ASHG2017|基因组中的大片段重复让人类与众不同

美国人类遗传学协会(ASHG)2017年会于本周在佛罗里达州奥兰多举行。这是遗传学界的一大盛事,每年吸引数千名科学家参加。在会议上,他们介绍遗传学各个方面的研究进展。 10月17日,加州大学戴维斯分校的Paulina Carmona-Mora介绍称,人类基因组中的大片段非编码DNA的重复可能造成人类与非人灵长类动物之间的差异。鉴定这些重复及其对性状和行为的影响,也许有助于解释遗传对人类疾病的贡献。 Paulina Carmona-Mora、Megan Dennis博士及其同事研究了人类特异重复(HSD)的历史,这些超过1,000 bp的DNA片段在人类中重复出现,而灵长类动物或其他动物却没有。在这项研究中,他们重点关注不编码基因但调控其他基因表达的HSD区域。 “这些调控元件的独特之处在于,它们往往影响同一染色体上附近基因以及基因组中其他区域的表达,”Dennis博士说。“这意味着一个重复可能影响许多基因,扩大其影响。......阅读全文

基因重复的概念

基因重复(英语:Geneduplication)是指含有基因的DNA片段发生重复,可能因同源重组作用出错而发生,或是因为反转录转座(retrotransposition)与整个染色体发生重复所导致。这些基因的复制品通常可幸免于选择压力,也就是说,这类突变在生物体中一般无负面的影响。也因此突变的速度高

重复基因的概念

重复基因指染色体上存在多数拷贝基因,重复基因往往是生命活动最基本,最重要的功能相关的基因。

重复基因的分类

重复基因经常被分为两种类型:(1):中等重复DNA序列(moderately repetitive DNA)。由相对较短的序列组成。在基因组中,其重复次数一般在10~1000次。这些序列遍布整个基因组,并负责mRNA前体剪接时二级结构的形成(这是内含子中的反向重复序列配对形成双链体区域)。(2):高

细胞化学词汇基因重复

中文名称:基因重复外文名称:Geneduplication意    义:含有基因的DNA片段发生重复原    因:因同源重组作用

关于基因重复的简介

  基因重复在演化过程中扮演重要角色,近百年中受到科学界中许多成员的支持。大野干在1970年的著作《基因重复造成的演化》(Evolutionbygeneduplication)中发展了这个理论。此外科学家认为,酵母菌的整个基因组,在1亿年前经历了重复作用。植物体内也常见基因组的完整重复现象,例如小麦

基因重复的研究进展

基因重复是基因通过不等交换、逆转录转座或全基因组重复等途径产生一个与原基因相似的基因或碱基序列。它与生物体基因组大小的进化、新基因的起源、物种的分化以及基因抗突变的能力大小等都密切相关。文章综述了重复基因的产生机制、保留机制、选择作用、分化途径以及重复基因进化速率等方面的相关研究,揭示了基因重复对生

基因重复的概念和影响

基因重复(英语:Geneduplication)是指含有基因的DNA片段发生重复,可能因同源重组作用出错而发生,或是因为反转录转座(retrotransposition)与整个染色体发生重复所导致。这些基因的复制品通常可幸免于选择压力,也就是说,这类突变在生物体中一般无负面的影响。也因此突变的速度高

关于重复基因的类型介绍

  重复基因经常被分为两种类型:  (1):中等重复DNA序列(moderately repetitive DNA)。由相对较短的序列组成。在基因组中,其重复次数一般在10~1000次。这些序列遍布整个基因组,并负责mRNA前体剪接时二级结构的形成(这是内含子中的反向重复序列配对形成双链体区域)。 

分子遗传学词汇重复基因

重复基因指染色体上存在多数拷贝基因,重复基因往往是生命活动最基本,最重要的功能相关的基因。

分子遗传学词汇基因重复

中文名称:基因重复外文名称:Geneduplication定义:基因重复(英语:Geneduplication)是指含有基因的DNA片段发生重复,可能因同源重组作用出错而发生,或是因为反转录转座(retrotransposition)与整个染色体发生重复所导致。这些基因的复制品通常可幸免于选择压力,

