AgilentmiRNA芯片在各类样本中的应用（一）
1.新鲜组织样本新鲜组织一般包括以人类疾病诊断及治疗为目的，经患者或健康人同意后，从患者的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的病变组织或相邻健康组织，或者健康人的相同部位的对照组织。这些人类疾病相关的新鲜组织样本的整理、保存、研究对于提高疾病的诊断质量、促进临床工作、探讨及研究疾病的发病机制具有重要的意义。此外，新鲜组织样本还包括从其他物种的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的样本。采用新鲜组织样本，并使用Agilent miRNA芯片，可以对新鲜样本的miRNA表达谱进行及时直接的监测，从而对疾病，或者动植物的不同发育阶段，不同器官的miRNA表达谱进行研究，了解miRNA的表达趋势变化，和相应的功能。上海伯豪生物技术有限公司为客户提供了多年优质的Agilent miRNA芯片服务，发表了一系列相关论文。 伯豪案例选摘：肺癌组织样本： Huang W, Hu J, Yang DW, Fan XT, Jin Y......阅读全文
RNA修饰相关酶PCR芯片
应用场景：通过关键酶/蛋白的RNA表达变化，确定样品表型与特定RNA 修饰的联系 优势：预制的PCR板,覆盖68个针对不同RNA修饰的Writers/Erasers/Readers基因。精心优化的引物Tm值均一，并经过了严格的预实验验证，无须摸索引物设计和测试。工业化生产的高度均一的PCR
单核RNA测序的芯片现已上市
高通量的单核RNA测序方法——DroNc-Seq才刚刚在《Nature Methods》上发表。一转眼，相应的芯片已经上市。Dolomite Bio公司针对DroNc-Seq推出一款新的芯片，可实现高通量的单核RNA-Seq分析。 DroNc-Seq方法在Broad研究所的张锋（Feng
聚焦芯片到RNAseq的转型之路
自二十世纪九十年代中期以来，芯片就一直是基因组表达分析的中坚力量。在这一技术最辉煌的时期，准备研究基因表达模式的人都会想到使用芯片。不过随着测序成本的直线下降，RNA测序（RNA-seq）成为了越来越受欢迎的转录组分析方法。 DNA芯片上排列着大量的核酸探针，可以代表生物的整个基因组或部分基因
DNA芯片技术和RNA测序有啥不同？
日本推理小说家东野圭吾的作品《白金数据》中描述了这样一个未来世界：日本政府秘密建立名为“白金数据”的数据库。该库搜集了全国人民的DNA数据，通过对犯罪分子留在现场的毛发、体液等证物进行比对，警方可以高效、快速、准确锁定真凶。借助“白金数据”的帮助，一个检举率100%、冤案率0%的理想法制社会构建完
新型微流控芯片识别RNA的小片段
CRISPR / Cas技术不仅可以改变基因：根据弗莱堡大学的一项研究，通过使用所谓的基因剪刀，可以更好地诊断癌症等疾病。 在这项研究中，研究人员介绍了一种微流控芯片，该芯片可识别RNA的小片段，从而比目前可用的技术更快，更准确地指示特定类型的癌症。该结果最近发表在科学杂志“ Advanced
基因芯片与RNAseq的比较分析
最近几年二代测序（又叫NGS）很火，而且价格越来越便宜，原来都用芯片检测mRNA、miRNA、LncRNA表达量的，好像不少都换用RNA-seq了。那么，到底选择哪种更好呢？今天就来回答下这个问题。一句话—— 看研究目的。 常见误区一： 测序的准确性高，获得的信息更丰富 对，但又不对。
基因芯片与RNAseq的比较分析
基因芯片 vs RNA-seq哪个好 ？最近几年二代测序（又叫NGS）很火，而且价格越来越便宜，原来都用芯片检测mRNA、miRNA、LncRNA表达量的，好像不少都换用RNA-seq了。那么，到底选择哪种更好呢？今天就来回答下这个问题。一句话—— 看研究目的。常见误区一：测序的准确性高，获得的信息
抗甲基化干扰的小分子RNA芯片研究取得新进展
小分子RNA，包括siRNA(small interfering RNA)、miRNA(microRNA)、piRNA(piwi- interacting RNA)等，多次被美国《科学》杂志评为“十大科技突破”和“十大科学进展”，是当前生命科学研究的前沿热点。大量实验证据表明，这些小分子
Dolomite微流控芯片成功用于高通量单细胞DNA/RNA测序
