细菌Argonaute蛋白生成和加载DNA引导链的分子机制

近期,《分子细胞》(Molecular Cell)杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所王艳丽课题组及其合作者关于细菌Argonaute(Ago)蛋白独立生成和加载DNA引导链的最新研究成果,题为Autonomous Generation and Loading of DNA Guides by Bacterial Argonaute。 真核生物的Ago蛋白是RNA干扰通路的重要组分,它们利用小的RNA引导链靶向互补配对的RNA分子。RNA引导链的成熟和加载是通过不同的酶来完成的一系列催化反应。Ago蛋白也存在于原核生物中,它们参与抵抗外源入侵的DNA。与真核Ago蛋白利用RNA引导链靶向RNA分子不同,大量研究表明原核Ago蛋白利用DNA引导链靶向DNA分子。但是小干扰DNA(small interfering DNA, siDNA)引导链如何产生并加载到原核Ago蛋白的分子机制依然有待研究。 嗜热菌(Thermust......阅读全文

研究发现HYL1蛋白调控miRNA介导的翻译抑制过程

  中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在The Plant Cell上,发表了题为Cytoplasmic HYL1 modulates miRNA-mediated translational repression的研究论文。该研究组发现,HYL1蛋白除了介导m

我国科学家解析小RNA的生物合成机制

  小RNA是真核生物中重要的基因调控分子,在生长发育、基因沉默、抵御病毒等动植物的各类生理过程中起着至关重要的作用。小RNA的生物合成中,Dicer家族核酸内切酶选择性识别小RNA前体,切割RNA至特定长度,并选择性地将一条链递呈给下游AGO蛋白从而介导下游基因沉默。Dicer如何起到“分子尺”和

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北大,中科院最新Nature子刊揭示miRNA的新调控作用

  生物通报道:中科院遗传与发育生物学研究所,北京大学生科院的研究人员发现了一个单子叶植物所特有的、受RSV侵染抑制的水稻负调控抗病因子miR528,这项研究揭示了miR528及其调控的靶基因在水稻与病毒相互作用过程中的抗病机制。  这一研究成果公布在Nature Plants杂志上,文章的通讯作者

Cell公布2012最佳论文中国学者成果入选

  Cell杂志创刊于1976年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。在最新一期(12月21日)Cell杂志内容公布的同时,也盘点了本年度最佳论文,其中清华大学的戚益军研究组关于DNA双链断裂修复中起重要作用的新型小分子RN

Cell公布2012最佳论文中国学者成果入选

Cell杂志创刊于1976年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。在最新一期(12月21日)Cell杂志内容公布的同时,也盘点了本年度最佳论文,其中清华大学的戚益军研究组关于DNA双链断裂修复中起重要作用的新

Cell公布2012最佳论文中国学者占三篇

  Cell杂志创刊于1976年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。在最新一期(12月21日)Cell杂志内容公布的同时,也盘点了本年度最佳论文,其中清华大学的戚益军研究组关于DNA双链断裂修复中起重要作用的新型小分子RN

可在微量细胞中鉴定RBP作用靶点的新技术LACEseq被开发

  人类基因组编码了约1500个RNA结合蛋白(RNA-binding protein, RBP),它们往往通过结合RNA分子上的特定基序或结构元件而调控细胞内各种RNA分子的加工、定位、翻译和稳定性等。RBP在早期生殖、个体发育、细胞分化、增殖和凋亡等几乎所有的生理过程中都发挥了关键的调控作用。R

LACEseq方法在微量细胞中准确鉴定PTBP1的结合靶标

  6月10日凌晨,中国科学院生物物理研究所研究员薛愿超课题组及其合作者在Nature Cell Biology上,在线发表了题为Global profiling of RNA-binding protein target sites by LACE-seq的论文。  人类基因组编码了约1500个R

微生物所发现真菌跨界Small-RNA作用新机制

  自然界中,不同物种间进行着广泛的生物大分子交流,包括蛋白、DNA和RNA等(Zhao and Guo, 2019)。近年来,由跨界传递的small RNA(sRNA)介导的RNA沉默(RNA silencing or RNA interference,RNAi)受到了广泛关注。  RNAi是真核

韩春雨发表的NgAgo又有新功能!

  CRISPR/Cas 系统具有编辑 DNA 和 RNA 靶标的强大能力。然而,CRISPR/Cas 系统对特定识别位点、PAM 的需求限制了其在基因编辑中的应用。一些 Argonaute (Ago) 蛋白在 5' 磷酸化或羟基化引导 DNA (gDNA) 的引导下具有核酸内切酶功能。Ng

环状RNA研究深度剖析(二)

目标circRNA的机制研究 a RIP-qPCR:挑选功能最为明显的1个circRNA做RIP-qPCR实验,检测circRNA是否与AGO2蛋白结合。(AGO2是circRNA发挥海绵作用的指示蛋白) b RNA pull down:对上述circRNA进行RNA pull down实验,拉

AGO3基因编码功能及结构描述

该基因编码Argonaute家族的一个成员,在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的,包含PAZ结构域和PIWI结构域,可能在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用该基因位于1号染色体上,由Argonaute 4和真核翻译起始因子2C,1等家族成员串联而成。已鉴定出两个编码不同亚型的转录变体[由

AGO2基因的结构特点及作用

该基因编码Argonaute家族的一个成员,在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的,包含一个PAZ结构域和一个PIWI结构域它可能与dicer1相互作用,在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。

