证实基因组测序成功鉴定癌症相关突变

最近,UT西南医学中心的癌症研究人员表明,全基因组测序可以用来确定患者遗传性癌症的风险,这可能会促进癌症的预防、诊断和护理。 这项研究首次采用全基因组测序来评估258名癌症患者的基因组,以提高癌症诱发突变的诊断能力。相关研究结果发表在12月份的国际期刊《EBioMedicine》。 UT西南医学中心遗传学项目主任、内科医学教授Theodora Ross博士说:“全基因组测序是一种新的遗传学工具,可比以往确定一个人更多的DNA序列。我们的研究结果表明,临床上发现的突变有近90%是确信检测到的,另外还发现了其他的癌症基因突变,加之全基因组测序相关成本的降低,从而意味着这种方法将能够改善患者的护理,也会促进发现新的癌症基因。” UT西南医学中心癌症遗传学诊所的医生和遗传咨询师,帮助患者评估他们对许多类型癌症的发展风险,包括肾癌、皮肤癌、肺癌、乳腺癌、卵巢癌、结肠癌、内分泌和前列腺癌。如果一种已知的癌症遗传倾向被发现,那么Ro......阅读全文

癌症相关的基因突变类型及临床解释BLK

该基因编码src原癌基因家族的一个非受体酪氨酸激酶,典型地参与细胞增殖和分化该蛋白在b细胞受体信号传导和b细胞发育中起作用。该蛋白还刺激胰岛素的合成和分泌,对葡萄糖作出反应,并增强一些胰腺β细胞转录因子的表达。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-APLNR

该基因编码G蛋白偶联受体基因家族的一个成员编码蛋白与血管紧张素受体有关,但实际上是一种抑制腺苷酸环化酶活性的apelin受体,通过发挥高血压作用,对血管紧张素ii的压力作用起反调节作用。它在心血管和中枢神经系统、葡萄糖代谢、胚胎和肿瘤血管生成以及作为人类免疫缺陷病毒(HIV-1)受体发挥作用由选择性

Nature子刊:基因外的DNA突变会引起癌症

  随着对癌症机理认识的不断加深,我们已经找到了许多会导致癌症的基因突变,为患者带来了生命的希望。但在一个人的基因组里,只有2%的DNA是编码蛋白质信息的“基因”。剩下98%的DNA对癌症究竟有没有作用,有怎样的作用,至今依然没有一个定论。  今日,加州大学圣地亚哥分校(UCSD)的研究人员在《自然

癌症相关的基因突变类型及临床解释-BRAF

该基因编码蛋白属于raf/mil家族的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,参与调控MAP/ERKs信号通路,在细胞分裂、分化和分泌起重要作用。BRAF基因的突变与各种癌症相关,包括非霍奇金淋巴瘤,结直肠癌,恶性黑色素瘤,甲状腺癌,非小细胞肺癌,肺腺癌。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ARNT

该基因编码一个含有一个基本螺旋环螺旋结构域和两个特征性PAS结构域以及一个PAC结构域的蛋白质编码的蛋白质与配体结合的芳香烃受体结合,并有助于该复合物向细胞核移动,在细胞核中促进参与外源代谢的基因的表达该蛋白也是缺氧诱导因子1转录调控的共因子。该位点与12号染色体上的etv6(ets变异体6)基因的

癌症相关的基因突变类型及临床解释ALB

这个基因编码人类血液中最丰富的蛋白质。这种蛋白质在调节血浆胶体渗透压中发挥作用,并作为一种载体蛋白,用于多种内源性分子,包括激素、脂肪酸、代谢物以及外源性药物。此外,该蛋白具有广泛的底物特异性和酯酶样活性。编码的前蛋白经蛋白质水解处理生成成熟蛋白。从这种蛋白质衍生的肽epi-x4是cxcr4趋化因子

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ACACA

乙酰辅酶a羧化酶(acc)是一个复杂的多功能酶系统。acc是一种生物素酶,催化乙酰辅酶a羧化为丙二酰辅酶a,这是脂肪酸合成的限速步骤。ACC有两种形式,α和β,由两种不同的基因编码ACCα在成脂组织中高度富集该酶在转录和翻译水平上处于长期控制之下,通过靶向丝氨酸残基的磷酸化/去磷酸化和柠檬酸盐或棕榈

癌症相关的基因突变类型及临床解释-BAX

该基因编码的蛋白属于bcl2蛋白家族。BCL2家族成员形成异二聚体或同二聚体,并作为抗或促凋亡调节因子参与多种细胞活动。该蛋白与bcl2形成异二聚体,并作为凋亡激活剂发挥作用。据报道,该蛋白与线粒体电压依赖性阴离子通道(vdac)相互作用并增加其开放性,导致膜电位下降和细胞色素c的释放。该基因的表达

