不确定潜能的克隆性造血CHIP或可治疗白血病

克隆性造血是一种常见的与衰老相关的生物学状态,潜质未定的克隆性造血(CHIP)患者的恶性肿瘤发生率为每年0.5%~1%。扩增压力增加导致内源性免疫紊乱,端粒缩短引起染色体不稳定,当正常造血不能维持,出现克隆性干细胞的扩增和新的突变、造血干细胞和衰老相关的改变,包括DNA损伤应答改变、转录程序改变和表观遗传学改变等,这些都是导致克隆进展的潜在因素。 急性髓性白血病(AML,Acute myeloid leukemia)是一种影响成年人和儿童的血液癌症,其需要多个遗传变异才能发生,随着机体年龄增长,很多人都会产生一些突变,这些突变会使得特定的血细胞比其它细胞增殖地更快,从而形成自己独特的细胞群体,这一过程是第一次“打击”,其称之为“具有不确定潜能的克隆性造血”(CHIP,clonal hematopoiesis of indeterminate potential),其不一定是有害的。如果第二次打击使这些细胞变得恶性,这基本上......阅读全文

ChIPChip-E.-coli

AbstractChIP-Chip stands for Chromatin Immunoprecipitation and chip in the sense of DNA microarray. It is a technique to determine the genome-wide bin

ChIPChip技术的介绍与应用

人类基因组计划的完成开启了一个新的纪元——功能基因组时代来临,与基因信息相比较,人们更关注于基因的功能、调控网络与信号通路等信息。表观遗传学研究与核内蛋白因子的功能分析成为基因表达调控研究的重要组成部分。结合了染色质免疫共沉淀与基因芯片技术的ChIP-chip技术的浮现使得全基因组范围内DNA与蛋白

染色质免疫沉淀芯片(ChipChip)

该技术能够快速在目标基因组的染色体中确定特异DNA结合蛋白的准确结合位点,ChIP芯片也可以在一个基因组的任何感兴趣的区域内寻找染色体的结构改变。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因组范围内确定基因转录因子的DNA结合位点和其他DNA结合蛋白或蛋白复合体的DNA结合位点。(2)染色体活性状态的定

Tissue-preparation-protocol-for-ChIP

实验概要This protocol  describes how chromatin is prepared from tissue, which can subsequently  be used for chromatin immunoprecipitation (ChIP). It is re

ChIP-using-plant-samples

实验概要 The  immunoprecipitation (IP) of cross-linked chromatin with antibodies  specific for certain histone modifications (chromatin  immunoprecipitati

ChIP-新手心得

最近有不少战友在做ChIP实验,希望我的一点经验对大家有帮助(本贴不谈实验步骤,最后我会附件一份说明书,有详细步骤,另外建议像我一样的新手用试剂盒,避免不必要的麻烦)一、原理转录从基因的启动子区开始,由一系列的转录因子结合到基因的启动子区,通用转录因子结合在基本启动子区起始转录,而这个过程对基因的转

ChIP-using-plant-samples-–-Arabidopsis

实验概要This protocol describes how chromatin is prepared from Arabidopsis, which can subsequently be used for chromatin immunoprecipitation (ChIP). T

ChIP实验技术经验分享

染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,简称ChIP)是研究活体内蛋白质与DNA相互作用的一种技术。它利用抗原抗体反应的特异性,可以真实地反映体内蛋白因子与基因组DNA结合的状况。随着对基因功能研究的不断深入,这项技术正越来越多的被应用于科研的各个领域

ChIP实验技术经验分享

   染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,简称ChIP)是研究活体内蛋白质与DNA相互作用的一种技术。它利用抗原抗体反应的特异性,可以真实地反映体内蛋白因子与基因组DNA结合的状况。随着对基因功能研究的不断深入,这项技术正越来越多的被应用于科研的各个领域。

免疫学技术专题:染色质免疫沉淀芯片(ChipChip)

该技术能够快速在目标基因组的染色体中确定特异DNA结合蛋白的准确结合位点,ChIP芯片也可以在一个基因组的任何感兴趣的区域内寻找染色体的结构改变。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因组范围内确定基因转录因子的DNA结合位点和其他DNA结合蛋白或蛋白复合体的DNA结合位点。(2)染色体活性状态的定

技术推荐-|-ChIP的新玩法

  如果研究者们想知道蛋白在做什么,他们通常会采取直接的方式:免疫共沉淀能知道蛋白A和蛋白B有没有在一起,ChIP能确定蛋白A是否与核酸序列B结合。  染色质免疫共沉淀ChIP可以鉴定与指定蛋白结合的DNA序列,其基础理念能追溯到几十年前。如今ChIP已经成为了表观基因组学的一个基本工具,与新一代测

神经元芯片(Neuron-Chip)

为了经济地、标准化地实现LonWorks技术的应用,Echelon公司设计了神经元芯片。神经元这一名称是为了表明正确的网络控制机制和人脑是极为相似的。人脑中是没有控制中心的。几百万个神经元连接在一起,每个神经元都能通过位数众多的路径向其他的神经元发送信息。每个神经元通常专注于某一种特殊功能,但是任何

染色质免疫共沉淀(ChIP)

染色质免疫共沉淀实验方法原理在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“prorein A”特异性地结合到免疫球蛋白的FC片段的现象活用开发出来的方法。目前多用精制的prore

