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科学家发现新的RNA降解机制

在任何时候,一个生物体中的全部RNA分子,都是一段微妙的舞蹈所产生的产物。基因必须是“打开”或表达的,以便于把DNA转化为RNA,然后RNA被转化成蛋白质,才能完成一个生物体的生理需求。但是,同样重要的是,那些RNA转录本一旦不再需要就必须被清除。 最近,宾夕法尼亚大学的研究人员对于后面这个过程提出了一种新的见解,他们确定了一种新的RNA分子降解机制。由宾夕法尼亚大学生物系副教授Brian D. Gregory博士及该系博士后Xiang Yu带领的这项研究,提供了第一个证据表明,在植物中,RNA降解可能与RNA翻译发生在同一个空间和同一时间内。鉴于在酵母中确定了类似的过程,宾大的这项研究表明,这可能是一个进化上保守的过程。相关研究结果发表在10月7日的国际著名植物学期刊《Plant Cell》。延伸阅读:Cell揭示RNA降解新机制;Cell颠覆传统观点,mRNA降解的新故事;清华大学Nature子刊揭示RNA降解新机制。......阅读全文

Science杂志最受关注的文章(4月)

  美国的《Science》杂志由爱迪生投资创办,是国际上著名的自然科学综合类学术期刊,与英国的《Nature》杂志被誉为世界上两大自然科学顶级杂志。Science杂志主要发表原始性科学成果、新闻和评论,许多世界上重要的科学报道都是首先出现在Science杂志上的,比如艾滋病与人类免疫缺陷病毒之间的

RNA提取与RT-PCR

 1.RNA的提取  RNA的提取其实原理很简单:通过变性剂破碎细胞或者组织,然后经过氯仿等有机溶剂抽提RNA,再经过沉淀,洗涤,晾干,zui后溶解。但是由于RNA酶无处不在,随时可能将RNA降解,所以实验中有很多地方需要注意,稍有疏忽就会前功尽弃。  1.1分离高质量RNA  成功的cDNA合成来

血与泪的RNA抽提抽提经验

对大部分实验人员来说,RNA 抽提比基因组 DNA 抽提要困难得多。事实上,现有的 RNA 抽提方法/试剂,如果用于从培养细胞中抽提 RNA,比抽提基因组 DNA 更方便,成功率也更高。那为什么同样的方法用于组织 RNA 的抽提,总会碰到问题呢?组织 RNA 抽提失败的两大现象是: RNA 降解和组

RNA抽提经验

对大部分实验人员来说,RNA 抽提比基因组 DNA 抽提要困难得多。事实上,现有的 RNA 抽提方法/试剂,如果用于从培养细胞中抽提 RNA,比抽提基因组 DNA 更方便,成功率也更高。那为什么同样的方法用于组织 RNA 的抽提,总会碰到问题呢?   组织 RNA 抽提失

RNA提取和RT-PCR

真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从DNA PCR得到我们需要的基因呢?因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为内元(intron),真正编码蛋白的区段是被这些内元隔开的,这些编码区叫做外元(exon)。真核生物的DNA转录成为RNA之后,经过剪切和拼接,去掉这些非编码区,才形成成熟

增加RT-PCR灵敏度

分离高质量RNA成功的cDNA合成来自高质量的RNA。高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。RNA的质量决定了你能够转录到cDNA上的序列信息量的最大值。一般的RNA纯化方法是使用异硫氰酸胍/酸性酚的一步法。Trizol试剂法(见下图)将一步法加以提高,可以从多种

RT-PCR技术及RNA提取策略-3

成功的RT PCR的要素1、高质量RNA 成功的cDNA合成来自高质量的RNA。高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。RNA的质量决定了你能够转录到 cDNA上的序列信息量的最大值。一般不必使用oligo(dT)选择性分离poly(A)+RNA。不管起始模

RT-PCR实验方法大全

RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求:1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不会出太大问题。 3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单

