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质谱和蛋白质组学:击中目标

Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008) 作者:Nathan Blow 分析测试百科 译 近年来,质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度,使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面,更从容地面对挑战。 在2008年6月的美国质谱大会(ASMS)上,用于鉴定蛋白质生物标志物(指示了疾病或疾病状态的蛋白质)的质谱仪,成为了在质谱制造厂商中反复出现的一个主题。 Waters公司(美国,马萨诸塞州,Milford)推出了一款名为Xevo TQ MS的三重四极杆质谱仪,及其相应的软件包,两者都是为推动生物标志物从发现阶段到目标蛋白的验证阶段而设计的。安捷伦科技(美国,加州,Foster市)推出了新的6400系列的三重四极杆液质联用仪,并......阅读全文

Nature年度技术:定向蛋白质组学

  时近岁末,各大杂志接连进行了年终盘点,此前出版的《Nature》杂志也对2012年进行了回顾,评点了2012年的科技进展,科技政策以及重要人物,中国科学家王俊入选了人物篇。同时《Nature Methods》也盘点了今年与明年的技术热点,选出了2012年度技术成果:定向蛋白质组学(targe

SCIEX开启微流SWATH全景蛋白组学交流之旅

  由武汉国家生物产业基地主办,武汉金开瑞生物工程有限公司承办的第一届表观遗传组与蛋白质组学技术研讨会将于2019年8月12日-14日在湖北武汉举行。  此次会议针对蛋白质组学、三维基因组、表观遗传学等热点议题展开深入研讨,邀请了来自中科院、上海交大、同济大学、华中科技大学、华中农业大学等全国知名高

QTRAP代表文献回顾

 生物分子发表的代表性文献 QTRAP:同时具有三重四极杆和线性离子阱性能的独一无二的LC/MS/MS系统       QTRAP系统最早在ASMS 2002上,作为第一台商用的线性离子阱发布,是世界上唯一的线性离子阱和三重四极杆的复合

Waters蛋白质组学软件Progenesis® QI最新版本 提高检测效率

  2017年6月1日,沃特世公司(纽约证券交易所代码:WAT)推出了蛋白质组学软件Progenesis®QI的最新版本,它使科学家能够在更短的时间内获得更准确的结果。  多年来,蛋白质组学软件Progenesis QI一直是发现蛋白质组学和生物制药应用的黄金标准,用户能够利用labelfree分析

APAF选择TripleTOF 5600系统推进蛋白质组学研究

  全球生命科学分析技术的 领导者AB SCIEX公司,今天宣布,澳大利亚的蛋白质组分析中心(APAF)选择了AB SCIEX TripleTOF 5600系统,通过显著增加蛋白质组覆盖率来帮助推进蛋白质组学研究。TripleTOF 5600 系统是生命科学产业界最快、最灵敏的高分

《Nature》:新方法提高单细胞蛋白质组学质谱定量准确度

  单细胞蛋白质组学在蛋白丰度检测、转录修饰和翻译后修饰方面填补了单细胞转录组学的空白。单细胞蛋白质组学质谱(SCoPE-MS)是近年来兴起的一种定量分析多功能单细胞蛋白质组的方法,这种方法采用同位素标记和载体蛋白质组学来分析单个细胞【1】。同位素标记具有相同质量的化学标签,其中包含了独特的质量条码

第六届AOHUPO大会报告集锦(二)

  第六届亚太人类蛋白质组组织(AOHUPO)大会于2012年5月5日下午在北京国家会议中心开幕。这是亚太地区规模最大、影响最广、学术水平最高的蛋白质组学学术峰会。有20多个国家和地区的1000多名专家学者参会,提交相关领域学术论文近400篇。5月6日,大会继续进行,各

蛋白质组技术的研究进展

  大规模基因组测序计划的实施已改变生命科学的重心,在相当短的时期内,一些原核生物和某些低等真核生物的基因组序列已被测定. 1995年,流感嗜血杆菌基因组序列首次被破译,在此后不到两年的时间,近50个细菌的基因组序列已被完成. 然而,这仅仅是理解有机物功能的一个起点. 在基因组时代,许多DNA序列信

蛋白质组技术的研究进展

大规模基因组测序计划的实施已改变生命科学的重心,在相当短的时期内,一些原核生物和某些低等真核生物的基因组序列已被测定. 1995年,流感嗜血杆菌基因组序列首次被破译,在此后不到两年的时间,近50个细菌的基因组序列已被完成. 然而,这仅仅是理解有机物功能的一个起点. 在基因组时代,许多DNA序列信息仅

蛋白质组质谱新方法一览

2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动

赛默飞在ASMS 2019:领创前行,“质”能谱动

  分析测试百科网讯 每年的ASMS大会,赛默飞总会以炫目的新产品带给大家惊喜,今年也不例外,2019 ASMS上两款新产品再次刷新了Orbitrap的记录,一款是体积小巧但性能超强的Orbitrap ExplorisTM 480质谱仪,一款是再次刷新性能极限的Orbitrap EclipseTM三

技术推广 DIA+PRM技术,全蛋白筛选及目标蛋白验证一体化

  随着质谱仪器的不断更新换代,蛋白组学的技术也不断的革新,从最早的2-D电泳技术到基于LC-MSMS的蛋白定性;从Labelfree 技术到标记定量iTRAQ/TMT技术以及时下备受推崇的DIA/SWATH技术、PRM/MRM技术,每一次的技术革新都使得蛋白组学研究更上一阶。  当下蛋白组学研究中

暨大研发另类质谱鉴定算法,大幅提高蛋白质组鉴定能力

  暨南大学的研究人员利用翻译组测序(RNC-seq)数据作为稳态细胞内蛋白质的“标准答案”,并另辟蹊径,提出了蛋白水平上的一种简单有效的多算法结果整合策略,不用做额外的实验,零成本轻松提高蛋白质组鉴定数量,同时有效降低假阳性率。  鸟枪法质谱(shotgun mass spectrometry)是

Cell杂志最受关注十篇文章:稳居年榜首的是哪篇文章?