发现重复基因剪接信号演化特点

  近日,中科院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所孔祥银课题组张振国等人发现基因重复后基因剪接信号演化特点,以及这些变化对基因新结构形成的影响,该成果在线发表在《基因组生物学》(Genome Biology)杂志上。   在物种进化过程中,基因重复是经常发生的。那么基因重复后,基

细胞核基因组——重复顺序

  高度重复顺序其长度可能2、4、6、8等几个bp,较长的顺序可达200bp,但是重复拷贝数可达106次以上,例如染色体着丝粒、端粒和Y染色体长臂上的异染区就是由高度重复顺序的卫星DNA构成的,高度重复顺序不能转录,它们参与染色体结构的维持,形成结构基因间隔,可能与减数分裂时同源染色体的联会配对有关

水生所揭示重复基因新歧化功能

  重复基因被认为是基因功能歧化和新功能产生的源泉。鱼类特有的基因组加倍事件产生了大量的重复基因,这些重复基因为基因功能歧化和新功能产生提供了良好材料。近日,由中科院水生生物研究所桂建芳研究员主持的鱼类发育遗传学学科组在鱼类重复基因功能歧化研究上取得了重要进展。   他们首先在养殖鱼类银鲫中发现鉴

关于基因重复的研究进展介绍

  基因重复是基因通过不等交换、逆转录转座或全基因组重复等途径产生一个与原基因相似的基因或碱基序列。它与生物体基因组大小的进化、新基因的起源、物种的分化以及基因抗突变的能力大小等都密切相关。文章综述了重复基因的产生机制、保留机制、选择作用、分化途径以及重复基因进化速率等方面的相关研究,揭示了基因重复

关于基因重复的基本信息介绍

  基因重复(英语:Geneduplication)是指含有基因的DNA片段发生重复,可能因同源重组作用出错而发生,或是因为反转录转座(retrotransposition)与整个染色体发生重复所导致。这些基因的复制品通常可幸免于选择压力,也就是说,这类突变在生物体中一般无负面的影响。也因此突变的速

研究揭示多态性重复基因的基因组演化机制

  近百年来,进化遗传学工作致力于探索重复基因的起源机制和功能演化过程。经典观点认为,基因重复后产生两个完全等同的拷贝,其中一个冗余拷贝在自然选择作用下获得新功能。也有观点认为,剂量效应和不完整基因重复等因素使重复基因并非是等同的冗余拷贝。剂量敏感基因(满足剂量平衡效应的蛋白复合体成员基因或X染色体

分子的重复机制全基因组复制

又称多倍性,是减数分裂不分离导致整个基因组复制的现象。多倍体在植物中很常见,但动物上也发生过 [3]  。全基因组复制会使得许多其它基因最终丢失,返回到单一状态。然而,许多基因的保留导致了适应性创新。多倍体也是众所周知的物种形成的一个来源,因为具有与亲本物种不同染色体数目的后代通常不能与非多倍体生物

基因缺失和重复揭示了我们基因变化的“故事情节”

  通过在数目极大的人口中仔细观察拷贝数的差异,研究人员如今对选择过程会如何影响全球各地人口的基因组有了较好的了解。拷贝数差异指的是基因组间的结构差异,它是在DNA的大块部分被复制或删除时发生的。它会涉及含有多个基因的基因组区域或重要的调节区域。由于这个原因,研究人员推测这些变化是受到选择的,但对于

真骨鱼类全基因组加倍后重复基因进化研究引起关注

  基因和基因组加倍在进化过程中起了重要作用。1970年,Ohno提出脊椎动物进化早期的两次基因组加倍导致了脊椎动物基因组大小和复杂性的增加,同时也为脊椎动物的进化多样性提供了基础。大量的比较基因组学研究显示,真骨鱼类还经历了第三次基因组加倍,这一加倍被称为鱼类特有的基因组加倍。然而,在物种形成过程

生物学重复和技术重复的区别

生物学重复是指不同生物个体或者不同生物群体的样品之间进行地相同处理而进行的实验,而技术重复是指同一样品进行的多次相同实验。举例:对来自三只健康小鼠A、B、C的血清样品分别各进行一次双向电泳,这三次双向电泳就是生物学重复;而取其中一只小鼠的血清样品进行三次双向电泳,或者将三只小鼠的血清混合后的样品进行

eLife:为何癌基因不能通过重复性测试?

