7月9日《自然》杂志精选

封面故事: 南太平洋中的溶解铁 本期封面所示为整个南太平洋中溶解铁的一个三维视图。深海热液喷孔是铁(能够限制海洋生产力的一种必要痕量元素)的一个重要来源。最近的研究工作对人们长期所持的一个观点提出了质疑。该观点认为,从这种喷孔排放出的铁大部分都被在距离其来源很近的地方从海水中除去了,因此对于海洋生物地球化学的重要性有限。Joseph Resing等人报告了来自 “东太平洋海隆”南部的水热溶解的铁和其他痕量金属在南太平洋超过4000公里范围内的横向传输。利用来自从厄瓜多尔的曼塔和塔希提的帕皮提之间的35个水文地理站收集的样本获得的数据,本文作者估计,全球水热溶解的铁对海洋的输入量至少要比以前所报告的输入量大四倍。在一个模型研究的帮助下,他们提出:铁的物理化学稳定过程使得水热活动能够通过支持南大洋中的浮游植物生长来显著影响碳循环。 成星过程的控制 Dawn Erb分析了恒星反馈在限制恒星形成中所起的作用,重点关......阅读全文

北京基因组所发表RNA甲基化新发现

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA最后流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以在不改变DNA序列的基础上调控基因的表达,并由此决定细胞的分化和发育情况。实际上,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。  N6-methyladenosine(m

进行全基因组甲基化检测需要多少钱

建库是5000块钱一个库,测序就是1500每G,看您要测多少G的数据量,信息分析大概要5000块钱左右吧。。。

单细胞测序揭示了人类胚胎DNA甲基化动态

  2017年12月19日,北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心、生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组和北京大学第三医院乔杰研究组合作在国际知名学术期刊《自然遗传学》上在线发表题为“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimpla

《Nature》子刊:植物“永生”细胞甲基化重编程机制

  生殖细胞通常被认为是“不朽的”,因为它们的遗传物质可被后代完全继承。  DNA甲基化是DNA的一种修饰,能在不改变基因序列的前提下改变DNA活性。以DNA甲基化等修饰为核心的表观遗传学是当代生命科学发展最快的领域之一,在改善人类和植物健康等方面具有很高潜力。  DNA甲基化重编程是动物体内最常见

吉大和华大基因联合发现线虫基因组中存在DNA甲基化现象

2012年10月18日,吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象,改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史,同时也使以DNA甲基化

北京基因组所等发现RNA甲基化调控基因出核新机制

  中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂研究组和郑州大学第一附属医院生殖与遗传专科医院孙莹璞研究组、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究组合作研究,揭示了m5C(5-甲基胞嘧啶)修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。该研究成果以5-

dna甲基化与rna甲基化的区别

DNA甲基化和组蛋白修饰的相同点:都有包含甲基化修饰;不同点:修饰对象不同,一个是对DNA修饰,一个是对蛋白:组蛋白修饰。而RNA干扰是对RNA的降解,与前两者差异较大。

研究首次揭示DNA主动去甲基化可靶向病毒基因

βC1在体外和体内增强DME活性。中国农科院植保所供图  近日,中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队联合清华大学生命科学学院,首次发现植物病毒可以利用植物的DNA主动去甲基化机制来逃逸植物的防御反应,相关研究结果在线发表于《自然—通讯》(Nature Communicati

Nat-Commun:老化细胞中DNA甲基化扮演关键角色

  尽管在每个人的一生中其机体的DNA会一直保持不变,但是科学家们却知道机体DNA在不同年龄阶段的行使的功能却并不相同。随着个体年龄增加,机体DNA的甲基化模式会发生剧烈变化,DNA的甲基化模式被认为是机体DNA的第二种遗传密码,可以控制基因的开启或关闭,然而这些改变引发的后果却依然是一个谜。

在单细胞水平预测DNA甲基化的新方法

   如今,DNA甲基化的检测已经达到了单细胞的分辨率。不过,目前的方法还不能完整覆盖CpG,总是留下一些缺口。英国的一个团队最近开发出一种计算方法,可准确填补这些缺口。这项结果发表在《Genome Biology》杂志上。  研究人员使用所谓的深度神经网络策略来开发他们的方法,并命名为DeepCp

Cell发布革命性DNA甲基化分析技术

  Whitehead研究所的研究人员开发出了一种方法,监测单个细胞中随着时间推移发生的DNA甲基化改变。这一突破性的研究成果发布在顶级科学期刊《细胞》(Cell)杂志上。  DNA甲基化对正确控制基因表达及细胞身份——使得细胞具有相同遗传物质的细胞变为神经细胞、肌肉细胞或皮肤细胞,起至关重要的作用

细胞化学词汇细胞癌基因

中文名称:细胞癌基因存在位置:正常的细胞基因组激活前作用:促进正常细胞生长增殖分化和发育激活后作用:使细胞发生恶性转化定义:存在于正常的细胞基因组中,与病毒癌基因有同源序列,具有促进正常细胞生长、增殖、分化和发育等生理功能。细胞癌基因:存在于正常的细胞基因组中,与病毒癌基因有同源序列,具有促进正常细

罗氏甲基化捕获试剂创新甲基化研究方法

  自2004年美国批准Vidaza (azacitidine)可用于血液疾病( 如MDS)的治疗以来,通过改变致病基因的表观遗传学特征进行疾病治疗的方法,为人们带来了疾病的新治疗策略。然而,由于表观遗传检测方法的局限,要确定基因的碱基在何处以何种程度被甲基化一直以来困扰着研究者,从而难以确定基

