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揭示APOBEC3介导的DNA修复在CRISPR/Cas9基因编辑中突变新机制

中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所杨力研究组与上海科技大学陈佳研究组、南京医科大学沈彬研究组合作研究揭示了胞嘧啶脱氨酶(APOBEC)在CRISPR/Cas9引发的DNA断裂修复过程中产生突变的新机制,为进一步提高基因组编辑保真度提供了新思路。 CRISPR/Cas9是迄今为止最为高效便捷的基因组编辑技术。虽然其在生命科学基础研究和生物技术开发等领域被广泛应用,并在临床研究中显示出了极大潜力,但由于编辑过程中存在的非靶向突变以及基因治疗的不可逆性,CRISPR/Cas9技术的精确性问题一直是科学界的焦点所在。由于APOBEC能够在DNA单链断裂修复过程中结合单链DNA并造成随机突变,而单链核酸(如单链寡聚核苷酸、基因组单链DNA)在CRISPR/Cas9引发的DNA修复过程中广泛存在。因此,评估APOBEC能否在CRISPR/Cas9引发的基因组DNA修复过程中产生突变,对于改......阅读全文

Nature惊人发现:RNA,修复损伤的模板

  能够准确地修复自发的错误、氧化或诱变剂导致的DNA损伤对于细胞生存至关重要。这种修复通常是利用完全相同或同源的完整DNA序列来实现。但科学家们现在证实,在一种常见芽殖酵母细胞内RNA可充当模板用来修复破坏性最大的DNA损伤——DNA双链断裂。  尽管较早的研究表明了将RNA寡核苷酸导入到细胞中可

于洋博士等发现基因组长片段DNA插入的新机制

  我们身体中每个细胞的基因组DNA每天都会面临成千上万次的损伤。所幸的是,细胞中有一套能够修复各种类型损伤的机器来保证基因组的完整性(genome integrity)。修复DNA损伤的机器在从酵母到人所有的真核生物中都是非常保守的,因此酵母作为模式生物被广泛应用于DNA修复(DNA repair

DNA修复出错何以致癌?

  最近,日本大阪大学的一组研究人员发现,如果在DNA受到辐射损伤的时候DNA损伤应答(DDR)不起作用,那么,那些应该被去除的蛋白质反而会保留下来,遗传信息的丢失可能被刺激,当被错误修复的时候,这会导致肿瘤的形成。相关研究结果发表在《PLOS Genetics》杂志。  人们认为,细胞癌变的原因之

Science子刊发现全新的DNA修复机制

  DNA分子的化学性质并不是特别稳定,会形成不同性质的损伤,因此DNA损伤应答是必不可少的。莫斯科国立大学Vasily M. Studitsky教授的研究团队,发现了一个全新的DNA修复机制。这项研究发表在Science Advances杂志上,为防治神经退行性疾病带来了新启示。  “高等生物的D

Science子刊发现全新的DNA修复机制

  DNA分子的化学性质并不是特别稳定,会形成不同性质的损伤,因此DNA损伤应答是必不可少的。莫斯科国立大学Vasily M. Studitsky教授的研究团队,发现了一个全新的DNA修复机制。这项研究发表在Science Advances杂志上,为防治神经退行性疾病带来了新启示。  “高等生物的D

倒计时:给肿瘤细胞下套的PARP抑制剂来了

  不知道大家还记不记得今年年初的“兄弟自制药救母事件”。徐荣治及其兄长因母亲罹患卵巢癌,国内无药可医的情况下,毫无医药相关背景的兄弟俩开始着手自制靶向药救母。而他们制作的药物就是奥拉帕利。  奥拉帕利是全球首个上市的PARP抑制剂,2014年12月获FDA批准上市,用以治疗铂敏感复发卵巢癌。201

Nature子刊:提高CRISPR-Cas9保真度

  上海科技大学,中科院-马普计算生物学研究所,南京医科大学三处的研究人员合作发表了题为“APOBEC3 induces mutations during repair of CRISPR-Cas9-generated DNA breaks”的文章,证实了APOBEC在CRISPR/Cas9引发的同

APOBEC3介导的DNA修复在CRISPR/Cas9基因编辑中突变新机制

  中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所杨力研究组与上海科技大学陈佳研究组、南京医科大学沈彬研究组合作研究揭示了胞嘧啶脱氨酶(APOBEC)在CRISPR/Cas9引发的DNA断裂修复过程中产生突变的新机制,为进一步提高基因组编辑保真度提供了新思路。  

自然子刊:揭示基因组编辑新机制

  中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所杨力研究组与上海科技大学陈佳研究组、南京医科大学沈彬研究组合作研究揭示了胞嘧啶脱氨酶(APOBEC)在CRISPR/Cas9引发的DNA断裂修复过程中产生突变的新机制,为进一步提高基因组编辑保真度提供了新思路。  C