  大约在10年前,几个实验室发现了一个被称作MELK的基因在许多癌细胞类型中过度表达或受到高度激活。这一发现已促使正在开展多项临床试验来测试抑制MELK的药物是否能够治疗患者所患的癌症。如今,在一项新的研究中,来自美国冷泉港实验室(CSHL)的研究人员报道MELK实际上并未参与癌症产生。相关研究结

韩春雨NgAgo基因编辑技术可重复性引质疑

  近日,有关NgAgo基因编辑技术首篇论文实验的可重复性受到相关研究者质疑,该论文作者、河北科技大学副教授韩春雨在各类报告上回应这需要“高超的实验技巧”。对此,《中国科学报》记者在采访该领域专家时了解到,所谓“高超的实验技巧”实为实验“标准化”,目前多个实验室的重复实验结果即将出炉。  最近一个月

Nat-Biotechnol:基因组中的“黑物质——DNA重复片段”

  基因组的大部分区域由重复片段组成。这些“ DNA重复序列”在错误位置的扩增可能会产生严重后果。然而,DNA重复序列的扩增非常难以分析。柏林马克斯·普朗克分子遗传学研究所的研究人员最近开发的一种方法可以详细查看这些以前无法进入的基因组区域。它结合了纳米孔测序,干细胞和CRISPR-Cas技术。该方

北京生科院提出基因组重复区域组装新算法

  2016年12月,国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组学实验室赵方庆团队题为The combination of direct and paired link graphs can boost repetitive

多个短串联重复基因座的自动化检验

[实验原理]在一个PCR 体系中同时扩增多个基因座的方法叫做复合扩增(Multiplexing PCR)。STR的复合扩增增加了单次检测的信息量,提高了个人识别率,同时可降低成本和检材的消耗,因此显示出重要的法医学应用价值。其基本原理就是利用基因座内等位基因长度的不同;扩增的基因座之间片段长度范

中科院植物所阐明重复基因表达分化分子机制

  中国科学院植物研究所孔宏智研究组对重复基因表达分化的模式、过程和机制进行了研究,并取得重要突破。相关论文日前在线发表于《植物生理学》。  研究人员以拟南芥中的APETALA1(AP1)和CAULIFLOWER(CAL)基因为例进行了研究,这两种基因在表达的时、空、量上均有差异,且差异与其调控区一

Science:新研究揭示短串联重复序列如何影响基因表达

  几十年来,科学家们已经知道,“垃圾 DNA(junk DNA)”实际上起着至关重要的作用:尽管基因组中的蛋白编码基因提供了构建蛋白的蓝图,但是基因组中的一些非编码部分,包括以前被认为是 “垃圾DNA”的基因组区域,似乎可以提高或降低这些基因的表达。但人们一直不清楚某些非编码区域如何影响基因表达水

重复感染的特点

重复感染(superinfection)是指感染尚在进行中,同一种病原体再度侵袭而又感染。

如何诊断重复肾?

  1.如无异位开口及并发症,常无症状,不易发现。  2.如女性患者有正常排尿,兼有尿失禁,应考虑输尿管异位开口而作进一步检查。  3.膀胱镜检查在完全型者常可看到患侧多一个输尿管口,位于外上方的常是低位肾盂来的输尿管。  4.静脉尿路造影,如重复肾有功能,造影时可显示两个肾盂肾盏;如无功能,则仅显

动物中DNA转座子通过两种机制介导基因重复

  转座子被认为是宿主基因组演化的重要推动力。其类型众多,包含non-LTR(Long Terminal Repeat)型逆转座子、LTR型逆转座子、Helitron型DNA转座子、TIR(Terminal Inverted Repeat)型DNA转座子等,可引起包含基因重复(gene duplic