  Cell创刊于1974年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。Cell以发表具有重要意义的原创性科研报告为主,许多生命科学领域最重要的发现都发表在Cell上。本月《Cell》前十名下载论文为:  Hallmarks of

Cell杂志最受关注十篇文章

  Cell创刊于1974年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。Cell以发表具有重要意义的原创性科研报告为主,许多生命科学领域最重要的发现都发表在Cell上。本月《Cell》前十名下载论文为:  Hallmarks of

暨大另类质谱鉴定算法策略大幅提高蛋白质组鉴定能力

  鸟枪法质谱(shotgun mass spectrometry)是蛋白质组研究的标准研究方法。从质谱谱图中鉴定蛋白质需要依赖搜库算法,现有许多算法被开发出来,常见的如Andromeda(Maxquant), Mascot, COMPASS, X!Tandem, pFind, InsPecT, P

质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法介绍

  2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人

质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法

2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(四)

无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决

第五届金属组学国际研讨会大会报告(一)

  分析测试百科网讯 2015年9月9日-12日,第五届金属组学国际研讨会在北京西郊宾馆召开,会议由中国科学院科院高能物理研究所、清华大学共同主办,来自世界各地的近200位金属组学领域的专家学者汇聚一堂,探讨金属组学的最新进展及未

5分钟了解:啥仪器让蛋白质组学界诞生如此多牛人大咖

  蛋白质组学(Proteomics)一词,源于蛋白质(protein)与基因组学(genomics)两个词的组合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。” 1994年澳大利亚的Marc Wikins首次提出蛋白质组(Proteome)的概念,1997年

赛默飞推出可定制的软件和基于云的解决方案

  分析测试百科网讯 2017年6月5日,在ASMS2017上,赛默飞发布了新型软件和基于云的解决方案,帮助生命科学研究人员从其代谢组学和蛋白质组学数据中获得更多信息,从而提高生产力。  赛默飞色谱和质谱部生命科学质谱软件平台管理高级总监Mark Sanders说:“我们致力于不断开发完整和动态的工

暨南大学最新文章:制定蛋白质组“开放式搜索”质控标准

生物质谱具有高通量、高灵敏度的分析特点,是蛋白质组学研究的核心技术之一。基于数据库搜索的肽段质谱图谱鉴定方法是目前最有效和最广泛使用的蛋白质鉴定方法,然而仅有25%的图谱能被该方法识别。生物质谱具有高通量、高灵敏度的分析特点,是蛋白质组学研究的核心技术之一。基于数据库搜索的肽段质谱图谱鉴定方法是目前

周晓光:MALDI诞生30年小记

  基质辅助激光解吸电离(也就是通常所说的MALDI)于1987年首次由Hillenkamp 及Karas提出,如今已经30年。从那时起,通过应用这一“软电离”技术与飞行时间质谱(MALDI -TOF MS)的结合,成功地实现了为生物大分子提供快速和高度可靠检测手段的目的,同时也为生命科学领域提供了

郭天南:全景式组学研究为新冠重症早诊断提供决策依据

  分析测试百科网讯 在新冠肺炎COVID-19疫情肆虐全球之际,PCR技术在快速筛查中已大显神威,但进入临床后如何更早地区分轻症和重症患者,从而更准确地治疗和用药?5月27日中国研究人员在《Cell》发表文章,利用蛋白质组学和代谢组学的全景式分析,发现了重症患者体内应对病毒进攻特征性的分子改变,并

Ruedi小组用QTRAP开发出全球首个定量蛋白质组数据库

苏黎世理工学院借助AB SCIEX的QTRAP技术研发成功全球首个蛋白质组学MRM Atlas 基于质谱的在线数据库加速蛋白质分析   福斯特市,加利福尼亚—2010年10月4日,生命科学分析技术的全球领导者AB SCIEX公司,今天宣布瑞士联邦理工学院(苏黎世理工学院,ETH)与西雅

沃特世:同中国科学家深度合作共促糖组学创新

  分析测试百科网讯 如果说基因是生命的起点,那么糖蛋白的表现很大程度上就是研究生命功能的终点。人类蛋白中有50%以上都发生了糖基化的修饰,在病理和生理过程中糖蛋白发挥了至关重要的作用,在生物制药中最亮眼的单抗药100%都是糖蛋白药物。对糖蛋白和糖蛋白质组学的研究是贯穿生物制药、疾病与临床研究生生不

Applied Biosystems/MDS在国际质谱会议上展示生产力解决方案

2008年5月27日,丹佛(商业新闻) 质谱是以前是一项复杂的、仅为受过高度训练的专家使用的技术;如今质谱是一项主力分析技术,广泛地用于科学应用领域,包括基础研究、药物研发、食品及环境污染物检验和法医分析。 将质谱这一强大的技术整合到一个方便的平台,为跨学科的科学家服务,是Applied B

AB SCIEX欢迎蛋白质组学者们参加第10届HUPO会议的技术交流会

      第10届HUPO会议将在2011年9月4-7日于瑞士日内瓦举行,届时,AB SCIEX公司将举办技术讲座交流会。欢迎来自中国和全球各地的科学工作者们注册:Register for our works

HUPO见闻:SWATH对DDA将产生巨大冲击

      近一段时间,一直不断有Mann的新技术出现,THERMO的仪器基本上都是Mann首先发出的文章;而Aebersold自从回到瑞士以后在技术方面出的东西不多,今年ASMS质谱年会发