代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生物整体、器官或组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。代谢组学通过揭示内在和外在因素影响下代谢整体的变化轨迹来反映某种病理生理过程中所发生的一系列生物事件。代谢组学的研究对象与层次有哪些？一般来说，代谢组学关注的对象是分子量在1000以下的小分子化合物。根据研究的对象和目的不同，科学家将生物体系的代谢产物分析分为4个层次：代谢物靶标分析：某一个或几个特定组分的定性和定量分析，如某一类结构、性质相关的化合物（氨基酸、有机酸、顺二醇类）或者某一代谢途径的所有中......阅读全文
代谢组学全流程解决方案
赛默飞基于其超高分辨的静电场轨道阱（Orbitrap）质谱平台结合其功能强大的软件平台，提供代谢组学全流程解决方案。该方案不仅覆盖从极性代谢物到非极性代谢物的全面检测、峰提取与定量、统计学分析与可视化作图、代谢产物的全面鉴定、代谢通路分析等全流程的要求，而且还整合了从非靶标生物标记物发现到靶标生物标
【JOAT刘虎威编者按】专题：代谢组学和脂质组学
刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编。 近日，刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编进行了约稿审稿工作，并撰写了题为“专题：代谢组学和脂质组学”的编者按。 代谢
质谱仪在代谢组学和代谢研究中有着杰出表现
质谱仪以离子源、质量分析器和离子检测器为核心。离子源是使试样分子在高真空条件下离子化的装置。电离后的分子因接受了过多的能量会进一步碎裂成较小质量的多种碎片离子和中性粒子。它们在加速电场作用下获取具有相同能量的平均动能而进入质量分析器。质量分析器是将同时进入其中的不同质量的离子，按质荷比m/e大小分
代谢组学：一项艰巨的任务
学生化的孩子真是伤不起。糖代谢、脂代谢、核酸代谢，一系列代谢通路，一大堆代谢产物，简直让人头晕眼花。然而，这又不能跳过。毕竟，DNA编码蛋白质，而蛋白质在小分子上发挥其魔力。但很多时候，科学界对这些分子一无所知。 “如果你测定一滴血中的小分子，大约60% 所检测到的峰都无法与任何代谢物相匹配，
AFADESI空间代谢组学高级研修班
为做好AFADESI空间代谢组学技术服务工作，由中国科学院高能物理研究所测试中心和中国科学院-香港大学金属组学与健康和环境联合实验室共同承办的“AFADESI空间代谢组学高级研修班”将于2023年4月26日-4月27日在京召开。在这里，我们将竭诚为您提供丰富的前沿应用信息和与专家零距离交流的平台
临床代谢组学研究常见问题（一）
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。 Q：如何设置验证集和测试集？ A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这
综述：代谢组学在疾病中的应用
代谢组学经历了迅猛的技术演化在过去二十年。尤其是广泛靶向代谢组学技术的新起，实现一次性检测坚定上千种物质，同时能够定量。整合了非靶向和靶向代谢物检测技术的优点，创造性实现了高通量、高灵敏度靶向代谢物检测，为定性、定量检测大批量、低丰度代谢物提供了高效的方法。 应用代谢组学的定义事件的预测生
代谢组学常使用的数据库
代谢组主要是对小分子代谢物（一般50-1500 Da）进行高通量定性和定量分析，代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据，方便后续的代谢组学数据分析，揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。 目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD
临床代谢组学研究常见问题（一）
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。 Q：如何设置验证集和测试集？ A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这
利用精确血浆代谢组学方法揭示衰老相关代谢特征
过去二十年里，代谢（脂质）组学研究得到了迅速发展。液相色谱与高分辨质谱联用（LC-HRMS）技术是目前内源性代谢物最常用的手段，然而困扰LC-HRMS技术的分析精度和结构鉴定的瓶颈问题仍然存在。尤其是血浆样本，其组分化学性质各异，同时复杂的基质会显著减低代谢物定性与定量结果的准确性，导致生物学信
Cell提出一个新“组学”：蛋白质代谢小分子互动组学
科学家们提出了一个新的“组学”——一个处理蛋白质和小分子之间相互作用的互动组学（protein-metabolite interactomics）。此前系统生物学家专注于基因组学或蛋白质组学，现在他们日益发现了蛋白质-代谢小分子之间相互作用的重要性。 基因组学针对的是生物体基因的系统分析，而蛋
非靶向代谢组学中鉴定代谢产物适宜选用哪些分析方法
据相关科技要闻解读表明非靶向代谢组学已逐步成为研究生命活动的重要基础。它可高清呈现代谢产物的变化规律以及代谢种类，特别是那些评价高的非靶向代谢组学更是揭开了研究集体生命活动发生和发展的本质，现在就非靶向代谢组学中鉴定代谢产物更适宜选用哪些分析方法作简要阐述：1.主成分分析（PCA）非靶向代谢组学中鉴
Agilent与Stemina－宣布代谢组学领域的合作
Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究 2010 年 5 月 24 日，北京——安捷伦科技公司(纽约证交所：A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布，两家公司
Agilent与Stemina－宣布代谢组学领域的合作
Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究 2010 年 5 月 24 日，北京——安捷伦科技公司(纽约证交所：A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布，两家公司
Science：逆转传统认知，代谢组学揭示重要机制
来自Weill Cornell医学眼的研究人员在新研究证实氨基水杨酸(PAS)一种常用于治疗结核病(TB)的药物，通过在叶酸合成中的一种关键酶加工分解成不同的产物，干扰了随后在这条信号通路中起作用的酶。这一发表在11月1日《科学》(Science)杂志上的研究与从前认为其只与酶结合，而并未参
LCMS8060助力广泛靶向代谢组学研究
