发布时间:2014-05-29 10:15 原文链接: 【Nature子刊】农科院、华大基因联手完成甘蓝测序

  中国农业科学院油料作物研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、华大基因等多家研究机构的科学家们近日完成了对甘蓝基因组的测序,并将这种作物的基因组草图发表在五月二十三日的Nature Communications杂志上。文章的通讯作者是油料作物研究所的研究员刘胜毅(Shengyi Liu)。

  多倍化(Polyploidization)为植物的适应性进化提供了大量的遗传变异。但迄今为止人们还不清楚,这种基因组加倍是如何推动物种分化的。

  芸薹属植物(Brassica)是研究多倍体进化的一个理想模型,它属于十字花科,包含了多种重要的农业及园艺作物,例如白菜、甘蓝等等。

  研究人员通过Illumina、Roche 454和Sanger测序,完成了甘蓝(Brassica oleracea)的基因组草图,并将其与之前测序的姊妹种——白菜(B. rapa)进行比较。研究显示,甘蓝的基因组加倍区域存在着大量的染色体重排和基因丢失事件,其转座元件大量扩增。在甘蓝和白菜的基因组中,特定通路的基因保留和基因表达存在差异,许多旁系同源和直系同源基因出现了选择性剪切。此外,研究还鉴定了与抗癌植物素生产和形态差异有关的基因,展现了基因组加倍和差异化的结果。(白菜基因组测序:中国农科院、华大基因联合发表Nature Genetics新文章)白菜和甘蓝是我国主要的蔬菜作物,这项基因组研究不仅有助于人们进一步理解芸薹属的基因组进化,还为许多重要作物的研究提供了宝贵线索。解析芸薹属的基因组进化和分化过程,可以帮助人们更好地对相关蔬菜和油料作物进行育种。

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