在基因组测序中,PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而,PCR也带来一些问题,包括不均匀扩增,导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序(NGS)平台而言,测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR-Free的基因组测序。文库制备的变革2009年,Sanger研究院的Iwanka Kozarewa博士及其同事介绍了一种无需扩增的Illumina文库制备方法(Nature Methods 2009;6:291–295)。他们表示,GC偏向的基因组的定位和组装有所改善。这种方法采用簇扩增步骤来富集完全连接的模板链,降低了重复序列的发生率,改善了序列定位和SNP检出。这种方法的核心是采用no-PCR接头,它们包含额外的序列,让模板能够与流动槽表面直接杂交,这样就不再需要PCR步骤。作者表示,通过此方法产生的DNA模板量低于PC......阅读全文
这几天,已经有很多媒体报道从各个角度、特别是一线医护人员的直观视角,总结过这次应对新冠肺炎疫情的过程中出现的、特别是早期疾病发现和预警过程中的一些问题。 我首先得强调一句:在疫情的危急时刻大家都希望听好消息、正能量,这个没错,我也一样。但是,这不意味着所有反思、批评和建议都是添乱、都是制造恐慌
【摘要】 2005年454公司首推划时代的新一代测序仪,从而引发了测序市场上454、Illumina、ABI等公司在新一代测序技术上的比拼高潮。也正是这种你追我赶,让绘制人类全基因组图谱由过去的耗费4.37亿美元和13年时间,骤然缩短到如今SOLiD 3运行一次即获得50GB可定位测序数据。新一代
454公司可谓新一代测序技术的奠基人。2005年底,454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System,被《Nature》杂志以里程碑事件报道,开创了边合成边测序(sequencing-b
2009年,基因组定向捕获工具的出现,让外显子组的捕获成为可能。科学家们普遍认为外显子组测序比全基因组测序更有优势,特别是对罕见的单基因疾病。不仅仅是费用更低,数据的阐释也更为简单。因此,外显子组测序也在2010年被《Science》杂志评为年度十大突破。 数百篇已发表的文章,也证实了外显
在一项新的研究中,来自美国加州大学伯克利分校和克莱蒙特学院联盟凯克研究所的研究人员将CRISPR与用石墨烯制成的电子晶体管结合在一起,构建出一种可在几分钟内检测出特定基因突变的新型手持设备。这种称为CRISPR-Chip(CRISPR芯片)的设备可用于快速诊断遗传疾病或评估基因编辑技术的准确性。
Technologies(现为Thermo Fisher收购)公司全国临床与科研事业部销售总监、ThermoFisher公司全国临床市场战略总监柴映爽写了一系列文章,对基因测序领域进行了深入剖析。让我们看看这个领域深入工作的人士,怎么看待2015年基因测序市场大热这一现实的。 ▌第一篇:基
2012和2013年,由北京大学多个研究团队合作完成的世界首个高精度人类男性和女性个人遗传图谱相关论文相继发表于《科学》和《细胞》杂志。这一工作采用的单细胞DNA扩增技术MALBAC,与以前的技术相比,该技术将单细胞全基因组测序的精确度大幅度提高,以至于能够发现个别细胞之间的遗传差
2012和2013年,由北京大学多个研究团队合作完成的世界首个高精度人类男性和女性个人遗传图谱相关论文相继发表于《科学》和《细胞》杂志。这一工作采用的单细胞DNA扩增技术MALBAC,与以前的技术相比,该技术将单细胞全基因组测序的精确度大幅度提高,以至于能够发现个别细胞之间的遗传差异。 MAL
基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的,是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。图片
核酸分子杂交技术由于核酸分子杂交的高度特异性及检测方法的灵敏性,它已成为分子生物学中最常用的基本技术,被广泛应用于基因克隆的筛选,酶切图谱的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突变的检测等。其基本原理是具有一定同源性的原条核酸单链在一定的条件下(适宜的温室度及离子强度等)可按碱基互补原成双链。杂交的
新一代测序 新一代测序(NGS)技术一路走来,逐渐褪下其神秘面纱,进入越来越多的实验室。随着时间的推移,NGS系统从“高端大气上档次”的大型平台演化成满足个性化需求的台式测序仪。MiSeq、Ion Torrent和454 GS Junior这些仪器的上市,也推动了测序平台的普及。同
近年来涌现出不少 DNA 甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析 (methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。 特异位点的甲基化检测 甲基化特异性 PCR (MS-PCR)
近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。一、特异位点的甲基化检测1. 甲基化特异性PCR(MS-PCR)这种方法经济实用,
近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。一、特异位点的甲基化检测1. 甲基化特异性PCR(MS-PCR)这种方法经济实用,
