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ScienceAdvance|​农科院揭示lncRNAs调控水稻农艺性状变异机制

2019年12月18日,Science Advances杂志在线发表了来自中国农业科学院作物科学研究所杨庆文团队、刘君团队和华盛顿圣路易斯大学的Ken Olsen团队完成了水稻(亚洲栽培稻)及其祖先种(普通野生稻)非编码区lncRNA的注释,结合多重组学方法研究了水稻lncRNA的进化历史,从全基因组水平揭示了lncRNAs调控水稻重要农艺性状变异的分子机制。 尽管高达90%的真核生物基因组能够发生转录,但仅2%的转录本能够编码蛋白。阐明非编码区变异对农艺性状多样性形成的作用机理具有重要意义,是揭示作物遗传变异的基础。研究结果表明,栽培稻中95%的lncRNA表达量下调,且下调的lncRNA在进化过程中具有与定向选择一致的显著分子特征,差异表达的lncRNAs靶基因富集于与碳固定能力和碳水化合物代谢相关的位点。部分lncRNAs表达量降低直接导致淀粉含量和粒重的增加,从而通过lncRNAs的全基因组注释重塑了水稻转录组的表......阅读全文

Science Advance|​农科院揭示lncRNAs调控水稻农艺性状变异机制

  2019年12月18日,Science Advances杂志在线发表了来自中国农业科学院作物科学研究所杨庆文团队、刘君团队和华盛顿圣路易斯大学的Ken Olsen团队完成了水稻(亚洲栽培稻)及其祖先种(普通野生稻)非编码区lncRNA的注释,结合多重组学方法研究了水稻lncRNA的进化历史,从全

灵长类动物结构变异的机制

  2013年度基因组生物学大会(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美国纽约冷泉港实验室召开。这是基因组学领域最大的会议之一,吸引了多个著名研究所的大牛参加。会议主题包括高通量基因组学和遗传学、复杂性状的遗传学、功能和癌症基因组学、计算基因组学、进化基因组学以

科学家揭开耳聋基因变异分子机制

小核糖核酸miR-96变异是主因  英国科学家最近发表在美国《国家科学院院刊》(PNAS)上的一份研究报告称,小核糖核酸miR-96发生变异,可导致渐进性失聪。该分子机制的发现为改善听力损失和失聪的治疗手段奠定了基础。  该研究由英国谢菲尔德大学和剑桥桑格研究院等几所研究机构科学

张德强团队深度解析林木次生生长遗传调控机制

  近日,北京林业大学教授张德强研究团队依托林木分子设计育种高精尖创新中心与国家重点研发计划课题,以毛白杨群体为模式,采用转录组测序、基因组重测序、SNP检测等技术手段及关联作图策略,系统揭示了林木次生微管组织差异表达lncRNAs的全基因组分布模式与表达规律,发现lncRNA保守序列元件主要与“维

汉字首登Nature 农科院等完成亚洲栽培稻基因组变异研究

  水稻是全世界最重要的粮食作物之一,对水稻全球品种进行基因组研究,对于挖掘有利等位基因和指导基于全基因组信息的分子育种具有重大的理论和实践意义,是关系着国家乃至全球粮食安全的重大战略问题。  2011年9月,全球3000份水稻核心种质资源基因组项目(3K Rice Project)正式启动,该项目

农科院研究揭示水稻全基因组功能单倍型自然变异特征

  近日,中国农业科学院作物科学研究所(以下简称作科所)水稻分子设计技术与应用创新团队构建了一个全基因组基因功能单倍型(gcHap)数据集,全面揭示了亚洲栽培稻基因功能单倍型自然变异特征,提出亚洲栽培稻多起源(驯化)假说,并开发了适用于功能单倍型数据全基因组关联分析和全基因组预测的软件包“HAPS”

中国农科院植保所揭示水稻抗病新机制

  近日,笔者从中国农业科学院植物保护研究所获悉,该所王国梁研究团队对泛素连接酶SPL11底物SPIN6蛋白在水稻抗病调控途径中的作用机理研究取得新进展。相关研究结果于2015年2月6日在线发表在院选SCI顶尖核心期刊《科学公共图书馆病原(PLoSPatho⁃gens)》上。  泛素蛋白酶体途径是真

农科院深化机制体制改革 稳定经费并适度竞争

粮油加工创新团队首席科学家王强(左三)研究员在指导实验。中国农科院加工所提供   让科研人员从到处跑课题,到待在实验室里搞科研   走进北京中关村南大街12号,中国农业科学院的大院里,往日繁忙的景象没有了:主楼前停放的一排排汽车不见了,来回穿梭的人也少多了。岁末年初,本该是科研人员最忙碌的时候,

Nature Methods:针对LncRNAs的新型精准基因测序技术

  现在有一种新的基因测序技术-“捕获测序'(CaptureSeq),能使我们以更高的分辨率去探索人类基因组。它优于现有的基因测序技术,能精确捕捉测量许多具体的活性基因样品(即使基因的表达时间仅按分钟水平计算)。这个技术对癌症研究具有革命性的影响。在实际应用中,可用于包括许血液肿瘤的诊断。这篇文章

Science、EMBO重要发现:编码蛋白质的lncRNAs

  不久之前,研究人员还认为RNA分为两类:生成蛋白质的编码RNAs和发挥结构作用的非编码 RNAs。发现小分子RNAs开启了全新的研究领域。然而现在研究人员兜了个圈又回到了原地,推测一些长链非编码RNAs可能生成了具有生物功能的小蛋白。近期发表在《EMBO Journal》杂志上的一项研究