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小规模快速制备果蝇RNA

小规模快速制备果蝇RNA 试剂、试剂盒 Northern 样品缓冲液 lmol L 乙酸 酚 氯仿 DEPC 处理的水 GHCL 溶液 无水乙醇 实验步骤 一 材料与设备1)Northern 样品缓冲液:2.2mol/L 甲醛,1mol/LMOPS,50% 甲酰胺2)lmol/L 乙酸3) 酚:氯仿(1:1)4)DEPC 处理的......阅读全文

研究人员揭示RNA剪接在阿尔茨海默症中的作用

  2019年10月8日,美国贝勒医学院Joshua Shulman教授课题组在Cell Reports发表题为Tau-mediated Disruption of the Spliceosome Triggers Cryptic RNA-splicing and Neurodegeneration

Cell Reports | 郭采薇等揭示RNA剪接在阿尔茨海默症中的作用

  pre-mRNA剪接过程是基因表达调控的重要步骤,对于形成极具多样性的神经细胞转录组尤为关键。因此,RNA 剪接失调能够引起包括脊髓性肌肉萎缩症和肌萎缩性脊髓侧索硬化症等多种神经疾病【1,2】。2013年,美国Emory大学的Seyfried教授课题组发现RNA剪接失调可能也是引起阿尔兹海默症的

进化分析揭示编码区和非编码区RNA编辑的功能调控效应

  2017年3月,国际知名学术期刊PLOS Genetics在线发表了斯坦福大学Jin Billy Li课题组和中山大学生命科学学院张锐课题组共同研究的题为“Evolutionary analysis reveals regulatory and functional landscape of c

PNAS:华人科学家揭示神经退行性变背后的“RNA海绵”

  近来人们发现,基因C9orf72的突变是肌萎缩侧索硬化症ALS和额颞叶痴呆FTD中最常见的病因。不过,人们还并不清楚该突变引发神经退行性疾病的机制。   Emory大学医学院的研究人员发现,这种ALS/FTD突变形成了一种“RNA海绵”,吸收并隔绝了一个重要的调节蛋白。文章于四月一日发表在美国

Nature子刊:最大、最精确的RNA编辑位点列表

  由布朗大学领导的一个研究小组编译出了一份最大型、经最严格验证的果蝇RNA编辑位点列表。该研究生成了关于这一模式生物基础生物学的一些新见解,研究结果发表在9月29日的《自然结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。   这

基因技术专题-2

RNAi技术RNA干扰(RNA interference, RNAi)是近年来发现的研究生物体基因表达、调控与功能的一项崭新技术,它利用了由小干扰RNA(small interfering RNA, siRNA)引起的生物细胞内同源基因的特异性沉默(silencing)现象,其本质是siRNA与对应

Dicer酶结构及作用原理

1、Dicer酶在RNA干扰研究中会用到Dicer酶,Dicer酶是RNaseIII型家族中的蛋白酶,可特异识别dsRNA,它可以切割以各种方式进入到细胞内的dsRNA,将其切割成19-21bp大小的短RNAs。Dicer是来自果蝇RNA干扰必须的RNaseIII型蛋白。Dicer酶是RNase I

拯救渐冻人,发现ALS真正诱因

  肌萎缩性脊髓侧索硬化症(Amyotrophic lateral sclerosis,ALS),又被称作卢伽雷氏症,也就是最近被大家所关注的渐冻人。该疾病是由于破坏性的神经退行性变和运动神经元缺失所引起,病人肌肉麻痹,一般在发病后2到5年内就会死亡。目前,这种疾病仍然无药可治。  ALS与其他神经

超高分辨直接观测基因表达的染色质时空调控

  生命科学的一个基本问题是在个体发育中,单个细胞如何分化成各种类型的组织细胞。这个过程高度依赖于基因表达的精确时空调控,而这种细胞特异基因表达与染色质的调控密切相关。比如,不同的顺式调控原件增强子能够在不同细胞中选择性地激活目标基因。每个基因经常由分布在千碱基(kb)甚至兆碱基(Mb)以外的多个增

