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研究揭示microRNA定量调控规律

将系统生物学建模分析与合成生物学实验相结合解析microRNA 定量调控规律。 日前,清华大学的汪小我、谢震研究组,通过合成与系统生物学方法揭示microRNA定量调控规律。相关成果发布在《美国科学院院刊》上。 microRNA是一类短的非编码RNA,通过与靶RNA结合抑制靶基因表达,在动植物中起到重要的转录后调控作用。每一类microRNA可以结合多种靶RNA。当microRNA表达量一定时,靶RNA通过与microRNA的竞争性结合消耗细胞内游离的microRNA,从而影响其对其他靶基因的调控,这一现象被称为竞争性内源RNA(ceRNA)效应。RNAi技术中的脱靶现象也与该效应密切相关。定量地刻画ceRNA效应,对理解microRNA调控规律和改进RNAi技术都具有重要意义。 论文将系统生物学建模分析与合成生物学实验相结合,建立了microRNA调控的数学模型,构建对应的合成基因线路并植入细胞中模拟ceRNA效应,证实......阅读全文

云序客户8.0分成果揭秘还愁lncRNA功能机制如何研究吗?

  LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能的了

云序客户8.0分成果揭秘:还愁lncRNA功能机制如何研究吗?

  文章导读   LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱

主要农作物产量性状重大研究计划项目指南发布

关于发布“主要农作物产量性状的遗传网络解析”重大研究计划2014年度项目指南的通告 国科金发计〔2014〕14号   根据国家自然科学基金“主要农作物产量性状的遗传网络解析”重大研究计划的总体工作安排,现公布本重大研究计划2014年度项目指南,请依托单位及申请人按要求提出项目申请。   国家自

基因技术专题-2

RNAi技术RNA干扰(RNA interference, RNAi)是近年来发现的研究生物体基因表达、调控与功能的一项崭新技术,它利用了由小干扰RNA(small interfering RNA, siRNA)引起的生物细胞内同源基因的特异性沉默(silencing)现象,其本质是siRNA与对应

“汤姆-索亚”调节蛋白以一种撞了就跑的机制启动基因转录

  一个基因组科学家团队发现了一种“撞了就跑”的机制,它可让细胞核中的调节蛋白在涉及启动基因激活的运作时采取一种“汤姆-索亚”的行为。  他们的这一刊载于《美国科学院学报》上的研究所聚焦的蛋白是可组织基因信息从DNA流向信使RNA(mRNA)的转录因子。他们的结果显示了转录因子(TFs)是如何先激活

Nature子刊:四十年前旧假说获得新证

  大约四到六百万年前,人类与黑猩猩从进化树上分支开来。科学家们认为,基因调控序列的突变,在这一进化过程中起主要作用。现在,康奈尔大学的一项新研究,为这一理论提供了进一步的证据,文章发表在Nature Genetics杂志上。   人类和黑猩猩的蛋白差异很小,相似度超过99%。大约四十年前,科

染色质免疫沉淀法(Chromatin immunoprecitation,ChIP)

染色质免疫沉淀法(Chromatin immunoprecitation,ChIP)是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况,还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。核小体组蛋白可以发生多种翻译后的共价修饰,如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等,这些

华大基因最新研究揭开蜂类社会系统演化之谜

  在自然界中,有许多动物包括人类演化出了群居生活的社会行为。根据社会化水平高低,物种可以分为独居、兼性、初等社会性、完全社会性等四种形态。而且随着社会化程度的提高,群体内成员之间的分工也更加的明确和复杂。完全社会性是最高级的生物社会组织形态,具有群居、合作抚育幼体、繁殖分工以及世代重叠等特点。完全

兄弟非双胞胎基因完全相同 身体任何器官可互换

两人血型是罕见的“纯合子”。躺在病床上的王贵福血型检测与哥哥王贵银的配型几乎完全一样  如果两个人的基因一模一样,将意味着什么?答案很明确:从血型细胞构成等方面,完全相同的可以互换器官;从性格喜好等方面,两人也应该相同!近日,经西南医院血液科检测,一位白血病患者和比他大四