德研究发现与DNA双链断裂修复相关基因

  德国研究人员在寻找参与修复脱氧核糖核酸(DNA)双链断裂的基因方面获得进展。研究小组在人类细胞中找到61个位点,并发现了此前未知的与DNA双链断裂修复有关的基因。该研究结果将显著加速DNA修复基因的继续搜寻,并带来新的医疗应用可能。相关研究成果发表在6月29日的《公共科学图书馆·生物学》杂志上。

与DNA双链断裂修复相关新基因被发现

  德国研究人员在寻找参与修复脱氧核糖核酸(DNA)双链断裂的基因方面获得进展。研究小组在人类细胞中找到61个位点,并发现了此前未知的与DNA双链断裂修复有关的基因。该研究结果将显著加速DNA修复基因的继续搜寻,并带来新的医疗应用可能。相关研究成果发表在6月29日的《公共科学图书馆·生

电转仪助力CRISPR编辑iPSC新进展: 协同基因编辑效应

  2006年,日本科学家山中伸弥(Shinya Yamanaka)教授利用逆转录病毒将4个转录因子转入成体细胞,将其转变为诱导多能干细胞(induced pluripotent stem cells, iPSC)。从此后,诱导多潜能干细胞研究领域取得了极大进步,被用于研究人类疾病,目前已经有多项研

PNAS惊人发现 肺炎会损害DNA

  肺炎是全球死亡的主要原因,最近的一项研究显示,肺炎的一种最常见致病菌,可能会损害肺细胞的DNA。相关研究结果发表在六月十五日的《PNAS》杂志。  在这项研究中,来自新加坡-麻省理工学院(MIT)研究与科技联盟(Singapore-MIT Alliance for Research and Te

PNAS惊人发现:肺炎会损害DNA

  肺炎是全球死亡的主要原因,最近的一项研究显示,肺炎的一种最常见致病菌,可能会损害肺细胞的DNA。相关研究结果发表在六月十五日的《PNAS》杂志。  在这项研究中,来自新加坡-麻省理工学院(MIT)研究与科技联盟(Singapore-MIT Alliance for Research and Te

天差地别!CRISPR导致的DNA断裂后修复与理论差距巨大

  尽管世人对CRISPR-Cas9基因编辑抱有很高期望,科学家们仍对其人体临床应用持怀疑态度。为什么呢?  “基因编辑非常强大,但是到目前为止还有许多问题和错误需要探索。它们的工作方式就像一个黑匣子,有许多猜想和假设,”加州大学伯克利分校分子生物学教授Jacob Corn说。“现在,我们终于有能力

抑制线粒体修复,有望带来癌症创新疗法

  线粒体像是细胞中的“发电站”,通过呼吸作用为各种细胞活动提供能源。它们有自己的 DNA,这些 DNA 编码对线粒体功能非常重要的蛋白。在产生能源的过程中,线粒体不可避免地产生大量能够损伤 DNA 的活性氧自由基 (reactive oxygen radicals)。而线粒体 DNA 因为位于线粒

Nature揭示不同寻常的DNA复制机制

  研究人员发现了细胞如何修复一种潜在的破坏性DNA损伤——双链DNA断裂的细节。   当由于氧化、电离辐射、复制错误和某些代谢产物使得染色体经受双链断裂时,细胞会利用遗传相似的染色体通过一种涉及断裂分子两端的机制来修补这一缺口。为了修复失去一端的断裂染色体,细胞会利用DNA复制机器的一种独特构型

竟能追溯到30亿年前!科学家发现高度保守的DNA修复因子

  如果骨头断裂或肌腱折断,我们会立即寻求治疗。但是,对于我们体内最脆弱,最珍贵的细胞染色体DNA的破裂频率十分惊人,有人估计每个细胞每天破裂多达10,000次,但这通常不会造成任何后果,这是因为有大量的DNA修复蛋白可以修复被化学或物理诱变剂,或正常细胞磨损损坏的DNA,预防基因组灾难。如果没有这

Nature子刊:阻断DNA修复机制可提高脑瘤放疗效果

  最近,美国德克萨斯大学(UT)西南医学中心的研究人员证明,在两种肿瘤细胞系和小鼠中阻断关键的DNA修复机制,能够改善高致命性脑瘤(称为胶质母细胞瘤,glioblastomas)的放射疗法效果。   放射疗法(radiation therapy)可引起DNA的双链断裂,必须得到修复肿瘤

抑制PTEN磷酸化可增强成胶质细胞瘤的放疗敏感性

  PTEN (gene of phosphates and tensin homologue deleted on chromosome ten)是肿瘤抑制基因,其编码的具有磷酸酯酶活性的蛋白,是机体维持正常生理功能所必须的因子。作为肿瘤抑制基因,PTEN对受体酪氨酸激酶(receptor tyr

《Nature》子刊:同济大学等成功制备神经干细胞衰老模型

  衰老是指随时间推移身体组织的机能下降,经常引起衰老相关的退行性疾病,例如:三篇论文深入了解衰老带来的神经元变化。越来越多证据表明,神经干细胞的衰老,对于中枢神经细胞衰老非常重要。然而,其根本分子机制的阐述却因为缺乏合适的衰老模型而受阻。   2014 年3月13日,来自同济大学、南通大学、清华

为什么癌症无法消灭?