上海生科院发表关于神经系统环形RNA研究的专评

  6月4日,国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员陈玲玲和计算生物学研究所研究员杨力题为Gear up in circles的专评,对当期Molecular Cell 和4月刊Nature Neuroscien

美NCI科学家撤销一篇PNAS论文

  美国国家癌症研究所(NCI)的研究人员近日撤回了一篇RNAi方面的。这篇论文于2009年发表在美国《国家科学院院刊》(PNAS)上,曾鉴定出一种RNA依赖的RNA聚合酶(RdRP),它在果蝇的RNAi中发挥作用。  据论文作者、NCI的研究人员Concetta Lipardi和报道,果

模式动物研究进展

  在生命科学与人类健康领域中,实验动物在生命活动中的生理和病理过程,与人类有很多相似之处, 建立人类重大疾病的动物模型,对分析疾病的发病机制,解答特定人群对某种疾病的易感性,及新药研发等过程发挥着至关重要的作用。然而,由于各种模式动物在基因水平以及体内微生物组成等方面都与人类有着相当大的差别,而疾

模式动物研究进展

  在生命科学与人类健康领域中,实验动物在生命活动中的生理和病理过程,与人类有很多相似之处, 建立人类重大疾病的动物模型,对分析疾病的发病机制,解答特定人群对某种疾病的易感性,及新药研发等过程发挥着至关重要的作用。然而,由于各种模式动物在基因水平以及体内微生物组成等方面都与人类有着相当大的差别,而疾

毒性蛋白损害神经细胞

  近日来,马克斯·普朗克生物学研究所的科学家们已经破获一种方法,在这个方法中一个特定的基因突变会导致神经元损伤形成两种严重的疾病。在极少数情况下,病人可能会在同一时间得这两种疾病,肌萎缩性脊髓侧索硬化症和额颞痴呆症。  肌萎缩性脊髓侧索硬化症是一种毁灭性的运动神经元疾病,它会导致肌肉迅速弱化和死亡

用RNase III制备siRNA库来诱发RNAi(1)

小分子干扰RNA (Small interfering RNA ,siRNA ) 是一种非常有效的工具,能够在包括哺乳动物细胞在内的多个体系中抑制特定基因的表达,从而研究某个基因的功能或者是相关信息。但是这种强有力的方法的难题之一是需要设计,合成siRNA s 和验证其效果,从而找到最有效的

2.3.2 果蝇RNA的大规模制备

本方法可从 100 只果蝇或约 2g 果蝇胚胎中制备 RNA。试剂、试剂盒5mol LLiCl70% 乙醇酚:氯仿(1:1)20 mg ml 蛋白酶 K95%(V V) 乙醇.RNA 匀浆缓冲液3mol L 乙酸钠实验步骤一 材料与设备1)5mol/L LiCl2)70% 乙醇:70% (V/V)E

生物物理所揭示新的长非编码RNA在神经系统中的作用机制

  10月15日,Nucleic Acid Research杂志在线发表了中科院生物物理研究所刘力研究组和陈润生研究组合作的最新研究成果The novel long non-coding RNA CRGregulates Drosophila locomotor behavior。该研

新的长非编码RNA在神经系统中的作用机制

  10月15日,Nucleic Acid Research杂志在线发表了中科院生物物理研究所刘力研究组和陈润生研究组合作的最新研究成果The novel long non-coding RNA CRGregulates Drosophila locomotor behavior。该研究发现

Cell子刊:RNA剪接或成治疗阿尔兹海默症的潜在分子靶标

  众所周知,RNA剪接失调与某些神经退行性疾病的发展有关,例如脊髓性肌萎缩和肌萎缩性侧索硬化症。而阿尔兹海默症作为世界上最常见的神经退行性疾病,在这一领域仍未得到详细的研究。  于是,在2013年,美国Emory大学的Seyfried教授课题组在这一领域开启了最前沿的研究。该研究首次发现RNA剪接

