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单细胞基因组扩增法的定量评估

近日, Nature出版集团旗下刊物Scientific Reports刊发南方科技大学副教授贺建奎课题组最新研究成果《单细胞基因组扩增法的定量评估及其在检测单个海马神经元基因拷贝数变异的应用》,从多个角度评估了三种最常用的单细胞基因组扩增方法。经过细致比较发现,MALBAC和GenomePlex WGA4的方法在拷贝数变异检测方面明显优于MDA方法。 该研究从GC偏好性、扩增重复性、全基因组层面的扩增均一性等多个方面系统地比较了三种最常用的单细胞全基因组扩增方法(GenomePlex WGA4、MDA和MALBAC)。研究发现,用MALBAC和WGA4方法获得的单细胞基因组测序的结果高度可重复,并具有较高的成功率。其中MALBAC方法在三种方法中重复性最好,但是对高GC含量(DNA四种碱基中鸟嘌呤和胞嘧啶所占的比率)基因组扩增存在偏好。随后研究人员利用MALBAC方法的高度重复性开发生物信息学方法,来矫正该方法内部的GC......阅读全文

单细胞分离用于单细胞基因扩增

 单细胞分离连接不同管径大小的毛细玻璃针,可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等,如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。  单细胞分离用于各种类型的细胞分离培养、纯化、检测;获得单克隆细胞;用于单细胞基因扩增,

单细胞的可靠全基因组扩增

目前多种新型分析技术,如新一代测序和芯片,都是为细胞群体而设计的,需要一定的样本量。对于一些临床或法医样本,如肿瘤细胞或循环胎儿细胞等,它们的细胞数量有限,直接限制了其下游应用。例如,在分析肿瘤细胞中的体细胞DNA突变或单个细菌基因组时,单细胞中的DNA无法满足测序的mg级样品量需求。为了从少量样品

单细胞基因组扩增法的定量评估

  近日, Nature出版集团旗下刊物Scientific Reports刊发南方科技大学副教授贺建奎课题组最新研究成果《单细胞基因组扩增法的定量评估及其在检测单个海马神经元基因拷贝数变异的应用》,从多个角度评估了三种最常用的单细胞基因组扩增方法。经过细致比较发现,MALBAC和GenomePle

单细胞全基因组扩增技术大比武

2013年,权威技术期刊《Nature Methods》将年度技术授予了单细胞测序。正如社论中所说,每个细胞都是独一无二的--它占据了独特的空间位置,它的复制基因组中携带了独特的错误。然而,过去以细胞群体为对象的研究只获得了平均值,而忽略了异质性。目前多种新型分析技术,如NGS,都是为细胞群

谢晓亮教授Science报道新型单细胞基因组线性扩增法

  谢晓亮教授在4月14日的Science上发表文章报道了实验室的最新研究:一种新型的单细胞基因组线性扩增的方法——转座插入(LIANTI,Linear Amplification with Transposon Insertion)。LIANTI法在检测拷贝数目变异和单核苷酸变异上的准确度都优于以

肺细胞 PCR基因扩增原理及方法步骤

实验概要PCR扩增目标DNA片段。实验原理多聚酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性、退火、延伸三个基本反应步骤构成。1. 模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右

癌细胞 PCR基因扩增原理及方法步骤

实验概要PCR扩增目标DNA片段。实验原理多聚酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性、退火、延伸三个基本反应步骤构成。1. 模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右

新型单细胞扩增技术有助避免遗传病

  中美研究人员在新一期美国《科学》杂志上报告说,他们研制出一种新型单细胞全基因组扩增技术,在此基础上不仅有望避免许多遗传性疾病遗传给后代,从基因组角度更深入地认识癌症也将成为可能。  单细胞研究是当前生命科学研究的重要方向之一。许多关键的生命活动都和细胞间个体差异密切相关;许多重要的生命科学和医学

细胞化学词汇--基因扩增

基因扩增是指某一个特定基因的拷贝数选择性地增加而其它基因的拷贝数并未按比例增加的过程。

CloneSelect 单细胞分离系统 OR 传统单细胞克隆方法

CloneSelect™ Single-Cell Printer™ f.sight™ ( f.sight )被开发用于满足这些需求, 它可以柔和地接种单个细胞至微孔,同时记录整个细胞接种过程,提供单克隆性的图像证据以及优异的接种后细胞生长用于细胞株开发在这个研究中,我们开展了六组实验,用无血清培养基