Antpedia LOGO WIKI资讯

样本抽提中RNA降解的解决方法

从临床样本出发进行芯片、测序等高通量生物学研究是最常用的思路,但样本采集过程受制于病理特征、病例数量等因素,耗时费力。无数期盼等来了期待中的临床样本,做个RNA抽提还常常……降解样本的RNA完整度低,长链RNA变成了短链,在常规的扩增过程中会发生探针检测的目的片段的丢失,导致芯片结果的不准确。遇到RNA降解了怎么办?有条件的话,重新收样一定是更佳选择。样本取材时注意操作迅速稳定,尽快液氮速冻。也可以选用RNAlater等RNA保存试剂,但也需要严格按照此类试剂的操作规范进行,否则也达不到对RNA的保护效果。比如浸泡RNAlater前,组织样本尽量切割成任一方向小于0.5cm的小块,以保证浸泡尽可能充分。但是珍贵样本怎么可能轻易重新取到呢?降解的珍贵样本真的只能扔了么?No!针对降解样本Affymetrix官方推出了一款表现优秀的降解RNA扩增标记试剂盒:SensationPlus™ FFPE Amplification an......阅读全文

样本抽提中RNA降解的解决方法

  从临床样本出发进行芯片、测序等高通量生物学研究是最常用的思路,但样本采集过程受制于病理特征、病例数量等因素,耗时费力。无数期盼等来了期待中的临床样本,做个RNA抽提还常常……   降解样本的RNA完整度低,长链RNA变成了短链,在常规的扩增过程中会发生探针检测的目的片段的丢失,导致芯片结果的不

样本抽提中RNA降解的解决方法

从临床样本出发进行芯片、测序等高通量生物学研究是最常用的思路,但样本采集过程受制于病理特征、病例数量等因素,耗时费力。无数期盼等来了期待中的临床样本,做个RNA抽提还常常……降解样本的RNA完整度低,长链RNA变成了短链,在常规的扩增过程中会发生探针检测的目的片段的丢失,导致芯片结果的不准确。遇到R

RNA降解

新鲜细胞:如果试剂没有问题,且外源性污染也可以排除,那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如  果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞,一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织:某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏,胸腺等),即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮条件下将组织

RNA提取时RNA降解原因

1 ) 新鲜细胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织: 某些含有内源性核酸酶的样品,很难避免RNA酶的降解,建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎,并且,匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品: 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放,然后转移到-70℃冰箱存

信使RNA的降解

同一细胞内的不同mRNA具有不同的寿命(稳定性)。在细菌细胞中,单个mRNA可以存活数秒至超过一小时,但平均寿命为1至3分钟,因此,细菌mRNA的稳定性远低于真核mRNA。哺乳动物细胞mRNA的寿命从几分钟到几天不等。mRNA的稳定性越高,从该mRNA产生的蛋白质越多。 mRNA的有限寿命使细胞能够

Nature揭秘RNA降解机制

  就好像我们利用碎纸机来销毁不再有用或包含有潜在破坏性信息的文件一样,细胞利用一些分子机器来降解不必要或有缺陷的大分子。来自马克斯普朗克生物化学研究所(MPIB)的科学家们,现在揭示出了细胞核区室利用一种特异的RNA外来体(exosome)的机制——这一大分子机器负责了核糖核酸(RNAs)的降解和

FFPE样本核酸(DNA/RNA)制备

福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织切片的存档代表了珍贵且来源广泛的生物医学研究材料。随着越来越多的研究人员转向 FFPE 样品的分子分析,开发特定的操作步骤,考虑这些样品的独特性质就变得越来越重要。QIAGEN 在 FFPE 样本纯化及下游检测整个流程中都提供完善的解决方案。QIAamp

Cell新文章解析RNA降解机制

  如同我们利用碎纸机来销毁不再有用或是包含潜在破坏性信息的文件一样,细胞利用分子机器来降解不需要或有缺陷的大分子。来自马克思普朗克生物化学研究所的科学家们现在解码了在降解核糖核酸(RNA)过程中起至关重要作用的一个蛋白质复合物(Ski复合物)的结构。这项研究发表在8月15日的《细胞》(Cell)杂

避免RNA降解的方法有哪些?

(1)在用来验证完整性之前先在变性胶上分析RNA。(2)运用良好无污染的技术分离RNA(3)将组织提取后立刻提取RNA,并将提取好的RNA反转录为cDNA进行低温保存。

RNA 和 DNA 提取的降解问题

降解问题是RNA制备中常常到的问题。因为在 RNA 提取过程中,样品储存不当或裂解效率低等情况都会导致降解。对于 DNA 提取,降解不是一个大问题,因为对于 PCR,DNA 可以被剪切并且工作正常,如果不希望有较多剪切的 DNA,可以使用弱裂解的方法。