Science:基因组卫士piRNA如何发挥作用?

piRNA(Piwi-interacting RNA)被称为基因组的卫士,它与特定蛋白相互作用形成分子防御系统,来捍卫基因组的稳定性。那么,piRNA究竟如何区分外源和内源的基因序列呢?芝加哥大学的研究人员近日找到答案并发表在《Science》杂志上。 piRNA是一类长度约为26-31 nt的单链RNA分子,发现于2006年。在动物生殖系统中,它与Piwi蛋白一起沉默转座子,保护基因组的稳定性,被人们称作基因组的免疫系统。与免疫系统相似,piRNA系统能够区分敌我,启动应答,并适应新的入侵者。 为了弄清楚piRNA是如何做到这一点的,研究人员此次探究了线虫(C. elegans)生殖细胞所产生的piRNA。他们还想知道线虫为何有如此大量的piRNA(超过15,000个)以及它们的功能是什么。 之前的研究发现,Piwi招募一组比较小的RNA,它们与目标序列相对应。于是,研究人员创建了一个合成的piRNA,其序列不存在......阅读全文

Science:基因组卫士piRNA如何发挥作用?

   piRNA(Piwi-interacting RNA)被称为基因组的卫士,它与特定蛋白相互作用形成分子防御系统,来捍卫基因组的稳定性。那么,piRNA究竟如何区分外源和内源的基因序列呢?芝加哥大学的研究人员近日找到答案并发表在《Science》杂志上。  piRNA是一类长度约为26-31 n

Science:重大突破!揭示piRNA建立安全系统保护基因组机制

  数以千计的具有不同核苷酸序列的短RNA分子起着安全卫士的作用,能够识别和沉默侵入基因组的企图,比如病毒或被称为转座子的寄生元件插入到宿主基因组中的DNA。  这些不同的小RNA分子,被称为与Piwi蛋白相互作用的RNA(Piwi-interacting RNA, piRNA),是由各种动物(如从

Cell发布piRNA重要发现

  来自东京大学的一个研究小组鉴别出了一种叫做“Trimmer”酶,其参与生成了保护生殖细胞基因组免遭不必要遗传重写的一类小RNA。  “跳跃基因”(又称转座子)是可以在基因组中四处移动的DNA小片段。它们可以破坏宿主基因,与癌症和其他一些疾病有关联。因此,生物体需要控制它们,尤其是在生成动物精子和

同济大学翁志萍等揭示机体对于piRNA入侵的应答机理

  反义Piwi相互作用RNA(piRNA)指导生殖细胞发育过程中已建立的转座子的沉默,正义piRNA驱动反义Piwi池的乒乓扩增,但生殖细胞如何响应基因组入侵尚不清楚。  2019年10月10日,同济大学翁志萍,麻省大学医学院William E. Theurkauf及昆士兰大学Keith Chap

Nature:新研究揭示piRNA产生机制

  在一项新的研究中,来自日本东京大学的研究人员发现了微小基因组防御者---由称为piRNA的短链RNA组成---的更多细节,这些微小基因组防御者通过保护可产生精子和卵子的生殖细胞的基因组来确保生育能力。相关研究结果于2020年1月29日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Zucchini c

中科院Cell子刊解析piRNA作用通路

  来自中科院上海生命科学研究院的研究人员近日在新研究中证实,piRNA在精子发生后期通过APC/C触发了MIWI泛素化及MIWI/piRNA机器清除。这一研究发现对于深入了解piRNA作用通路在哺乳动物精子发生中的功能机制具有重要意义。相关论文发布在1月14日的《发育生物学》(Developmen

生化与细胞所等研究发现小鼠PIWI/piRNA代谢调控机制

  国际知名学术期刊Developmental Cell于1月13日发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所刘默芳组、王恩多组关于piRNA在精子发生后期触发小鼠PIWI(MIWI)蛋白经 APC/C-泛素途径降解的最新研究成果。该工作与李劲松研究员、上海计划生育研究所施惠娟研究员、美国路

植物miRNA及piRNA的逆转录

miRNA在植物的发育、抗病、和应激反应中发挥着重要作用。一般认为,这些小的非编码RNA通过靶向mRNA剪切,在后转录水平调节植物的基因表达。这些基因表达中的靶向变化由数百个成熟miRNA的差异表达所调控,每个成熟miRNA结合在靶mRNA的特定序列上。因此,对植物的成熟miRNA调控和表达进行分析

