韩敬东课题组研究成果在《GenomeResearch》发表

近日,国际基因组研究权威期刊《Genome Research》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所、中科院遗传与发育生物学研究所和清华大学等处的最新研究论文“Single-cell-level spatial gene expression in the embryonic neural differentiation niche”。在这项研究中,研究人员开发了一种半自动化的原位杂交图像分析流程,并使用这种分析流程,在单细胞分辨率上得出了大脑皮质层中基因的空间表达模式,以深入了解大脑皮层发育过程中所发生的关键过程。 本文通讯作者的中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所韩敬东研究员,早年毕业于中国药科大学,1996年在美国Albert Einstein College of Medicine获博士学位,1997年至1998年在美国洛克菲勒大学霍华德休斯医学研究所从事博士后研究,后在美国多家公司担IT任......阅读全文

关于LacZ基因的医学研究分析

  在医学方面,利用LacZ基因在哺乳动物中对某些重要蛋白质基因的时空表达和调控进行研究更是蓬勃发展,文献量也增加较快。在哺乳动物中枢神经系统中,翻磷脂(myelin)对于轴突的形态、功能和生长有显著影响。用由髓磷脂基本蛋白基因的启动子与LacZ基因构成的融合基因制成转基因小鼠来研究髓磷脂的时空表达

植物生长室对转基因玉米的研究分析

抗虫转基因作物之一的玉米是全球商品化最快的产品,它通过转入苏云金芽孢杆菌的 晶体蛋白基因使玉米自身产生抗虫蛋白而达到抗虫目的,对靶标害虫玉米螟有很好的控制作用。随着越来越多的转Bt基因玉米在全球大规模商业化种植,其对环境及土壤生态系统的风险评价受到了广泛的关注。植物生长室在研究过程中可以进行培育,

大型研究为癌症基因组分析奠定基础

  12月9日,国际癌症基因组协会(ICGC)在著名的《Nature Communications》杂志,发表了一篇令人瞠目的文章,它为即将到来的癌症基因组学研究时代,奠定了基础。该项目,是由Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG)和German

Nature:最大规模基因组分析研究

  一个国际研究小组完成了对所有生命形式有史以来最大规模的基因组分析研究。以前所未有的细节绘制出了真核基因的进化史,提供了有关最早期生命形式进化机制的一些新见解。  这篇发表在《自然》(Nature)杂志上的研究论文,是建立在著名古生物学家Stephen Jay Gould的研究工作基础之上,Gou

ACMG:基因芯片分析技术研究进展

  1-   采用基因芯片分析技术揭示慢性淋巴细胞白血病(Chronic Lymphocytic Leukemia)与10q24.32复发性等位基因缺失有关   Genomic microarray analysis of chronic lymphocytic leukemia reveals

Nature发布大型全基因组RNA分析研究

  由来自宾夕法尼亚州立大学的化学家和植物生物学家领导的一个研究小组开发出了一种分子技术,将有助于科学团体以从前不可能达到的规模,来分析在基因表达调控中起重要作用的分子。   科学家们开发出了一种方法,能够更精确预测在活细胞内核糖核酸分子(RNAs)的折叠情况,由此阐明植物以及其他的活体生物对环境

PNAS:研究人员开发癌症基因表达分析新技术

  密歇根大学综合癌症中心的研究人员开发了一项新技术,可更好地了解癌细胞与正常细胞中RNA有可能存在差异的原因,并将推动更深入地了解肿瘤全基因组测序检测。研究人员将这一成果发布在《美国科学院院刊》(PNAS)杂志上。   当研究人员测序癌细胞的RNA时,他们可以将之与正常细胞进行比较,看看哪里存在

DNA分析系统:基因甲基化研究的最佳工具

甲基化研究对于基因的 调控和肿瘤的发生有非常密切的关系。在一般正常的细胞中,基因调控区CpG岛处于非甲基化的状态。而当细胞发生癌变后,这些CG区域往往呈现甲基化状态。英国医学刊物《the Lancet》报道奥地利因斯布鲁克医学院的专家们早就可以通过检测大便中DNA的甲基化变化,把健康人的大便

