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深入研究非编码RNA的新工具

最近,加拿大多伦多大学Donnelly中心的一个研究小组,开发出了一种方法,可使科学家们能够深入探索“ncRNAs在人类细胞内做了什么”。 这项研究发表在5月19日的《Molecular Cell》杂志,同一天,来自新加坡基因组研究所的Yue Wan研究组与斯坦福大学的Howard Chang研究组分别在《Molecular Cell》和《Cell》发表论文,他们开发出了类似的方法,研究不同生物中的RNAs。相关阅读:清华张强锋博士Cell发布RNA研究重要成果。 在人类基因组的30亿个代码中,只有百分之二的蛋白质编码基因。基因被复制、转录成信使RNA(mRNA)分子,它们为构建细胞中的蛋白质提供了模板。剩余98%的基因组,最初被一些人认为缺乏功能的重要性。然而,大部分的非编码基因组——在一半和三分之一之间,也被复制到RNA。 结果,所产生的ncRNAs可能做什么,取决于你问的是谁。一些研究人员相信,大多数ncRNAs......阅读全文

Nature里程碑式成果:“垃圾”DNA的起源

  来自宾州大学的研究人员取得了一项里程碑式的研究新发现:他们发现了转录起始的精确位点,从而为解析基因组“暗物质”的起源迈出了重要的一步。这一研究成果公布在9月18日的《Nature》杂志上,这将有助于分析复杂疾病特征所在的确切位置。   所谓基因组“暗物质”,其实就是基因组中的非编码RNA——不

中科大最新Nature子刊发现lncRNA新功能

来自中科大的消息,中国科学技术大学教授单革课题组发现并命名了一个长链非编码RNA――5S-OT,并发现在灵长类中,5S-OT RNA获取了调控多个基因可变剪切的新功能。该研究成果发表在10月3日出版的《自然-结构和分子生物学》上。论文的共同第一作者为课题组的博士生胡珊珊和硕士生王小林。从酵母到人类的

我国学者揭示长链非编码RNA顺式调控基因表达的新模式

  国际学术期刊Cell Stem Cell(《细胞·干细胞》)于近日在线发表了清华大学医学院沈晓骅研究组的最新研究成果“Divergent lncRNAs regulate gene expression and lineage differentiation in pluripotent cel

科学家发表非编码RNA相互作用数据库NPInter v4.0

  非编码RNA对生物分子的调控作用,一直是RNA功能研究的前沿。在以往的研究中,非编码RNA被发现可以和蛋白质、RNA以及基因组相互作用,调控复杂生物过程。比如经典的长非编码RNA Xist可以和X染色体相互作用并影响剂量补偿效应。理解非编码RNA和生物分子的相互作用对于研究非编码RNA的功能以及

【盘点】长链非编码RNA的研究进展

   非编码RNA在生命调控过程中扮演着重要角色,近年来的研究成果常入选CNS年度十大科学突破。人类基因组转录区高达76%,但转录产物中只有不到2%是编码蛋白质的mRNA,其他均为非编码RNA,其中microRNA (miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)等调控

中科大发现新型生命“暗物质”或与重大疾病有关

  非编码RNA(核糖核酸),被称为生命体中 “暗物质”。日前,中国科学技术大学单革教授实验室发现一类新型环状非编码RNA,并揭示了此类非编码RNA的功能和功能机理。成果发表在国际知名杂志《自然·结构和分子生物学》上。    非编码RNA是一大类不编码蛋白质,但在细胞中起着调控作用的RNA分子。正如

RNA与机体健康研究最新进展一览

  【1】Cell:我国科学家揭示环状RNA在先天免疫中起着重要作用  doi:10.1016/j.cell.2019.03.046  在真核生物中,共价闭合的环状RNA(circular RNA, circRNA)是由前体mRNA反向剪接数千个基因的外显子产生的。它们通常低水平表达,并经常表现出细

起底RNA,跑龙套还是暗黑教主?

