Antpedia LOGO WIKI资讯

基因调控程序在进化中被循环利用

长久以来,科学家受到一个问题的困扰:在进化过程中,控制胚胎发育的基因调控程序是一次性“创生”多次利用,还是在不同物种中各自形成了不同的新程序?据《每日科学》4月17日报道,最近,澳大利亚和美国的一个联合小组通过对一种关键转录因子结合位点的研究发现,调控生物中胚层发育的基因程序一直是被“循环利用”的,而不是动物们各自的独创。相关论文发表在最近出版的《自然·遗传学》上。 生物的每个细胞中遗传信息都是一样的。不同细胞之所以显出不同的性质,是因为基因活性受到遗传程序的调控,通过基因开关,形成了肌肉、骨骼、肝脏及其他多种类型细胞。胚胎发育过程有着严格的时间和空间次序,基因程序控制着这种次序性,使DNA(脱氧核糖核酸)上的一维信息逐渐发展成生物体的三维结构。胚胎干细胞定向逐级分化由复杂的调控网络控制,涉及多个功能基因开启与关闭,转录因子在决定基因是否表达及转录效率中起重要作用。 联合小组选......阅读全文

高通量的转录因子活性检测

  转录因子(transcription factor,TF)在真核生物的基因表达过程中发挥着重要作用,或调节基因表达的强度,或控制目的基因的时空特异性表达,或应答外界刺激和环境胁迫。近年来,随着干细胞研究的不断升温,人们对转录因子的兴趣也日益浓厚。同一个基因组,为何最终分化成不

ArrayStar转录因子活性ELISA检测法

ArrayStarTM转录因子活性ELISA试剂盒可以快速、灵敏地检测细胞核提取物中转录因子的DNA结合活性。试剂盒采用96微孔板,标记探针是生物素标记的双链寡核甘酸片段,含有转录因子的特异性DNA结合序列。当标记探针与细胞核抽提物一起孵育时,核抽提物中活性形式的转录因子与探针特异性结合,形成转录因

Nature Methods报道革新性结合蛋白分析技术:SMiLE-seq

  洛桑联邦理工大学的科学家们开发出了一种革新性测序技术,能更快,更准确,更高效的分析DNA结合蛋白,这将会改变遗传学的游戏规则。这一研究成果公布在1月16日的Nature Methods杂志上。  基因是指产生细胞所有蛋白质的DNA编码,作为这一重要生理进程的开始,基因首先必须从DNA转录成RNA

Nature Methods报道革新性结合蛋白分析技术:SMiLE-seq

  生物通报道:洛桑联邦理工大学的科学家们开发出了一种革新性测序技术,能更快,更准确,更高效的分析DNA结合蛋白,这将会改变遗传学的游戏规则。这一研究成果公布在1月16日的Nature Methods杂志上。  基因是指产生细胞所有蛋白质的DNA编码,作为这一重要生理进程的开始,基因首先必须从DNA

Cell:揭秘转录因子如何相互作用制造心脏

  刊登于Cell杂志上的一项研究报告中,来自格莱斯顿研究所(Gladstone Institutes)的科学家们近日通过研究发现三种转录因子可以彼此相互作用,并且同基因组相互作用从而影响胚胎心脏的形成,如果没有这些蛋白质(转录因子)的相互作用就会引发新生儿出现严重的先天性心脏缺损;通过理解心脏发育

启动子与转录因子/基因表达调控蛋白

目的基因的表达调控生命活动丰富多彩、千变万化。但是万变不离其宗,不管如何变化都围绕着中心法则展开。核酸作为遗传物质指导蛋白质的表达,表达产生的一些特殊蛋白(如转录因子、调控蛋白)反过来又对DNA指导合成蛋白质的过程进行调控。对基因表达调控的研究一直是生物学研究热点,涉及到生命活动的各个过程,也是各类

研究蛋白质与DNA相互作用的主要方法

  一、引言   在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。   重组DNA技术的发展,人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要:   a、鉴定分析

研究蛋白质与DNA相互作用的主要方法

一、引言在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。重组DNA技术的发展,人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要:a、鉴定分析参与基因表达调控的DNA元件

Science:相分离与基因转录间存在怎样的关联?

