Antpedia LOGO WIKI资讯

重测序构建芝麻超高密度图谱以及花序基因的定位

连锁分析寻找QTL位点,是最经典的性状定位方法。而遗传图谱的密度是限制定位精度的其中一个方面。目前,构建图谱的方法已从基于传统的SSR、AFLP等基于片段长度多态性的分子标记,过渡到了基于SNP芯片或NGS测序的SNP分子标记。NGS测序最常用的是简化基因组测序和全基因组重测序,区别在于标记数量的多少。随着测序价格的不断降低,重测序高密度标记的优势将更加明显。本文介绍了伯豪客户近期的一篇使用重测序(该研究中重测序服务由伯豪生物提供)构建图谱进行QTL定位的文章。研究背景芝麻是重要的油籽作物,具有无限花序的特征,俗称“芝麻开花节节高”。但是,这样的性状使种子不同时间成熟,极不利于作物收集,影响农产品质量。图1. 无限花序(Dt)和有限花序(dt)的形态区别。其中dt型仅在茎顶端形成花簇。技术路线研究结果在此前的QTL定位研究中,使用构建的芝麻遗传图谱远未达到饱和。这项研究使用了全基因组重测序策略,对两种生长特征的亲本和其F2群体构......阅读全文

重测序构建芝麻超高密度图谱以及花序基因的定位

连锁分析寻找QTL位点,是最经典的性状定位方法。而遗传图谱的密度是限制定位精度的其中一个方面。目前,构建图谱的方法已从基于传统的SSR、AFLP等基于片段长度多态性的分子标记,过渡到了基于SNP芯片或NGS测序的SNP分子标记。NGS测序最常用的是简化基因组测序和全基因组重测序,区别在于标记数量的多

小豆F2群体的简化基因组测序构建高密度SNP遗传图谱

  小豆营养丰富、医食两用,在促进健康、改善膳食结构等方面具有重要作用。然而,小豆遗传研究相对缓慢,导致新基因发掘及资源利用效率低下,难以满足生产和市场的需求。  近期,中国农业科学院作物科学研究所食用豆种质资源研究程须珍课题完成的题为“Construction of a high-density

海洋所完成凡纳滨对虾基因组并构建高密度遗传连锁图谱

  近日,中国科学院海洋研究所海洋动物生殖与遗传工程课题组利用高通量测序技术,对凡纳滨对虾的基因组进行了基因组探查(Survey)分析,并在此基础上成功构建全球标记密度最高的对虾遗传连锁图谱。  基因组探查(Survey)分析结果显示,凡纳滨对虾基因组中重复序列和杂合度比例均很高,其高复杂度使得国际

华南植物园等完成麻疯树基因组组装及高密度遗传图谱构建

  麻疯树(Jatropha curcas L.)为大戟科木本油料植物,是生产生物柴油的重要能源植物之一。  中国科学院华南植物园研究员吴国江团队联合国内多家单位完成了麻疯树全基因组测序和组装,组装基因组大小为320.5 Mbp,在基因组中共发现了27,172个蛋白编码基因。另外研究人员构建了以麻疯

芝麻大规模全基因组关联分析完成

  由中国农科院油料所张秀荣研究员领衔的芝麻与特色油料遗传育种创新团队,与中科院国家基因研究中心等单位合作,在国际上率先完成了芝麻高密度单倍型图谱构建、主要农艺性状大规模全基因组关联分析。10月19日,国际知名期刊《自然·通讯》杂志在线发表了上述研究成果。  该研究得到973、国家自然科学基金、中国

高密度脂蛋白的生理作用

高密度脂蛋白是颗粒zui小的血浆脂蛋白,其直径为7.5~10 nm,密度为1.21 g/cm3,含有6%胆固醇、13% 胆固醇酯与50% 蛋白质,分子量为(1.5~3)×106,其载脂蛋白大多为载脂蛋白A。在肝、肠和血液中合成,担负着将内源性胆固醇(以胆固醇酯为主)从组织往肝脏的逆向转运。血浆高密度

高密度脂蛋白的生理作用

高密度脂蛋白是颗粒zui小的血浆脂蛋白,其直径为7.5~10 nm,密度为1.21 g/cm3,含有6%胆固醇、13% 胆固醇酯与50% 蛋白质,分子量为(1.5~3)×106,其载脂蛋白大多为载脂蛋白A。在肝、肠和血液中合成,担负着将内源性胆固醇(以胆固醇酯为主)从组织往肝脏的逆向转运。血浆高密度

新研究或让铁电材料实现超高密度信息存储

  中科院沈阳金属研究所研究人员通过国际合作,在铁电材料中发现了通量全闭合畴结构以及由顺时针和逆时针闭合结构交替排列构成的大尺度周期性阵列,并发现了闭合结构核心处存在巨大弯电效应,有望使铁电材料实现超高密度信息存储功能,相关成果4月16日在线发表于《科学》杂志。  铁电材料与铁磁材料具有极强的类比性

高密度监测技术是趋势

高密度监测技术是趋势关于水环境监测,总体来说包含多种方面技术的整合系统,包括实验室的系统、监测系统、在线监测、污染源监测等,这些数据汇集到监控中心,通过数据分析得到一个比较全面的水环境状态的数据。不仅能够表明水域的生态状况,而且可以监测污染源的情况,从而指导我们水污染控制的工作。目前,我国环境状况与

工程菌高密度发酵

实验方法原理发酵工业是既古老又崭新的工业,它的形成经历了漫长的岁月。随着科学技术的发展,发酵工业不断地得到发展和充实。现代发酵工业就是传统的发酵技术与现代DNA重组、细胞融合等新技术相结合,而发展起来的现代生物技术,并通过现代化学工程技术生产有用物质或直接用于工业化生产的一种大工业体系,是生物技术的