RNAi的发现和起源

首次发现dsRNA能够导致基因沉默的线索来源于线虫Caenorhabditis elegans的研究。>1995年,康乃尔大学的Su Guo博士和>Kemphues在试图阻断秀丽新小杆线虫(C.  elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义

基因技术专题-1

专题一:RNA干扰技术(RNAi)1995年,康奈尔大学的Su Guo博士用反义RNA阻断线虫基因表达的试验中发现,反义和正义RNA都阻断了基因的表达,他们对这个结果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究证明,在正义RNA也阻断了基因表达的试验中,真正起作用的是双链RNA。这些

RNAi——双链RNA引起的基因敲除(1)

1995年,康奈尔大学的Su Guo博士用反义RNA阻断线虫基因表达的试验中发现,反义和正义RNA都阻断了基因的表达,他们对这个结果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究证明,在正义RNA也阻断了基因表达的试验中,真正起作用的是双链RNA[1]。这些双链RNA是体外

Gene Dev:研究果蝇提示衰老相关疾病的发病机制

  阿尔茨海默氏病和亨廷顿病通常都与老化相关,但她们之间的生物联系一直不甚明了。现在,Rutgers大学研究人员通过学习常见果蝇中小RNA分子,寻求解答上述问题。   Ammar Naqvi博士表示:利用果蝇,我们能够检测特定microRNA模式,当microRNA绑定到特定蛋白质时,会有助于

3月19日《自然》杂志精选

      封面故事:引导花粉管生长的化学引诱剂   本期封面所示为一个花粉管在一种新发现的化学引诱剂LURE1引诱下按字母“N”的形状生长。精确的花粉管引导是开花植物成功受精的关键。花粉管引诱剂的概念是19世纪末提出的,当时人们发现花粉管朝介质上被切除的雌蕊组织的方向生

RNAi技术研究进展

  RNA干扰(RNA interference,RNAi)是多种生物体内由双链RNA(doublestranded RNA,dsRNA)介导同源mRNA 降解的现象。RNAi现象先后在不同生物中被发现,植物学家称它为共抑制(co-suppression)或转录后基因沉默(post transcri

RNAi技术研究进展

RNA干扰(RNA interference,RNAi)是多种生物体内由双链RNA(doublestranded RNA,dsRNA)介导同源mRNA 降解的现象。RNAi现象先后在不同生物中被发现,植物学家称它为共抑制(co-suppression)或转录后基因沉默(post tran

RNAi技术研究进展

  RNA干扰(RNA interference,RNAi)是多种生物体内由双链RNA(doublestranded RNA,dsRNA)介导同源mRNA 降解的现象。RNAi现象先后在不同生物中被发现,植物学家称它为共抑制(co-suppression)或转录后基因沉默(post transcri

六篇Genome Res:模式生物的“百科全书”

  modENCODE项目的一系列最新成果登上了本期Genome Research杂志的封面。这一项目启动于2007年,是建立在ENCODE计划之上的模式动物“生命百科全书”,旨在对两个模式生物(黑腹果蝇和秀丽隐杆线虫)的功能性基因组元件进行综合性分析。modENCODE联盟本次发表的六篇文章,为人

Nature揭示RNA修饰在大脑功能和性别决定中的重要作用

  RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用,兼具信息分子和调控分子双重功能。据估计RNA上有一百多种化学修饰,但绝大多数修饰的功能还鲜为人知。本期Nature发表的一项研究指出,RNA修饰对果蝇神经系统的功能至关重要,也在性别决定起到了重要作用。  N6-methyladenosine(m6A)是真

纳米孔测序搞定超级难搞的基因

  Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一台MinION测序仪的。他所在的康涅狄格大学实验室是首批获得Oxford Nanopore Technologies测序仪的客户。尽管准确性不稳定,通量也不高,但Graveley和他的同事决定立刻就试试。  对于MinION,众多讨论