Cell子刊:piRNA,DNA的贴身保镖

  生殖细胞的DNA一直处于严密的保护之下,欧洲分子生物学实验室EMBL的研究团队日前为人们揭示了这个至关重要的保护机制,相关论文发表在七月九日的Cell Reports杂志上。  转座子又称为跳跃基因,是一种“自私”的DNA链。转座子能够进行自我复制,还能在染色体不同位点之间跳跃,会导致基因失活甚

动物所piRNA的高精度预测算法研究获得突破

  第二代测序技术又称作深度测序技术,应用到RNA上统称作RNA-seq或RNA测序,它已成为基因表达和转录组分析的重要手段。第二代转录组测序数据中含有大量不编码蛋白质的ncRNA序列,因为它们像宇宙中的暗物质一样难以识别和有重要功能,也被称为“基因组暗物质”。由于数据量巨大,保守性差

Cell子刊:生殖细胞的piRNA通路大名单

  转座子广泛存在于生物的基因组中,能够自我复制,并随机插入到染色体上,因此又被称为跳跃基因。转座子在生殖细胞中特别危险,可能导致不孕或对后代发育产生严重影响。在进化过程中,复杂生物形成了一套生殖细胞基因组的防御机制,这一机制被称为piRNA通路。   冷泉港实验室(CSHL)Gregory

NCB:李鑫组揭示核糖体介导piRNA的形成

  piRNA (PIWI-Interacting RNA) 是一类与PIWI蛋白相互作用的非编码小RNA,其长度在24—35nt左右,主要存在于动物的生殖细胞中。piRNA与PIWI蛋白结合形成PIWI/piRNA分子机器,其主要作用之一是沉默减数分裂过程中被激活的转座子(Transposon)—

可爱龙教授Cell评述重要结构生物学进展

  在所有的非编码RNA中, piRNA 数量最多, 主要存在于生殖系统,这种RNA在动物生殖组织中可以引导PIWI蛋白质沉默有害的转座子。其关键作用复合物:piRNA诱导沉默复合体piRISC的生物合成涉及多个步骤,至今科学家尚未清楚了解这个步骤的分子机制。  近期一组研究人员报道了PIWI-cl

小RNA领域牛人Science发表重要研究成果

  来自奥地利科学院分子生物技术研究所(IMBA)的研究人员,揭示出了细胞利用来生成一类生殖细胞特异性的小分子调控RNAs——piRNAs的分子机制。他们的研究结果发表在5月15日的《科学》(Science)杂志上。  领导这一研究的是IMBA的分子生物学家Julius Brennecke,这位学者

小鼠粗线期piRNA指导精子形成

piRNA是新近在动物生殖系细胞中发现的一类与PIWI家族蛋白相互作用的小分子非编码RNA,在哺乳动物的精子发生过程先后出现两次表达高峰,分别被称为前粗线期piRNA与粗线期piRNA。学者对在早期生精细胞中表达的前粗线期piRNA的作用已有所了解,而在减数分裂前后大量表达的粗线期piRNA的功能还

RNA研究先驱Nature获piRNA突破性新发现

  来自冷泉港实验室的科学家们取得重要进展,了解保护动物基因组防止称作转座子的潜在危险遗传元件这一过程的最早期步骤。如果失去控制,这些基因组寄生物可能会肆意泛滥,导致不育。   冷泉港实验室的Gregory J. Hannon教授和Leemor Joshua-Tor共同领导了这一研究。Hann

分析细胞卓越中心等发表关于piRNA的综述文章

  9月14日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员刘默芳研究组和法国蒙彼利埃大学人类遗传学研究所教授Martine Simonelig团队合作,在Nature Reviews Molecular Cell Biology上,在线发表了题为Emerging role

Cell免费论文:转录调控的新思路

  来自奥地利维也纳分子生物技术研究所的研究人员发现了转座子和piRNA对染色质模式,以及基因表达的广泛影响,对于未来深入探索这一沉默途径,以及染色质状态基因表达具有重要的意义。相关成果公布在Cell杂志上,目前可免费获取。   领导这一研究的是分子生物技术研究所的Julius Brennecke

杰出女科学家再发Cell解析调控机制

  来自美国麻省大学医学院,英国牛津大学等处的研究人员发现DEAD-box家族蛋白中两个成员:UAP56和Vasa在piRNA生成和功能行使过程中扮演了重要角色,并指出了一种新型核周转录沉默机制。相关成果公布在Cell杂志上。   文章的通讯作者分别是麻省大学医学院生物信息学和整合生物学部的翁志萍

日科学家发现可抑制基因组损伤的蛋白质

  日本科学家发表于最新一期《自然》杂志网络版的论文说,他们经动物实验发现,人类以及许多动物体内都有的Zuc蛋白质在抑制转位子造成的基因组损伤过程中发挥着重要作用,这项研究成果将有助于解开不孕症发病的机制。   日本科学技术振兴机构和东京大学15日联合发表新闻公报介绍了上述成果。公报说,动物基因组

