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eccDNA新型生物标志物的多种应用

实验方法:eccDNA-seq 文章内容1. 血浆中eccDNA检测eccDNA高通量检测的关键步骤是要通过实验手段对其进行有效的富集。研究者通过线性DNA的去除、eccDNA的纯化、建库、测序,生物信息分析对反式剪切位点(junction site)的识别从而完成对eccDNA的鉴定。5例孕期女性的血浆样品中eccDNA的富集与高通量测序结果显示:1)核酸外切酶V(exoV)去除线性DNA的过程对eccDNA的富集效果非常明显;2)同一个体血浆中的eccDNA与线性DNA相比最显著的特征在于长度分布。线性DNA长度在166bp左右富集,而MspI方法纯化的eccDNA主要在202和338bp处有明显集中,并且338bp处的eccDNA数目要明显多于202bp附近的eccDNA个数。图1 线性DNA和eccDNA长度比较2. 胚胎源和母源eccDNA检测比较之前的研究结果显示胚胎源(fetal ori......阅读全文

eccDNA新型生物标志物的多种应用

  新年伊始,eccDNA(染色体外环状DNA)的相关研究成果不断。2019年11月同期Nature、Cell报道了环状DNA通过高度开放染色质、复杂的拓朴异构特征增强表达的颠覆性发现,2019年12月Nature Genetics也刚刚揭示了eccDNA能够驱动神经母细胞瘤基因重排的全新功能。这一

eccDNA新型生物标志物的多种应用

  新年伊始,eccDNA(染色体外环状DNA)的相关研究成果不断。2019年11月同期Nature、Cell报道了环状DNA通过高度开放染色质、复杂的拓朴异构特征增强表达的颠覆性发现,2019年12月Nature Genetics也刚刚揭示了eccDNA能够驱动神经母细胞瘤基因重排的全新功能。这一

eccDNA新型生物标志物的多种应用

实验方法:eccDNA-seq 文章内容1. 血浆中eccDNA检测eccDNA高通量检测的关键步骤是要通过实验手段对其进行有效的富集。研究者通过线性DNA的去除、eccDNA的纯化、建库、测序,生物信息分析对反式剪切位点(junction site)的识别从而完成对eccDNA的鉴定。5例

eccDNA新型生物标志物的多种应用

  文章导读   新年伊始,eccDNA(染色体外环状DNA)的相关研究成果不断。2019年11月同期Nature、Cell报道了环状DNA通过高度开放染色质、复杂的拓朴异构特征增强表达的颠覆性发现,2019年12月Nature Genetics也刚刚揭示了eccDNA能够驱动神经母细胞瘤基因重排

新型生物标志物——KHK-A

由休斯敦德克萨斯大学MD安德森癌症中心领导完成的该项研究,发表在《自然细胞生物学》杂志上的结论如是说。研究表明,一种被称为KHK(己酮糖磷酸激酶或果糖激酶)的基因在癌细胞与正常肝组织中的表达有所不同。MD安德森癌症中心神经肿瘤学教授,资深作者Zhimin Lu说:正常肝细胞催化葡萄糖和果糖发生反应产

国自然研究热点——eccDNA的前世今生(三)

小编在这儿也给大家整理了eccDNA表达谱的研究思路,如下图。 (2)生物标志物eccDNA优于线性DNA的生物稳定性以及独特的分子结构特征,为迅速发展的无创活检道路增添了新的方向,如果有较多的临床样本,它非常适合做生物标志物的研究。下面这篇文章是eccDNA在液体活检方面探索的先驱文章,小编带大家

生物标志物的识别如何帮助改善多种人类疾病的诊疗?

  近年来,科学家们通过研究鉴别出了多种指示疾病的生物标志物,这对于多种疾病的诊断和新型疗法的开发具有非常重要的意义,本文中,小编就对近期相关研究报道进行整理,分享给大家!  【1】BBRC:科学家鉴别出结直肠癌的新型生物标志物  doi:10.1016/j.bbrc.2018.11.149  近日

新型生物标志物能够帮助医生预防死产

  根据最近由阿尔伯塔大学研究者们作出的研究成果,新型生物标志物能够帮助医生预防死产。  “当我们通过分析有过死产经历的女性的血液样本,以及将其与正常女性的样本进行比较之后,我们其中存在一些化学性质的差异”,改文章的首席躲着,来自生物系的教授David Wishart说道:“这表明我们能够预测以及预

国自然研究热点—eccDNA的前世今生

  2019年11月,顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)的重要研究,彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界,一时之间,将人们的目光都吸引到这个科研界的新宠

国自然研究热点—eccDNA的前世今生

  ​1. eccDNA为什么火?它到底是何方神圣?   2019年11月,顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)的重要研究,彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知,同时也迅速引爆了整个生