随着现代生物学的发展，细胞群体的研究已不再能满足科研需求。单细胞测序通过对单个细胞进行测序，解决了用组织样本测序或样本少时无法解决的细胞异质性难题，为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向。 2011 年，《自然方法》杂志( Nature Methods )将单细胞测序列为年
生物芯片技术芯片分类
根据芯片上的固定的探针不同，生物芯片包括基因芯片、蛋白质芯片、细胞芯片、组织芯片，另外根据原理还有元件型微阵列芯。表达谱基因芯片是用于基因功能研究的一种基因芯片。是目前技术比较成熟，应用最广泛的一种基因芯片。
研究比较芯片和测序在分析无细胞胎儿RNA转录组上的能力
来自GenomeWeb的消息——美国塔夫茨医学中心（Tufts Medical Center）的一组研究人员最近评估了芯片和新一代测序在分析无细胞胎儿RNA中基因表达的能力，这些胎儿RNA来自羊水上清。 他们发现，表达芯片带来了基因表达的更广泛视图，特别是对低浓度或降解的样品，而在这一方面，R
生物芯片是纳米芯片么
生物芯片和纳米这百个概念貌似扯不上边，唯一有点关系的是，它上面点制的核酸或蛋白等探针大小是以纳米级度别的。生物芯片目前主要做科研用，成熟的临床应用的芯片应该博奥生物做过不少工作但基本被埋没了，虽然是很实用的产品问，但一方面是找不到对应的市场或者说根本答就没人去推广，另一方面是生物芯片是新生事物专，国
简述Lifespan组织芯片生物芯片
Lifespan组织芯片是生物芯片技术的一个重要分支，与基因芯片、蛋白质芯片及细胞芯片等一样，属于一种特殊、新型的生物芯片，是一种新型的高通量、多样本的研究的工具。组织芯片组织芯片，也称组织微阵列(tissue microarrays)，是将数十个甚至上千个不同个体组织标本以规则阵列方式排布于同一固
生物芯片的芯片制备方法
包括原位合成和预合成后点样。原位合成：适用于寡核苷酸，通过光引导蚀刻技术。已有P53、P450，BRCAI/BRCA2 等基因突变的基因芯片。预合成后点样：是将提取或合成好的多肽、蛋白、寡核苷酸、cDNA、基因组DAN等通过特定的高速点样机器人直接点在芯片上。该技术优点在于相对简易低廉，被国内外广泛
生物芯片中芯片制备方法
包括原位合成和预合成后点样。原位合成：适用于寡核苷酸，通过光引导蚀刻技术。已有P53、P450，BRCAI/BRCA2 等基因突变的基因芯片。预合成后点样：是将提取或合成好的多肽、蛋白、寡核苷酸、cDNA、基因组DAN等通过特定的高速点样机器人直接点在芯片上。该技术优点在于相对简易低廉，被国内外广泛
生物芯片技术的芯片分类
根据芯片上的固定的探针不同，生物芯片包括基因芯片、蛋白质芯片、细胞芯片、组织芯片，另外根据原理还有元件型微阵列芯。表达谱基因芯片是用于基因功能研究的一种基因芯片。是目前技术比较成熟，应用最广泛的一种基因芯片。
生物芯片的芯片制备方法
包括原位合成和预合成后点样。原位合成：适用于寡核苷酸，通过光引导蚀刻技术。已有P53、P450，BRCAI/BRCA2 等基因突变的基因芯片。预合成后点样：是将提取或合成好的多肽、蛋白、寡核苷酸、cDNA、基因组DAN等通过特定的高速点样机器人直接点在芯片上。该技术优点在于相对简易低廉，被国内外广泛
组织芯片的制备——冰冻组织芯片
实验材料新鲜组织试剂、试剂盒OCT 包埋剂切片黏合剂仪器、耗材1 mm 孔径针载玻片实验步骤将每个需要制备 TMA 的新鲜组织，不经固定包埋在 OCT 包埋剂中， -20℃ 中冻成块。另外，再将 OCT 包埋剂倒在长 3 cm×宽 1.5 cm×高 lcm 的模具中， -20℃ 中冻成块。用特制的
让芯片更“新”——器官芯片技术
最近，我刚刚为大家介绍过“芯片实验室”这一前沿技术。顾名思义，芯片实验室也就是将实验室搬到了芯片上，它可以将多种实验室操作，例如样品制备、生化反应、检测分析，集成于一块几平方厘米的芯片上，从而对于细菌、病毒、污染物、生物标记物等进行检测和分析，帮助监测人体健康状况。今天，我们要介绍的创新成果，仍然是
组织芯片
组织芯片(tissue chip)，也称组织微阵列(tissue microarrays)，是生物芯片技术的一个重要分支，是将许多不同个体组织标本以规则阵列方式排布于同一载体（使用载玻片最多）上，进行同一指标的原位组织学研究。该技术自1998年问世以来，以其大规模、高通量、标准化等优点得到大范围
生物芯片技术的芯片制备方法