一、基因检测公司梳理 目前全国涉及基因检测概念的公司有200余家,按照业务范围划分,这些公司可以分为:①最上游的基因检测仪器开发企业(测序仪、芯片扫描仪、PCR设备),②提供样本处理试剂和耗材的中上游企业(建库试剂盒、检测试剂盒、工具酶、基因芯片),③提供第三方基因检测服务的中游企业
新产品,代表着商品化的创新技术,正不断突破研究的障碍和上下极限。这种“有偿分享”推动了新技术的普及,带来了科学研究突破的新希望,也引导科研的新方向。新的技术平台让研究手段提升到更高层次和新的境界,您当然有更多“机会”抢先一步发现原来“因技术所限”尚未知的新发现!站得高,看得更远;也因看得更远,更
目前多种新型分析技术,如新一代测序和芯片,都是为细胞群体而设计的,需要一定的样本量。对于一些临床或法医样本,如肿瘤细胞或循环胎儿细胞等,它们的细胞数量有限,直接限制了其下游应用。例如,在分析肿瘤细胞中的体细胞DNA突变或单个细菌基因组时,单细胞中的DNA无法满足测序的mg级样品量需求。为了从少量样品
2017年上半年,全球消费级基因检测领域表现活跃,接连发生几起大事件。 7月底,美国创业公司Exploragen宣布推出基于用户DNA的生活方式APP,即将在苹果APP Store上发布,能为用户提供生物睡眠特征、咖啡因代谢及其他个性化建议。无独有偶,与Exploragen同台竞技的还有另一家
2017年1月15日,未来论坛2017年会暨首届未来科学大奖颁奖典礼在北京举行。香港中文大学医学院副院长、李嘉诚健康科学研究所所长及化学病理学系系主任卢煜明教授,因开创的无创DNA产前检测(NIPT)技术在人类重大出生缺陷防控领域的杰出贡献,获颁“2016年未来科学大奖-生命科学奖”并发表主题演
众所周知,在不同的情况下,在不同的组织中,基因表达的水平也不同。如今,研究人员可利用多种技术来追踪基因表达水平的差异,如定量 PCR、芯片或测序。《Genome Technology》杂志这一次请来了几位科学家,让他们分享一下应如何选择这些技术。此外,研究人员也谈到了解决质量控制和数据分
如果是基因测序产业上游的公司,产品销售的目标客户广泛,横跨科研、医疗、商检领域,产品包括测序仪、DNA提取试剂盒、捕获试剂盒/多重子扩增试剂盒、建库试剂盒、上机测序试剂盒,其中测序仪、上机测序试剂盒两者是绑定的,DNA提取试剂盒、捕获试剂盒/多重子扩增试剂盒、建库试剂盒是可以用第三方的产品,国内
目前全国涉及基因检测概念的公司有200余家,按照业务范围划分,这些公司可以分为: ①最上游的基因检测仪器开发企业(测序仪、芯片扫描仪、PCR设备); ②提供样本处理试剂和耗材的中上游企业(建库试剂盒、检测试剂盒、工具酶、基因芯片); ③提供第三方基因检测服务的中游企业; ④提供测序数据存
罗氏应用科学部(Roche Applied Science)旗下的Roche NimbleGen公司的宣布推出商业化的NimbleGen序列捕获技术(NimbleGen Sequence Capture technology),以帮助那些希望对基因组选定目标区域进行高通量测序的科学家们。这项新技术使
今年早期,ABI公司应用SOLiD 3系统领先的寡核苷酸连接和检测技术对人类基因组进行了测序,费用低于6万美元。这台新仪器的技术改进使更高的样品和数据通量成为可能,从而有望进一步降低基因组测序的费用。例如,更廉价的基因组数据有望加速疾病关联和生物标志物的发现,从而改善诊断和疾病处理,支持与个人最佳治
近年来,基因测序技术飞速发展,使得几十个甚至上百个基因的测序能够在几天之内完成,测序的成本也下降到普通百姓可以承受的范围,这使得基因测序的临床应用成为可能。在临床研究方面,外显子组甚至全基因组的基因测序大大加速了疾病分子标志物的寻找,使得多种疾病病因的诊断与分型与以往相比更加精确,在用药时也能更
中世纪,一个侍者在清洗麻风病患者的褥疮。 利用新方法,研究人员分析了提取自受害者骨头和牙齿的历经数世纪之久的病原体。 去年8月,Johannes Krause进行了一个鲜有人尝试的“壮举”:他对一具700年历史的人体骸骨进行了遗传尸检。Krause从一个死于14世纪丹麦麻风病人隔离区
利用新方法,研究人员分析了提取自受害者骨头和牙齿的历经数世纪之久的病原体。 去年8月,Johannes Krause进行了一个鲜有人尝试的“壮举”:他对一具700年历史的人体骸骨进行了遗传尸检。Krause从一个死于14世纪丹麦麻风病人隔离区的年轻女性牙齿中提取了DNA,并计算了来自细菌、污染
Bio-Rad Laboratories公司在当地时间本周一宣布,已同意收购数字PCR方面的竞争对手RainDance Technologies,具体的交易价格尚未透露。此次收购预计在2017年第一季度完成。 这是一次资本领先者对技术领先者的收购。在RainDance快速崛起之前,Bio-Ra
Bio-Rad Laboratories公司在当地时间本周一宣布,已同意收购数字PCR方面的竞争对手RainDance Technologies,具体的交易价格尚未透露。此次收购预计在2017年第一季度完成。 这是一次资本领先者对技术领先者的收购。在RainDance快速崛起之前,Bio-Ra
分子杂交技术 互补的核苷酸序列通过Walson-Crick 碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA 分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DN