基因及基因产物分析

  基因突变引起的单基因病往往表现在酶和蛋白质的质和量的改变或缺如。因此,酶和蛋白质的定性定量分析是诊断单基因病或分子代谢病的主要方法。根据分子代谢病的临床特点可以从三个层次检测和分析。  1.代谢产物的检测酶缺陷导致一系列生化代谢紊乱,从而使代谢中间产物、底物、终产物旁路代谢产物发生变化。因此,检

华大基因中心正研究智商基因

  中国有基因中心进行天才基因比对研究,希望解开人类智力密码。相关研究容易引起道德争议,被利用来针对某个族群。亦有学者担心,人类有朝一日会藉研究成果,透过胚胎筛选技术製造天才婴儿。   深圳华大基因中心进行的基因智力专桉,是将从世界各地收集到的2000组聪明人的基因样本,和普通人的基因样本做比对,

PNAS:新型DNA分析策略助力土壤宏基因组研究

  对于土壤微生物来说,这是最好的时代。虽然没有人进行过准确的调查,但一勺土壤中就容纳了数千亿个微生物细胞,包含成千上万的物种。密歇根州立大学(MSU)微生物生态学中心的特聘教授Jim Tiedje指出:“土壤是地球上最多样的微生物栖息地,但我们很少了解土壤微生物的身份和功能。”Tiedje和M

全球生物库荟萃分析推动全基因组关联研究

历史上,人类基因的相关发现主要源自欧洲血统的人身上,如何将这些发现很好地转移到其他非欧洲人身上,仍然是一个悬而未决的问题。 目前,一个由来自四大洲的23个生物资料库组成的合作项目,正在揭示这种多样性的缺乏所造成的差距,如遗漏的致病突变等。该项目拥有超过200万志愿者的基因组数据。 近日,发表

复旦大学最新综述:基因功能富集分析研究

  “核心刊物”迎来了新期刊:科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英

Pyrosequencing-DNA分析系统:基因甲基化研究的最佳工具

甲基化研究对于基因的调控和肿瘤的发生有非常密切的关系。在一般正常的细胞中,基因调控区CpG岛处于非甲基化的状态。而当细胞发生癌变后,这些CG区域往往呈现甲基化状态。英国医学刊物《the Lancet》报道奥地利因斯布鲁克医学院的专家们早就可以通过检测大便中DNA的甲基化变化,把健康人的大便与结肠癌患

基因组所参与的人类全基因组关联分析合作研究获重要进展

与血小板数量相关的GWAS SNP与222 kb 以外的JAK2基因相关联  日前,中科院北京基因组研究所重大疾病基因组与个体化医疗实验室“百人计划”方向东研究员项目组助理研究员渠鸿竹博士等参与开展的国际合作研究“人类疾病全基因组关联分析研究”获得重大进展。相关研究成果Systema

研究利用基因测序分析中国北方家猪的驯化路线

  2017年8月10日的《科学报告》发表了一篇名为Origin and dispersal of early domestic pigs in northern China的文章,利用基因测序分析了中国北方家猪的驯化路线。  粉红色,肉墩墩,娇憨憨,大家熟知的猪的形象,是人类驯化的结果,和它们青面

花叶芋叶片关联分析和叶绿体基因组研究获进展

广东省农业科学院环境园艺研究所特色花卉研究室在花叶芋叶片重要观赏性状关联分析和叶绿体基因组研究方面取得新进展。相关研究分别发表于Physiologia Plantarum和Genes。 花叶芋(Caladium)是天南星科花叶芋属多年生草本植物,被誉为“观叶皇后”。花叶芋资源丰富,表型性状变异丰

简述基因的影响研究

  女性生育的时间与基因存在关联。科学家通过研究发现特定的基因变异能够让生育期更长、更年期更迟,从而使一些女性拥有高于常人10%的生育率。Mills教授和其他250名研究员一起,通过对33万男女生育信息进行统计和分析,结果发现基因能够影响一个人首次性行为的时间,另外对首次怀孕的年龄以及更年期何时到来