解锁5分m6A甲基化谱文章新思路

1.构建OSC细胞模型--MG63/DXR作者选择人的OS细胞系--MG63,通过阿霉素DXR诱导,建立了多药耐药性细胞株--MG63 / DXR。并通过分析其特定的细胞表面标志物CD133和CD117 / STRO-1;干细胞相关基因的表达量;皮下注射对裸鼠的致瘤潜力等多个方面数据证明MG

-Nature重大成果:最全面的人类器官表观基因组图谱

  多年来,科学家们成功获得了人类基因组的工作图——编码人类生命的完整DNA序列图像。而现在他们仍然在往这一图集添加新页面——散布在DNA链上,影响了基因抑制的化学标记物——甲基的图谱。  来自Salk研究所的科学家们报告称,他们构建出了来自个体捐赠者(包括女人、男人和孩子)十多种不同人类器官最全面

甲基化msap方法的引物需要筛选吗

甲基化msap方法的引物需要筛选DNA甲基化是一种表观遗传修饰,它是由DNA甲基转移酶(DNA methyl-transferase,Dnmt)催化S-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体,将胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶(mC)的一种反应,在真核生物DNA中,5-甲基胞嘧啶是唯一存在的化学性修饰碱基.CG二核苷酸

《细胞》:人类原始生殖细胞研究获重要成果

   封面设计源于中国古代象征生殖的图腾——玄武,寓意哺乳动物通过有性生殖(蛇与龟)来维持完整的生命周期(圆环),而中心处的生殖细胞(红色)则在遗传信息的世代沿袭中起着非常关键的作用   人类生殖细胞系(精子、卵细胞及原始生殖细胞)、囊胚以及着床后胚胎体细胞的DNA甲基化水平示意图   父本印迹基因

DNA甲基化在肿瘤发生中的作用

越来越多的研究表明,在肿瘤形成过程中包含两大类机制。一个是通过DNA核苷酸序列改变而形成突变,即遗传学机制。肿瘤作为一种遗传学疾病在分子生物学领域已经得到证实。另外一个就是表观遗传学(epigenetics)机制,即不依赖DNA序列改变导致基因表达水平的变化,它在肿瘤形成过程中的作用越来越受到重视。

甲基化领域重要研究成果解读!

  本文中,小编整理了近年来科学家们在甲基化研究领域取得的重要研究成果,与大家一起学习!  【1】Science:重大进展!揭示DNA甲基化增强基因转录机制  doi:10.1126/science.aar7854  DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能够在不

中科院学者最新Nature改写教科书对DNA甲基化酶的分类

   雌性哺乳动物的一生中只能提供有限数目的卵子。卵子的DNA甲基化水平很低,只有精子和绝大部分终末分化的体细胞的DNA甲基化水平的一半左右。然而,卵子的这种独特的DNA甲基化状态是怎样形成的,受哪些因子调控,又有着怎样的生物学意义却并不清楚。  中科院生物物理研究所的研究人员发表了题为“Stell

研究人员揭示超级增强子动态甲基化调控转录异质性

  CpG DNA甲基化早在70年代就被提出是一种用来控制基因表达的DNA化学修饰,而我们对DNA甲基化在基因组不同区域的具体功能,在疾病、发育过程中所扮演的具体角色,以及控制基因表达的详细机理,直到今天并没有全面详细的认知。  2019年8月15日,美国Whitehead研究所Rudolf Jae

什么是甲基化?

甲基化,是指从活性甲基化合物上将甲基催化转移到其他化合物的过程,可形成各种甲基化合物,或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内,甲基化是经酶催化的,这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸加工。

什么是甲基化

甲基化是指从活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上将甲基催化转移到其他化合物的过程。可形成各种甲基化合物,或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内,甲基化是经酶催化的,这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸(RNA)加工

甲基化的概念

甲基化,是指从活性甲基化合物上将甲基催化转移到其他化合物的过程,可形成各种甲基化合物,或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内,甲基化是经酶催化的,这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸加工。

DNA甲基化分析

The influence of methylation on the promoter activity and gene expression and the involvement of DNA methylation in carcinogenesis caused an extensive

什么是甲基化?

  甲基化是指从活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上将甲基催化转移到其他化合物的过程。可形成各种甲基化合物,或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内,甲基化是经酶催化的,这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸(RNA)加工。

RNA甲基化测序

1、NSUN2影响m5C在HEK293细胞中整体分布情况NSUN2被报道是RNA甲基转移酶,能使tRNAs和mRNA发生m5C甲基化修饰。为了探究NSUN2对HEK293细胞mRNA m5C甲基化修饰的影响。作者利用CRISP/Cas9技术敲减NSUN2(NSUN2-/-HEK293细胞)后进行

RNA甲基化研究

近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》(影响因子:

什么叫甲基化

甲基化(Methylation)指向底物引入甲基的过程,一般是以甲基取代氢原子.在生物系统内,甲基化是经酶催化的,这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸(RNA)加工.重金属修饰可以在生物系统外发生.组织样本的化学甲基化也是组织染色的方法之一.甲基化是蛋白质和核酸的一

DNA甲基化预测

实验概要本实验分别对DNA片段、基因、启动子和外显子进行了甲基化的计算预测,并且随机选择了1000甲基化的和1000未甲基化的个体进行预测。用于甲基化预测的特征有:GC相关特征、四联体频率、转录因子结合位点(TFBSs)。所有预测方法均采用Weka提供的软件进行。实验步骤1. DNA甲基化数据本研究