AGO2基因编码功能及结构描述

该基因编码Argonaute家族的一个成员,在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的,包含一个PAZ结构域和一个PIWI结构域它可能与dicer1相互作用,在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2009年9月]This gene e

RNA干扰相关知识RNARISC

RNA-induced silencing complex(RISC):一种RNA-蛋白质复合物,通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC,miRNA组装miRISC。RISCs(无论siRISC还是miRISC)包括两种类型:切割型和不切割型。

RNAinduced-silencing-complex(RISC)的功能和用途

RNA-induced silencing complex(RISC):一种RNA-蛋白质复合物,通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC,miRNA组装miRISC。RISCs(无论siRISC还是miRISC)包括两种类型:切割型和不切割型。

贺福初院士、周钢桥研究员发表癌症新成果

  来自军事医学科学院放射与辐射医学研究所的研究人员,通过遗传关联研究和功能分析调查了AGO2单核苷酸多态性(SNPs)与鼻咽癌风险之间的关系。这项研究发布在本月的《BMC Cancer》杂志上。  国际著名细胞生物学家、遗传学家贺福初(Fuchu He)院士和军事医学科学院放射与辐射医学研究所的周

北大学者发表Cell论文:首次发现外源植物蛋白可抗肿瘤

癌症作为一种细胞异常增殖的疾病,是全球主要的公共卫生问题。癌症的诱因非常复杂,是胞内多种调控通路的突变和微环境共同作用的结果,其中微小RNA(miRNA)是近年来被认为与癌症发生息息相关的重要RNA分子。在哺乳动物中,具有2-nt 3' 末端悬垂的成熟miRNA双链可以被Argonaute(

科学家发现西瓜抗黄瓜绿斑驳花叶病毒的基因

近日,中国农业科学院郑州果树研究所瓜果质量安全监测与控制技术创新团队发现西瓜抗黄瓜绿斑驳花叶病毒的基因。相关研究成果发表于《分子植物病理》(Molecular Plant Pathology)。ClAGO1和ClAGO5沉默加重了黄瓜绿斑驳花叶病毒的症状,病毒积累量增加。中国农科院供图黄瓜绿斑驳花叶

最新发现两种肠道微生物的Ago酶,能够常温切割DNA

  2019年7月30日,中科院动物研究所王皓毅团队和中科院北京生命科学研究院赵方庆团队合作,在 Cell Discovery 杂志发表了题为:Argonaute proteins from human gastrointestinal bacteria catalyze DNA-guided cl

Core-RISC的概念

Core RISC:是介导目标mRNA切割过程或者翻译抑制的最小的RNA-蛋白质复合物。在人和果蝇身上发现的分子量少于200kDa的RISCs可能就是core RISC的重要代表。AGO蛋白质和Core RISC密切相关。

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Core RISC:是介导目标mRNA切割过程或者翻译抑制的最小的RNA-蛋白质复合物。在人和果蝇身上发现的分子量少于200kDa的RISCs可能就是core RISC的重要代表。AGO蛋白质和Core RISC密切相关。

Core-RISC的概念

Core RISC:是介导目标mRNA切割过程或者翻译抑制的最小的RNA-蛋白质复合物。在人和果蝇身上发现的分子量少于200kDa的RISCs可能就是core RISC的重要代表。AGO蛋白质和Core RISC密切相关。

-Genes--Devel:科学家揭示老化和神经变性之间的内在关联

  阿尔兹海默氏症和亨廷顿氏症等疾病经常和老化相关,但是其两者之间的关系却一直并不清楚,近日,来自美国罗格斯大学的研究人员通过对常见果蝇的小RNA分子进行研究来揭示疾病发生和老化之间的关系,相关研究成果刊登于国际杂志Genes & Development上。   Ammar Naqvi教授

RNA蛋白免疫沉淀技术简介

RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。RIP这种新兴的技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合

推动癌症发展的RNA结合蛋白

  最近,一项关于白血病细胞基因表达的研究,发现了一种RNA结合蛋白,在推动癌症的发展过程中起着重要的作用。该蛋白通常活跃在胎儿组织,在成年人体内是关闭的,但它在一些癌细胞中被再度活化。这种表达模式使它成为抗癌药物的一个有吸引力的靶标,因为阻断它的活动,不太可能造成严重的副作用。  这项新的研究,发

科学家发现西瓜抗黄瓜绿斑驳花叶病毒的基因

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502734.shtm近日,中国农业科学院郑州果树研究所瓜果质量安全监测与控制技术创新团队发现西瓜抗黄瓜绿斑驳花叶病毒的基因。相关研究成果发表于《分子植物病理》(Molecular Plant Pathol

AGO3基因突变与药物因子介绍

该基因编码Argonaute家族的一个成员,在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的,包含PAZ结构域和PIWI结构域,可能在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用该基因位于1号染色体上,由Argonaute 4和真核翻译起始因子2C,1等家族成员串联而成。已鉴定出两个编码不同亚型的转录变体[由

AGO3基因的结构特点和功能作用

该基因编码Argonaute家族的一个成员,在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的,包含PAZ结构域和PIWI结构域,可能在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用该基因位于1号染色体上,由Argonaute 4和真核翻译起始因子2C,1等家族成员串联而成。已鉴定出两个编码不同亚型的转录变体。