引言:今年三月份,来自英国的科学家Michael Stubbington博士和TapioLönnberg博士一起,基于Fluidigm公司C1 mRNA测序样本及相应数据,开发出一套用于研究T细胞基因序列信息的开放型分析工具---TraCeR,同时结合T细胞亚群的转录组数据分析,从而进一步揭示在不同免疫反应中蕴含的更深层次的T细胞功能特异性。该研究成果发表在著名的《nature methods》杂志上。原文链接:http://www.nature.com/nmeth/journal/v13/n4/full/nmeth.3800.html 研究背景及成果当机体受到外源性入侵时,免疫系统会召集所有免疫细胞亚群通过产生免疫反应与病原体进行对抗。由于病原体存在着多种多样的差异,因而相应产生的免疫反应和和每个阶段内涉及的细胞类型也有所不同。T细胞受体中V(D)J基因区域的随机重排,导致了T细胞种类的复杂多样化;这种多样化使T细胞在识别和杀......阅读全文
肿瘤组织中免疫细胞的组成在免疫治疗中起关键作用,然而人类肿瘤组织中免疫细胞的异质性和分化途径还有待研究。李汉杰博士等通过对25名黑色素瘤患者肿瘤中免疫细胞的单细胞转录组测序和单细胞TCR测序分析,发现大量的CD8 T细胞的转录组呈连续性梯度分布,跨越了从“过渡态”到“功能失调状态”的分化途径。相
引言 今年三月份,来自英国的科学家Michael Stubbington博士和Tapio Lönnberg博士一起,基于Fluidigm公司C1 mRNA测序样本及相应数据,开发出一套用于研究T细胞基因序列信息的开放型分析工具 ---TraCeR,同时结合T细胞亚群的转录组数据分析,从而进一步
解析细胞表型是免疫学中一个共同的单细胞分析目标。然而,T细胞受体V(D)J基因区域的随机重排带来了T细胞群体的复杂变化。这形成了庞大的T细胞部队,以便识别特定的外源蛋白,引发有效的免疫反应。 为了在单细胞水平实现深度的T细胞分析,Fluidigm近日在C1™系统上推出了一个全新的免疫学应用 –
前言 近年来,靶向PD-1/PD-L1抗体的效果无疑戏剧性地引导我们对癌症治疗总体方法和对宿主-肿瘤生物学理解的改变。由于癌症治疗过程中,T细胞会发生功能性障碍,大多数癌症病人单独接受PD-1或者PD-L1抗体治疗后,并不能表现出持久的抗肿瘤反应。因此进行抗体联用策略和治疗无疑成为了靶向可
【科学前沿】Science Immunology:狙击肿瘤,PD-1与GITR抗体联用竟有事半功倍之妙! 前言近年来,靶向PD-1/PD-L1抗体的效果无疑戏剧性地引导我们对癌症治疗总体方法和对宿主-肿瘤生物学理解的改变。由于癌症治疗过程中,T细胞会发生功能性障碍,大多数癌症病人单独接受P
作者:Carrie 单细胞测序技术 基因测序在体外诊断市场中的重要性日益突出。其中,单细胞测序技术自2009年问世,2013年被Nature Methods评为年度技术以来,越来越多地被应用在科研领域。2015年以来,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、S
2017年5月,《Cell》杂志连续刊登了美国西奈山伊坎医学院研究人员的工作,他们分离了来自肺癌病人肿瘤组织、正常肺组织以及外周血的免疫细胞,利用TCR测序和质谱流式(CyTOF)等技术对细胞特定转录本和表面30多个蛋白Marker进行检测分析,绘制了早期肺腺癌肿瘤微环境中免疫细胞的详细图谱。根
2017年5月,《Cell》杂志连续刊登了美国西奈山伊坎医学院研究人员的工作,他们分离了来自肺癌病人肿瘤组织、正常肺组织以及外周血的免疫细胞,利用TCR测序和质谱流式(CyTOF)等技术对细胞特定转录本和表面30多个蛋白Marker进行检测分析,绘制了早期肺腺癌肿瘤微环境中免疫细胞的详细图谱。根
北京大学张泽民研究团队与美国安进公司欧阳文军团队、北京大学人民医院申占龙课题组合作,在结直肠癌浸润T细胞的特征与动态变化研究方面取得了突破性进展,相关成果于10月30日在线发表于《自然》。 T细胞在肿瘤免疫和免疫治疗中占据核心地位,如何系统刻画人体内T细胞的动态变化一直是研究难点。张泽民团队等
北京大学张泽民研究团队与美国安进公司欧阳文军团队、北京大学人民医院申占龙课题组合作,在结直肠癌浸润T细胞的特征与动态变化研究方面取得了突破性进展,相关成果于10月30日在线发表于《自然》。 T细胞在肿瘤免疫和免疫治疗中占据核心地位,如何系统刻画人体内T细胞的动态变化一直是研究难点。张泽民团队等
研究人员应用单细胞测序技术全面揭示了轻中型、重型新冠肺炎患者及其从发病期到康复期机体整体免疫学变化特征、机制和规律。 今年年初,新冠肺炎疫情在世界范围内快速暴发。根据世界卫生组织最新统计数据显示,截止到2020年8月11日,新冠肺炎在全球已导致累计近2000万确诊病例和超过73万死亡病例,平
由冷泉港亚洲主办的单细胞基因组学前沿学术会议(Frontiers in Single Cell Genomices)日前在苏州独墅湖会议酒店举行。美国科学院院士、斯坦福大学Stephen Quake教授作为本次会议的重要特邀嘉宾,在会上做了精彩演讲。 Quake教授谈到,近几年随着单细胞测序技
2017 年 6 月 15 日,北京大学生命科学学院 BIOPIC 中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大 -清华生命科学联合中心张泽民研究组,首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组,及美国 AMGEN 公司的欧阳文君研究组在《Cell》杂志
