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通过高通量测序分析细菌群落分布提供文物保护新思路

2月7日,中国科学技术大学科技史与科技考古系龚德才教授团队在国际期刊《Scientific Reports》发表学术论文,题为《考古发掘前墓葬环境研究新视角:通过高通量测序分析细菌群落分布》(A new perspective on studying burial environment before archaeological excavation: analyzing bacterial community distribution by high-throughput sequencing)。该文报道了通过16S rRNA扩增子测序的方法对湖北荆州望山桥一号楚墓的细菌多样性和群落分布加以分析,结果证明墓葬环境不同取样点的微生物群落组成各异,而盗洞内样品的差异性更为明显。研究表明文物材料的保存状况和细菌群落的分布息息相关,发现不动杆菌属可能在墓葬中有机质文物的降解中起到重要作用,而拟杆菌属的大量存在则有利于文物的保存。......阅读全文

通过高通量测序分析细菌群落分布 提供文物保护新思路

  2月7日,中国科学技术大学科技史与科技考古系龚德才教授团队在国际期刊《Scientific Reports》发表学术论文,题为《考古发掘前墓葬环境研究新视角:通过高通量测序分析细菌群落分布》(A new perspective on studying burial environment bef

高通量测序

  高通量测序技术又称“下一代”测序技术,以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。高通量测序包括:大规模平行签名测序、聚合酶克隆、454焦磷酸测序、离子半导体测序和DNA 纳米球测序等技术。  高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DN

高通量测序技术

没有测序的癌症诊断是不完整的,完整的癌症诊断应该包括一系列基于细胞遗传学技术、荧光原位杂交技术、标准分子技术以及NGS的预后与预测性分析。对于早期癌症患者来说,NGS序列分析在多种癌症的筛查技术中具有不容忽视的代表性;而对于晚期癌症患者,大量的侵入性测试往往只能筛查出少数几个药物靶点。 随

首份全球土壤细菌群落图谱绘成

  一个国际研究小组在最新一期《科学》杂志上发表论文称,根据其绘制出的首份全球土壤细菌群落图谱,占比仅为2%的500多种细菌主导着整个地球土壤的生态过程,它们将成为科学家未来的重点研究目标。图片来源网络    土壤中的细菌占地球生物总量的很大一部分,它们在调节陆地碳动态变化、营养循环及植物生产能力等

转录组高通量测序

(第二代高通量测序技术-454)  转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titanium第二代

什么是高通量测序

高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

高通量测序的意义

  高通量测序技术的诞生可以说是基因组学研究领域一个具有里程碑意义的事件。该技术使得核酸测序的单碱基成本与第一代测序技术相比急剧下降, 以人类基因组测序为例, 上世纪末进行的人类基因组计划花费 30 亿美元解码了人类生命密码, 而第二代测序使得人类基因组测序已进入万(美)元基因组时代。如此低廉的单碱