  DNA结合转录因子(TF)是真核基因表达的典型调节因子。针对转录因子的早期研究揭示出它们的结构良好的DNA结合结构域(DNA binding domain, DBD)并鉴定出转录所需的功能上至关重要的激活结构域(activation domain, AD)。后来很明显的是,许多激活结构域包含着固

研究团队发现玉米籽粒发育与灌浆协同调控中心因子

  近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员巫永睿课题组在Plant Cell上,在线发表了题为The B3 Domain-Containing Transcription Factor ZmABI19 Coordinates Expression of Key Factors Require

狙击艾滋病毒――“引蛇出洞”还是“关门打狗”?

  曾庆平   有很多非专业或跨专业人士对于人类为何数十年攻克不了艾滋病难题感到迷惑不解,那是因为他们不太了解艾滋病毒致病的“特洛伊木马”机制。   艾滋病毒之所以能“摧毁”人类的免疫系统,是因为它们专门感染并杀死免疫细胞。不过,只要它们在免疫细胞内复制并产生新的病毒,人体都能立即识别它们并设法

真核基因转录水平的调控-2

(3)增强子的位置可在基因5′上游、基因内或其3′下游的序列中,而其作用与所在基因旁侧部位的方向似无关系,因为无论正向还是反向,它都具有增强效应;(4)增强子所含核苷酸序列大多为重复序列,其内部含有的核心序列,对于它进入到另一宿主之后重新产生增强子效应至关重要;(5)增强子一般都具有组织和细胞特异性

张余课题组揭示细菌Class III转录激活机制

  9月28日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心合成生物学重点实验室研究员张余课题组在Nature Chemical Biology上,在线发表题为CueR activates transcription through a DNA distortion mechanism的研究论文,主要研究细菌

Hoxb5细胞的命运我做主将B细胞重编程为功能性T淋巴细胞

  小编:天地悠悠过客匆匆潮起又潮落~~~   小鼠甲:咳咳,咱们是个严肃的科普节目……   小编:天地洪荒,宇宙万物,生命起源,又到了万物~~~   小鼠乙:(咆哮体)现在是冬天!冬天!咱们几(今)天要讲的是细胞!细胞!   小编:呃(⊙o⊙)… 好吧,咱们今天要讲的是细胞(*^▽^*),

Nature Biotechnology:可取代ChIP-seq的新技术

  生物体内的所有细胞都携带着相同的遗传物质——DNA。不同细胞读取和表达不同的部分,从而实现特异性的功能。比如说,神经细胞表达的基因帮助它们给其他神经细胞传递信息,而免疫细胞表达基因帮助它们合成抗体。  这样的基因表达受到转录因子的控制,但人们一直很难定位功能性转录因子在DNA上的结合位点。之前的

ChIP 新手心得

最近有不少战友在做ChIP实验,希望我的一点经验对大家有帮助(本贴不谈实验步骤,最后我会附件一份说明书,有详细步骤,另外建议像我一样的新手用试剂盒,避免不必要的麻烦)一、原理转录从基因的启动子区开始,由一系列的转录因子结合到基因的启动子区,通用转录因子结合在基本启动子区起始转录,而这个过程对基因的转

揭秘效应性T细胞和耗竭性T细胞早期命运决定

  T细胞耗竭(T cell exhaustian)是广泛存在于慢性感染和癌症环境中的一种现象。在慢性系统性炎症疾病中,耗竭性T细胞(Tex cells)是控制抗原的主要参与者之一,其高表达免疫抑制分子诸如PD-1, Tim-3 和Lag-3。治疗药物如Anti-PD-1 blockade Nivo

EMSA实验问题与解答

以下问题是以Promega公司试剂盒为例。凝胶迁移实验1)什么是凝胶迁移或电泳迁移率实验?凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互

三篇Nature Methods:定位基因组的调控序列

  科学家们利用染色质对DNase消化和Tn5转座的敏感性,对基因组的调控序列进行定位和解读。   近来越来越多的证据显示,许多遗传学差异并非直接影响基因,而是改变控制基因开/关的调控序列。近期Nature Methods杂志上发表了三篇文章,介绍了在基因组中定位调控序列的新技术,阐述了进行数

Nature:表观遗传与基因调控的新发现

  最近在《Nature》杂志发表的一篇研究中,瑞士Friedrich Miescher生物医学研究所(FMI)的Dirk Schübeler和他的研究小组,描述了转录因子和DNA表观遗传修饰之间的相互作用,会对基因调控有何影响。科学家发现,转录因子可以通过DNA甲基化模式的改变而间接合作:通过去除