2017年6月16日,北京大学生命科学学院BIOPIC中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大-清华生命科学联合中心张泽民研究组,首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组,以及美国AMGEN公司的欧阳文军研究组在Cell杂志发表了题为“Landscape o
2017年6月15日,北京大学生命科学学院 BIOPIC 中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大 -清华生命科学联合中心张泽民研究组,首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组,及美国 AMGEN 公司的欧阳文君研究组在《Cell》杂志发表了题为
来一个关于B细胞重新编程为T细胞的精彩故事^_^且听我慢慢讲来[1] ……目前已经有很多研究证明通过特定转录因子的表达可以将多能或多能细胞导向分化成特定类型的细胞或从一个谱系转变为另一个谱系。比如Gata1的表达将单核细胞前体转化为红系-巨核细胞和嗜酸性粒细胞[2-4] ,Ceb
小编:天地悠悠过客匆匆潮起又潮落~~~ 小鼠甲:咳咳,咱们是个严肃的科普节目…… 小编:天地洪荒,宇宙万物,生命起源,又到了万物~~~ 小鼠乙:(咆哮体)现在是冬天!冬天!咱们几(今)天要讲的是细胞!细胞! 小编:呃(⊙o⊙)… 好吧,咱们今天要讲的是细胞(*^▽^*),
小儿发作性结肠炎和炎性肠病(IBD)对婴儿和儿童的生长有显著作用,但对疾病亚型的病因尚不完全了解。 2019年11月14日,广州医科大学张玉霞、杨敏、龚四堂等与北京大学白凡课题组合作共同通讯在Cell 在线发表题为"Mucosal Profiling of Pediatric-Ons
随着我国肿瘤发病率的逐年提高,寻找一种高效的治疗肿瘤方案成为社会上持续关注的目标。利用人体自身免疫功能开展的抗肿瘤治疗成为学界焦点。 6月16日,北京大学生命科学学院BIOPIC中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大-清华生命科学联合中心张泽民研究组联合首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京
根据克隆选择理论的中心宗旨,T细胞作为机体应对外界病原威胁的关键组成部分之一,需要被抗原激活从而发挥作用,然而,机体内绝大多数T细胞在整个生命过程中并非处于激活状态而是由保持静默的初始T细胞组成【1】。无论是是克隆选择理论还是近年基于克隆选择理论的研究都未指出负调节信号在维持初始T细胞静默状态中
澳大利亚加文医学研究所的科学家开发了一种新的单细胞测序方法RAGE-Seq(Repertoire and Gene Expression by Sequencing),该方法兼备高通量、靶向、长读长和单细胞测序特征,能够高准确度和灵敏度的识别全长抗原受体序列,追踪与癌症免疫反应相关的免疫细胞。7
近年来,随着精准医疗的发展,癌症治疗已经取得了长足的进步,其中借助免疫系统开发的多种治疗方法被人们寄予厚望。虽然部分治疗方法在临床治疗中已经获得一定的成功,但大多数只对部分患者有效,并且还会导致耐药、超进展以及免疫相关严重不良反应等问题。因此,了解免疫系统在癌症治疗中的表现,准确筛选最有可能获益
科学家通过使用单细胞转录组测序技术,完成了超过5000个T细胞的测序数据积累与分析。这是国际上迄今为止针对T细胞的最大规模研究。此项研究由北京大学生命科学学院BIOPIC中心、北大—清华生命科学联合中心张泽民研究组等联合完成,相关成果6月16日在线发表于《细胞》杂志。 基于人体免疫系统保护机体
细胞在肿瘤、病毒、细菌、寄生虫、移植组织、过敏原、甚至自身抗原的适应性免疫应答中都发挥着重要的调节作用。大部分 T 淋巴细胞在其细胞表面表达单一的、高度特异性的抗原受体(TCR),与 MHC-抗原肽复合物相结合并识别其中特异的抗原肽,启动获得性/特异性免疫应答机制,比如 T 细胞介导的细胞免
癌症之所以难以攻克,很大程度上因为肿瘤微环境的造成的海量细胞异质性,进而导致治疗失败【1】。同时由于目前针对肿瘤浸润免疫细胞的免疫治疗方案如雨后春笋般奔向市场,单细胞测序技术日新月异的进展,都对临床上原位模拟肿瘤微环境模型提出了迫切的需要和更高的要求【2】。 同时目前体外肿瘤培养系统很难还原体
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程,继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐,本月在《Nature
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程,继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐,本月在《Nature
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程,继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐,本月在《Nature
1月4日,国际学术期刊Journal of Biological Chemistry 发表了中国科学院上海营养与健康研究院常兴研究组的研究成果“Single-cell RNA-Seq analysis identifies a noncoding interleukin 4 (IL-4) RNA
“2019中国生物医药创新合作大会”于9月26-27日在上海召开,本次大会由万怡医学主办,上海市生物医药行业协会、上海市浦东新区生物产业行业协会、美国驻华使领馆商务处、张江生命健康产业(孵化)联盟、上海隽润网络科技有限公司协办,百华协会、香港生物科技协会、同写意、新药创始人俱乐部、上海股权投资协