阿尔茨海默病患者RNA降解更快,这或是一个治疗新线索

  阿尔茨海默症是目前最常见的一种痴呆症,虽然发现至今过去了100多年,但它的潜在机制仍然没有被完全理解,目前也没有任何有效的治疗方法。近期,一项发表于Nature Communications上的研究发现,阿尔茨海默症患者的RNA降解速度更快,RBFOX1蛋白不足。  这项研究将焦点放在mRNA分

RNA抽提注意事项和经验指南-1

背景介绍实验前方法/试剂的选择问题解答 (外源性污染导致的问题不在本解答考虑中)RNA 抽提的“三大纪律八项注意”Rnase 污染的10大来源RNase 和 DEPC 处理RNA 抽提的10大窍门提高 RNA 得率经典抽提小技巧特殊组织的抽提样品冻融的影响RNA 质量的判断RNAguard:使降解成

RNA抽提注意事项和经验指南-1

背景介绍实验前方法/试剂的选择问题解答 (外源性污染导致的问题不在本解答考虑中)RNA 抽提的“三大纪律八项注意”Rnase 污染的10大来源RNase 和 DEPC 处理RNA 抽提的10大窍门提高 RNA 得率经典抽提小技巧特殊组织的抽提样品冻融的影响RNA 质量的判断RNAguard:使降解成

阿尔茨海默病患者RNA降解更快,这或是一个治疗新线索

  阿尔茨海默症是目前最常见的一种痴呆症,虽然发现至今过去了100多年,但它的潜在机制仍然没有被完全理解,目前也没有任何有效的治疗方法。近期,一项发表于Nature Communications上的研究发现,阿尔茨海默症患者的RNA降解速度更快,RBFOX1蛋白不足。  这项研究将焦点放在mRNA分

阿尔茨海默病患者RNA降解更快,这或是一个治疗新线索

  阿尔茨海默症是目前最常见的一种痴呆症,虽然发现至今过去了100多年,但它的潜在机制仍然没有被完全理解,目前也没有任何有效的治疗方法。近期,一项发表于Nature Communications上的研究发现,阿尔茨海默症患者的RNA降解速度更快,RBFOX1蛋白不足。  这项研究将焦点放在mRNA分

Nat Rev Genetics | 环状RNA的合成与功能

  环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明,环状RNA具

RT-PCR成功的几个要素

1、高质量RNA成功的cDNA合成来自高质量的RNA。高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。RNA的质量决定了你能够转录到cDNA上的序列信息量的最大值。一般不必使用oligo(dT)选择性分离 poly(A)+RNA。不管起始模板是总RNA还是poly(A)

PCR仪的用途及使用方法

 PCR的用途及使用方法真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从DNA PCR得到我们需要的基因呢?因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为内元(intron),真正编码蛋白的区段是被这些内元隔开的,这些编码区叫做外元(exon)。真核生物的DNA转录成为RNA之后,经过剪切和拼接,去掉

RNA提取和RT-PCR

在做Northern等杂交实验、构建cDNA文库、获取能够编码真核生物蛋白的基因、获得RNA病毒基因时,会用到RNA提取和RT-PCR技术。真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从DNA PCR得到我们需要的基因呢?因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为内元(intron),真正编码蛋白的区段是

PCR仪的用途及使用方法

PCR仪的用途及使用方法真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从DNA PCR得到我们需要的基因呢?因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为内元(intron),真正编码蛋白的区段是被这些内元隔开的,这些编码区叫做外元(exon)。真核生物的DNA转录成为RNA之后,经过剪切和拼接,去掉这些非编码

科学家发现新形式的mRNA调控

  RNA,曾经被认为是DNA和蛋白质之间的一个“中间人”,现在被公认为是一个阶段,许多调控过程可以在这个阶段上进行,以允许基因表达的灵活性,从而使细胞和组织发挥功能。  最近在《Plant Cell》杂志上发表的一项新研究中,宾夕法尼亚大学的生物学家使用来自人类和植物的材料,检测信使RNA(mRN

RNA提取的流毒非浅的经典误区

RNA提取的流毒非浅的经典误区(RNA提取的实践指南) 最近碰到了好几个RNA提取的初学者来实验室学习如何提取RNA,对于如此简单的操作,却有如此多的人提取不出来,细问一下,原来他们的知识来源都是书本上或者网上的“RNA提取注意事项一类”的所谓经验,其实,他们提取不出来的真正原因,恰恰是他

