 如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE,那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里,我们不考虑传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效,而是因为它们通常耗时、耗力,不

蛋白质组是什么

蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组(genOME),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变. 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个

蛋白质组的概念

蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组(Genome),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(protein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个

蛋白质组服务介绍​

基因是生物体的基本遗传单位。然而,基因本身并不能直接行使功能,其功能的发挥最终需要通过表达出的蛋白质体现出来。蛋白质是细胞所有功能的主要执行者,其功能的发挥决定了人体健康与疾病的各种状态。蛋白质组是在宏观的角度全面、系统地解析蛋白质状态与功能的科学,是“后基因组”时代的核心研究内容。蛋白质组是比基因

蛋白质组研究系统

4700 TOF/TOF蛋白质组分析系统4700TOF/TOF蛋白质组分析系统是全球第一台TOF/TOF 串联飞行质谱仪,它作为目前的最新质谱技术,它一问世即被世界各大蛋白组研究中心和著名蛋白质实验室所争相采用。它由两级TOF和高能碰撞池组成,其工作原理是离子在MALDI源中产生并被加速和聚焦;对于

首届中国计算蛋白质组学研讨会第一轮通知

  The First China Workshop on Computational Proteomics (CNCP2010)   2010年11月10日至11日, 北京   一.会议简介   随着蛋白质组学的兴起,特别是质谱技术的快速发展,蛋白质组学研究中产生的数据规模越来越大。依靠简单

学术小人物的学术盛会-第二届中国计算蛋白质组学会议

“2012第二届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP)”在北京举行   【导语】蛋白质组学研究产生大量的数据,简单的手工处理无法满足需求。将计算机算法与软件工具结合自动处理蛋白质组数据,成为蛋白质组学研究的重要分 支,这就是“计算蛋白质组学”,以解

蛋白质组的鉴定方法

如蛋白质鉴定结果、蛋白质的亚细胞定位、蛋白质在不同条件下的表达水平等信息。目前应用最普遍的数据库是NRDB和dbEST 数据库。NRDB由SWISS2PROT 和GENPETP 等几个数据库组成,dbEST是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)和欧洲生物信息学研究所(EBI)共同编辑的核酸数据库;

蛋白质组技术(Proteomic-Techniques)

一、研究材料1995年,Wasinger等在第一篇蛋白质组研究文章中研究的对象为目前已知最小但能自主复制的原核微生物——支原体Mycoplasma genitalium。1996年,研究对象即扩展到单细胞真核生物——酵母以及人体正常组织及病理标本[28],进而突破了早期人们普遍认为的“蛋白质组研

蛋白质组的鉴定方法

如蛋白质鉴定结果、蛋白质的亚细胞定位、蛋白质在不同条件下的表达水平等信息。目前应用最普遍的数据库是NRDB和dbEST 数据库。NRDB由SWISS2PROT 和GENPETP 等几个数据库组成,dbEST是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)和欧洲生物信息学研究所(EBI)共同编辑的核酸数据库;

蛋白质组鉴定技术简述

如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE,那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定。在这里,我们不考虑传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达。并不是因为这些方法无效,而是因为它们通常耗时、耗力,不