  9月20日,一篇“新研究挑战分子生物学中心法则”的报道表示,发表在《科学》杂志上的新研究表明,RNA在DNA修复过程中短暂现身,随后隐退。这一发现被认为是RNA在DNA“失能”时,主持生命密码的传递工作。视觉中国  然而,在1957年,英国科学家弗朗西斯·克里克在学术会议讲座最先提出“中心法则”

专家指南:如何研究基因调控(一)

随着基因组学研究的深入,人们已经不再满足于了解基因的功能,而是对基因调控表现出愈加浓厚的兴趣。现在,我们知道,DNA甲基化和组蛋白修饰可调控基因,microRNA和非编码RNA也可以。基因调控的研究工具也越来越多,包括RNA-seq、ChIP-seq、ChIP-chip等。究竟该采用哪种方法来测定m

eLife:首次发现促癌非编码RNA因子—LAST

  中国科学技术大学吴缅教授研究组发现一条受c-Myc转录激活的长非编码RNA。  中国科学技术大学吴缅教授研究组发表了题为“LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA

不得了,大牛告诉你lncRNA甲基化如何研究

  lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。   RNA甲基化,作为最新的国

非编码RNA为癌症研究提供新思路

  澳大利亚纽卡斯尔大学和中国科技大学等机构合作完成的两项最新研究表明,非编码RNA(核糖核酸)在癌症治疗方面存在巨大潜力,有助于开发出新型的癌症靶向治疗方法。  非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA。长期以来,全球各地开展的癌症研究主要针对能编码蛋白质的基因,这些基因只占人类基因组的2%。  发表

上海生科院揭示非编码RNA和转座子在长寿中的作用机制

  3月21日,中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所研究员韩敬东在《细胞-报告》(Cell Reports)上在线发表了题为Impact of Dietary Interventions on Noncoding RNA Networks and mRNAs Encoding Chromatin

蛋白质机器与生命过程调控重点专项2个项目启动

  近日,国家重点研发计划蛋白质机器与生命过程调控重点专项“植物非编码RNA-蛋白质复合机器的功能和作用机制” 项目和“高分辨率冷冻电镜新技术新方法的发展及在结构生物学中的应用”项目的实施启动会在清华大学召开。教育部科技司、清华大学科研院、科技部高技术研究发展中心和项目参与单位相关人员参加了启动会。

非编码RNA结合肌细胞增强因子2D调控肌肉发育

  近日,农科院特产研究所李光玉研究员带领的研究团队发现了一个新的在肌肉发育过程中发挥重要功能的长非编码RNA,该非编码RNA-Irm通过直接结合肌细胞增强因子2D来调节肌源性基因的转录,进而调节肌生成。该研究结果为动物肌肉生长发育研究提供了新的调节因子和表观调控机制,对深入解析肌肉生长发育的分子调

中国科学家Nature子刊发布lincRNA研究重要发现

  来自香港中文大学、中国科学院广州生物医药与健康研究院的研究人员证实,一种叫做Linc-YY1的lincRNA分子通过与转录因子YY1互作,促进了成肌分化和肌肉再生。这一研究发现发布在12月11日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。  香港中文大学的王华婷(Huat

长非编码RNA与肺癌转移

  我们体内的大多数DNA(约80%)并没有编码蛋白,不过它们会转录为RNA。这些非编码的RNA分子负责在细胞中实现多种功能。microRNA等小RNA已经被研究得很多了,近年来人们又发现了一类长非编码RNA,这些RNA拥有两百个以上的核苷酸。   长非编码RNA对细胞周期、细胞生长和细胞死亡等细

一文速览丨2019年曹雪涛团队在Science,PNAS发表成果盘点

  2019年,曹雪涛团队在Science,Nature Immunology,PNAS 等杂志上发表了13篇重要研究成果,在免疫学领域取得重大进展,iNature系统盘点一下曹雪涛团队的研究成果:  【1】干扰素-γ(IFN-γ)对于细胞内细菌固有的免疫反应至关重要。 非编码RNA和RNA结合蛋白

Cell子刊:超保守lncRNA的重要功能

  谈到遗传物质,我们往往指的是从父母那儿继承到的DNA(脱氧核糖核酸)。这些DNA会转录成为RNA,进而指导各种蛋白质的合成,例如血红蛋白或胰岛素。除了这些RNA之外,细胞中还存在着大量神秘的非编码RNA。  MicroRNA是最广为人知的一种非编码RNA,这种微小的分子控制着众多基因的启动和关闭

从心脏病到癌症——长非编码RNA到底发挥了什么作用?