包括原位合成和预合成后点样。原位合成：适用于寡核苷酸，通过光引导蚀刻技术。已有P53、P450，BRCAI/BRCA2 等基因突变的基因芯片。预合成后点样：是将提取或合成好的多肽、蛋白、寡核苷酸、cDNA、基因组DAN等通过特定的高速点样机器人直接点在芯片上。该技术优点在于相对简易低廉，被国内外广泛
生物芯片与与电子芯片的比较
生物芯片和电子芯片有什么区别呢？其实电子芯片和生物芯片有着既远又近的关系。“它们相同的地方在于，都用很小的元件，储藏很大的信息量，输入输出也很大。”杨洪波说。所谓的生物芯片输出，就是在平方厘米大的芯片上，用特制的扫描仪扫出1百万个化学分子的反应信号，“一行一行地扫，小到0.5微米的地方也全部会被扫到
组织芯片的制备——石蜡块组织芯片
实验方法原理首先制作模具蜡块（受体，recipient）。从供体蜡块（donor）上取样，取样针分别有 0.6 mm、1.0 mm、1.5 mm 和 2.0 mm 几种，在 1 个大小 45 mm×20 mm 的模具蜡块上，以 0.6 mm 取样针间隔 0.1 mm，可排列 1000 余个位点，如取
RNA干涉(RNA－Interference，RNAi)（2）
早期的 RNAi 技术可用在研究与胚胎发育相关基因的功能上，但是由于细胞分裂造成 dsRNA 的稀释，使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早期 RNAi 技术的不足，Tavernarakis 等将 RNAi 技术做了一些改进及更动，将目的基因之标的序列以反向重复的方式，由
RNA干扰技术(RNA－interference，RNAi)
1995年，康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫（C. elegans）中的par-1基因时，发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达，而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA（sense RNA）以期观察到基因表达的增强。但得到的结果
RNA干涉(RNA－Interference，RNAi)（1）
基因沉默（gene silencing）是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面，基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物（genetically modified organisms）的障碍，另一方面，它又是植物抵抗外来核酸入侵（如病毒）的一种反应，为植物抗病毒的遗传育
RNA提取时RNA降解原因
1 ) 新鲜细胞： 裂解液的量不足，使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织： 某些含有内源性核酸酶的样品，很难避免RNA酶的降解，建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎，并且，匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品： 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放，然后转移到-70℃冰箱存
蛋白芯片制作与应用（4）－液态芯片
液态芯片原理编码微球：分别用不同配比的两种荧光染料将直径5.6μm的聚苯乙烯微球（Beads）染成不同的荧光色，从而获得多达100种经荧光编码的微球。 交联探针、抗体或抗原：把针对不同检测物的核酸探针、抗体或抗原以共价方式结合到特定荧光编码的微球上。 检测反应：先把针对不同检测物的、用不同荧光色编码
microRNA－芯片与表达谱芯片的联合应用
microRNA 芯片与表达谱芯片的联合应用——探究胃癌细胞株的原发性耐药的分子机制药物耐受是肿瘤治疗领域的一大难题，一般分为两种类型：其一为原发性耐药，即先前未经治疗的肿瘤细胞天生就对某种药物不敏感；其二是获得性耐药，指经过治疗的肿瘤细胞再次接受该药物治疗时变得不敏感。 目前， 国际上许多科研
小芯片上的大文章——生物芯片
想象一下，在一块指甲大小的玻片、硅片、尼龙膜等材料上放上生物探针，它首先与待检测样品进行反应，然后对与反应结果相关的信号进行收集，最后再用计算机或其他方法分析数据结果，会产生什么效果呢？答案就是对细胞、蛋白质、DNA以及其他生物组分的准确、快速、大信息量的检测。这也就是我们所说的生物芯片。生物芯片的