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非靶向代谢组学中鉴定代谢产物适宜选用哪些分析方法

据相关科技要闻解读表明非靶向代谢组学已逐步成为研究生命活动的重要基础。它可高清呈现代谢产物的变化规律以及代谢种类,特别是那些评价高的非靶向代谢组学更是揭开了研究集体生命活动发生和发展的本质,现在就非靶向代谢组学中鉴定代谢产物更适宜选用哪些分析方法作简要阐述:1.主成分分析(PCA)非靶向代谢组学中鉴定代谢产物所采用的方法是影响代谢组学研究分析成功与否的关键要素之一。主成分分析(PCA)现今应用较为广泛的数据降维算法,它可将代谢产物中可能存在相关性的变量转换为一组线性不相关的变量,从而使得代谢产物的主成分因子迅速被读取。2.偏小二乘判别分析(PLS-DA)非靶向代谢组学中鉴定代谢产物的方法是多种多样的,偏小二乘判别分析(PLS-DA) 也是其中一种应用率较为广泛的分析方法,这种分析方法可以通过提取多种代谢产物成分因子的不同组合来区分代谢结果,相当于从海量数据中挖掘具有潜在标志的代谢因子。3.正交偏小二乘判别分析(OPLS-DA)据......阅读全文

基于 Orbitrap GC-MS 的非靶向代谢组学(一)

Stefan Weidt,2 Bogusia Pesko,2 Cristian Cojocariu,1 Paul Silcock,1 Richard J. Burchmore,2 and Karl Burgess21Thermo Fisher Scienti_c, Runcorn, UK2Glasg

基于 Orbitrap GC-MS 的非靶向代谢组学(三)

使用 SIMCA 软件进行多变量统计分析。5将结论数据转化为更为直观的对数值,将 Y 类别设为各时间点,生成数据的偏最小二乘判别分析(PLS-DA)模型。该软件生成分数图和载荷图,以显示沿着主成分每个时间点的聚类和分离(图 6)情况。从本次分析可知,死亡后立即取样的样品(RAT_T0)聚集在

基于 Orbitrap GC-MS 的非靶向代谢组学(二)

   图 2. 大鼠肌肉组织样品代谢 0–3 天后的 GC-MS 色谱图(自上而下天数增加),X 轴为保留时间,Y 轴为强度(固定为1E9 计数)。例如,记下高亮区域中峰强度随时间的变化。 化合物发现阶段Q Exactive GC 系统获取了每个样品的全扫描色

代谢组学 | 肿瘤治疗之靶向葡萄糖代谢

  能量代谢重编程是肿瘤的十大特征之一,其中葡萄糖代谢异常是肿瘤代谢最突出的特征。在氧气充足的情况下,肿瘤细胞依然倾向于进行糖酵解,将葡萄糖代谢为乳酸。肿瘤细胞有氧糖酵解能力是正常细胞的20 ~ 30倍,为肿瘤代谢提供 大量能量和中间产物。因此,靶向糖酵解等异常环节的代谢酶是抗肿瘤治疗的重点。一些研

基于赛默飞 Orbitrap GC-MS的非靶向代谢组学

  引言:代谢组学旨在表征和定量生物系统中的完整小分子代谢通路或 代谢物组。代谢物组包含小分子多元混合物(包括氨基酸、糖 和磷酸糖、生物胺和脂质)。非靶向代谢组学挑战性,因 为其要求定性和定量上百个不同种类化合物,而有关这些代谢 物的经验知识有限。因此,有必要使用一个既可以以非靶向的 方式灵敏检测特

基于赛默飞 Orbitrap GC-MS的非靶向代谢组学

引言:代谢组学旨在表征和定量生物系统中的完整小分子代谢通路或 代谢物组。代谢物组包含小分子多元混合物(包括氨基酸、糖 和磷酸糖、生物胺和脂质)。非靶向代谢组学挑战性,因 为其要求定性和定量上百个不同种类化合物,而有关这些代谢 物的经验知识有限。因此,有必要使用一个既可以以非靶向的 方式灵敏检

代谢组学的研究方法

代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?       代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生