苏长青:miRNA治疗癌症?也许不是全能,但充满希望

   在百度上输入“肝癌”二字,除了一些百科性质的内容,常常还能看到“肝癌晚期能活多久”,“家人得了肝癌怎么办”,或者是“肝癌真的没得救了吗”之类的检索项。作为最常见的恶性肿瘤,原发性肝癌也许对于其它国家来说只是恶性肿瘤排行榜的一个名字,但是对于占据了全球一半新发肝癌病例的中国来说,这种疾病好似触手

基因检测临床应用中的难题:基因型与表型信息关联

  新一代测序技术的出现,使得基因组数据以及新基因突变的发现呈现爆炸式增长。基因组学研究所面临的挑战不再是单纯的数据产生,而是数据的解读。基因组学的信息如果不能和临床、表型的数据关联,就不能很好地解释复杂的基因变异以及生物学相关问题。  与大多数研究不同,临床表型信息的收集,必须考虑临床医疗环境的约

基因检测临床应用中的难题:基因型-表型关联重要性

  新一代测序技术的出现,使得基因组数据以及新基因突变的发现呈现爆炸式增长。基因组学研究所面临的挑战不再是单纯的数据产生,而是数据的解读。基因组学的信息如果不能和临床、表型的数据关联,就不能很好地解释复杂的基因变异以及生物学相关问题。  与大多数研究不同,临床表型信息的收集,必须考虑临床医疗环境的约

四川大学魏于全院士发表CRISPR新研究

  人锌指蛋白32(ZNF32)是一种Cys2-His2锌指转录因子,在细胞命运中发挥重要的作用,但是其功能仍然是未知的。近期在国际学术期刊《Oncotarget》上发表的一项研究中,来自四川大学和南开大学等处的研究人员,采用CRISPR相关的蛋白9系统,揭示了ZNF32功能在神经干细胞标记SOX2

Cell Rep:一种蛋白如何推动肿瘤转移

  最近,加州大学圣塔克鲁兹分校的分子、细胞和发育生物学副教授Jeremy Sanford发现,他一直在研究的一个蛋白质,似乎对于推动癌细胞的扩散和转移,发挥着重要的作用。这个蛋白质被称为IGF2BP3,表示“胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白3”。  IGF2BP3通常活跃在胎儿组织中,在大多数

特定细胞类型标记的细胞核分离

从大量的植物或动物组织中分离出特异性的细胞类型是费力和棘手的。为了研究表观遗传学上的改变和在不同细胞系中不同表达的基因,如癌细胞与正常细胞,或者拟南芥中两种类型的表皮细胞(epidermal cell),人们通常必须采用激光捕获显微切割(laser capture microdissection,

为生命工厂奠基 合成生物学研究期待完美基因工具

  从进化的角度讲,酵母与制作止痛剂可谓风马牛不相及。但是通过对这种微生物的基因重新进行编辑,美国斯坦福大学科学家Christina Smolke使其精确地拥有了这一功能,Smolke团队用糖作为一种原料,将酵母转变成了一个“生物工厂”,生产出了有效的止痛剂氢可酮。  这是合成生物学的有名案例之一。

专家呼吁加强我国合成生物学研究力度

  “合成生物学是21世纪初新兴的生物学研究领域,是在阐明并模拟生物合成的基本规律之上,达到人工设计并构建新的、具有特定生理功能的生物系统,从而建立药物、功能材料或能源替代品等的生物制造途径,我国必须重视和加强这一领域的研究与开发。”近日,在以“合成生物学基础前沿问题”为主题的第144期东方科技论坛

一波新的CRISPR工具浮出水面

  当你读到这篇文章时,又一波CRISPR工具将会浮出水面。它们将需要接受测试和优化。不过,如果你询问开发者你在开展概念验证研究时是否应当试用它们时,你将仅获得鼓励。毕竟,迄今为止它们还不能从Addgene公司获得,但是将会很快上市了。  最新发布的一系列CRISPR工具包括新的谱系追踪方法,该方法

Cell:剪接体与疾病

  剪接体(Spliceosomes)是由RNA和蛋白分子组成,大小为60S的多组分复合物,这种机器能进行Pre-mRNA剪接,即把内含子去除并把外显子序列连接成为成熟的mRNA,这是基因表达与调控的重要环节之一。从作用机制上来看,剪接体作为动态分子机器,需要由亚基从头逐步组装组合,来完成每个剪接事