Cell子刊发布首个植物转录因子文库

  近日科学家们借助自动化平台,建立了首个植物遗传学开关的综合性文库,以帮助全球学者更好的理解植物对环境改变的适应,培育更好的植物品种。相关论文于七月十七日发表在Cell旗下的Cell Reports杂志上。  该文库的建立耗时八年,包含大约两千个植物转录因子的克隆。转录因子是天然的遗传学开关,研究

基因激活疗法可抑制小鼠肝损伤

  洛杉矶加利福尼亚大学的化学家Hsian-Rong Tseng 说:“这是一项非常令人兴奋的工作,这将使转录因子传输到另一个不同的领域。”  我们的细胞产生超过一千个独特的转录因子,它们每一个都会结合到DNA的一个特定区域来提示基因的转录:从DNA创建 RNA模板来合成新的蛋白质。改变这些因子的活

PNAS:“打了就跑”的转录因子

  细胞核中的调控蛋白,在活化基因时采取了一种“打了就跑”(hit-and-run)的策略。美国国家科学院院刊PNAS杂志上发表的一项最新研究,深入解析了这种高效的转录模式。  “就像马克吐温笔下闯了祸就跑的汤姆·索亚一样,转录因子结合启动子并激活转录之后就会立即离开,让小伙伴们去继续自己未完成的工

控制植物胚珠发育的重要机制

  植物的种子是人类和动物的重要食物来源,而种子是从受精后的胚珠发育而来的。植物的胚珠由多种细胞和组织组成,其中包括最为重要的种系细胞(germline cell)。研究植物胚珠的发育过程的分子调控机理以及其中的种系细胞的命运决定机制一直是植物生物学领域的研究热点。1999年,科学家们通过遗传学方法

转录因子活性ELISA

转录因子活性ELISA是建立在ELISA基础上的高灵敏度的检测方法,比EMSA的灵敏度高l0倍,在5h内就能完成。不涉及放射性和凝胶电泳,安全简便,而且这种微孔板的形式能同时检测1—96个样品。ArrayStarTM转录因子活性ELISA试剂盒可以快速、灵敏地检测细胞核提取物中转录因子的DNA结合活

酵母双杂交技术及其在蛋白质组研究中的应用

作为后基因组时代出现的新兴研究领域之一, 蛋白质组学(proteomics)正受到越来越多的关注。 蛋白质组学的研究目标是对机体或细胞的所有蛋白质进行鉴定和结构功能分析。 蛋白质组学的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白质分离技术如二维凝胶电泳和高效液相层析, 经典的蛋白质鉴定方法如氨

酵母双杂交技术及其在蛋白质组研究中的应用

     作为后基因组时代出现的新兴研究领域之一, 蛋白质组学(proteomics)正受到越来越多的关注。 蛋白质组学的研究目标是对机体或细胞的所有蛋白质进行鉴定和结构功能分析。 蛋白质组学的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白质分离技术如二维凝胶电泳和高效液相

调控基因表达的“染色质环”新因子筛选获进展

  中国科学院广州生物医药与健康研究院、生物岛实验室研究员姚红杰课题组通过系统性筛选在基因组上与CTCF共定位的转录因子,鉴定出大量与CTCF存在高共定位率的新转录因子,并选取了转录因子BHLHE40进行后续的功能验证,发现BHLHE40可以调控CTCF在基因组上的结合,进而影响其介导的远

李平华团队开发出高通量研究玉米基因位点新技术

李平华(左二)和研究生查看模式植物长势 山东农大供图  10月9日,《自然—通讯》在线发表了山东农业大学农学院教授李平华等中外科学家合作研究成果。他们探索出高通量研究玉米转录因子调控位点的新技术,利用大规模转录因子数据重新构建了玉米叶片基因表达调控网络,使玉米基因编辑不再“大海捞针”。  玉米是世界

云序生物为你解密ATAC-seq研究方案

  ATAC-seq最近几年是比较火的一种测序技术。那ATAC-seq技术到底什么呢?ATAC-seq的全称是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing, 运用测序手段研究转座酶可接近的染色质的一种技术。该技术通过转座酶对某