  2500年前,当古希腊医师希波克拉底给恶性肿瘤命名为καρκνο(意为螃蟹或小龙虾,英文译为cancer,中文译为癌)的时候,仅仅是对病人体表可见的恶性肿瘤做了形态上的描述:恶性肿瘤通常从中心的肿块向周边伸出一些分支,状如螃蟹。然而,希波克拉底不可能知道的是,更多的情况下,癌症可以发生在人体的不

奥拉帕利前列腺癌适应症上市申请获优先审评

  1月20日,阿斯利康和默沙东宣布,Lynparza(olaparib)的补充新药申请已获美国受理并授予优先审查资格,用于转移性去势抵抗性前列腺癌(mCRPC),携带有害或疑似有害生殖系或同源重组修复基因突变(HRRm)患者,这些患者既往接受新型激素药物治疗后发生疾病进展。PDUFA日期设定为20

RNA为模板 首次实现植物同源重组修复

  中国农业科学院作物科学研究所作物转基因技术与应用创新团队与美国加州大学圣地亚哥分校合作,使用核糖核苷酸(RNA)作为同源重组修复(HDR)的模板,成功获得后代无转基因成分的抗ALS抑制剂类除草剂水稻植株。这是在植物中首次成功利用RNA作为脱氧核糖核酸(DNA)同源重组修复模板。相关研究论文北京时

潘学文博士Nature解析DNA修复

  生物通报道:来自贝勒医学院的研究人员指出了一种核小体重构因子:Fun30在DNA双链端粒末端切除过程中扮演的重要角色,为进一步解析DNA双链断裂修复过程提供了新思路,相关成果公布在Nature杂志上。   文章的通讯作者之一是华裔科学家潘学文博士(Xuewen Pan,生物通音译),其早年

研究解读DNA损伤领域新进展

  本文中,小编整理了多篇研究报道,共同解读科学家们在DNA损伤研究领域取得的新成果,分享给大家!  【1】Nature:重大进展!揭示修复酒精引起的DNA损伤的新机制  doi:10.1038/s41586-020-2059-5  在一项新的研究中,来自荷兰胡布勒支研究所和英国剑桥医学研究委员会分

Nature揭秘CRISPR系统的选择识别机制

  细菌具有一种免疫系统来对抗称作为噬菌体的入侵病毒,也许会让你感到有些惊讶。并且像从单细胞到人类的所有免疫系统一样,细菌免疫系统面临的第一个挑战就是要检测出 “外源物质”与“自身物质”的差异。这并不简单,因为病毒、细菌和所有其他的生物都是由DNA和蛋白质构成。来自Weizmann研究所和以色列特拉

没有放疗仪器,如何做放疗研究?

  肿瘤治疗的三大手段,手术、化疗、放疗。手术,每个肿瘤外科医生天天都在手术台上进行研究。化疗,在三大手段中目前是临床基础科研领域研究最多的地方。放疗,临床基础研究总在不温不火中进行。原因是啥呢。听放疗科医生介绍,其实从临床角度来说,不少肿瘤治疗,采用放疗比手术和化疗效果好。季博在这里不展开讨论他们

没有放疗仪器如何做放疗研究?

肿瘤治疗的三大手段,手术、化疗、放疗。手术,每个肿瘤外科医生天天都在手术台上进行研究。化疗,在三大手段中目前是临床基础科研领域研究最多的地方。放疗,临床基础研究总在不温不火中进行。原因是啥呢。听放疗科医生介绍,其实从临床角度来说,不少肿瘤治疗,采用放疗比手术和化疗效果好。季博在这里不展开讨论他们的临

DNA损伤修复机制——非同源末端链接NHEJ和同源重组HR

  生命极其脆弱,我们每天在电子辐射、紫外线、雾霾等等各种外部环境及细胞代谢产物等内源因素影响下,我们生命的核心-DNA都会受到不同程度的损伤,其中DNA双链断裂(DSBs,Double strand breaks)是损伤中最为严重的一种,然而生命却又极其强大,我们无时无刻不在受伤,也无时无刻不在自