一文了解剪切体与疾病的关系

  剪接体(Spliceosomes)是由RNA和蛋白分子组成,大小为60S的多组分复合物,这种机器能进行Pre-mRNA剪接,即把内含子去除并把外显子序列连接成为成熟的mRNA,这是基因表达与调控的重要环节之一。从作用机制上来看,剪接体作为动态分子机器,需要由亚基从头逐步组装组合,来完成每个剪接事

云序生物最新“RNA 甲基化”研究汇总-拟南芥篇

  关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,

云序生物最新“RNA 甲基化”研究汇总-拟南芥篇

  关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,

我国大规模细胞培养生物反应器综述(四)

3.2.4生物反应器中试系统设计对于生产量大的传统生物技术产品,为了对已经通过前期研究(实验室研究和市场分析)的产品进行过程优化研究,在中试规模上达到高生产水平或质量,并进而为车间生产提供工艺放大依据和设备设计依据,必要时还可进行小批量生产,提供应用试验样品、或供市场销售的部分产品。为此,近年来许多

2019年,中国“大农业”里那些高科技

   今年,我国“大农业”科研领域又诞生了诸多令人惊奇的发现,每一条都与我们息息相关。它们涵盖了观赏农业、林业、作物、医学等各个领域,包括睡莲、玉米、硅藻等进展。为了展现这些成就,本报特此就我国农业科学家今年发表的大部分重要论文进行梳理,以飨读者。野生玉米大刍草、SK、现代玉米自交系ZHENG58的

两篇Nature文章: 深入探究Myc的功能机制

  在正常细胞增殖过程中Myc基因表达受到严格调控,而在人类癌症中往往出现调控异常,此外,研究表明在小鼠中Myc异常表达可引发癌症,表明健康细胞和癌症中Myc调控基因表达的方式一定存在着差异。发表在7月9日《自然》(Nature)杂志上的两篇新文章,提供了有关Myc在正常和癌细胞中发挥不同作用的一些

细胞工程(cell engineering)技术介绍

广义的细胞工程(cell engineering)指所有应用于生物学和医学的、以细胞为操作对象的技术手段,其中也包括细胞培养。一般地说,细胞工程主要指应用各种手段对细胞不同结构层次(整体、细胞器、核、基因等)进行改造,如进行细胞融合、核移植、基因转移等,以获得具有特定生物学特性的细胞。一.细胞融

Cell惊人发现:抑癌的tRNA片段

  多年来,科学家们一直对漂浮在从细菌到哺乳动物,包括人类在内各种细胞中的一些遗传物质短片段感到困惑。它们是细胞利用来生成蛋白质的一些遗传指令的片段,但由于长度太短而无法实现它们通常的用途。在本周的《细胞》(Cell)杂志上,来自洛克菲勒大学的研究人员发现了有关这些片段在人体中所起作用的一个重大线索

Cell惊人发现:抑癌的tRNA片段

  多年来,科学家们一直对漂浮在从细菌到哺乳动物,包括人类在内各种细胞中的一些遗传物质短片段感到困惑。它们是细胞利用来生成蛋白质的一些遗传指令的片段,但由于长度太短而无法实现它们通常的用途。在本周的《细胞》(Cell)杂志上,来自洛克菲勒大学的研究人员发现了有关这些片段在人体中所起作用的一个重大线索

汤富酬Nature Cell Biology发文 揭示人类消化道发育细胞图谱

  人类胚胎发育过程中食道、胃、小肠、大肠的细胞类型图谱及其关键生物学特征。  消化系统是人体中最重要的器官系统之一,而消化道作为消化系统最重要的组成部分,其在食物消化、营养吸收、废物排泄、抵抗微生物入侵等多个方面起着极其重要的作用。消化道主要由食道、胃、小肠、大肠组成。揭示这四种器官在人类胚胎发育

用化学常识解释转基因

  河南日报退休高级编辑,大河健康报退休总编,河南农大兼职教授,中国新闻奖获得者。  各位女士、各位先生:  大家好。大家都是经常来图书馆借书、看书的读者,如今喜欢看书的人真是难能可贵。看年龄,大家多数是60后、50后,少数是70后、40后。大家可能都不是生物专业的大学生,但是大家在中学阶段都学过化