简化ChIP分析的新方法

  最近,美国普渡大学的研究人员开发出一种方法,称为ZipChip,可大大降低ChIP分析的时间和成本,同时还能提高灵敏度。  染色质免疫沉淀(ChIP)研究,对于染色质相关蛋白和组蛋白修饰在基因组中的定位,提供了深入的见解。然而,标准的ChIP方法耗时、昂贵、费力,由于涉及大量的步骤,易受实验误差

染色质免疫共沉淀(ChIP)

实验方法原理在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“prorein A”特异性地结合到免疫球蛋白的FC片段的现象活用开发出来的方法。目前多用精制的prorein A预先结合

染色质免疫共沉淀(ChIP)

实验方法原理 在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“prorein A”特异性地结合到免疫球蛋白的FC片段的现象活用开发出来的方法。目前多用精制的prorein A预先结

染色质免疫共沉淀(ChIP)

            实验方法原理 在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“prorein A”特异性地结合到免疫球蛋白的FC片段的现象

基因芯片(gene-chip)的原理

基因芯片(gene chip)的原型是80年代中期提出的。基因芯片的测序原理是杂交测序方法,即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法,在一块基片表面固定了序列已知的八核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG,与基因芯片上对应位置的核酸探针产生互补匹配时,通

弥补ChIPseq缺陷的新工具

  来自美国麻省大学医学院的研究人员开发出了一项新技术,可以提供真核生物基因组的详细三维(3-D)图像,这有可能帮助科学家们解答一些有关染色质结构的关键问题。在发表于《细胞》(Cell)杂志上的研究论文中,这一称作为Micro-C的新技术使得研究人员能够以核小体分辨率来分析染色体折叠,填补了以往一些

辞旧迎新,ChIP都有哪些新玩法

  如果研究者们想知道蛋白在做什么,他们通常会采取直接的方式:免疫共沉淀能知道蛋白A和蛋白B有没有在一起,ChIP能确定蛋白A是否与核酸序列B结合。  染色质免疫共沉淀ChIP可以鉴定与指定蛋白结合的DNA序列,其基础理念能追溯到几十年前。如今ChIP已经成为了表观基因组学的一个基本工具,与新一代测

染色质免疫共沉淀技术(ChIP)

真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在。因此,研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay, CHIP)是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。它的基本原理是在活细

用CRISPR-突破ChIPseq的局限

  生物体内的所有细胞都携带着相同的遗传物质——DNA。不同细胞在转录因子的控制下表达不同的基因,从而实现特异性的功能。比如说,神经细胞表达的基因有助于向其他神经细胞传递信息,而免疫细胞表达的基因有助于它们合成抗体。  将染色质免疫共沉淀技术与下一代高通量测序技术相结合的染色质免疫共沉淀测序(ChI

染色质免疫共沉淀技术(ChIP)

真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在。因此,研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay, CHIP)是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。它的基本原理是在活细

ChIP实验的三大法宝

在基因调控领域,可以说没有比表观遗传学更热的话题了。而染色质免疫共沉淀ChIP是表观遗传学研究中最常用的方法。  ChIP通过针对染色质相关蛋白(组蛋白、转录因子等)的抗体,来鉴定与该蛋白(或蛋白修饰)相连的序列。这种方式能够帮助人们定位基因组中发生的表观遗传学改变。举例来说,针对H3K4me3(赖

ChIPSeq分析常见问题集锦

染色质免疫共沉淀测序(ChIP-Seq)是指对染色质免疫共沉淀(ChIP)获得的DNA片段进行大规模测序,并能把所研究蛋白的DNA结合位点精确定位到基因组上。Roche GS FLX Titanium 、Illumina Hiseq2000和AB SOLID 4 这3种测序技术均可以用于ChIP-

flipchip倒焊芯片的封装特点

flip-chip倒焊芯片。裸芯片封装技术之一,在LSI 芯片的电极区制作好金属凸点,然后把金属凸点与印刷基板上的电极区进行压焊连接。封装的占有面积基本上与芯片尺寸相同。是所有 封装技术中体积最小、最薄的一种。但如果基板的热膨胀系数与LSI 芯片不同,就会在接合处产生反应,从而影响连接的可靠性。因此

Crosslinking-chromatin-immunoprecipitation-(XChIP)-protocol

实验概要ChIP is a powerful  tool that allows the specific identification of proteins or histone  modifications to regions of the genome. Chromatin is isol

ChIP实验的四个注意事项

染色质免疫沉淀 (ChIP) 用于检测细胞核中天然染色质内的蛋白质与 DNA 之间的相互作用。ChIP 实验首先需要将细胞固定,即将蛋白质与 DNA 相互作用交联固定到位。然后将染色质打断为片段,使用抗体对目的蛋白质以及与其结合的所有 DNA 进行免疫沉淀。最后,解交联,对沉淀 DNA 进行纯化。纯

染色质免疫共沉淀技术(ChIP)-实验

实验概要染色体免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是基于体内分析发展起来的方法,也称结合位点分析法,在过去十年已经成为表观遗传信息研究的主要方法。这项技术帮助研究者判断在细胞核中基因组的某一特定位置会出现何种组蛋白修饰。ChIP不仅可以检测体内反

ChIP常见问题分析与解决办法

本文列出了ChIP实验中常见的问题以及解决办法,供您实验参考! 问题