mGWAS (metabolome Genome-Wide Association Study)指基于代谢组学的全基因组关联分析，是将代谢组数据作为表型，与基因型数据进行关联分析的一种方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细，因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高。 海南大学和华中农业大学的罗杰
代谢组学在疾病诊断中的应用
代谢组学 （metabolomics）的出现是生命科学研究的必然。在20世纪90年代中期发展起来的代谢组学，是对某一生物或细胞中相对分子量小于1,000的小分子代谢产物进行定性和定量分析的一门新学科。代谢组作为系统生物学的重要组成部分，在临床医学领域具有广泛的应用前景。 代谢产物是基因表达的最终
大连化物所等肝癌代谢组学研究取得进展
近日，中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的高分辨分离分析及代谢组学研究团队(1808组)与上海东方肝胆医院王红阳院士课题组合作，将基于液相色谱-质谱用于肝癌组织非靶标代谢组学研究并取得了重要进展，相关研究成果已经在线发表在Cancer Research杂志上。 原发性肝癌是全球最
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担，而上游的（核酸、蛋白质等）大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面，如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等，所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游，所提供的是生物学的终端信息
当代谢组学技术遇到单细胞测序技术
代谢组的状态是对遗传因素、外部环境和治疗干预等信息的综合反映，因此是一个跟踪和了解上述因素对表型影响的理想研究目标。代谢组可做多种样品类型、结果富含各种信息、可作为连接其他组学数据与表型之间的桥梁。过去20年，组学研究飞速发展，处于中心法则末端的代谢组学虽然起步较晚但是发展很快。很多组学研究目前已进
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担，而上游的（核酸、蛋白质等）大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面，如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等，所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游，所提供的是生物学的终端信息。如
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担，而上游的（核酸、蛋白质等）大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面，如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等，所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游，所提供的是生物学的终端信息
第一届全国代谢组学及蛋白质组学双星峰会
继测序之后，基于质谱技术的代谢组学及蛋白组学于生命科学研究领域发展迅速。应用质谱技术从分子层面对生命体进行动态、精准的检测，可以了解生命体内代谢与蛋白整体水平的变化，为基础科学研究提供新方向。 为了贯彻 “两城一中心”的战略，江北新区继基因测序平台后，又重磅打造了质谱检测平台，旨在服务生命
大熊猫乳汁蛋白质组学和代谢组学国际合作获进展
国家国际科技合作专项项目“大熊猫乳蛋白的分析及人工乳的研制”承担单位成都大熊猫繁育研究基地联合英国格拉斯哥大学首次对大熊猫乳汁展开了蛋白质组学和代谢组学研究，取得了阶段性进展。双方研究人员通过非麻醉的方式采集驯化后的大熊猫母乳，连续采集至幼仔出生后180天，并对乳汁进行了蛋白组学和代谢组学的研
J－Proteome－Res:－代谢组学应用于微囊藻毒素代谢研究
微囊藻毒素(MCLR)，作为一种肝毒素，正在威胁着人类的公共卫生安全。在体内，肝脏是MCLR主要攻击的器官，然而具体代谢变化目前任然未知。近日，中国科学院水生生物研究所谢平等研究人员在与上海敏芯信息科技公司的合作下，通过对灌服MCLR的大鼠模型进行代谢组学的研究，向我们揭示了MCLR扰乱肝脏代谢
安捷伦举办芯片液相色谱及蛋白质组学/代谢组学用户交流会
疾病蛋白质组学重庆市市级重点实验室第二届学术委员会研讨会 暨安捷伦第一届芯片液相色谱及蛋白质组学/代谢组学用户交流会成功举办 2007年秋，为了开发建立一套全新理念的，与临床研究紧密联结的整体化蛋白质组学研究平台，以实现科研及早期临床诊断、新药开发及个体化医疗的需求，安捷伦科技和西南
岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究
靶向代谢组学中，通常需要同时检测多个目标组分，这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。 岛津超快速质谱（UFMS）拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例，其驻留时间（Dwell time≥0.8 ms）、切换时间（Pause time≥1 ms）、扫描速度（Scan s
2015－年代谢组学技术高级培训班通知
代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科，是系统 生物学的重要组成部分。已在疾病诊断、医药研发、精准医学、营养食品科学、 毒理学、环境学，植物学等领域得到广泛应用。 中国的代谢组学与国际在同步发展，到目前为止，中国人发表的代谢组学相 关的文章数量已在国际上排第
代谢组学与临床医学的研究进展
人体是一个复杂的系统，存在于这一系统中的生物分子相互关联、互相依赖。近年来，人们已经意识到生物学的整体复杂性以及基因构成与环境因素之间的复杂交互作用，而对这些交互作用的理解已经不能单单从基因组学、蛋白质组学或转录组学水平去揭示。关注生物分子之间途径及网络的动态变化和关系的系统生物学（system
高深度空间代谢组学助力肿瘤微环境研究
肿瘤的发展除了与癌细胞自身基因突变导致的恶性增殖有关以外，还与肿瘤微环境息息相关。在癌症中，正常组织中和谐的细胞相互作用关系被破坏，原本保护正常细胞生存的微环境在肿瘤细胞的影响下，逐渐演变成适应肿瘤生长的条件。针对肿瘤微环境的检测和表征研究也可为癌症治疗提供新的思路。目前空间多组学技术已用于研究几种