用RNase III制备siRNA库来诱发RNAi(1)

小分子干扰RNA (Small interfering RNA ,siRNA ) 是一种非常有效的工具,能够在包括哺乳动物细胞在内的多个体系中抑制特定基因的表达,从而研究某个基因的功能或者是相关信息。但是这种强有力的方法的难题之一是需要设计,合成siRNA s 和验证其效果,从而找到最有效的

RNA抽提注意事项和经验指南-4

经典抽提小技巧 1: Phenol 纯化:将等体积的 1:1 Phenol/Chloroform 加入,剧烈混允 1-2 分钟。高速离心 2 分钟。小心取上清 (80-90%)。决不能取到中间层。可以使用等体积的反应液加入 Phenol/Chloroform 中,同样再取出上清。将两次的上清

生物芯片入门(三):基因表达谱芯片实验操作1

待检测样品制备生物样品往往是非常复杂的生物分子混合体,除少数特殊样品外,一般不能直接与芯片反应,必须将样品进行生物处理。从血液或活组织中获取的DNA/mRNA样品在标记成为探针以前必须扩增以提高阅读灵敏度,但这一过程操作起来却有一定的难度。比如在一个癌细胞中有成千上万个正常基因的干扰,杂合癌基因的检

核酸分离与纯化的设计与原则

细胞内的核酸包括DNA与RNA两种分子,均与蛋白质结合成核蛋白(nucleoprotein)。DNA与蛋白质结合成脱氧核糖核蛋白(deoxyribonucleoprotein,DNP),RNA与蛋白质结合成核糖核蛋白(ribonucleoprotein,RNP)。其中真核生物的DNA又有染色体DNA

如何选择最佳的全血DNA、RNA提取方法?

从全血中提取DNA和RNA应该说是最基本的工作了,提取的DNA和RNA质量的好坏直接影响了下游的实验和分析,可供选择的方法非常多,乱花渐欲迷人眼,如何选择最适合的方法,成了很多人实验开始前最难以抉择的事情。我们从两个方面,层层剥茧,分析最佳的实验方法。 1、全血的采集保存和DNA的提取I. 用含抗凝

样本抽提中RNA降解的解决方法

  从临床样本出发进行芯片、测序等高通量生物学研究是最常用的思路,但样本采集过程受制于病理特征、病例数量等因素,耗时费力。无数期盼等来了期待中的临床样本,做个RNA抽提还常常……   降解样本的RNA完整度低,长链RNA变成了短链,在常规的扩增过程中会发生探针检测的目的片段的丢失,导致芯片结果的不

Nature揭秘RNA降解机制

  就好像我们利用碎纸机来销毁不再有用或包含有潜在破坏性信息的文件一样,细胞利用一些分子机器来降解不必要或有缺陷的大分子。来自马克斯普朗克生物化学研究所(MPIB)的科学家们,现在揭示出了细胞核区室利用一种特异的RNA外来体(exosome)的机制——这一大分子机器负责了核糖核酸(RNAs)的降解和

RNA抽提- 成功经验法则

本期专文要来跟大家讨论的话题是核糖核酸(RNA)的萃取,看到这里各位心中可能已经起了疑问: RNA 萃取不是很简单吗?只要照着标准步骤操作,加一加试剂就完成了,有必要大费周章特地开篇幅来谈这件事吗?其实越简单的东西遇到困难时就越难解,各位看倌就请耐着性子,听我们娓娓道来。Lab 的经验和客户

Nat Struct Mol Biol:冷冻电镜技术揭示RNA降解新通路

  2013年12月15日,清华大学生命科学学院王宏伟教授课题组在《Nature》子刊《Nature Structural and Molecular Biology》在线发表题为“Visualization of Distinct Substrate Recruitment Pathways

清华大学王宏伟教授发表最新Nature子刊文章

  2013年12月15日,清华大学生命科学学院王宏伟教授课题组在《Nature》子刊《Nature Structural and Molecular Biology》在线发表题为“Visualization of Distinct Substrate Recruitment Pathways