RealspaceandrealtimedynamicsofCRISPRCas9visualizedby...(三)

Fig. 4Structural rearrangement of the HNH domain. a, b HS-AFM images of the HNH domain in the high-height (a) and low-height (b) states. The mean center positions of the HNH and REC1 domains are indicated by dots. Red and blue lines indicate the cross-sectional position used for the height distribution analysis in Supplementary Fig. 5d. For comparison, the Cas9–RNA–DNA models in the I and D states are ......阅读全文

realtime/qPCR-常遇到的那些疑问

  通常来讲,real-time PCR( qPCR)的反应程序不需要像常规的 PCR 那样,要变性、退火、延伸 3 步。由于其产物长度在 80~150 bp 之间,所以只需要变性和退火就可以了。   SYBR@Green 等染料法,好在 PCR 扩增程序结束后,加一个溶解程序,来形成溶解曲

Realtime-PCR-数据导出-——-ABI仪器篇

  1. Real-time PCR数据:Real-time PCR完成后,所有数据并非可以直接导出,由于每一次实验的情况都不相同,仪器的很多默认设定都会对最终数据结果造成重大偏差,所以在完成PCR过程后,需要人为对实验结果进行条件设置,才能提取到科学有效的实验结果,进而完成对实验结果的分析和判断。

Dynamic-Monitoring-ofCellular-Remodeling-Induced-bythe-Transforming-Growth1

The plasticity of differentiated adult cells could have a great therapeutic potential, but at the same time, it is characteristic of progression of se

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

realtime-PCR中内参基因的CT值

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realtime-PCR负对照有信号问题分析

引物设计不够优化:应避免引物二聚体和发夹结构的出现。 引物浓度不佳:适当降低引物的浓度,并注意上下游引物的浓度配比。 镁离子浓度过高:适当降低镁离子浓度,或选择更合适的 mix 试剂盒。 模板有基因组的污染:RNA 提取过程中避免基因组 DNA 的引入,或通过引物设计避免非特异扩增。

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

realtime-PCR中内参基因的CT值

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Realtime-PCR实验心得和RNA提取心得

并不是所有的实验都可以做real-time的,技术路线要选好当你的基因表达量少或有些不表达具体就是做普通pcr跑胶条带比较弱,不是很亮的情况下个人觉得最好不要选择real,不容易做好,特别是融解曲线用sbgr green染料做的话,引物设计时扩增片断最好小于250bp,太长了不好扩预实验先rt-pc

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

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这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

Realtime-PCR与RTPCR的区别

实时荧光定量PCR原理所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。1.内标在传统定量中的作用由于传统定量方法都是终点检测,即PCR到达平台期后进行检测,而PCR经过对数期扩增到达平台期时,检测重

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这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

Realtime-PCR-数据导出-——-ABI仪器篇(二)

 •    6. StepOne阈值(Threshold):选中孔板中所有的数值,如下界面选择log、Target对话框•    将每个基因的Tredshold Auto勾选掉,阈值数值调整范围原则在指数增长期。阈值数值调整范围原则在指数增长期,该范围中,曲线斜率相同,ΔCT值不变 •    注意同

引物设计原则(Principle-of-realtime-quantiation-PCR-primer-)

1、引物的长度一般为15-30bp,常用的是18-27bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74°C,不适于Taq DNA聚合酶进行反应。2、引物序列在模板内应当没有相似性较高,尤其是3’端相似性较高的序列,否则容易导致错配。引物3’端出现3个以上的连续碱基,如GGG或CCC,也会使错误

realtime-PCR中内参基因的CT值

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实时荧光定量PCR(RealTime-PCR)实验流程

一、RNA的提取(详见RNA提取及反转录)不同组织样本的RNA提取适用不同的提取方法,因为Real-Time PCR对RNA样品的质量要求较高,所以,正式实验前要选择一款适合自己样品的提取方法,在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在总rna的提取过程中,注意避免mRNA的断裂;取2u

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

Realtime-PCR-数据导出-——-ABI仪器篇(一)

1. Real-time PCR数据:Real-time PCR完成后,所有数据并非可以直接导出,由于每一次实验的情况都不相同,仪器的很多默认设定都会对最终数据结果造成重大偏差,所以在完成PCR过程后,需要人为对实验结果进行条件设置,才能提取到科学有效的实验结果,进而完成对实验结果的分析和判断。

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这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

体外荧光法检测核内体早期动力学

A fluorescence-based in vitro assay for investigating early endosome dynamicsSina V Barysch1,2, Reinhard Jahn1 & Silvio O Rizzoli2ABSTRACTEarly endoso

Nature发布CRISPRCas9重大新成果

   来自麻省总医院的一个研究小组找到了一种新方法来扩大强大基因编辑工具——CRISPR-Cas9 RNA引导核酸酶的使用及提高其精确性。他们的研究论文在线发表在6月22日的《自然》(Nature)杂志上。  在这篇Nature文章中,研究人员描述了一种演化版本的DNA切割酶Cas9。相比于迄今为止

Nature技术突破:光控CRISPRCas9系统

  发表在6月15日《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上的一项研究中,来自日本的研究人员报告称他们构建出了更好的CRISPR基因编辑系统:一种光激活的新型Cas9核酸酶使得研究人员能够在空间和时间上更好地控制RNA引导的核酸酶的活性。  加州大学戴维斯分校干细胞生物学家

CRISPRCas9治疗视网膜血管生成疾病

  血管生成是导致视力丧失、失明和多种退化性眼部疾病(包括增生性糖尿病视网膜病变、湿性老年黄斑变性、早产儿视网膜病变等)的特征之一,随着病程发展,这些血管还会渗漏、破裂、甚至导致视网膜脱离,使视力受损。根据最新《Nature Communications》报道,研究人员提出用基因编辑技术防止视网膜血

基因编辑工具CRISPRCas9遭遇新挫折!

  在一项新的研究中,来自德国明斯特大学的研究人员发现,在小鼠进行常规的CRISPR-Cas9基因插入过程中,不必要的DNA重复频率很高。相关研究结果发表在2020年2月21日的Science Advances期刊上,论文标题为“Pervasive head-to-tail insertions o