癌症相关的基因突变类型及临床解释-AGK

该基因编码的蛋白质是一种参与脂质和甘油脂质代谢的线粒体膜蛋白。编码蛋白是一种脂质激酶,催化磷脂酸和溶血磷脂酸的形成这个基因的缺陷与线粒体DNA缺失综合征10有关。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-APOE

这个基因编码的蛋白质是乳糜微粒的一个主要的凋亡蛋白。它与特定的肝脏和外周细胞受体结合,对富含甘油三酯的脂蛋白成分的正常分解代谢至关重要。该基因与载脂蛋白C1和C2基因簇中的19号染色体定位该基因突变导致家族性β-脂蛋白血症或Ⅲ型高脂蛋白血症(HLP-Ⅲ),其中血浆胆固醇和甘油三酯升高是乳糜微粒和极低

癌症相关的基因突变类型及临床解释BPTF

该基因通过其编码蛋白与针对阿尔茨海默病患者脑匀浆制备的单克隆抗体的反应性进行鉴定。对原蛋白(胎儿alz-50活性克隆1,fac1)的分析表明,该蛋白可能参与转录调控,是一种含有dna结合区和锌指基序的810a a蛋白。胎儿脑和神经退行性疾病患者中检测到高水平的FAC1这个基因编码的蛋白质实际上比最初

癌症相关的基因突变类型及临床解释ALDOC

该基因编码一类果糖二磷酸醛缩酶基因家族成员编码蛋白在大脑海马和浦肯野细胞中特异表达,是一种糖酵解酶,催化果糖-1,6-二磷酸和果糖1-磷酸分别可逆地切割为二羟基丙酮磷酸和甘油醛-3-磷酸或甘油醛。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ARAF

丝氨酸/苏氨酸 - 蛋白激酶A-Raf或简称A-Raf是人类中由ARAF基因编码的酶。[5] A-Raf是丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶的Raf激酶家族的成员。 与该家族的其他成员(Raf-1和B-Raf)相比,对A-Raf知之甚少。它似乎具有其他同种型的许多特性,但其生物学功能尚未得到彻底研究。所有

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ATRX

该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域,因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化,它调节其核基质和染色质的结合,并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)综合征有关,通常伴有α-地中海贫血(ATR

癌症相关的基因突变类型及临床解释--ALCAM

该基因编码激活的白细胞粘附分子(alcam),也称为CD166(分化簇166),是免疫球蛋白受体的一个亚家族的成员,在细胞外区域有五个免疫球蛋白样结构域(vvc2c2c2)。该蛋白与T细胞分化抗原CD6结合,参与细胞粘附和迁移过程。发现了编码不同亚型的多种选择性剪接转录变体。

同日两篇《自然》:基因突变可能抑制癌症?

  今日,《自然》杂志在线发表了两篇来自日本科研团队的最新研究论文。研究中,科学家们使用一系列遗传学的手段,找到了溃疡性结肠炎背后的常见突变基因。令人意外的是,其中一些基因突变,看起来似乎有抑制癌症的效果!  溃疡性结肠炎是一种常见的慢性炎症性疾病,病情常为带血的腹泻。如果患者的病情无法得到长期控制

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ATIC

该基因编码一种双功能蛋白,对从头嘌呤生物合成途径的最后两个步骤进行催化。N-末端结构域具有磷酸核糖氨基咪唑甲酰胺甲酰转移酶活性,C-末端结构域具有IMP环水解酶活性。该基因突变导致AICA核糖尿症。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-BLM

bloom综合征基因产物与含有dna解旋酶的desh盒recq亚群有关,具有dna刺激的atp酶和atp依赖的dna解旋酶活性。引起布鲁姆综合征的突变会删除或改变螺旋酶基序,并可能使3'-5'螺旋酶活性丧失。正常蛋白可能起到抑制不适当重组的作用。

癌症相关的基因突变类型及临床解释ALK

ALK基因编码一种受体酪氨酸激酶(eceptor tyrosine kinase ,RTK),为跨膜蛋白,属于胰岛素受体超家族,在大脑发育与及特定的神经元中起重要作用。最初在间变性大细胞淋巴瘤(anaplastic large cell lymphoma, ALCL)发现ALK-NPM1融合蛋白,目

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ACADSB

短/支链酰基辅酶a脱氢酶(ACADSB)是脂肪酸或支链氨基酸代谢中催化酰基辅酶a衍生物脱氢的酶家族中的一员底物特异性是定义该基因家族成员的主要特征。acadsb基因产物对短支链酰基辅酶a衍生物(s)-2-甲基丁基辅酶a具有最大的活性,但也与其他2-甲基支链底物和短直链酰基辅酶a发生显著反应。该cDN