死亡基因的研究意义

这一特别的基因会影响一个人会在一天的哪个时间段内死去。人体内几乎所有的生理过程都有一个昼夜节律,这意味着,它们的高峰值主要出现在一天的某个时间段内。甚至死亡(也是一种生理过程)也有它的昼夜节律,大多数人的死亡昼夜节律平均出现在早晨,所以大多数人通常死于早晨。有些人死亡节律时间段在上午11点左右。研究

基因功能研究策略

随着人类基因组计划的顺利进行,越来越多的新基因被发现,基因功能研究成为生命科学领域中的重大课题,目前基因功能研究方法主要有基因转导、反义技术、转基因和基因剔除、染色体转导、RNA 干涉等。一、 正常情况:DNA→mRNA→蛋白质→功能(遗传效应以及表型)二、 基因功能研究策略:1、 基因功能的获得(

基因调控的研究方法

  筛选突变型   这是在原核生物中广泛应用的方法,例如在乳糖操纵子的研究中筛选失去了基因调控能力的组成型,包括调节基因发生突变和操纵基因发生突变的突变型,以及筛选即使有乳糖或其他诱导物存在的情况下仍然不能合成β-半乳糖苷酶的超阻遏型等等。  激素诱导   在高等的真核生物中,除了离体培养的体细胞以

遗传重组热点基因研究

        遗传重组(它涉及DNA股的断开和重接以产生新的基因组合)是真核细胞生物中的一种基本的生物学过程。在哺乳动物减数分裂的时候,在这一专门化的细胞分裂过程中,来自母系和父系的染色体被一分为二并产生出精子细胞和卵子细胞,而重组过程则将同源染色体的不同部分连接在了一起,从而导致了后代中的基

转基因技术基因工程疫苗的研究

  使用DNA重组生物技术,把天然的或人工合成的遗传物质定向插入细菌、酵母菌或哺乳动物细胞中,使之充分表达,经纯化后而制得的疫苗。应用基因工程技术能制出不含感染性物质的亚单位疫苗、稳定的减毒疫苗及能预防多种疾病的多价疫苗。  目前已经商业化使用的部分基因工程疫苗:  乙肝疫苗、丙肝疫苗、百日咳基因工

基因分析的定义

中文名称基因分析英文名称gene analysis定  义对基因结构、功能等特点进行的分析。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

基因检测DNA分析

DNA分析主要用于识别单个基因异常引发的遗传性疾病,如亨廷顿病等。DNA分析的细胞来自血液或胎儿细胞。

基因型分析

Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD)Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) by  (DNA KAFFE)RAPD analysis has been successfully used in mapping

MHC基因结构分析

   一、小鼠H-2基因复合体  (一)H-2复合体的结构  本世纪30年代,Gorer在鉴定近交系小鼠血型抗原时曾发现4组红细胞抗原,命名为抗原Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ。其中抗原Ⅱ只存在于某些品系而不存在于另一些品系小鼠中。其后,Snell等用近交系小鼠中生长的肿瘤分别移植于其杂交子代,肿瘤只能在抗原Ⅱ阳性

生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功...(四)

FFPET 样本特异性RealTime ready qPCR检测潜在生物标志物假设检验我们使用的第一套临床样本来自于各种用于人类研究的福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织。肿瘤来源的 FFPE  组织是临床试验或生物标志物研究中,治疗复合物研发最具有相关性的样本材料。使用 High Pure

生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功...(二)

材料与方法 细胞培养于标准条件下进行肿瘤细胞系(ACHN、Caki、SJSA、PANC-1、MDA-MB231、AsPC-1、SK-MES、NCI-H322M、22RV1)培养。使用TWEAK或 Anti-TWEAK(RO5458640)分别对细胞进行处理。于不同时间点收集肿瘤细胞系(0、6、2

生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功...(一)

生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功能学检测RealTime ready 应用生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功能学检测RealTime ready应用 Sabine Lohmann*, Andrea Herold*, Tobias Bergauer#, Anton Belouso