小鼠睾丸中MIWI/piRNA介导了mRNA的剪切

最新一期的国际学术期刊《Cell Research》在线发表了由中科院动物所和中科院生化细胞所共同完成的在小鼠生精细胞发生中MIWI/piRNA的功能机制的研究论文,报道了在小鼠睾丸中piRNA发挥着类似siRNA的功能,可以指导MIWI对于mRNA的剪切,保证小鼠配子的正常生成。本项研究工

小鼠睾丸中MIWI/piRNA介导了mRNA的剪切

  最新一期的国际学术期刊《Cell Research》在线发表了由中科院动物所和中科院生化细胞所共同完成的在小鼠生精细胞发生中MIWI/piRNA的功能机制的研究论文,报道了在小鼠睾丸中piRNA发挥着类似siRNA的功能,可以指导MIWI对于mRNA的剪切,保证小鼠配子的正常生成。本项研究工作是

小鼠睾丸中MIWI/piRNA介导了mRNA的剪切

  最新一期的国际学术期刊《Cell Research》在线发表了由中科院动物所和中科院生化细胞所共同完成的在小鼠生精细胞发生中MIWI/piRNA的功能机制的研究论文,报道了在小鼠睾丸中piRNA发挥着类似siRNA的功能,可以指导MIWI对于mRNA的剪切,保证小鼠配子的正常生成。本项研究工作是

研究发现PANDAS复合物在piRNA调控异染色质形成的分子机制

  转座子(transposon)由冷泉港实验室Barbara McClintock(诺贝尔奖)首先在玉米中发现。转座子又被称为“跳跃基因”,类似于内源性病毒,能够在宿主基因组中“复制和粘贴”自己的DNA,以达到其自我“繁殖”的目的。转座子的“跳跃”可能会产生基因组不稳定性,并导致动物不孕不育。有多

复旦大学,中科院Cancer-Res发现癌症转移的新机制

  生物通报道:来自中科院生物化学与细胞生物学研究所,复旦大学中山医院等处的研究人员发表了题为“KRAS-NFκB-YY1-miR-489 signaling axis controls pancreatic cancer metastasis”的文章,发现KRAS通过激活NF-κB炎症信号通路激活

Nature:小RNA生物学里程碑成果-解开piRNA生物合成谜题

  PIWI相互作用的RNA,简称piRNAs,是一类小型的调控RNAs ——长度只有22–30个核苷酸的小块核酸。它们可能很小,但是与它们相关的Argonaute蛋白一起,piRNAs就能够“沉默”转座因子,所谓的自私基因,存在于植物、真菌和动物的基因组中。piRNA介导的沉默可以作用于染色质,以

Genes--Development:USTC复合物在piRNA转录中的功能

  这一研究在线虫中发现了一个参与piRNA转录过程的上游序列转录复合物(USTC复合物)。  piRNA是一类在动物中保守的非编码小RNA,在转座子沉默、生殖发育、基因表达调控和性别决定等过程中发挥重要作用。  来自中国科学技术大学生命科学学院光寿红课题组与剑桥大学的Eric Miska课题组合作

Science揭示基因组的捍卫者

  从细菌到人类,生物体都必须要保护自身对抗称作为转座子的寄生遗传元件,并且赌注下得很大。这些DNA片段可在基因组中四处跳跃破坏基因,其可以造成极大的破坏因此细胞有专门的监视机制来抑制它们。  为了保护后代对抗基因组破坏,这些天然防御系统发生缺陷通常会导致不育不孕。在动物中,对抗捣乱转座子的主要防御

卡耐基科学研究所张钊:成功追踪到跳跃基因的移动

  卡耐基科学研究所张钊(ZZ Zhao Zhang)课题组7月26日在《Cell》发文,利用他们最新开发的方法追踪到了果蝇模型中跳跃基因的移动。  我们的DNA序列大约一半都是“跳跃基因”,它们也被称为“转座子”,在发育中的精子和卵子中,转座子在整个基因组的“移动”事关进化。但是,因为不稳定性,它

陈大华研究组JCB解析piRNAs发生机制

  小分子piRNAs(Piwi-interacting RNAs)在抑制转座子活性和维持基因组稳定性起重要作用,但其发生和调控的分子机制仍不清楚。果蝇生殖细胞为研究这一机制提供了良好的模型。果蝇生殖细胞中piRNAs 的发生包括初级加工和次级加工两个过程,其中piRNAs次级加工途径,又称乒乓循环