癌症相关的基因突变类型及临床解释ATM

ATM基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,这种蛋白是一种重要的细胞周期检查点激酶,通过磷酸化调控下游一系列重要蛋白,包括抑癌蛋白p53和BRCA1、检查点激酶CHK2、检查点蛋白RAD17和RAD9以及DNA修复蛋白NBS1。ATM和与其密切相关的蛋白ATR被认为是在细胞周期调控以及DNA损伤

癌症相关的基因突变类型及临床解释-AXL

酪氨酸蛋白激酶受体UFO是一种人类由AXL基因编码的酶。 该基因最初被命名为UFO,因为这种蛋白质的功能不明。 然而,自其发现以来的几年中,对AXL表达谱和机制的研究使其成为一个越来越有吸引力的目标,特别是对于癌症治疗。 近年来,AXL已成为癌症细胞免疫逃逸和耐药性的关键促进因素,导致侵袭性和转移性

癌症相关的基因突变类型及临床解释ACTB

这个基因编码六种不同的肌动蛋白中的一种。肌动蛋白是高度保守的蛋白质,参与细胞运动、结构、完整性和细胞间信号传导。编码蛋白是收缩装置的主要组成部分,也是两种广泛表达的非肌肉细胞骨架肌动蛋白之一。该基因突变导致Baraitser-Winter综合征1,其特征是人类患者的智力残疾和独特的面部外观。在整个人

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ATR

该基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,与ATM(一种在共济失调性毛细血管扩张症中突变的基因编码的蛋白激酶)关系最为密切。这种蛋白和atm与pombe-rad3裂殖酵母菌(schizosaccharomyces pombe rad3)具有相似性,后者是细胞周期停滞和DNA损伤修复反应中所需的细胞

癌症相关的基因突变类型及临床解释-BCR

断裂簇区域蛋白(BCR)也称为肾癌抗原NY-REN-26,是人类中由BCR基因编码的蛋白质。 BCR是BCR-ABL复合物中的两个基因之一,其与费城染色体相关。 已经发现了编码该基因的不同同种型的两种转录物变体。 虽然BCR-ABL融合蛋白已被广泛研究,但正常BCR基因产物的功能尚不清楚。 该蛋白质

癌症相关的基因突变类型及临床解释-BCOR

该基因编码的蛋白被鉴定为bcl6的相互作用共压子,bcl6是一种POZ/锌指转录抑制因子,是生发中心形成所必需的,可能影响细胞凋亡。这种蛋白选择性地与bcl6的poz结构域相互作用,但不与其他8种poz蛋白相互作用。特定的I类和II类组蛋白脱乙酰基酶(hdacs)与这种蛋白相互作用,这表明这两类hd

癌症相关的基因突变类型及临床解释AIP

这个基因编码的蛋白质是芳香烃的受体和配体激活的转录因子。编码的蛋白质作为多蛋白复合物的一部分存在于细胞质中,但在配体结合后被转运到细胞核。这种蛋白质可以调节许多外源代谢酶的表达。此外,编码的蛋白可以特异性地结合并抑制乙型肝炎病毒的活性。已经发现了三个编码不同亚型的转录变体。

癌症相关的基因突变类型及临床解释AFDN

该基因编码一个多域蛋白,参与胚胎发育过程中细胞连接的信号和组织该基因与t(6;11)(q27;q23)易位的急性髓系白血病(americ myeloid leukemia,all-1)基因融合。另外,编码不同亚型的剪接转录变体已经被描述用于该基因,然而,并不是所有的都已经被完全描述出来了。

癌症相关的基因突变类型及临床解释BLCAP

该基因编码一种通过刺激细胞凋亡来减少细胞生长的蛋白质。选择性剪接和选择性启动子的使用导致编码同一蛋白质的多个转录变体。该基因印在大脑中,每个亲本等位基因表达不同的转录变体。从上游启动子启动的转录变体优先从母体等位基因表达,而从散布的NNAT基因(GeneID:4826)下游启动的转录变体则从父等位基

癌症相关的基因突变类型及临床解释--APC

APC为抑癌基因,所编码的蛋白在Wnt信号通路中起负调控作用,也参与到细胞迁移、粘附、转录激活和凋亡中。这个基因缺陷导致家族性腺瘤性息肉(FAP),这是一种常染色体显性遗传疾病,通常易发生癌变,主要机制为突变的APC基因缺失了与Axin的结合序列,因而不能与Axin、CK1和GSK-3β形成β-ca