  直到近几年才发现人类基因的70%是非编码RNA,非编码RNA不能翻译为蛋白质,但仍在人体中发挥重要作用。Stefanie Dimmeler是首批发现一个microRNA亚群在血管再生中发挥重要作用的研究人员之一,她最近获得了欧洲研究委员会(ERC)的ERC高级研究员资助,这使她能够对另一群非编码

9月15日《自然》杂志内容精选

    封面故事: 科学家被控过失杀人  2009年4月6日,意大利中部Abruzzo地区发生6.3级地震,对几个中世纪山区城镇造成严重损害。超过300人失去了生命,大约1500人受伤,65000人短时间无家可归。今年早些时候,6名科学家和1名政府官员因未能评估和告知地震的潜在风险而

我国学者发现新型非编码核糖核酸

  中国科学技术大学单革教授实验室近期发现了一种新型的环状非编码核糖核酸(RNA),为进一步揭示人类生命原理,以及未来解释并防治一些重大疾病提供参考。该研究成果日前发表在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》上。   核糖核酸(RNA)是存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体,而非编码R

张建之教授PNAS解析RNA编辑

  如果一些编码位点的RNA编辑受损,就会引起严重的疾病。因此,一些人认为编码性RNA编辑是对人体有利的。   近年来的基因组研究显示,人类基因组中有超过一千个编码位点受到了RNA水平上的A(adenosine)-to-I(Inosine)编辑。许多这样的RNA编辑事件属于非同义替换。   现在

非编码RNA(ncRNA)在前列腺癌发生发展中的作用机制

  人类基因组计划的研究结果显示, 仅有2.5万~3万个蛋白质编码基因, 占总基因组序列不到3%, 其余基因组序列转录产生的RNA都是非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA). ncRNA与恶性肿瘤发生发展关系密切. 近年来, 关于ncRNA中的长链非编码RN(lncRNA)以及环

全国核糖核酸学术讨论会在沪召开

中国生物化学与分子生物学会理事长、上海生科院院长李林院士致词  今天,第九届全国核糖核酸(RNA)学术讨论会在中科院上海生科院举行。中科院上海生科院王 恩多院士、陈晓亚院士、中科院北京遗传发育所曹晓风院士、中国医学科学院/第二军医大学曹雪涛院士、中科院北京生物物理所陈润生院士、清华大学孟安明院 士、

生命科学家陈玲玲:倾力探索未知,揭示谜底

  在生命科学奇妙世界里,存在许多鲜为人知的神秘“暗物质”,非编码RNA(核糖核酸)就是其中之一。中国科学院生物化学与细胞生物学研究所研究员陈玲玲长期从事长非编码RNA领域的前沿研究,致力于发现分子家族,破解基因密码,揭开生命神秘面纱。  这位40岁的年轻女科学家认为,探索是极有意义的挑战,“如果人

精准医学:是变革,还是新壶装旧酒

  精准医学的概念不是美国总统奥巴马首次提出的,却因他的大名而成为2015年医学界最热的关键词。今年,各种形式的医学学术会上,精准医学都成为必不可少的“座上宾”。  什么是精准医学?  ——在生命科学和医学实践所处的重要转折点上应运而生  2015年1月20日,美国总统奥巴马在美国国会作国情咨文报告

Cell Reports报道揭示非编码RNA和转座子在长寿中的作用机制

  3月21日,中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所研究员韩敬东在《细胞-报告》(Cell Reports)上在线发表了题为Impact of Dietary Interventions on Noncoding RNA Networks and mRNAs Encoding Chromatin

北京林大在新型非编码RNA转录调控机制方面取得新进展

  近日,国际植物学TOP期刊《Plant Biotechnology Journal》(IF: 7.443, 植物学一区)发表北京林业大学林木分子育种创新团队研究成果,题目是“Osmotic stress-responsive promoter upstream transcripts (PROM

中国科大等在非编码RNA研究方面取得新成果

  9月25日,国际学术期刊《自然—通讯》在线发表了中国科学技术大学生命科学学院单革教授实验室的研究论文Escherichia coli noncoding RNAs can affect gene expression and physiology of Caenorhabditis elegan