发布时间:2014-03-12 10:51 原文链接: JAMA:全基因组测序用于临床仍存在技术挑

  据3月12日发表在《美国医学会杂志》上的一则研究报告披露,在一项有12名成年人参与的探索性研究中,应用全基因组测序(WGS)与不完整的遗传性疾病基因的覆盖、检测具有最高潜在临床影响的基因变异的低复验性,以及临床报告发现的不确定性有关,尽管在某些案例中,WGS会发现基因变异株从而引入早期的医疗干预措施。

  随着进行人类DNA测序的技术性障碍的减少及其成本降至接近1000美元,全基因组测序(WGS)正日益被用于临床医学。测序可成功地协助临床诊断并揭示罕见的家族性疾病的遗传基础。不管是何背景,即使是在看来健康的个体中,WGS预计也会揭示具有潜在临床重要性的遗传学发现。然而,根据文章的背景资讯,针对具有临床意义的发现却很少有综合性的临床解读及报告。应用测序及与发现并报告这些及其它临床发现有关的临床机会和成本的技术灵敏度及临床遗传学发现的复验性仍然还未被定义。

  加州斯坦福的斯坦福遗传性心血管疾病中心的Frederick E. Dewey, M.D.及其同事招募了12名成年志愿参与者,他们在2011年11月至2012年3月间进行了WGS。一个多学科的团队审查了所有潜在可报告的基因发现。五位医师基于这些基因发现提出了最初的临床追踪。

  研究人员发现,WGS的使用与不完整的遗传性疾病基因的覆盖有关;对发现具有最高潜在临床影响的基因变异有着低复验性;以及对临床报告的WGS发现存在着不确定性。在每位参与者中发现了2-6个个人疾病风险的结果。医师对测序结果的审查提示应考虑对每位参与者进行中位数(中点)为1-3个的初步诊断测试及转诊。

  文章的作者写道,他们对这一技术的临床经验说明了在临床上采用 WGS的数个挑战,其中包括尽管WGS的分析有效性正在得到改善,但对个体基因变异的敏感及准确评估的技术性挑战仍然存在。此外,对WGS数据进行全面临床解读的人类资源需求仍然是相当巨大的,且对可能引起疾病的基因变异株进行分类还存在着很大的不确定性。

  “在临床医学上确定WGS的作用时应该要考虑到这些问题。”

相关文章

首款CRISPR基因编辑疗法距美国上市咫尺之遥

4月3日,VertexPharmaceuticals(Nasdaq:VRTX)和CRISPRTherapeutics(Nasdaq:CRSP)宣布完成了examglogeneautotemcel(ex......

加速满足临床疾病诊断需求金域医学新开发超600个项目

罕见病原体Sanger测序揪出“致病菌”、全基因组测序解决罕见病诊断难题、阿尔茨海默病血液检测让老年痴呆早发现……近日,在中华医学会第十七次全国检验医学学术会议上,广州金域医学检验集团首次召开年度新项......

深圳先进院:细胞命运决定机制的研究获进展

细胞分化使基因型相同的细胞产生在形态、结构和生理功能上差异的细胞。关于细胞分化过程的发生,经典表述认为细胞的基因功能以及它们形成的复杂调控网络在时空上控制了基因的表达量,从而编程了细胞命运决定(fat......

定量解析“基因开关”,探索细胞命运决定机制

细胞可以通过命运决定过程来不断适应环境变化,实现和完善其自身功能。理解细胞命运决定的具体机理对于回答复杂生命如何诞生、实现组织和器官再生、以及合成人工生命体等问题非常重要。北京时间3月24日,一项发表......

打开一个基因中的“藏粮密码”主效耐碱基因可增产约20%

“我国人多地少,在工业化和城镇化发展的背景下,确保18亿亩耕地红线,粮食安全生产存在巨大压力。如何破题?”“把边际土地,特别是盐碱地的作用发挥出来,就能大幅缓解这个压力。”3月22日,中国科学院院士李......

北大重庆大数据研究院将共建“基因智能大数据实验室”

18日在重庆召开的2023世界中联中医药大数据产业高峰论坛上,北京大学重庆大数据研究院与上海睿昂基因科技股份有限公司签署共建“基因智能大数据联合实验室”(以下简称实验室)战略合作协议,双方将发挥各自优......

华大基因2022年度业绩快报,利润同比下滑近42.57%

近日,深圳华大基因股份有限公司发布2022年度业绩快报,报告显示华大基因2022年度营业总收入约71.26亿元人民币,同比上年增加5.32%。2022年度营业利润约10.47亿元人民币,同比上年减少4......

基因组育种大数据计算新工具“天权”发布

近日,国际学术期刊《核酸研究》(NucleicAcidsResearch)发表了华中农业大学动物遗传育种团队开发的基因组育种大数据计算新工具HIBLUP,中文名为“天权”。相关论文被期刊评为“突破性进......

环境中致病菌毒力基因高通量检测获新进展

近日,中科院生态环境研究中心土壤环境科学与技术实验室朱永官院士团队在环境中致病菌毒力基因高通量检测方面取得新进展,相关研究成果以“VFG-Chip:Ahigh-throughputqPCRmicroa......

肺癌类器官药敏测试预测临床疗效总体准确率高达83.3%!

肺癌有着极高的死亡率,晚期肺癌患者的预后常常较差。目前已经开发出基于基因检测技术的分子靶向治疗,可以明显延长晚期肺癌患者的总生存期并提高生活质量。为了提出个性化治疗方案肺癌有着极高的死亡率,晚期肺癌患......