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基因编辑鼠的构建GuideRNA设计和筛选

众所周知,CRISPR/Cas9被业内誉为“基因剪刀”,它可以高效地实现靶基因的编辑,自问世以来就备受关注和青睐。CRISPR/Cas9系统是由CRISPR相关基因和Cas9组成,Cas9核酸酶会在向导RNA(Guide RNA, gRNA)的指引下,在完整基因组上的特定位点完成切割反应,同时Cas9的切割也依赖于gRNA和基因组特定位点配对区5′端的PAM结构。在前几期中我们已经详细介绍过利用CRISPR/Cas9系统构建基因编辑大小鼠的基本流程。然而,在具体的实验过程中,首先大部分的我们都会遇到这样一个问题,该如何根据研究目的设计sgRNA,如何选择活性较高的sgRNA等。在2013年,哈佛大学David Liu课题组通过研究证明CRISPR/Cas9的特异性仅与gRNA配对的靠近PAM处7-12bp碱基相关,这说明CRISPR/Cas9系统仍存在一定的脱靶风险。因此如何降低CRISPR/Cas9的脱靶效应也成为......阅读全文

基因编辑鼠的构建 Guide RNA设计和筛选

众所周知,CRISPR/Cas9被业内誉为“基因剪刀”,它可以高效地实现靶基因的编辑,自问世以来就备受关注和青睐。CRISPR/Cas9系统是由CRISPR相关基因和Cas9组成,Cas9核酸酶会在向导RNA(Guide RNA, gRNA)的指引下,在完整基因组上的特定位点完成切割反应,同

基因编辑鼠 sgRNA表达载体构建

继上次发表的Guide RNA设计和筛选的相关知识之后,希望大家还没有忘记相关的操作和技巧,今天,我们就来和大家聊聊后续的实验,在基因编辑鼠的过程中,sgRNA表达载体是如何构建的呢?在靶点筛选结束之后,下一步就要进行sgRNA载体构建。在构建表达载体前,应根据实验目的选取合适的表达质粒。比如进行实

基于碱基编辑的全基因组扰动文库构建与筛选技术

  通过全基因组规模扰动文库的构建与筛选,从宏观基因组层面系统研究基因型与表型的对应关系,是微生物功能基因组学研究的重要方法。相较于单个基因扰动文库的构建与筛选,混合文库的构建与筛选可通过一次实验实现特定条件下对上千个基因的同时筛选,显著提高通量。近年来,CRISPR/Cas技术凭借着精简高效、可编

基因组文库和cDNA文库的构建及筛选

刘芝华 中国医学科学院肿瘤研究所  分子肿瘤学国家重点实验室 概念: 基因组文库是含有某种生物体全部基因的随机片段的重组DNA克隆群体;cDNA文库是指含有所有重组cDNA的克隆群体。   基因组文库:来源于基因组DNA,反映基因组的全部信息,用于基因组物理图谱的构建,基因组序列分析,基因在染色体上

基因编辑那么热,可是你都会用了吗?

  基因编辑是一种遗传工程技术,针对某个序列已知但功能未知的序列,通过改变生物的遗传基因,使其特定的基因功能丧失作用,通过研究对生物体造成的影响,进而推测出该基因的生物学功能。本文为你科普基因编辑三大技术:  基因敲除  进行DNA水平编辑。一般用于构建基因敲除鼠模型。  CRISPR/Cas9:C

各种类型的基因编辑鼠如何建系?

《鼠年说鼠》系列文章,每周二更新,专门解答大小鼠铲屎官们在养鼠过程中经常遇到的繁育与鉴定类的问题,同时向大家征集问题,任何基因编辑鼠饲养繁殖或鉴定的困惑统统可以丢给小赛,小赛会给您回复或统一在后面的内容为大家做出详细的解答。今天我们就开始第九期的内容吧~  完全性基因敲除、基因敲入(点突变)鼠如何建

张锋:想用“魔剪”CRISPR治疗人类疾病,没那么简单

  7 月31日,Broad研究所的CRISPR先驱张锋及其研究小组成员David Scott在《自然》子刊Nature Medicine上发表了题为“Implications of human genetic variation in CRISPR-based therapeutic genom

1篇Nature、1项医学大奖!大神张锋又开挂了……

  5位CRISPR科学家包揽“大奖”  8月15日,美国最著名的医学大奖—— Albany Medical Center Prize in Medicine and Biomedical Research 的2017年获奖名单揭晓。包括张锋、Jennifer Doudna、Emmanuelle C

上海生科院利用CRISPR/Cpf1系统实现水稻多基因定点编辑

  3月19日,《分子植物》(Molecular Plant)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Multiplex Gene Editing in Rice using the CRISPR-Cpf1 System 的研究论文。该工作在水稻中利用CRIS

基因编辑技术成功治疗实验鼠血友病

  日本一个研究小组近日报告说,他们利用基因编辑技术成功治疗了实验鼠的血友病。未来有望在此基础上开发出能根治血友病的疗法。  血友病是由于基因异常导致的出血性疾病,其特征是人体无法生成凝血因子或者凝血因子生成不足,导致凝血时间延长,出血难以止住。有的患者为了预防出血,从小就要每周注射1至3次凝血因子